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1、HBV变异对乙肝病毒标志物和DNA定量的影响 来源：本站 |作者：奚华新， 蒋跃明 |时间：2006-11-28 9:50:13 | 浏览： 387 字号选择大 中 小 摘 要 目的： 了解无锡地区HBV前CC基因变异情况,探讨基因变异对乙肝病毒标志物(HBVM)及HBV DNA定量的影响。方法： HBVM用时间分辨荧光定量试剂检测;HBV DNA定量PCR以德国Roche Lightcycler 荧光定量扩增仪检测;HBV DNA前CC测序使用 德国Roche Mag NA Pure LC 全自动核酸提取，加样系统; 美国Beckman Coulter CEQ 8000 Genetic An
2、alysis System。结果： 92例乙肝患者血清中有41例(446)发生前CC区nt1896位变异,41例中有34例HbeAg阴性,7例HbeAg仍为阳性;以nt1896位是否变异分组,变异组和未变异组HBV DNA定量无显著性差异。结论： nt1896位变异导致HBeAg转阴,HBV病毒变异对HBVM有决定性的影响,但该变异对HBV复制无影响。 关键词 DNA序列分析; 基因变异; HBVM DNA定量 Affection of Gene Mutation to Serological Markers and Quantity of DNA of Hepatitis B Virus X
3、I Huaxin, JIANG Yueming (1.The Blood Center of Wuxi,Wuxi Jiangsu 214021; 2.Wuxi Hospital for Infectious Disease,Wuxi Jiangsu 214007, China) Abstract Objective: To report HBV preCCgene mutation in wuxi area,to determine the affection of gene mutation to serological markers and quantity of DNA hepatit
4、is B virus.Methods： Serological markers of hepatitis B virus were detected by timeresolved fluorescence immunoassay. Quantitative analysis of HBV DNA PCR was performed by Roche Lightcycler fluoresencent quantitative amplification analyzer which made in Germany. HBV DNA preCCgene fragments were direc
5、tly sequenced by Roche MagNA Pure LC automatic nucleic acid getting, sampling system made in Germany and Beckman CoulteCEQ8000Genetic Analysis System made in the U.S. Results： Fortyone from nintytwo(4192)patients had preCCgene mutation at site at nt1896.there thirtyfour HBeAg were negative and seven
6、 HBeAg were positive.Gene mutation at site at nt1896 didnt affect virus replication. Conclusion： How HBeAg getting negative was dependant on nt1896 site gene mutation.Gene mutation at site at nt1896 didnt affect hepatitis B virus replication. Key words DNAgene fragments analysis;Gene mutation;Serolo
7、gical markers of hepatitis B virus;Quantitative analysis of HBV DNA HBV感染在临床可产生不同的肝脏疾病谱,过去多以HBV免疫学标志物来判断病毒感染状况1。但随着分子生物学技术的发展,研究发现肝脏疾病谱不仅与宿主的免疫有关,也与病毒本身密切相关,即HBV 本身也存在变异。对HBV变异的判断,最可靠和精确的方法是从病人体内检出HBV DNA,用DNA测序法来确定病毒的变异,目前对于HBV的变异的研究比较集中在关于前C区及S基因区的变异。本文结合92例乙肝患者的PCR定量、免疫学标志物定量结果以及DNA前CC区测序结果报道如下。
