基因探针-分子杂交技术.ppt

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1、基因探针 分子杂交技术,基因探针,基因探针,即核酸探针,是一段带有检测标记,且序列已知的,与目的基因互补的核酸序列(DNA或RNA)。,分子杂交技术的分类,根据其检测对象不同,可分为,基本操作程序,Southern杂交,检测样品DNA的处理,电泳分离及变性处理,转移并固定到滤膜上,探针的制备及杂交,检测与分析,检测样品DNA的处理,提取检测样品的基因组DNA 用限制性内切酶对其进行酶切,至大小不同的DNA片段,电泳分离及变性处理,琼脂糖凝胶电泳分离DNA片段,变性处理 通常DNA变性的方法:热变性、酸碱变性、化学试剂变性 在0.4M NaOH碱性条件下变性,凝胶,0.4M NaOH,转移并固定

2、到滤膜上,通过毛细管虹吸法,将凝胶上的DNA转移到硝酸纤维素膜或尼龙膜上。最后通过紫外线照射将DNA固定在滤膜上。,转移的方法,毛细管虹吸法、电转移法、真空转移法,探针的制备,一、探针的合成 PCR、化学合成等方法 二、探针的标记 同位素:3H、35S、32P等 非同位素:地高辛、生物素、荧光素等,地高辛: 可以与dCTP连接成地高辛-dCTP,原理: 地高辛 + 抗地高辛抗体 (带有荧光素或酶的标记),杂交,预杂交:将结合了DNA分子的滤膜先与特定的预杂液进行预杂交,也就是将滤膜的空白处用鱼精DNA或牛奶蛋白封闭起来,防止在杂交过程中滤膜本身对探针的吸附。 杂交:在一定的温度和溶液条件下,将

3、标记的探针与滤膜混合,如果滤膜上的DNA分子存在与探针同源的序列,那么探针将与该分子形成杂合双链,从而吸在滤膜上。,洗膜:经过一定的洗涤程序将游离的探针分子除去。,安装杂交管,杂交炉,检测与分析,1、放射自显影:适用于放射性同位素标记的探针 2、比色或化学发光检测:适于非同位素标记的探针 通过放射自显影或生化检测,就可判断滤膜上是否存在与探针同源的DNA分子及其分子量。,Northern杂交,1、检测对象为RNA。 2、与Southern杂交不同的是:1)不需要限制性核酸酶切;2)变性方法不是碱变性,而是采用化学试剂变性法。 3、主要用于检测某一组织或细胞中已知的特异mRNA的表达水平,或比较不同组织或细胞的同一基因的表达情况。,Western杂交,1、基本原理和基本过程与Southern 杂交基本相同 2、检测对象为蛋白质(或酶) 3、SDS-PAGE电泳分离 4、用“抗体-抗原”免疫反应或“DNA-protein”结合反应鉴别滤膜上的蛋白质。,Thank You !,

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