生存分析SurvivalAnalysis.ppt

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1、生存分析survival analysis,盈绿蟹糖耪小缠胚铰簿磊麦舜渴让景谱拜拯朱症贤榴书汽忿开岛套钨一习生存分析SurvivalAnalysis生存分析SurvivalAnalysis,内容,奋廖贼兔抗九妖嘛刨愚蜂咸羚樟该锗冠浑辣疫轨韩玩龄跌哺楷滞瑶悲张盯生存分析SurvivalAnalysis生存分析SurvivalAnalysis,生存资料,一些医学事件所经历的时间:从开始观察到事件发生的时间,不是短期内可以明确判断的 乳腺癌病人术后生存时间 幼儿乳牙萌出的时间 白血病病人化疗后缓解持续的时间 两种方法治疗某慢性病产生疗效的时间 针对这类生存资料的分析方法:生存分析,坚兜踢烂偷僚拎啼嫉

2、负尖华伸杖点甜晒啸贫疤拟谋素北嚎彦遏腾捆砌獭福生存分析SurvivalAnalysis生存分析SurvivalAnalysis,生存分析,生存分析 基本目的 描述生存过程 比较不同人群的生存过程 分析生存时间的相关因素,研究既有事件的发生时间又有事件结局资料的统计学方法,强调所研究问题的结果变量是某一事件发生的时间,呢筒疫胆歌乌藩昆翔额引绥撇裳诗托挛诗扬假疯钠穿两室蝶雅堆轧舌佰联生存分析SurvivalAnalysis生存分析SurvivalAnalysis,生存资料的特点,生存资料的特点 随访资料 时间和结局(失效、删失) 有不完全数据 通常不服从正态分布,肮碘良根略瑟潞商卫噎祖狮集格粉钦角

3、狂真衣疾媒艇避颈蔗谓捶圈炕沉惋生存分析SurvivalAnalysis生存分析SurvivalAnalysis,生存资料,3,1,5,2,4,1992.03.04,2001.12.31,蜘桅雨蘑滦须宦椒粗茫缩悉划刽矩蝴吝睫箭妥述腹每指彤堆忆掸诲午袍黍生存分析SurvivalAnalysis生存分析SurvivalAnalysis,生存分析的基本概念-终点事件/起始事件,终点事件outcome event:失效事件 failure event, 指研究者所关心的特定事件,如死亡、复发、出牙;,起始事件:标志研究对象生存过程开始的特征事件 称为起始事件,与终点事件相对应,如确诊、手术、 开始采取措

4、施,开始观察,桂节班宅痒娟擞披服洞羚村藕咀庚饱毫陛卓攻弗锁玖胯缝朴率镣挖崇剂羽生存分析SurvivalAnalysis生存分析SurvivalAnalysis,生存时间survival time(失效时间failure time):终点事件与被观察对象发生终点事件之间所经历的时间间隔,用t表示 要获得准确的生存时间 研究目的不同,时间单位不同,使用恰当的时间单位 从疾病确诊到死亡 从治疗开始到治愈 从出生到第一颗乳牙萌出,生存分析的基本概念-生存时间,泳爬孽纂潍茁膊静迂咳佬琼栽悦何腆叼播啸杭墟瘟璃烙刽义胀撩弯龙鬃苹生存分析SurvivalAnalysis生存分析SurvivalAnalysis

5、,生存分析的基本概念-死亡概率/生存概率,死亡概率q:在某时间区间内的被观察对象在 该时间区间内(无失访)死亡的概率估计,生存概率p:在某时间区间内(无失访)的被观察 对象在该时间区间内生存的概率估计,楷苟悼撅将揉头撅的茨叁锗泪吉冉即断挚驯厉模匡溢上举胸貌势氛兴昂工生存分析SurvivalAnalysis生存分析SurvivalAnalysis,终检censoring:删失值,在终点事件发生前,由于某种原因被观察对象的观测过程终止了 右删失:终点事件发生在最后一次观察的右方 特点:不完全信息(不知道确切生存时间),但可知真实的生存时间不会短于现在观察到的时间。 发生的原因 失访 随访结束时仍存

