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1、结构化学选读,课程基本目的,生物大分子结构与生物分子识别的基本原理 研究生物大分子结构与识别的生物物理化学方法 生物大分子结构与生物分子识别研究进展,绝世唐门 ,课程主要内容,1、蛋白质及核酸结构原理 2、蛋白质结构预测方法 3、蛋白质折叠研究 4、用于蛋白质、核酸构象研究的光谱学方法 （紫外、荧光、圆二色光谱等） 5、生物分子识别研究的物理化学方法 （等温滴定量热，超速离心等） 6、 生物大分子结构测定 7、蛋白质及药物分子设计,蛋白质结构分类： 球蛋白（水溶性蛋白） 膜蛋白 纤维蛋白,蛋白质功能分类,催化功能 运输功能 营养和贮存功能 收缩和运动功能 结构功能 防御功能 调控功能 其它,蛋
2、白质折叠问题,蛋白质序列、结构、功能,序列,结构,功能,有关的蛋白质结构数据库,蛋白质晶体结构数据库 Brookhaven PDB (生物信息服务器） RCSB-PDB （http:/www.rcsb.org) 蛋白质结构分类库 SCOP CATH PDBSUM,一级结构 二级结构 三级结构 四级结构,蛋白质的一级结构,20种氨基酸残基由肽键相连成的序列 AGPFSCHEDSGPFCSFPGA?,蛋白质结构原理 1、20种标准氨基酸 疏水性Ala Val Leu Ile Phe Pro Met 带电：Arg Lys Asp Glu (His) 极性：Ser Thr Cys Asn Gln Hi
3、s Tyr Trp 特殊：Gly (Pro) 2、多肽链状结构 3、二硫键 CYS-S-H + H-S-CYS CYS-S-S-CYS,20种标准氨基酸 疏水性Ala Val Leu Ile Phe Pro Met 带电：Arg Lys Asp Glu (His) 极性：Ser Thr Cys Asn Gln His Tyr Trp 特殊：Gly (Pro),氨基酸的稳定性与后修饰,Cys, Met Asn Ser, Thr, Tyr Gly Pro,His0.360 Cys0.210 Ser0.130 Lys0.100 Thr0.100 Asn0.080 Arg0.055 Gln0.050 Glu0.050 Asp0.045 Ala0.025 Met0.025,Ile-0.005 Tyr-0.040 Val-0.060 Gly-0.070 Phe-0.120 Trp-0.140 Leu-0.180 Pro-0.200,氨基酸残基在活性部位出现的几率,