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1、第二章1、核苷酸主要由哪几部分组成？答：核苷酸（nucleotide）由磷酸和核苷（nucleoside）组成，核苷由戊糖和碱基组成。1、由两条互相平行的脱氧核苷酸盘绕而成2、脱氧核糖和磷酸交替连接排列在外侧构成基本骨架，碱基排列在内侧3、两条链上的碱基通过氢键结合组成有规律2、核酸的理化性质有哪些？答：稳定性：由于氢键作用，DNA双链和RNA结构似乎是稳定的酸效应：酸可以是使核酸水解碱效应：强碱条件下其碱基的互变构态的改变以及特异性氢键破坏而变性化学变性：破坏堆积于碱基间的疏水作用粘性：分子很长，因此其溶液具有较高的粘性浮力密度：1.7可以用氯化铯溶液密度梯度离心法加以分析纯化。3、如何通过
2、吸光值判断DNA的纯度答：A260/A280的比值可用于估计双链DAN样品的纯度，对于纯的该比值为1.8，若比值大于1.8则意味着RNA污染，若比值小于1.8则有蛋白质污染4、解链温度：变性是在一个相当窄的温度范围内完成，在这一范围内，紫外光吸收值达到最大值的50%时的温度称为DNA的解链温度，又称融解温度。退火：热变性的DNA经缓慢冷却后即可复性，这一过程称为退火。DNA复性(renaturation)：在适当条件下，变性DNA的两条互补链可恢复天然的双螺旋构象，这一现象称为复性。变性：在物理或化学作用下，可导致两条链之间氢键断裂，而核酸分子中的所有共价键则不受影响杂交：具有互补序列的两条核
3、苷酸单链在一定条件下按单链配对原则形成双联的过程拓扑异构体(topisomer):具有特定连接数的环状双链DNA拓扑异构酶（topisomerases）：调节DNA超螺旋水平的酶，与DNA形成共价结合蛋白质DNA中间体，在其磷酸二酯键处造成暂时性裂口，使DNA的多核苷酸链穿越改变分子的拓扑状态。 构成染色质（chromatin）真核生物的染色质都包含一个很长的线性DNA分子，并且组装在细胞核内，染色质用来描述构成真核生物染色体的高度有序DAN-蛋白质复合物染色质结构被用来包装和组成染色体DAN并能在细胞周期的不同阶段调整压缩DAN水平组蛋白（histone）染色质中主要的蛋白质成分是组蛋白，一
4、类分子质量较小的碱性蛋白，与DAN紧密结合，组蛋白有四个家族，H1A/H2B/H3/H4以及另一类具有不同特性特定功能的H，不同物种具有不同的组蛋白变异体核小体（nuclesome）由H2A/H2B/H3/H4各两分子生成的八聚体和大约200bp的DAN组成端粒（telomerse）线性DNA末端形成端粒染色体来保护DNA分子免受降解和渐进的截断，端粒是由一种专一的端粒酶合成的短重复序列构成，独立于正常的DNA复制DNase1超酶性（dnase 1 hypersensitivity）染色质活性区，或因结合特异性蛋白或因进行转录而被松散的30纳米纤丝的区域，其特点是对DNA酶一的高度敏感性异染色
5、体（heterochromatin）中期染色质的一部分结构比较紧密，无转录活性5、简述大肠杆菌染色体结构1）结构简练：不转录部分很少且常是控制基因表达的序列2）存在转录单元：多顺反子mRNA，这些功能相关的RNA和蛋白质基因协同表达。3）有重叠基因：同一段DNA能携带两种一同的蛋白质信息，主要是：一个基因完全存在于另一个基因内;部分重叠;两个基因只有一个碱基对的重叠。6、真核生物与原核生物基因组相比，区别如下： 基因组大且复杂； 不编码区远大于编码区； 基因组DNA与蛋白质结合，形成的染色体存在于核内； 编码区不连续； 重复序列次数不等； 以多复制起点的形式复制； 转录产物为单顺反子； 与原核
6、相同，也存在可移动因子。7、真核生物染色质构成的三个层次核小体，染色质的第一层次。是染色质的基本结构单位。核小体是由组蛋白核心和盘绕其上的DNA构成。核心由组蛋白H2A，H2B，H3及H4各2分子组成，是一个八聚体；DNA在组蛋白核心上盘绕1.8圈，组蛋白H1在核小体外边，结合于连接DNA上，使核小体彼此连接。平均每个核小体重复单位约占DNA200bp。30nm纤丝，染色质的第二层次。念珠串的核小体链进一步折叠盘绕形成30nm染色质纤丝，每一圈为6个核小体，使DNA压缩大约100倍。辐射的环，染色质的第三层次。在念珠串的核小体链进一步折叠盘绕的染色质纤丝组成突环的基础上，再由突环形成玫瑰花结形