8、1 材料与方法 11 分析对象 本组92例为无锡地区2004年1月10月在无锡市传染病医院门诊及住院的乙肝患者,均为HBVDNA阳性病人。 12 检测方法 121 乙肝病毒标志HBsAg、抗HBs、HBeAg、抗Hbe和抗HBc以美国PE1235automatic immunoassay system 检测,试剂为上海新波产的两对半时间分辨荧光定量试剂。 122 定量聚合酶联反应(PCR)HBV DNA定量PCR 以德国Roche Lightcycler荧光定量扩增仪检测,试剂为深圳匹基产HBV DNA荧光定量试剂。 123 HBV DNA前CC区测序 使用 德国Roche MagNA Pur
9、e LC全自动核酸提取、加样系统,获得HBV DNA模板; 在美国PE9600扩增仪扩增:94预变性3 min,94 30 s,50 30 s,72 30 s,循环35次; 用Promega公司的PCR产物纯化试剂盒纯化PCR产物; 纯化产物用Beckman测序试剂盒进行测序反应:96 20 s,55 20 s,604 min,循环30次,终止测序反应,然后在美国Beckman Coulter CEQ8000 Genetic Analysis System上得到HBV DNA 的序列和图谱。所测HBV DNA序列的碱基位置:nt17372483,所测长度:746 bp,上游引物序列及位置:5G
10、AGTTGGGGGAGATTAG3(17371756),下游引物序列及位置:5AAAGTTTCCCACCTTATGAGTC3(24832462);引物由上海生工生物工程技术有限公司合成。 124 统计学处理 采用t检验和2检验。 2 结 果 21序列结果 序列结果见表1。表1 主要前CC区基因变异位置与意义 22 1896位图谱 1896位正常图谱见图1,突变图谱见图2。 23 HBVM与1896位变异 HBVM与1896位变异结果比较见表2。 24 1896位变异与e抗原相关性 1896位变异与e抗原相关性见表3,经过2检验P005)。说明该变异不影响病毒复制。 3 讨 论 表1中HBV D
11、NA 1827位ntca突变达88, 表2 HBVM与1896位变异表3 1896位变异与e抗原相关性表4 病毒与DNA定量相关性基本体现无锡地区HBV DNA单核苷酸多态性突变水平,意义目前不详。1896位ntga突变达446(4192),据国外报道,这种变异大多发生在亚洲东部及南欧地区,发生率可以高达4760,而在美国只有10左右,胡耀仁等2报道宁波乙肝患者1896位变异率为4258,本文结果与报道相近。由于1896位ntca突变(鸟嘌呤腺嘌呤),使原来编码色氨酸的前C区第28个密码子(TGG)转变为翻译终止密码子(TAG),因而前C蛋白的翻译中断,HBeAg不能产生,检测会出现阴性结果,
12、从表3中可见,与变异有关HBeAg转阴有34例,从而证实1896位变异与HBeAg转阴具有密切相关性。2005位ntta突变和2074位nttc突变因为是密码子的第三碱基发生突变,翻译的氨基酸仍是原来的氨基酸,属同义突变。 图谱分析是测序仪利用4种荧光染料分别标记终止物ddNTP,通过电泳将各个荧光标记片段分开,经激光扫描,光栅分光,区分代表不同碱基信息的不同颜色的荧光,在 CCD摄影机上同步成像。图1显示1896位正常为G,图2显示1896位发生突变为A。 从表3可以看出(由表2中统计而来),1896位变异组共有41例,其中34例e抗原阴性,说明与1896位变异有密切关系(P005),说明1
13、896位变异会导致HBeAg不能产生,检查阴性结果,但不能反映HBV复制减轻和消失,而仍有HBV前C区变异病毒的存在和复制,结论与文献相符3。 李伯安等4认为单独的血清学标志检测不能反映肝脏的病变程度,也不能良好反映病毒的复制。 临床上对不同肝脏疾病谱的认识,有必要结合二对半结果和PCR DNA定量以及基因测序结果,才会对乙肝病毒的感染状况有一个比较准确的判断,才能对症治疗,取得较好的治疗效果。由于前CC区1896位的变异,导致HBeAg转阴,不能就此而否定病毒的复制。 测序结果表明,HBV病毒基因变异对HBVM结果产生根本性的影响,它们是基因型和表现型的关系,即基因型决定表现型,但病毒复制继
14、续进行。 参考文献 1 许化溪.病原生物学检验：理论与临床M.北京:人民卫生出版社,2003:243-244. 2 胡耀仁,唐锡尔,应 豪,等.乙型肝炎患者HBV前C区变异及临床意义J.宁波医学,1999,11(3):103-104. 3 曹 利,张汉荣,孙 梅,等.乙型肝炎病毒C基因启动和前C终止变异与乙型肝炎标志物模式的关系及临床意义J.临床荟萃,2005,20(2):61-63. 4 李伯安,戚 扬,刘 岩,等.慢性乙型肝炎血清学标志HBV DNA定量分析及HBV前CC变异的临床研究J.军事医学科学院院刊,2004,28(2):152-154. ( 1.无锡市中心血站检验科， 江苏 无锡 214021；2.无锡市传染病医院检验科， 江苏 无锡 214007