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1、楚雄师范学院生物化学课程教学大纲徐成东制一、课程名称生物化学 二、课程的性质、目的与任务 生物化学是生物技术专业的专业基础课。设置该课程的目的，就是要使学生从分子水平了解生命现象的化学本质，了解生物体的组成、结构、性质、功能及代谢。通过本课程学习，要使学生掌握生物化学的基本理论、基本知识和基本方法，为从事生物科学研究奠定良好的基础。四、教学的基本要求 本课程大纲为理论教学部分。理论教学要求学生掌握生物体的基本化学组成及这些组成的性质，掌握生物体内的主要代谢途径，及主要代谢调控方式。三、教学的基本内容：第一章 蛋白质化学第一节 蛋白质通论 一、蛋白质的化学组成与分类 二、蛋白质的大小与分子量 三
2、、蛋白质的构象 四、蛋白质功能的多样性第二节 蛋白质的构件分子氨基酸 一 、常见的蛋白质氨基酸的结构通式 二、二十种常见的蛋白质氨基酸分类及结构 三、不常见的蛋白质氨基酸和非蛋白质氨基酸 四、氨基酸的性质 五、蛋白质的水解第三节 蛋白质的共价结构一、 一、蛋白质中氨基酸的连接方式二、 二、肽和肽键的结构三、 三、肽的物理化学性质四、 四、天然存在的活性肽五、 五、蛋白质一级结构的测定第四节 蛋白质的三维结构 一、 研究蛋白质构象的方法 二、多肽主链折叠的空间限制 三、R基团间的相互作用及稳定蛋白质三维构象的作用力 四、 二级结构与超二级结构 五、 纤维蛋白质的结构 六、球状蛋白质的三级结构和结
3、构域 七、 亚基缔合和四级结构第五节 蛋白质的分子结构与功能 一、同源细胞色素c的种属差异与分子进化 二、一级结构的局部断裂与蛋白质的激活 三、肌红蛋白和血红蛋白的结构与功能 四、免疫球蛋白的结构与功能第六节 蛋白质的性质 一、 两性解离性质及等电点 二、 蛋白质胶体性质 三、 蛋白质的沉淀 四、 蛋白质的变性与复性 五、 蛋白质的紫外吸收特性 六、 蛋白质呈色反应 教材：生物化学（沈同主编，1991） 学时数：72 主要参考书：生物化学（王镜岩主编，2002）第二章 核酸化学第一节 第一节 核酸通论 一、 一、核酸的发现和研究简史二、 二、核酸的种类和分布三、 三、DNA储存遗传信息的证实第
4、二节 核酸的基本构件分子核苷酸 一、碱基、核苷和核苷酸 二、核苷酸的生物学功能第三节 DNA结构 一、核酸分子中的共价键 二、 DNA 一级结构 三、DNA碱基组成的Chargaff规则 四、 DNA的二级结构 五、 DNA的三级结构 六、DNA与蛋白质复合物的结构第四节 RNA的种类和结构 一、RNA的种类和一级结构 二、tRNA 三、mRNA 四、rRNA第五节 核酸的物理化学性质 一、 核酸的两性解离性质 二、 核酸的紫外吸收（max=260nm） 三、 核酸的变性、复性和分子杂交 四、核酸的熔解温度（Tm） 五、核酸的沉降性质第六节 人类基因组计划（HGP）简介一、 一、HGP概况二、
5、 二、HGP取得的成绩三、 三、HGP面临的挑战第三章 酶学第一节 酶的概念及作用特点一、 一、酶及生物催化剂概念的发展二、酶作用的特点 三、酶的化学本质 四、酶专一性类型第二节 酶的命名和分类 一、酶的命名 二、酶的国际系统分类法第三节 酶催化作用的结构基础和高效催化的策略 一、酶催化的中间产物理论 二、酶的活性中心和必需基团 三、酶作用专一性机理 四、酶高效催化有关的策略第四节 酶促反应的动力学 一、酶的活力与测定 二、底物浓度对反应速度的影响 三、酶浓度的影响 四、温度对酶促反应速度的影响 五、pH的影响 六、激活剂的影响 七、抑制剂的影响第五节 重要的酶类及酶活性的调节控制 一、多酶体
