分子生物学复习名词解释.doc

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1、分子生物学重点名词解释1. Adapors pr:接头蛋白是指一些本身无酶活性,只是在信号通路中起连接,接头或停靠作用的细胞内蛋白质,它们能介导上游和下游信号转导蛋白间形成信号复合物。2. Akt:蛋白激酶B(PKB)是PI-3K的间接靶酶。PKB为与PKA和PKC家族成员具有同源性的丝/苏氨酸蛋白激酶,由因证实该酶是病毒癌基因v-akt产物而被称为Akt.3. allosteric effect) 别构效应一些特定的小分子化合物(如代谢终产物)与酶分子的调节亚基或部位结合时,可诱导和影响催化亚基或部位的空间结构改变,使催化活性增高或降低。4. antisense RNA:反义RNA与细胞内D

2、NA或RNA序列互补形成杂交体而阻断或减弱其转录或翻译过程的RNA片段。5. AP-1:活化蛋白质一1,是广泛研究的癌基因产物之一,AP-1是Fos和Jun蛋白家族成员中一个二聚体。这些蛋白质具有一个羟基到DNA结构域“亮氨酸拉链”二聚化界面,它能识别在许多基因调节区所发现的假回文序列。6. apotosis:凋亡是机体细胞在正常生理或病理状态下发生的一种自发的程序化的死亡过程,其发生受到机体的严密调控。7. arrestin阻遏蛋白:在转录水平上对基因表达产生负调节的蛋白质,抑制开放启动子复合物8. attenuator:衰减子trp操纵子前导序列中有一小段序列可形成转录终止子结构。对操纵子

3、的减弱有转录作用。9. Calmodulin:钙调蛋白是细胞内重要的调节蛋白,由一条多肽链组成,有4个Ca2+结合位点,当胞浆Ca2+增高,Ca2+与CaM结合,其构象改变,而激活Ca2+-CaM激酶。10. CASCADE:级联控制,每一个发育阶段均受到前一阶段的产物的调节,其产物又可充当转录因子调节下一阶段的反应的机制。11. Caspsae:天冬氨酸特异性半胱氨酸蛋白酶,他们的活化与炎症因子合成及细胞凋亡有关。12. CDK:细胞周期蛋白依赖性酶,高等真核细胞细胞周期的调节依赖于异二聚体蛋白激酶来完成,这些蛋白激酶是由调节亚单位和催化亚单位两部分组成。调节亚单位称为细胞周期蛋白。催化亚单

4、位称为细胞周期蛋白依赖性激酶它单独存在时不表现酶活性,只有与细胞周期蛋白结合时才表现活性。13. CDNA:以mRNA为模板。利用反转录酶合成的与mRNA互补的DNA。14. CDNA文库:存在于转化细菌内,由克隆载体所携带的所携带的所有CDNA片段的集合。15. CEA:顺式作用元件,与结构基因表达调控相关,能被基因调控蛋白特异性识别和结合的DNA序列4,可影响自身基因表达活性,包括启动子,增强子,沉默子。16. comformatlon:构象,肽链由于单链旋转产生主链原子空间位置排布变化。17. competent cell:感受态细胞,细胞处于容易接受外源DNA的状态叫做感受态,大肠杆菌

5、经过一定处理过程可以形成感受态细胞。在分子克隆中,感受态细胞转化效率的高低是限制克隆成功率的重要因素。18. CREB:cAMP结合蛋白,它是第一个发现的与CRE结合的转录因子,可介导cAMP对基因转录的调节。CREB以二聚体形式结合在特定的DNA序列上,但无转录激活作用,磷酸化是其活化的必要条件。19. C细胞周期:细胞周期指由细胞分裂结束到下一次细胞分裂结束所经历的过程,所需的时间叫细胞周期时间。可分为四个阶段,即DNA复制前的G1期,DNA合成期S期,DNA复制后的G2期以及有丝分裂期M期。20. C值:基因组的大小通常以一个基因组中的DNA含量来表示,称为生物体的C值。21. DD:死