7、状的结构，进而组装成螺旋圈，由螺旋圈再组装成染色单体。总之，染色体是由DNA和蛋白质构成的不同层次缠绕线和螺线管结构8基因（gene）是原核、真核生物以及病毒的DNA和RNA分子中具有遗传效应的核苷酸序列，是遗传的基本单位。基因组（genome）是指细胞或生物体中,一套完整单体的遗传物质的总和;或指原核生物染色体、质粒、真核生物的单倍体染色体组、细胞器、病毒中，所含有的一整套基因。断裂基因（split gene）：指基因的编码序列在DNA分子上不连续排列，而被不编码的序列所隔开。外显子（exon）：编码的序列，是基因中对应于信使RNA的区域。内含子（intron）：不编码的间隔序列，是信使RN
8、A被转录后的剪接加工中去除的区域。基因家族是指真核生物基因组中来源相同，结构相似，功能相关的一组基因。基因簇是指基因家族中的各成员紧密成簇排列成大段的串联重复单位，定位于染色体的特殊区域。C值：指生物单倍体基因组中的DNA含量。C值矛盾：是指真核生物中DNA含量的反常现象、9、原核生物的基因组特点1）结构简练：不转录部分很少且常是控制基因表达的序列2）存在转录单元：多顺反子mRNA，这些功能相关的RNA和蛋白质基因协同表达。3）有重叠基因：同一段DNA能携带两种一同的蛋白质信息，主要是：一个基因完全存在于另一个基因内;部分重叠;两个基因只有一个碱基对的重叠。第三章10、简述半保留复制机制及如何
9、通过实验证明答、DNA在复制过程中碱基间的氢键首先断裂，双螺旋解旋并被分开，产生互补的两条链，这样新形成的两条DNA分子与原来DNA分子的碱基顺序完全一样，每个子代分子的每一条链来自亲代，另一条则是新合成的。实验：将大肠杆菌长期在以N15做氮源的培养基中培养，得到N15DNA，由于该DNA分子的密度比普通DNA的密度大，在氯化铯密度梯度离心时两种DNA分子形成位置不同的带区，他们用普通培养基培养N15标记的大肠杆菌，通过一代后所有DNA的密度在14和15之间既形成一半N14一半N15的杂交分子，两代后出现了等量的杂交份子，若在继续培养可看到15增多，说明半保留复制11、复制的主要方式答、线性D
10、NA双链的复制眼型 复制叉生长方式有单一起点的单向及双向和多个起点的双向几种。DNA正在复制的部分在电镜下观察起来犹如一只眼睛，称为复制眼。环状DNA双链的复制：型，滚环型和D环型12、简述半不连续复制的过程答：DNA复制时，以35走向为模板的一条链合成方向为53，与复制叉方向一致，称为前导链；另一条以53走向为模板链的合成链走向与复制叉移动的方向相反，称为滞后链，其合成是不连续的，先形成许多不连续的片断（冈崎片断），最后连成一条完整的DNA链。13、简述原核生物DNA聚合酶的种类及功能答、DNA聚合酶，多功能酶但不是复制主要聚合酶，它：1）有35核酸外切酶活性，这种活性和聚合酶活性紧密结合在
11、一起，既可合成DNA链，又能降解DNA，保证了DNA复制的准确性；2）有53核酸外切酶活性，可作用于双链DNA，又可水解5末端磷酸二酯键，被认为在切除由紫外线照射而形成的嘧啶二聚体中起着重要的作用。3）也可用以除去冈崎片段5端RNA引物，使冈崎片段间缺口消失，保证连接酶将片段连接起来。DNA聚合酶为多亚基酶，具有53方向聚合酶活性，但酶活性很低，也不是复制的主要酶。其35核酸外切酶活性可起校正作用。其生理功能主要是起修复DNA的作用。DNA聚合酶也是多亚基酶，全酶由10种亚基组成，含有锌原子。有53方向聚合酶活性，也有35核酸外切酶活性。活力较强，为DNA聚合酶的15倍，DNA聚合酶的300倍