6、系(multienzyme system) 二、别构酶(allosteric enzyme) 三、共价调节酶(covalent regulatory enzyme) 四、酶原(enzymogen或proenzyme)的激活 五、同工酶(isoenzyme) 六、抗体酶(abzyme)第六节 酶工程简介 一、化学酶工程 二、生物酶工程 第四章 维生素与辅酶第一节 维生素的概念与分类 一、维生素的一般概念和重要性 二、维生素的分类和与辅酶的关系第二节 重要的脂溶性维生素 一、维生素A 二、维生素D 三、维生素K 四、维生素E第三节 重要的水溶性维生素- 一、维生素C 二、维生素B1和焦磷酸硫胺素（
7、TPP） 三、维生素B2和FMN、FAD 四、泛酸与辅酶A（CoA） 五、烟酸、烟醚胺和NAD、NADP 六、维生素B6及其磷酸吡哆醛（胺） 七、生物素- 八、叶酸和四氢叶酸(FH4) 九、维生素Bu和B，z辅酶 十、硫辛酸第四节 作为辅酶的金属离子-第五章 生物膜的结构与功能第一节 第一节 生物膜的组成 一、膜脂 二、膜蛋白 三、糖类第二节 生物膜的结构和特点 一、生物膜中分子间的作用力 二、生物膜结构的主要特征 三、生物膜分子结构模型第三节 生物膜的功能一、 一、生物膜与物质运送二、生物膜与能量转换三、生物膜与信号转导第六章 新陈代谢引论和生物能学概述第一节 新陈代谢通论 一、新陈代谢概念
8、 二、能量代谢在新陈代谢中的重要地位 三、新陈代谢的调节四、 四、代谢中常见的有机反应机制第二节 新陈代谢研究方法 一、同位素示踪法 二、酶抑制剂的应用 三、气体测量法 四、核磁共振波谱法 五、利用遗传缺陷症研究代谢途径第三节 生物能学 一、有关热力学的一些基本概念 二、自由能的概念 三、化学反应中自由能的变化和意义四、生物体的能流和能量产生的三个阶段第四节 高能化合物一、 一、高能化合物的概念 二、高能磷酸化合物的类型 三、ATP是生物体中自由能的流通货币第七章 糖与糖代谢第一节 糖类化学概述 一、糖类的生物学作用 二、单糖的立体结构 三、重要的单糖及衍生物 四、重要的寡糖五、 五、重要的多
9、糖六、 六、复合糖第二节 单糖的代谢 一、葡萄糖的主要代谢途径及细胞定位 二、糖酵解（EMP） 三、丙酮酸的去路：无氧降解和有氧降解途径 四、三羧酸循环（TCA） 五、磷酸戊糖途径（PPP） 六、糖的异生 七、乙醛酸循环第三节 糖原的分解和生物合成 一、糖原的分解 二、糖原的生物合成 三、糖原代谢的调控第四节 糖代谢的调节 一、糖酵解途径的调节血糖浓度的调节 二、三竣酸循环的调节 三、磷酸戌糖途径的调节 四、糖异生作用的调节 五、糖原代谢的调节第八章 生物氢化电子传递和氧化磷酸化作用第一节 生物氧化概述 一、生物氧化的特点 二、生物氧化过程中CO2的生成 三、生物氧化过程中H2O的生成四、有机
10、物在体内氧化释能的三个阶段第二节 线粒体生物氧化体系 一、线粒体结构特点 二、电子传递呼吸链的概念 三、呼吸链的组成 四、机体内两条主要的呼吸链及其能量变化 五、电子传递抑制剂第三节 氧化磷酸化作用 一、 氧化磷酸化和磷氧比（P/O）的概念 二、氧化磷酸化的偶联机理 三、氧化磷酸化的解偶联和抑制 四、线粒体外NADH的氧化磷酸化作用 五、葡萄糖彻底氧化生成ATP的总结算 六、能荷第四节 非线粒体氧化体系第九章 脂类代谢第一节 概述 一、脂类的一般概念 二、脂肪的消化和吸收 三、脂类转运和脂蛋白的作用第二节 脂肪的分解代谢 一、脂肪的水解 二、甘油的转化 三、脂肪酸的分解代谢 四、酮体的代谢第三