6、亡结构域,死亡受体胞内区有一个由约80-90个氨基酸残基组成的死亡结构域,为一种接头结构,它不仅存在于死亡受体中,还存在于与死亡受体连接的接头蛋白分子中它们自身有相互连接的倾向,能介导死亡受体形成三聚体,并使受体与接头蛋白相连接。22. defferentiation:细胞的分化是指一个生物体的细胞之间在形态结构,生理机能和生化特性上发生稳定差异的过程。23. DR死亡受体:TNF家族受体中部分有介导细胞凋亡作用的受体。死亡受体能通过与配体结合,接受死亡信号,通过接头蛋白激活诱导凋亡和/或激活NF-KB及JNK的信号通路,导致细胞凋亡和其它生物效应。24. D结构域:多肽链上的一个区域,它折叠

7、成空间独特的结构单位,受体胞外区有多种结构域,它们参与配体的识别和结合,不同的结构域的组合赋予受体细胞胞外区不同的功能。25. DNA结合域:反式作用因子中产检的结构域模式,不同反式作用因子的DNA结合域即使具有相同的结构特征,其结构也不会完全一致,常见的结合域通常具有锌指结构,同源异性结构域,亮氨酸拉链结构,螺旋环螺旋结构,碱性-螺旋结构之一。26. EF手:钙离子结合蛋白, DNA结合蛋白中常见模序(螺旋-环-螺旋),由两个相互垂直的螺旋以及之间的连接环组成,Ca2+结合在环上。27. enhancer增强子:是一段短的序列,其中含有多个作用元件,可以特异的与转录因子结合,增强基因的转录活

8、性。28. enzyme:是由活细胞合成的,对其特异底物起高效催化作用的大分子,是机体内催化各种代谢反应最主要的组化剂,其化学本质是蛋白质。29. FAK粘附斑激酶:粘附分子中的整合素能介导细胞与细胞外基质的粘附和信号转导。整合素介导的信号转导有多种PTK和PTP参与。其中具有起始作用的PTK是FAK。FAK的N端有与整合素B亚基结合部位,C端有一序列能使FAK向粘附斑靠近,称粘附斑靶标。30. GC:鸟甘酸环化酶,由4条多肽链组成,胞外区有Cys,胞内区较长,有蛋白激酶样结构域和鸟甘酸环化酶区,但蛋白激酶样区无激酶活性,可能是GC的调节区,NPR-A和NPR-B都属于鸟甘酸环化酶受体。31.

9、 gene:指DNA分子上具有遗传效应的特定核苷酸序列的总称。32. Gene diagonosis:基因诊断是指利用分子生物学的技术方法,直接检测体内DNA或RNA的结构或水平变化,从而对疾病做出诊断的方法。33. gene therapy:基因治疗:是指把基因导入人体细胞,使其发挥生物学效应,从而达到治疗疾病的技术方法。34. genetic engineering:在体外应用人工方法进行基因重组,然后把重组的基因导入宿主细胞,进行复制,转录及翻译的过程。35. genomic library:是指含有某种生物体全部基因片段的重组DNA克隆群体。36. gp130:分子量130KD的糖蛋白

10、,由918氨基酸残基组成,胞外区有6个纤连蛋白的III型组件。共用该亚基的为IL-6R家族。它们的配体作用靶细胞种类很广泛,有神经元,肝细胞,心肌细胞,巨噬细胞等。37. Grb2:生长因子受体结合蛋白2分别通过其SH2和SH3与激活的生长因子受体及下游的Ras的鸟甘酸交换因子Sos结合,从而形成稳定的信号复合物,而GEF作为Ras的激活交换因子能激活Ras信号通路。38. G蛋白:鸟嘌呤核苷酸的结合蛋白,有三种类型:三聚体G蛋白,低分子量的单体小G蛋白和高分子量的其他G蛋白,有内在的GTP酶活性,通过其GTP/GDP结合状态的转化,在细胞的信号转导过程中起信号转换或分子开关的作用。39. h

