文库生成软件LGS.ppt

上传人:本田雅阁 文档编号:3204956 上传时间:2019-07-30 格式:PPT 页数:15 大小:864.01KB
返回 下载 相关 举报
文库生成软件LGS.ppt_第1页
第1页 / 共15页
文库生成软件LGS.ppt_第2页
第2页 / 共15页
文库生成软件LGS.ppt_第3页
第3页 / 共15页
文库生成软件LGS.ppt_第4页
第4页 / 共15页
文库生成软件LGS.ppt_第5页
第5页 / 共15页
点击查看更多>>
资源描述

《文库生成软件LGS.ppt》由会员分享,可在线阅读,更多相关《文库生成软件LGS.ppt(15页珍藏版)》请在三一文库上搜索。

1、文库生成软件(LGS),颜淑玮 2010,创建步骤 评价及修改 关于方法,创建步骤(示意图),1. 先创建Method,并命名,新Method必须建立在现有库中的Method基础上,保存,2. 再建库,新文库的名称需与新Method一致,把将来要比对的菌种名称添加到新库中。,GENUS-SPECIES-SUBSPECIES,3. 接下来要将已知的菌种的脂肪酸信息导入到新建菌库的菌种条目下,这样就把分析结果转变为比对模板了。,4. 保存操作后,打开新文库,可以查看所有的信息,设定参数,参考相似度及参考标准偏差(质心距离) 设定参考偏差(质心距离)为某个值,则参考相似度则为另一个设定值。 显示参数

2、 分支数(最大显示条目数=分枝3+1个匹配) SI阈值 SI阈值因子(最佳匹配阈值因子=显示SI阈值),衡量及改进,可视化评估(Train后可见) 1特征图 (最后确认),柱状图确认(SD3,距离修改右端,sample list修改需regenerate),衡量及改进,2D-Plot确认(x*y100),衡量及改进,SI值确认(x0.81.0; y0.1; 绿线以下),衡量及改进,调整参数 Training Parms 特征值加数(默认值2,即阈值为2倍标准差,分类越细设定应越小) 最大错配及最大特征标准偏差 no match 零特征标准偏差(sample有,entry无) 质控阈值(SD/Mean) 关联项必须选,衡量及改进,关于方法,可修改选项(自建方法,Root your Method) Sample Control, Calibration Control and Calibration Sequence(根据研究目的) 物质命名修改 Method与Library的对应关系 1 培养及衍生化方法一致 2 物质命名表一致,

展开阅读全文
相关资源
猜你喜欢
相关搜索

当前位置:首页 > 其他


经营许可证编号:宁ICP备18001539号-1