12、。它能在引物的3OH上以每分钟5万个核苷酸的速率延长新生DNA链，是大肠杆菌DNA复制中链延长反应的主导聚合酶。聚合酶、在1999年发现，主要涉及DNA的错误倾向修复。当DNA受到严重损伤时，即可诱导产生这两种酶，使修复缺乏准确性，出现高突变率。14、叙述大肠杆菌DNA复制过程答、DNA改变双螺旋构想解链酶解开双链，在单链DNA结合蛋白和DNA聚合酶3的共同作用下合成先导链方向与复制叉推行的方向一致。在后随链上当复制叉进一步打开时，产生冈崎片段，复制叉继续前进引物酶合成新的RNA引物，与DNA单链结合准备引发合成新的冈崎片段。15、叙述真核DNA的复制特点答、真核生物DNA复制的特点：1）真核
13、生物每条染色质上可以有多处复制起始点，而原核生物只有一个起始点，真核生物原点数决定于物种和组织两者；2）真核生物的染色体在全部完成复制之前，各个起始点上DNA的复制不能再开始，而原核生物复制起始点上可以连续开始新的DNA复制，表现为虽有一个复制单元，但有多个复制叉；3）真核生物DNA的复制子被称为ARS(autonomously replicating sequences, 自主性复制序列)，其复制的起始需要起始原点识别复合物（ORC）参与。4）真核生物复制叉的移动速度约50 bp/s，不到大肠杆菌的1/20。5）真核细胞中主要有5中DNA聚合酶，分别称为DNA聚合酶、。-引物合成；DNA的修
14、复；线粒体DNA合成酶、主要负责DNA复制的酶，参与前导链和滞后链的合成、去掉RNA引物后把缺口补全。16、replication fork:复制叉复制时双链DNA要解开成两段分别进行DNA合成，所以复制起点成叉子形状DNA解链酶（helicase）：DNA解链酶能通过水解ATP获得能量来解开双链DNA，并在DNA上沿一定方向移动。大肠杆菌的复制解链酶有DnaB、PriA和Rep蛋白，DnaB蛋白沿53方向移动，PriA和Rep蛋白沿35方向移动DNA primase (引物酶) synthesizes primers every 1000-2000 nt on the lagging str
15、and. Origin：原点复制起始时的DNA序列Replica:复制子单独复制一个DNA单元成为一个复制子，他是一个可以动的单位SSB：The single stranded bubble is coated with single-stranded binding protein (ssb) to protect it from breakage and to prevent the DNA renaturing. Primosome:引发体，DNA复制过程中引发合成每个刚起片段时所需的多蛋白复合物包括引发蛋白，具有ATP酶活性的蛋白质以及引物酶第四章17、基因突变：由于某种原因构成基因的
16、核苷酸种类数量和排列顺序发生变化从而导致基因的改变点突变：也称作单碱基替换，指由单个碱基改变发生的突变转换：由一种嘧啶碱基替换另一种嘧啶碱基或由一种嘌呤碱基置换置换另一种嘌呤碱基同义突变：由于生物密码子存在兼并线象，使碱基被替换之后产生了新的密码子，但新的密码子是同义密码子，所编码的氨基酸类型不便错义突变：由于结构基因中的某个核苷酸的变化使一种氨基酸的密码子变成另一种氨基酸的密码子18、什么是DNA的损伤？DNA结构的改变有哪两种类型？答：在生命过程中DNA结构发生的任何变化 碱基改变和双螺旋结构扭曲19、什么是DNA的修复？细胞对DNA的修复系统主要有哪几种？答：是细胞对DNA受损伤后的一种
17、反应，这种反应可能是DNA恢复原样重新执行它原来的功能，但有时并非完全消除DNA的损伤，只是使细胞能够耐受者DNA的损伤而留存下来Direct repair （DNA的直接修复）直接修复是把损伤的碱基回复到原来状态的一种修复。有以下几种方式：光复活作用；O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶（MGMT）；单链断裂修复。 Decombination repair（重组修复）机体细胞对在复制起始时尚未修复的DNA损伤部位可以先复制再修复，这种方式称为重组修复。SOS response (易错修复和应急反应)许多能造成DNA损伤或抑制的DNA复制的过程能引起一系列复杂的诱导效应，这种效应称为SOS应急反