11、omologous recombination:同源重组是指重组发生在DNA同原序列之间,不需要特异的DNA序列,而是依赖于两分子之间序列的相同或相似。40. homology pr:同源蛋白质:对内含子的选择剪切可翻译出不同的蛋白质量,或一组相似的蛋白质家族,都可以称为同源蛋白质。41. HSP热休克蛋白:具有分子伴侣活性,只与蛋白质分子的非天然构象结合,而不与已经折叠成天然构象的蛋白分子结合。42. isozyme:同一种属中不同基因或等位基因编码的多肽链所组成的单体,纯聚体或杂交体,其物理,化学及生物学性质不同而能催化相同反应的酶。43. JAK:指另一种酪氨酸蛋白激酶,该家族有四个成员

12、:JAK1,JAK2,JAK3,Tyk2。它们的分子量为120-140KD,不含SH2和SH3结构域,其C端都都有激酶区和激酶相关区,JAK家族成员介导细胞因子受体的跨膜信号转导。44. JNK:是在研究某些细胞因子和生长因子的作用时发现的,这些因子作用于细胞后,可使转录因子C-jun的氨基末端被磷酸化而活化,催化这一磷酸化作用的酶即称为C-jun的氨基末端激酶。它能使C-junN末端转录活化区的丝氨酸磷酸化,提高其转录活性,JNK信号通路有三级酶促级联反应,即MEKK1/2-JNKK-JNK。45. klenow片段:DNAPloyI的大片段,具有35外切酶活性和聚合活性,是进行分子生物学研

13、究的常用工具酶。46. leader sequence有意义链:基因转录只能以双链DNA分子中的一股链做为模板。而另外一股链不能充当模板,其中与mRNA具有相同序列的DNA单链称为有意义链,而另一条作为转录模板,称为模板链,又称为反义链。47. Leu Lip:某些肽段上每7个AA出现一个Leu,连接8个这样的周期。这样的肽段以a螺旋存在时,所有的Leu都沿螺旋排列在一条直线上,两条这样的a螺旋上的Leu可像拉链一样相互交叉在一起,使蛋白二聚化。48. MAPK:即丝裂原活化蛋白激酶,是指参与细胞内若干信号转导的重要级联过程的一系列酶。它主要包括MAPKKK,MAPKK,和MAPK三大类,组成

14、一个依次激活的酶级联反应系列,,MAPK与细胞生长和增值有关,生长因子为其配体。49. MCS:多克隆位点,PUC18,PUC19质粒中有一个有多个限制性内切酶的单一酶切位点的区域。50. MJRRS:多链免疫识别受体,由可变链组成胞外区,能结合多种抗原,由恒定链组成胞内区无酶活性,都有ITAM免疫受体酪氨酸激活基序。51. molecular chaperones:分子伴侣蛋白:在体内又一大类蛋白质分子能够阻止未完全折叠好的其它蛋白质(包括新生肽键和细胞处于使蛋白变性的胁迫条件下完整的蛋白分子)之间形成无活性的不可逆聚集体而帮助多肽链在高蛋白浓度环境下的有效折叠。52. motif:某些分子

15、蛋白质中,可见一个或多个具有二级结构的肽段,在空间结构上相互接近,形成一个二级结构的聚集体,称模序。53. mRNA干扰性互补RNA:能阻碍转录和翻译的一种小分子RNA,它的碱基顺序与ompF-mRNA的5末端附近的顺序互补。54. mRNA的选择性剪接:真核细胞基因表达所转录出的前体mRNA的剪接过程中,参与拼接的外显子可以不按其基因组线性分布次序拼接,内含子也可以不被切除而保留,即内含子或外显子是否出现在成熟的mRNA中是可以选择的。55. multigene family:多基因家族就其本意来讲是指核苷酸序列或编码产物的结构具有一定程度同源性基因,其编码产物常常具有相似的功能。56. N