11、节 脂肪的生物合成 一、脂肪酸的生物合成 二、磷酸甘油的生物合成 三、三酰甘油的生物合成脂肪酸的生物合成第四节 磷脂和糖脂的代谢 一、磷脂的结构及降解 二、磷脂的生物合成 三、糖脂的合成与分解第五节 胆固醇的代谢 一、胆固醇的生物合成 二、胆固醇的去路第六节 脂肪代谢的调节 一、激素对脂代谢的调节 二、脂肪酸合成的调节第十章 蛋白质的酶促降解和氨基酸的代谢第一节 第一节 蛋白质的酶促降解一、 一、蛋白水解酶二、食物中蛋白质的消化吸收三、细胞内蛋白质降解第二节 氨基酸的分解与转化 一、氨基酸代谢的概况 二、氨基酸的脱氨基作用 三、氨基酸的脱羧基作用 三、氨基酸降解产物的去向第三节 氨基酸的生物合
12、成一、 一、必需氨基酸和非必需氨基酸二、 二、生物固氮的生物化学三、氨基酸碳骨架的来源四、氨基酸生物合成的调节第十一章 核酸的酶水解和核苷酸代谢第一节 核酸和核苷酸的分解代谢 一、核酸的酶水解 二、嘌呤碱的分解代谢 三、嘧啶碱的分解代谢第二节 核苷酸的合成代谢 一、嘌呤核苷酸的生物合成 二、嘧啶核苷酸的生物合成 三、脱氧核糖核苷酸的生物合成 第十二章 DNA的复制、修复和重组第一节 遗传信息传递的中心法则第二节 DNA的半保留复制 一、DNA半保留复制的概念和实验证明 二、催化DNA复制的酶类 三、原核细胞DNA的复制的起始点和方式 四、原核细胞DNA半保留半不连续复制的过程 五、DNA复制的
13、忠实性七、 七、真核细胞DNA的合成第三节 DNA的损伤和修复一、 一、直接修复（光复活）二、切除修复三、重组修复四、诱导修复（SOS）第四节 DNA突变 一、突变的类型 二、突变剂的作用第五节 DNA的遗传重组 一、同源重组（homologous recombination ） 二、特异位点重组（site-specific recombination） 三、转座重组（transpositional recombination） 第十三章 RNA的生物合成第一节 在DNA指导下的RNA合成 一、转录的概念 二、RNA聚合酶及催化反应 三、RNA合成过程 四、启动子和转录因子 五、终止子和终止因
14、子 六、RNA生物合成的抑制剂第二节 新生RNA的剪接和修饰 一、原核生物中RNA的加工 二、真核生物RNA的一般加工 三、RNA的拼接、编辑和再编码 四、RNA生物功能的多样性 五、细胞RNA以不同速度降解第三节 以RNA为模板的RNA合成 一、RNA的复制 三、端粒酶是一种特殊的反转录酶 第十四章 蛋白质的生物合成与修饰第一节 蛋白质生物合成体系 一、mRNA和遗传密码 二、tRNA三、 三、核糖体四、 四、辅助因子第二节 蛋白质的生物合成 一、氨基酸的活化 二、tRNA的特征性结构及其在识别密码子上的作用 三、大肠杆菌中肽链合成的过程 四、真核细胞蛋白质生物合成 五、蛋白质合成的抑制剂第
15、三节 多肽链合成后的定向运送和加工 一、多肽链合成后的定向运送 二、多肽链合成后的加工第十五章 细胞代谢和基因表达的调节第一节 细胞代谢的调节网络 一、代谢途径交叉形成网络 二、分解代谢和合成代谢的单向性 三、代谢的基本要略在于形成ATP、还原力和构造单元以用于生物合成 四、代谢调节的四级水平：第二节 酶活性的调节 一、代谢调节的概念 二、酶水平的调节 三、细胞结构对代谢途径的分隔控制调节 四、激素调节第三节 基因表达的调节细胞的信号传递系统 一、原核生物基因表达的调节操纵子学说 二、真核生物基因表达的调节 第十六章 基因工程和蛋白质工程第一节 第一节 DNA重组与基因工程一、DNA重组的技术
