ImageVerifierCode 换一换
格式:DOC , 页数:24 ,大小:4.21MB ,
资源ID:131104      下载积分:5 金币
已注册用户请登录:
账号:
密码:
验证码:   换一换
  忘记密码?
三方登录: 微信登录   QQ登录  
下载须知

1: 本站所有资源如无特殊说明,都需要本地电脑安装OFFICE2007和PDF阅读器。
2: 试题试卷类文档,如果标题没有明确说明有答案则都视为没有答案,请知晓。
3: 文件的所有权益归上传用户所有。
4. 未经权益所有人同意不得将文件中的内容挪作商业或盈利用途。
5. 本站仅提供交流平台,并不能对任何下载内容负责。
6. 下载文件中如有侵权或不适当内容,请与我们联系,我们立即纠正。
7. 本站不保证下载资源的准确性、安全性和完整性, 同时也不承担用户因使用这些下载资源对自己和他人造成任何形式的伤害或损失。

版权提示 | 免责声明

本文(蛋白质修饰位点预测详解.doc)为本站会员(飞猪)主动上传,三一文库仅提供信息存储空间,仅对用户上传内容的表现方式做保护处理,对上载内容本身不做任何修改或编辑。 若此文所含内容侵犯了您的版权或隐私,请立即通知三一文库(发送邮件至doc331@126.com或直接QQ联系客服),我们立即给予删除!

蛋白质修饰位点预测详解.doc

1、 蛋白质修饰位点分析目录实验目的2实验平台3实验过程4一、“人类connexin43”蛋白质磷酸化位点修饰41、“人类connexin43”蛋白质序列下载42、uniprot数据库查看蛋白磷酸化位点53、在线软件预测指定蛋白磷酸化位点6精品.(1)DISPHOS 1.3预测未知蛋白磷酸化位点6(2)PhosphoSitePlus预测指定蛋白磷酸化位点114、“人类connexin43”蛋白质磷酸修饰结论14二、“人类血红蛋白”糖基化位点修饰151、N型糖基化位点预测152、O型糖基化位点预测18(1)哺乳动物O型糖基化位点预测18(2)真核生物O型糖基化位点预测203、uniprot数据库查

2、看蛋白质糖基化修饰位点224、“人类血红蛋白”糖基化位点修饰结论22实验结论23(特别提示:ctrl+单击目录下的标题链接,可以跟踪标题;ctrl+单击标题后的图标可以返回目录)实验目的l 找出“人类connexin43”蛋白质上面的所有可能磷酸化位点,并说明为什么(注释)l 找出“人类血红蛋白”上面的糖基化位点,注释结果实验平台l uniprot数据库: http:/www.uniprot.org/(查看蛋白的修饰情况)l 预测未知蛋白磷酸化位点DISPHOS: http:/www.dabi.temple.edu/disphos/精品.PhosphoSitePlus:http:/www.ph

3、osphosite.orgl 预测未知蛋白的糖基化修饰位点N型糖基化位点预测:http:/www.cbs.dtu.dk/services/NetNGlyc/O型糖基化位点预测:http:/www.cbs.dtu.dk/services/NetOGlyc/http:/www.cbs.dtu.dk/services/YinOYang/实验过程一、“人类connexin43”蛋白质磷酸化位点修饰1、“人类connexin43”蛋白质序列下载蛋白序列: fasta.txt 精品.2、uniprot数据库查看蛋白磷酸化位点网站链接: http:/www.uniprot.org/精品.精品.3、在线软件预

4、测指定蛋白磷酸化位点(1)DISPHOS 1.3预测未知蛋白磷酸化位点网站链接:http:/www.dabi.temple.edu/disphos/精品.l 开始预测精品.精品.l 结果DISPHOS由蛋白序列预测蛋白磷酸修饰位点,总共有37个丝氨酸修饰位点,13个苏氨酸修饰位点,16个酪氨酸修饰位点。但是根据打分,只有8个丝氨酸修饰位点可能存在。精品.精品.(2)PhosphoSitePlus预测指定蛋白磷酸化位点网站链接:http:/www.phosphosite.orgl 开始预测 l 结果筛选参考文献来源多于5篇的磷酸化修饰位点,丙氨酸磷酸化修饰位点数目为1、丝氨酸为17、苏氨酸数目为

5、1、酪氨酸数目为7。精品.精品.精品.4、“人类connexin43”蛋白质磷酸修饰结论在线数据库查询和在线软件预测结果基本一致,“人类connexin43”蛋白质磷酸位点数量相对一般蛋白质较多,且丝氨酸磷酸修饰位点最多。“人类connexin43”蛋白质极有可能是一种活性较高的蛋白质,与机体的生物活性显著相关。精品.通过各种文献阅读和网络筛选发现connexin43蛋白质是一种哺乳动物连接蛋白,是主要的细胞缝隙连接蛋白,其表达的异常与多种疾病的发生有关。 二、“人类血红蛋白”糖基化位点修饰Ncbi下载人类血红蛋白的蛋白序列保存为:hemoglobin.txt1、N型糖基化位点预测网站链接:h

6、ttp:/www.cbs.dtu.dk/services/NetNGlyc/l 开始预测精品.l 结果精品.精品.2、O型糖基化位点预测(1)哺乳动物O型糖基化位点预测网站链接:http:/www.cbs.dtu.dk/services/NetOGlyc/l 开始预测精品.l 结果精品.(2)真核生物O型糖基化位点预测网站链接:http:/www.cbs.dtu.dk/services/YinOYang/l 开始预测l 结果精品.精品.3、uniprot数据库查看蛋白质糖基化修饰位点4、“人类血红蛋白”糖基化位点修饰结论在线数据库查询和在线软件预测结果基本一致,人类血红蛋白基本没有O型糖基化修饰位点,但是存在N型糖基化修饰位点。血红蛋白是高等生物体内负责运载氧的一种蛋白质,糖基化修饰可能和血红蛋白的信号传导功能有关。精品.实验结论人类connexin43”蛋白质磷酸位点数量相对一般蛋白质较多,且丝氨酸磷酸修饰位点最多;人类血红蛋白基本没有O型糖基化修饰位点,但是存在N型糖基化修饰位点。如有侵权请联系告知删除,感谢你们的配合!精品

宁ICP备18001539号-1