16、F-KB:是真核细胞的转录因子,它存在于几乎所有的细胞,此因子是Rel蛋白家族成员。未激活的NF-KB以异源或同源二聚体与它的抑制亚基IKBa形成三聚体存在于胞浆内。激活的NF-KB转入核内,诱导多种基因表达,参与免疫和炎症反应。57. okagaki fragment冈崎片段:由冈崎发现在DNA复制中,一条链的复制方向与解链方向相反,必须等模板链解开足够长度,在引物的作用下,沿5-3方向合成的一系列片段。58. oligomer:寡聚体,由两个或两个以上具有相对独立三维空间结构的相同或不同的亚基进一步通过非共价相互作用组装而形成的一种结构形式。59. Oncogenes癌基因:是一类基因,转

17、导其表达产物进入真核cell后能使cell如同肿瘤cell一样永生化,可分为病毒癌基因和细胞癌基因两类。60. operon操纵子:原核生物结构基因及其表达调控序列共同组成的基因表达调控单元。61. PCR:是以扩增的DNA分子为模板,以一对分别与模板5末端和3末端相互补的寡核苷酸片段为引物,在DNA聚合酶的作用下,按照半保留复制的机制沿着模板链延伸直至完成新的DNA合成,反复重复这一过程,即可使目的DNA片段得到扩增。62. PI3K:磷脂酰肌醇-3激酶,由两个亚基P85a和P110a组成,前者是调节亚基,后者是催化亚基,具有SH2,SH3,结构域,可介导多种信号转导,产生相应的生物学效应。

18、63. Prober核酸探针:一段与被检测的核苷酸序列互补的带有特殊标记的核苷酸片段。64. promoter:启动子一般位于基因转录起始点上游-100-200碱基对范围,是能够与RNA聚合酶结合并起始转录的核苷酸序列包括一组转录调控序列:TATA盒,CAAT盒,GC盒。65. protp-oncogene:原癌基因:大多数原癌基因属于调控细胞生长分化正常基因,原癌基因激活后可引起细胞生长分化失控,从而导致细胞癌变。66. Prp朊病毒:是引起一组人和动物神经退行性病变的病原体,是一种蛋白质感染颗粒,它具有不同于病毒复制方式的不依赖核酸的自身增殖能力。67. pseudogene假基因:与指某

19、些有功能的基因结构相似,但不能表达基因产物的基因。68. PSTK:在蛋白激酶催化的反应中,底物蛋白被磷酸化的氨基酸残基主要为丝氨酸,苏氨酸的,被称为丝/苏氨酸蛋白激酶。69. PSTP:丝/苏氨酸蛋白磷酸酶通常由催化亚基和调节亚基或靶向亚基组成。其特点是催化亚基和调节亚基并不是一对一的,而是一种催化亚基可与多种调节亚基结合。包括PPI,PP2A,PP2B,PPC。70. PTK:酪氨酸蛋白激酶,是一类能催化蛋白质酪氨酸残基磷酸化的蛋白激酶,共同特征是羧基端具有典型的PTK结构,该酶可催化自身或底物磷酸化。有两种类型一是受体络氨酸蛋白激酶RTK二是非受体酪氨酸蛋白激酶。71. Rb蛋白:视网膜

20、母细胞瘤蛋白,为抑癌基因rb的产物,是一个105-110Kda的核磷酸蛋白,具有多个可被磷酸化的丝氨酸,苏氨酸残基,只有当Rb处于低磷酸化状态,才是有活性的,具有生长抑制作用。72. response elenemts反应元件: 某些上游启动子元件和增强子所结合的反式作用因子,是某种特定刺激信号的受体,可促进基因在特定的刺激信号作用下开始表达,此种元件即反应元件。73. restriction modification system:限制-修饰体系:限制外源性DNA,保护自身DNA,维持遗传性状的稳定性。74. RFLP:限制性片段长度多态性,即用同一种限制性内切酶消化不同个体的同一段DNA时