18、应。SOS反应是细胞DNA受到损伤或复制系统受到抑制的紧急情况下，细胞为生存而产生的一种应急措施。SOS反应诱导的修复系统包括：避免差错的修复和易产生差错的修复两类。错配修复：识别新和成链中的错配并加以修复矫正，充分反映了母链序列的重要性，该系统识别母链的重要性来自于dam甲基化酶切除修复：特异性切除受损核苷酸20、同源重组：姐妹染色单体之间或同一染色体上有同源序列的DNA分子分子之间或分子之内的重新组合Holliday模型：具有相同或相近序列的两条同源双链分子间的重组，但也同样适用于具有有限同园区的两条不同分子，或是含有两个相互同源的独立区域而能进行自我重组的单分子，该模型的核心特征是两条同
19、源分子之间交换多聚核苷酸片段而形成的异源双链转座子：存在于染色体DNA上可自主复制和位移的基本单位参与转座子易位及DNA链整合的酶称为转座酶插入序列：是做简单的转座子，IS是细菌染色体和质粒DNA的正常组分，一个细菌细胞常带有少于10个IS序列。IS是一个自主的单位，每种IS都编码自身转座所需的蛋白质。复合型转座子：是一类带有某些抗药性基因的转座子，其两翼往往是两个相同或高度同源的Is序列表明其插入到某个功能基因两端时就可产生复合转座子21、简述转座子的转座机制。简述复制性和非复制性转座转座作用的机制是转座子插入到新的位点上产生交错切口，所形成的突出单链末端与转座子两端的反向重复序列相连，然后
20、由DNA聚合酶填补缺口，DNA连接酶封闭缺口。在复制性转座中，整个转座子被复制了，所移动和转位的仅仅是原转座子的拷贝，如TnA类转座。转座酶（transposase）和解离酶（resolvase）分别作用于原始转座子和复制转座子。非复制性转座中，原始转座子作为一个可移动的实体直接被移位，如IS序列、Mu及Tn5。22、DNA转座引起什么遗传效应？1转座引起插入突变。如果转座子插入位于某操纵子的前半部分，就可能造成极性突变，导致该操纵子后半部分基因失活。2转座产生新的基因。如果转座子上带有抗药性基因，它一方面造成靶DNA序列上的插入突变，同时也使这个位点产生抗药性。3转座产生的染色体畸变。当复制
21、性转座发生在宿主DNA原有位点附件时，往往导致转座子两个拷贝之间的同源重组，引起DNA缺失或倒位。4转座引起的生物进化。转座作用可以使原来在染色体上相距甚远的基因组合到一起，构建成一个操纵子或表达单元，也可能产生一些具有新的生物学功能的基因和新的蛋白质。23、简述玉米的控制元件，Ac-Ds系统，Spm-dSpm系统。玉米转座子同样具有典型的IS特征在转座子两翼有两个倒转重复序列，在靶DNA插入位点有两个短正向重复序列Ac-Ds（activator-dissociation system）系统：Ac为自主转座子，转录生成单一RNA。成熟mRNA长3500 bp，并含有一个长807个密码子的开放阅
22、读框，被4个内含子分割成5个外显子。Ac转座子两翼有11bp倒转重复序列，在靶DNA位点复制形成8 bp的正向重复。所有Ds都是Ac转座子的缺失突变体，如Ds 9 缺失了194 bp。非自主性转座子虽然缺失内源序列，但其两端转座特征序列完整，只要细胞内有相应的转座酶活性，它就能回复转座功能。Spm-dSpm (suppressor-promoter-mutator)系统：Spm是自主性因子，又称增强子，长8 287 bp，末端IR为13 bp，靶位点同向重复8 bp，含有3个内含子，2个阅读框。它能以激活型、钝化型和程序型3中形式存在，具有转座、整合和解离活性。dSpm是非自主性因子（又称抑制
23、因子），由Spm缺失而形成，长度不等，末端IR为13bp，靶位点同向重复8 bp，当dSpm插入结构基因后可引起基因的插入突变，影响结构基因表达，解离后形成回复突变，Spm-dSpm还能导致染色体断裂。24、简述果蝇的P转座子 P转座子：果蝇中几乎所有杂种不育都是由于P转座子插入基因组W位点而引起的。果蝇所有P转座子两翼都有31bp倒转重复序列，在靶DNA位点复制形成8 bp的正向重复原初转录产物包括外显子0、1、2、3及3个内含子。体细胞中只有前两个内含子被切除，产生包括外显子0-2的功能型mRNA，并被翻译成一个转座阻遏蛋白。在卵细胞中，内含子3能被切除，成熟mRNA包括4个外显子并被翻译