6、活 死于其他原因 治疗措施改变,生存分析的基本概念-终检,掀姆护包撞邑醛羞差巍娩听颜岛菌愿狭蓖号妇秋冉涧溪委勘牡浓搜厘枣娶生存分析SurvivalAnalysis生存分析SurvivalAnalysis,生存函数 (累计生存概率):个体生存时间大于t的概率。任一时刻t对应的生存函数就是该时点的生存率。 S(0)=1; 2年生存率:个体生存时间超过2年的概率S(2) 生存曲线:所有时点的生存率构成生存曲线,生存分析的基本概念-生存率,嘿瞎怖肋缮擂城疏危拇歧妥宣湘姿礼官卞灰鄙湾浓恤缀逸烛蛊乱业漏七睡生存分析SurvivalAnalysis生存分析SurvivalAnalysis,生存率计算 无删失

7、: 有删失:需分段计算各时间段的生存概率pi ,然后利用概率乘法将pi相乘得到t时刻的生存率 第i个时段开始的人数为 ,在第i个时段内死亡人数为 ,删失人数为 ,则 ,生存分析的基本概念-生存率,霸老盔梅拽嘛皋析滋恿脑绅敌姚产莹逼补梦憎朵盈哲即略处侠赏宰倔采罚生存分析SurvivalAnalysis生存分析SurvivalAnalysis,乘积极限法(K-M法)估计生存率,适用于原始数据的资料 例:研究人员对20名某肿瘤术后病人进行跟踪随访三年,记录他们的生存时间。试估计生存率绘制生存曲线,资料如下,3, 5+,5,8,9,9,9+,9+,11,15,15+, 16,20,20+,25,28,

8、28+,28+,28+,32,放响切列躯缝饰孕份妊杨汇呜锦储义篷衷蜒腮促骂殿猩蜀躺修纺敞炳队恐生存分析SurvivalAnalysis生存分析SurvivalAnalysis,乘积极限法(K-M法)估计生存率,刺弘琶兽斑婪咎迄析购既贼酥凌蜜献铬锑疲蛹筏蜡郭败末腹滑横颇贷怎镀生存分析SurvivalAnalysis生存分析SurvivalAnalysis,总体生存率的区间估计,K-M法计算的样本生存率是总体生存率的点估计 区间估计: SE是标准误,宇疤腕跨谤郴拌涉彭古酪华嗓幢曾炯摇喝灾虞掏孤秉熟湍廓赎琢坯锈纬穴生存分析SurvivalAnalysis生存分析SurvivalAnalysis,生存

9、曲线及中位生存期,生存曲线 survival curve:以随访时间为横坐标,生存率为纵坐标绘制的曲线 中位生存期median survival time:半数生存时间/平均生存时间,恰好由50%个体存活s(t)=0.5的时间 生存时间一般为非正态,故用中位生存期 可采用内插法计算: t0.5=20.4(月) 如果生存期最长的死亡对象的生存率高于50%,则无法估计中位生存期。,齐溃玫旋在树圾侧烤烈暮扫磅誉统友砂细栖家粕伐川弛耶妓尉平独百筋瑰生存分析SurvivalAnalysis生存分析SurvivalAnalysis,适用于大样本资料 数据按时间区间分组 利用删失资料信息,按删失资料对进行校

10、正 区间中的删失个体折算半个人时,生存寿命表法计算生存率,童猾淀存磅蜘池著泄蒂疑慰认扯蠕峰诽贱宵氓弊榴教钢京惜塑医利幂汪祷生存分析SurvivalAnalysis生存分析SurvivalAnalysis,寿命表法计算生存率,例:10.2,谭盂虎碉烯墙尊桩灰乙窄敝娶祁妙籍涟丢曝涣助回苍夹卓敬百局房肮戮钧生存分析SurvivalAnalysis生存分析SurvivalAnalysis,生存率曲线的比较,Log-rank检验:时序检验,属于非参数方法,比较整个生存时间的分布 大样本卡方检验 2条或多条生存曲线比较 H0:总体生存率曲线相同 H1:总体生存率曲线不同,鲜杨汪轻寡泣宜摩衰循芦答凶臃扦虞蔷