21、,由于碱基组成的变化而改变限制性内切酶的识别位点,从而会产生长度不同的DNA片段。这种方法成为限制性片段长度多态性技术。75. ribozyme:核酶又称催化性RNA,有内切酶活性,切割位点高度特异,可切割特定的基因转录产物,抑制基因表达。76. RIP:受体相互作用蛋白,它是PSTK通过与TRADD连接,介导死亡受体对NF-KB和JNK信号通路的激活作用。77. RME:细胞外的分子与受体结合后,胞吞到细胞内,称为受体介导性胞吞,不仅为受体配体复合物的解离所必须,而且还是细胞得以高效率,高选择性,快速的摄取细胞外亲水分子的唯一手段,具有重要的生物学意义。78. RNA editing:是通过

22、对mRNA的加工使遗传信息在mRNA水平上发生改变。79. RTK:酪氨酸蛋白激酶直接装配在受体的胞内区,兼有受体和酶两种作用,被称为受体酪氨酸蛋白激酶。80. RT-PCR:又称逆转录PCR,是以RNA为起始材料进行逆转录反应生成DNA,再以DNA为模板进行PCR扩增,而获取目的基因或检测基因表达的技术方法。81. SD序列:在原核生物mRNA起始密码AUG上游方向10个碱基左右之前,有一段富含嘌呤的序列,这一序列以AGGA为核心,为SD序列,因能与核蛋白体30S小亚基中165Rrna3断富含UCCU序列互补,又称核蛋白体结合位点。82. SH2:是胞内信号转导蛋白中证实的第一个胞浆信号域,

23、该区最早是在src癌基因家族产物同源的PTK中发现的,由100多个氨基酸残基组成,不同于PTK中的催化区,故被命名为同源区2,存在于PTK,PTP的蛋白底物中及一些接头蛋白中,当PTK或RTK活化并自身磷酸化后,其中含PY基序和具有SH2的蛋白结合形成复合物。83. SH3:存在于多种PTK及参与PTK信号转导的蛋白中。它还存在于骨架蛋白中。含有SH3的蛋白也常常含有SH2。SH3由55-70个氨基酸残基组成,能与约由10个氨基酸残基组成的富含脯氨酸的基序组合,该基序即SH3的配体具体核心的PXXP共有序列。84. SHC:含有SH2结构域,PTB结构域和甘氨酸/脯氨酸富含序列。该蛋白既能通过

24、SH2与受体中py肽段结合,又能被PTK磷酸化后通过py-SH2区结合Grb2,从而启动RTK-ShcGrb2-Sos-Ras信号通路,介导多条信号通路。85. signalling domain:信号域:保守的非催化区域,能特异的识别与结合配体,在细胞的信号转导和信号网络的形成中有重要作用。86. silencer:沉默子通过启动子来抑制转录的顺式作用元件。87. Smad pr:是哺乳动物中一类介导TGFR超家族信号转导的蛋白,它因与果蝇的Mad蛋白和线虫的Smad蛋白具有同源性而得名,哺乳动物Smad家族有8个成员,它们是TGFR信号转导的介导者和调节者。88. Southern blo

25、tDNA印迹法:DNA分子经限制性内切酶消化和琼脂糖凝胶电泳将所得DNA片段按分子量大小分离放入碱溶液中使其变性再将变性后的单链DNA从凝胶中吸印转移至硝酸纤维素薄膜或尼龙膜上,这种薄膜再用于杂交反应,酶探针进行检测目的DNA是否插入载体或整合于细胞染色体中的方法。89. STAT:胞浆区的信号转导子和转录活化子,具有SH2结构域。它能结合到细胞因子受体的PY短肽序列,被JAK磷酸化后脱离受体,酪氨酸磷酸化的STAT在胞浆区内进行同源二聚化或异源二聚化,转入细胞核内,与DNA顺式元件结合,启动基因转导。90. telomeras.端粒酶:是一种特殊的聚合酶,可以在染色体末端添加末端重复序列。9