24、成转座酶，导致P转座子转座和配子体败育。实验表明，体细胞中存在一个与外显子3特异性结合的蛋白，这种蛋白与RNA的结合妨碍了内含子3的剪接。第五章 第一节25、promoters启动子: 启动子是RNA聚合酶识别、结合和开始转录的一段DNA序列，含有RNA聚合酶特异性结合和转录起始所需保守序列。Transcription compiex转录复合物:转录复合物 启动子选择阶段RNA聚合酶与启动子可逆性结合形成封闭复合物Terminator终止子: 终止子(terminator T)是给予RNA聚合酶转录终止信号的DNA序列Termination factor终止因子: 协助RNA聚合酶识别终止信号
25、的蛋白质因子则称为终止因子。Read through通读: 有些终止子的作用可被特异的因子阻止，使聚合酶能越过终止子继续转录，称为通读(readthrough)，Rho-dependent termination: 当RNA聚合酶转录到发夹结构时发生一定时间的停顿，这时如果没有因子，转录将会继续下去；只有当因子存在时，转录才终止26、the E.coli RNA polymerase（聚合酶）的组成及各部分功能两个亚基，一个亚基，一个撇亚基，和一个w亚基组成核心酶，加上一个谁个吗亚基后成为聚合酶全酶亚基可能与核心酶的组装及启动子的识别有关，并参与RNA聚合酶和部分调节因子的相互作用和撇亚基组成
26、了聚合酶的催化中心，他们在序列上与真核生物RNA聚合酶的两个大亚基有同源性27、启动子-10区及-35区功能。答10、几乎所有的启动子都含有一个6bp的序列，该六聚体通常位于转录起始位点上游10bp处，共有的事TATAAT35、RNA聚合酶全酶的识别位点对全酶有很高的亲和性，功能，提供RNA聚合酶识别信号，有助于DNA局部双联的解开，两者共同决定了启动子强度，也调控转录的速度28叙述原核生物转录过程。答：转录的基本过程包括模版识别，转录起始，通过启动子及转录子的延伸和终止模版识别：主要指RN聚合酶与启动子DNA双链相互作用并与之相结合的过程起始转录：RNA聚合酶结合在启动子上以后，使启动子附近
27、的DNA双链解旋并解链，形成转录泡以便使底物荷塘核苷酸与模版DNA碱基配对转录延伸：、RNA聚合酶释放四个吗因子离开启动子后，核心酶沿模版DNA链移动并使新生的RNA链不断延伸的过程终止转录：当RNA链延伸到终止位点时，RNA聚合酶不再形成新的磷酸二酯键，转录泡瓦解，RNA回复双链状态，而ENA聚合酶和RNA链都从模版上释放出来，这是终止转录36、RNA hairpin 结构特点。 答：细菌16sRNA的3撇端既非常保守又高度自我互补，技能形成发卡式结构。与MRNA互补的部分也参与这个发卡的形成。表面上看这似乎是一对矛盾，一对序列不可能在形成发卡的同时又与MRNA相结合，事实上这正好说明序列配
28、对是动态的，可变的，翻译起始物的生成很可能包含了RRNA3撇端的发卡结构的改变，启动蛋白翻译以后，其染色体被打破为核糖体的移动创造了条件第五章第二节37、palindromic回文结构:dna序列中的一条从左到右和从右到左读是一样的序列，由相邻的反向重复组成Camp receptor protein受体蛋白(CRP):受体蛋白是一个转录激活因子通过与CAMP的结合而被激活Attenuator弱化子:是指原核生物操纵子中能显著减弱甚至终止转录的一段核苷酸序列The leader peptide前导肽:由前导序列指导合成的含有14个氨基酸残疾的肽38、The operon model 操纵子模型
29、由哪三个基本组成部分？答The structural genes for enzymes involved in a specific biosynthetic pathway whose expression is coordinately (协调) controlled.Control elements such as an operator sequence, which is a DNA seq that regulate transcription of the structural genes.Regulator genes whose products recognize（识别）