16、路线二、基因工程的应用与前景三、DNA体外重组常用的酶第二节 第二节 蛋白质工程简介一、蛋白质的分子设计和改造 二、技术和核酸技术的相互增强第三节 核酸研究技术简介一、DNA序列测定三、基因文库与cDNA文库四、聚合酶链式反应（polymerase chain reaction, PCR）*第十七章 激素化学第一节 激素的概念与分类 一、激素的一般概念 二、激素的化学本质和分类第二节 重要的激素 一、动物激素 二、植物激素 三、昆虫激素第三节 激素的作用原理 一、受休及其特征 二、质膜激素受体的信息传递 三、胞内受体激素的信息传递* 学生自学，写读书报告四、教学进度 课程：生物化学 专业：生物
17、技术学时： 72 任课教师： 徐成东系主任签字： 主管部长签字： 20062007学年第1学期周次学时 讲授内容 作业 1周2周3周4周5周6周7周8周9周10周11周12周13周14周15周16周17周18周444444444444444444第一章 蛋白质化学第一节 蛋白质通论 一、蛋白质的化学组成与分类 二、蛋白质的大小与分子量 三、蛋白质的构象 四、蛋白质功能的多样性第二节 蛋白质的构件分子氨基酸 一 、常见的蛋白质氨基酸的结构通式 二、二十种常见的蛋白质氨基酸分类及结构 三、不常见的蛋白质氨基酸和非蛋白质氨基酸 四、氨基酸的性质 五、蛋白质的水解第三节 蛋白质的共价结构一、蛋白质中氨
18、基酸的连接方式二、肽和肽键的结构三、肽的物理化学性质四、天然存在的活性肽五、蛋白质一级结构的测定第四节 蛋白质的三维结构 一、 研究蛋白质构象的方法 二、多肽主链折叠的空间限制 三、R基团间的相互作用及稳定蛋白质三维构象的作用力 四、 二级结构与超二级结构 五、 纤维蛋白质的结构 六、球状蛋白质的三级结构和结构域 七、 亚基缔合和四级结构第五节 蛋白质的分子结构与功能 一、同源细胞色素c的种属差异与分子进化 二、一级结构的局部断裂与蛋白质的激活 三、肌红蛋白和血红蛋白的结构与功能 四、免疫球蛋白的结构与功能第六节 蛋白质的性质 一、 两性解离性质及等电点 二、 蛋白质胶体性质 三、 蛋白质的沉
19、淀 四、 蛋白质的变性与复性 五、 蛋白质的紫外吸收特性 六、 蛋白质呈色反应第二章 核酸化学第一节 核酸通论 一、核酸的发现和研究简史二、核酸的种类和分布三、DNA储存遗传信息的证实第二节 核酸的基本构件分子核苷酸 一、碱基、核苷和核苷酸 二、核苷酸的生物学功能第三节 DNA结构 一、核酸分子中的共价键 二、 DNA 一级结构 三、DNA碱基组成的Chargaff规则 四、 DNA的二级结构 五、 DNA的三级结构 六、DNA与蛋白质复合物的结构第四节 RNA的种类和结构 一、RNA的种类和一级结构 二、tRNA 三、mRNA 四、rRNA第五节 核酸的物理化学性质 一、 核酸的两性解离性质
20、 二、 核酸的紫外吸收（max=260nm） 三、 核酸的变性、复性和分子杂交 四、核酸的熔解温度（Tm） 五、核酸的沉降性质第六节 人类基因组计划（HGP）简介一、HGP概况二、HGP取得的成绩三、HGP面临的挑战第三章 酶学第一节 酶的概念及作用特点一、酶及生物催化剂概念的发展二、酶作用的特点 三、酶的化学本质 四、酶专一性类型 第二节 酶的命名和分类 一、酶的命名 二、酶的国际系统分类法第三节 酶催化作用的结构基础和高效催化的策略 一、酶催化的中间产物理论 二、酶的活性中心和必需基团 三、酶作用专一性机理 四、酶高效催化有关的策略第四节 酶促反应的动力学 一、酶的活力与测定 二、底物浓度