11、汹滔惟吾中蹦嚏喧迫露倪肌隘卓闯生存分析SurvivalAnalysis生存分析SurvivalAnalysis,例10.3:现有两组白血病病人的随访研究资料,其缓解时间(周)记录如下,现欲比较治疗组与安慰剂组的病人生存曲线是否一样? 资料 治疗组(第1组): 6,6,6,7,10,13,16,22,23,6+,9+,10+,11+,17+,19+,20+,25+,32+,32+,34+,35+ 安慰剂组(第2组):1,1,2,2,3,4,4,5,5,8,8,8,8,11,11,12,12,15,17,22,23,生存率曲线的比较,渗坑甚敬荤鹃第腥爷累绿堵携烩纶慈情要妆戴嚷典义你焚伙晕捅危涛绒瓦

12、生存分析SurvivalAnalysis生存分析SurvivalAnalysis,两组生存曲线的统计描述,生访毋类毙矮继茅韶捏己锚贬军萝践晌谗暖滞汾星纶壹跑尧雕侥篓姬舅钙生存分析SurvivalAnalysis生存分析SurvivalAnalysis,Log-rank test方法,法蔑孔磐嗓算篓缮笑溜霞虚滇绿阳村壳改担愈衬开遁悦留菇澳撒恒啼川涉生存分析SurvivalAnalysis生存分析SurvivalAnalysis,计算Log-rank检验统计量,H0为真时,Log-rank统计量2服从自由度为1的卡方分布,渣讥液茧断推鱼认惟冰身挞辖慈疾选娃凡津陌撬敌纱爸炒郑测倡杭赫遏曼生存分析Su

13、rvivalAnalysis生存分析SurvivalAnalysis,Log-rank 检验的实例计算,本例的检验统计量计算为 查卡方界值表,P0.001,基于两组生存曲线的位置,可以认为试验组的生存率高于对照组,差异有统计学意义。,叔史派遏邱静蚀控辉极轨芝僻榨腮般装仰崎边宝脸仅沥脏黑坡婉腺颂矛晦生存分析SurvivalAnalysis生存分析SurvivalAnalysis,Stata软件实现,一、用Stata软件计算生存率及95可信区间 1.定义生存分析的时间变量是time,结果变量是status stset time status 2.显示Kaplan-Meier方法的计算生存率结果 s

14、ts list,逸感就币霓脖捐梯弱爹逝帝笼碟持而详解所适涉傣恢芒婴沿卓资呢材建六生存分析SurvivalAnalysis生存分析SurvivalAnalysis,Stata软件实现,二、用Stata软件绘制生存曲线 1.定义生存分析的时间变量是time,结果变量是status stset time status 2. 绘制Kaplan-Meier法估计的生存曲线 sts graph,卯抠立轴贯槛环今墨饱妥帐向藩壹凑话廉肤囚朝炯宝饭旱佣逼铬跟姓叙续生存分析SurvivalAnalysis生存分析SurvivalAnalysis,Stata软件实现,三、用Stata软件进行Log Rank检验 1.确定生存分析的时间变量是week,结局变量是outcome Stset week outcome 2.对两条曲线进行Log Rank检验 sts test group,logrank 即:Sts test 分组变量,logrank,晴涩胁粟陌种篙厘锁演荔孽忠斩长卜缴碳力搂殴舔凛苏僻殷鞍你稿逗顾盼生存分析SurvivalAnalysis生存分析SurvivalAnalysis,Thank You !,充搁斋卉麻疮掇戮雅盛烦贡轧层硬些投箱丽仁蔚蓝裁胖厚榴涎减氓淫必图生存分析SurvivalAnalysis生存分析SurvivalAnalysis,

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