26、1. telomere.端粒:位于真核细胞线性染色体末端的特殊结构,由染色体末端DNA和末端DNA结合蛋白形成的复合物,对维持染色体稳定和指导复制有重要作用。92. terminator:终止子是结构基因中含有的一段反转回文序列,及其伴随的一段polyA序列。93. 反式作用因子:真核生物中能与顺式作用元件特异性结合,对基因表达的转录起始过程有调控作用的蛋白质。94. ubiquitination泛素化:将泛素间个地或连续地附着到将被降解的蛋白质赖氨酸残基上,这一过程称为蛋白质泛素化。95. vector载体:指携带目的基因的DNA片段进入宿主细胞进行扩增和表达的运载工具.96. Wester

27、n blotting:蛋白质印迹分析:首先将蛋白质用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳按分子大小分开,再将蛋白质转移到NC膜或其它膜上,膜上蛋白质的位置可以保持在与胶相对应的原位上。97. Zinc finger motif锌指结构存在于许多结合DNA的转录因子蛋白中,每一个大约30个AA组成的重复序列中都在相同位置上含有2个Cys和2个His,与一个Zn2+形成配位键。98. 蛋白酶复合物:蛋白酶体是所有真核生物中负责清除细胞内垃圾的除溶酶体以外的水解体系,蛋白酶体对蛋白质的降解通过泛素介导,所以又称为泛素降解途径. 99. 蛋白质变性:在各种理化因素的作用下,蛋白质的空间构象被破坏,导致其理化性质的改

28、变和生物活性的丧失。100. 蛋白质组:它在本质上指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征,包括蛋白质的表达水平,翻译后的修饰,蛋白与蛋白相互作用等,由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生,细胞代谢等过程的整体而全面的认识。101. 干细胞是一类具有自我复制能力(self-renewing)的多潜能细胞,在一定条件下,它可以分化成多种功能细胞。102. 核酸分子杂交:不同来源但有一定同源性的两条核酸单链DNA和RNA在一定条件下按碱基互补原则退火复性形成杂合双链。103. 核酸探针:一段与被检测的核苷酸序列互补的带有特殊标记的核苷酸片段。104. 基因的活化:基因转录胶经历的染色质构象的变化,是真核基

29、因特有的开关,DNA必须暴露,RNA聚合酶才能结合到DNA模板105. 基因定位:是指将基因定位于某一特定的染色体上,以及测定基因在染色体上线性排列的顺序与距离。106. 基因组:现在常指细胞或生物体的全套遗传物质。大小通常以一个基因组中DNA含量来表示。107. 三聚体G蛋白:由,三种亚基组成的异三聚体,故又称异三聚体G蛋白,可以增加信号转导的特异性,可变性和灵活性。108. 抑癌基因:抗癌基因,正常细胞内存在基因编码产物能抑制细胞转化和肿瘤发生的一类基因群。常见抑癌基因Rb,P53。109. 转录后水平调控:一般指转录起始后对转录产物进行一系列修饰,加工过程,主要包括内含子的选择性剪切,mRNA稳定性调节,RNA编辑等多个环节,这一级调控使真核生物遗传信息在转录后有了更多样的选择性,在决定细胞表形和蛋白质结构及功能的多样化上十分关键。110. 卫星DNA:就是出现在非编码区的串联重复序列。111. 基因表达:指生物gene组中结构基因所携带的遗传信息经转录,翻译的一系列过程,合成特定的蛋白质,进而发挥其特定的生物学功能和生物学效应。112. 蛋白质组学:指对一种细胞或一种组织在某种正常或异常条件下存在的所有蛋白质的定性或定量分析的研究思路。

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