21、对反应速度的影响 三、酶浓度的影响 四、温度对酶促反应速度的影响 五、pH的影响 六、激活剂的影响 七、抑制剂的影响第五节 重要的酶类及酶活性的调节控制 一、多酶体系(multienzyme system) 二、别构酶(allosteric enzyme) 三、共价调节酶(covalent regulatory enzyme) 四、酶原(enzymogen或proenzyme)的激活 五、同工酶(isoenzyme) 六、抗体酶(abzyme)第六节 酶工程简介 一、化学酶工程 二、生物酶工程 第四章 维生素与辅酶第一节 维生素的概念与分类 一、维生素的一般概念和重要性 二、维生素的分类和与辅
22、酶的关系第二节 重要的脂溶性维生素 一、维生素A 二、维生素D 三、维生素K 四、维生素E第三节 重要的水溶性维生素- 一、维生素C 二、维生素B1和焦磷酸硫胺素（TPP） 三、维生素B2和FMN、FAD 四、泛酸与辅酶A（CoA） 五、烟酸、烟醚胺和NAD、NADP 六、维生素B6及其磷酸吡哆醛（胺） 七、生物素- 八、叶酸和四氢叶酸(FH4) 九、维生素Bu和B，z辅酶 十、硫辛酸第四节 作为辅酶的金属离子-第五章 生物膜的结构与功能第一节 生物膜的组成 一、膜脂 二、膜蛋白 三、糖类第二节 生物膜的结构和特点 一、生物膜中分子间的作用力 二、生物膜结构的主要特征 三、生物膜分子结构模型第
23、三节 生物膜的功能一、生物膜与物质运送二、生物膜与能量转换三、生物膜与信号转导第六章 新陈代谢引论和生物能学概述第一节 新陈代谢通论 一、新陈代谢概念 二、能量代谢在新陈代谢中的重要地位 三、新陈代谢的调节四、代谢中常见的有机反应机制第二节 新陈代谢研究方法 一、同位素示踪法 二、酶抑制剂的应用 三、气体测量法 四、核磁共振波谱法 五、利用遗传缺陷症研究代谢途径第三节 生物能学 一、有关热力学的一些基本概念 二、自由能的概念 三、化学反应中自由能的变化和意义四、生物体的能流和能量产生的三个阶段第四节 高能化合物一、高能化合物的概念 二、高能磷酸化合物的类型 三、ATP是生物体中自由能的流通货币
24、第七章 糖与糖代谢第一节 糖类化学概述 一、糖类的生物学作用 二、单糖的立体结构 三、重要的单糖及衍生物 四、重要的寡糖五、重要的多糖六、复合糖第二节 单糖的代谢 一、葡萄糖的主要代谢途径及细胞定位 二、糖酵解（EMP） 三、丙酮酸的去路：无氧降解和有氧降解途径 四、三羧酸循环（TCA） 五、磷酸戊糖途径（PPP） 六、糖的异生 七、乙醛酸循环第三节 糖原的分解和生物合成 一、糖原的分解 二、糖原的生物合成 三、糖原代谢的调控第四节 糖代谢的调节 一、糖酵解途径的调节血糖浓度的调节 二、三竣酸循环的调节 三、磷酸戌糖途径的调节 四、糖异生作用的调节 五、糖原代谢的调节第八章 生物氢化电子传递和
25、氧化磷酸化作用第一节 生物氧化概述 一、生物氧化的特点 二、生物氧化过程中CO2的生成 三、生物氧化过程中H2O的生成四、有机物在体内氧化释能的三个阶段第二节 线粒体生物氧化体系 一、线粒体结构特点 二、电子传递呼吸链的概念 四、机体内两条主要的呼吸链及其能量变化 五、电子传递抑制剂第三节 氧化磷酸化作用 一、 氧化磷酸化和磷氧比（P/O）的概念 二、氧化磷酸化的偶联机理 三、氧化磷酸化的解偶联和抑制 四、线粒体外NADH的氧化磷酸化作用 五、葡萄糖彻底氧化生成ATP的总结算 六、能荷第四节 非线粒体氧化体系第九章 脂类代谢第一节 概述 一、脂类的一般概念 二、脂肪的消化和吸收 三、脂类转运和
26、脂蛋白的作用第二节 脂肪的分解代谢 一、脂肪的水解 二、甘油的转化 三、脂肪酸的分解代谢 四、酮体的代谢第三节 脂肪的生物合成 一、脂肪酸的生物合成 二、磷酸甘油的生物合成 三、三酰甘油的生物合成脂肪酸的生物合成第四节 磷脂和糖脂的代谢 一、磷脂的结构及降解 二、磷脂的生物合成 三、糖脂的合成与分解第五节 胆固醇的代谢 一、胆固醇的生物合成 二、胆固醇的去路第六节 脂肪代谢的调节 一、激素对脂代谢的调节 二、脂肪酸合成的调节第十章 蛋白质的酶促降解和氨基酸的代谢第一节 蛋白质的酶促降解一、蛋白水解酶二、食物中蛋白质的消化吸收三、细胞内蛋白质降解第二节 氨基酸的分解与转化 一、氨基酸代谢的概况
27、二、氨基酸的脱氨基作用 三、氨基酸的脱羧基作用 三、氨基酸降解产物的去向第三节 氨基酸的生物合成一、必需氨基酸和非必需氨基酸二、生物固氮的生物化学三、氨基酸碳骨架的来源四、氨基酸生物合成的调节第十一章 核酸的酶水解和核苷酸代谢第一节 核酸和核苷酸的分解代谢 一、核酸的酶水解 二、嘌呤碱的分解代谢 三、嘧啶碱的分解代谢第二节 核苷酸的合成代谢 一、嘌呤核苷酸的生物合成 二、嘧啶核苷酸的生物合成 三、脱氧核糖核苷酸的生物合成 第十二章 DNA的复制、修复和重组第一节 遗传信息传递的中心法则第二节 DNA的半保留复制 一、DNA半保留复制的概念和实验证明 二、催化DNA复制的酶类 三、原核细胞DNA
28、的复制的起始点和方式 四、原核细胞DNA半保留半不连续复制的过程 五、DNA复制的忠实性七、真核细胞DNA的合成第三节 DNA的损伤和修复一、直接修复（光复活）二、切除修复三、重组修复四、诱导修复（SOS）第四节 DNA突变 一、突变的类型 二、突变剂的作用第五节 DNA的遗传重组 一、同源重组（homologous recombination ） 二、特异位点重组（site-specific recombination） 三、转座重组（transpositional recombination） 第十三章 RNA的生物合成第一节 在DNA指导下的RNA合成 一、转录的概念 二、RNA聚合酶及
29、催化反应 三、RNA合成过程 四、启动子和转录因子 五、终止子和终止因子 六、RNA生物合成的抑制剂第二节 新生RNA的剪接和修饰 一、原核生物中RNA的加工 二、真核生物RNA的一般加工 三、RNA的拼接、编辑和再编码 四、RNA生物功能的多样性 五、细胞RNA以不同速度降解第三节 以RNA为模板的RNA合成 一、RNA的复制 三、端粒酶是一种特殊的反转录酶 第十四章 蛋白质的生物合成与修饰第一节 蛋白质生物合成体系 一、mRNA和遗传密码 二、tRNA三、核糖体四、辅助因子第二节 蛋白质的生物合成 一、氨基酸的活化 二、tRNA的特征性结构及其在识别密码子上的作用 三、大肠杆菌中肽链合成的
30、过程 四、真核细胞蛋白质生物合成 五、蛋白质合成的抑制剂第三节 多肽链合成后的定向运送和加工 一、多肽链合成后的定向运送 二、多肽链合成后的加工第十五章 细胞代谢和基因表达的调节第一节 细胞代谢的调节网络 一、代谢途径交叉形成网络 二、分解代谢和合成代谢的单向性 三、代谢的基本要略在于形成ATP、还原力和构造单元以用于生物合成 四、代谢调节的四级水平：第二节 酶活性的调节 一、代谢调节的概念 二、酶水平的调节 三、细胞结构对代谢途径的分隔控制调节 四、激素调节第三节 基因表达的调节细胞的信号传递系统 一、原核生物基因表达的调节操纵子学说 二、真核生物基因表达的调节 第十六章 基因工程和蛋白质工程第一节 DNA重组与基因工程一、DNA重组的技术路线二、基因工程的应用与前景三、DNA体外重组常用的酶第二节 蛋白质工程简介一、蛋白质的分子设计和改造 二、技术和核酸技术的相互增强第三节 核酸研究技术简介一、DNA序列测定三、基因文库与cDNA文库四、聚合酶链式反应（polymerase chain reaction, P 总复习 五、考核方式：考试，平时成绩30%，卷面70%。