30、 the control elements. 39、叙述the lactose operon 结构及诱导过程答：包括3个结构基因Z.Y.A以及启动子控制子，和阻遏子等，RNA聚合酶首先与启动子结合，通过操纵区向右转录，转录从0区中间开始，按ZYA的方向进行，每次转录出来的一条MRNA上都带有三个基因，转录的调控是在启动区和操纵区进行的，有乳糖时结构基因能够编码三种酶，半乳糖甘美透酶，和半乳糖苷乙酰转移酶，没有乳糖存在时基因编码的阻遏蛋白作为诱导物诱导阻遏蛋白变构，结合于操纵序列，乳糖操纵子被诱导开放合成分解乳糖的三种酶40、叙述CRP 对the lactose operon 的调控作用答：CR
31、P复合物是激活lac的重要组成部分，细菌对于此复合物的需要是独立的，与阻遏体系无关，转录必须有CRP复合物结合在DNA启动子区域因为CRP基因和环化酶基因的突变细菌即使同时也是I或O突变，都不能合成出lacrna所以认为CRP是一个不同于阻遏物的正调控因子，而lac操纵子的功能是在这两个相互独立的调控体系下完成的41、叙述The trp operon结构答：由5个编码与色氨酸生物合成有关的结构基因，TRP启动子和TRP操纵子基因序列基因序列组成只有当色氨酸缺乏时操纵子才被转录42、分别论述色氨酸操纵子的两个阻遏系统色氨酸操纵子的阻遏系统是色氨酸合成途径的第一水平调控，它主要调控转录的启动与否T
32、rp 操纵子中产生阻遏物的基因是trpR，距trp基因簇很远。trpR 基因突变常引起trp mRNA的组成型合成，该基因产物被成为辅阻遏蛋白（aporepressor）。该辅阻遏蛋白与色氨酸结合形成有活性的阻遏物，与操纵区结合并关闭trp mRNA转录。除非培养基中有色氨酸，否则这个辅阻遏蛋白不会与操纵区结合。第五章第三节43、CTD:RNA聚合酶的最大亚基在羧基端有七个氨基酸的重复序列，称为羧基末端结构域UCE：上游控制元件，长约50个碱基，开始于-100位点处UBF：上游结合因子。是一种特异的DNA结合蛋白，可以与UCE（上游控制序列）结合，还可以与核心元件上游的一段序列结合。SLI：选
33、择因子。他对RNA POLI的转录是必须的选择因子，与UBF-DNA复合物结合并使其稳定，然后RNA聚合酶1在结合进来并开始转录TBP：TATA结合蛋白是SLI的四个亚基之一，TBP为所有3种RNA聚合酶起始转录所需TAFS:TBP辅助因子是RNA聚合酶一所特异的TBP相关因子GTF：通用转录因子。作用于基本启动子上的辅助因子为任何细胞二型启动子起始转录所必须Enhancer：能提高转录起始效率的序列被称为增强子或强化子增强子可位于转录起始位点的5撇或3撇末端而且一般与所控制的靶基因的距离有关44、真核生物RNA polymerase 的类型、基本组成。答：真核生物有三种RNA聚合酶，根据对-
34、鹅膏蕈碱的敏感性不同可以分为RNA聚合酶 RNA聚合酶和RNA聚合酶。其中第一种对-鹅膏蕈碱不敏感。主要指导合成rRNA。第二种对-鹅膏蕈碱十分敏感，主要指导mRNA和snRNA合成。第三种则对-鹅膏蕈碱中度敏感，指导小RNA合成，如tRNA,scRNA等。45、真核生物RNA polymerase与原核生物RNA polymerase 的异同。答原核生物的RNA聚合酶由多个亚基组成:2称为核心酶,转录延长只需核心酶即可。2称为全酶,转录起始前需要亚基辨认起始点,所以全酶是转录起始必需的。真核生物RNA聚合酶有RNA-pol、三种,分别转录45s-rRNA; mRNA(其前体是hnRNA);以
35、及5s-rRNA、snRNA和tRNA。46、真核生物启动子的序列特征有哪些？答真核生物三类启动子分别由 RNA 聚合酶 I,II,III 进行转录.类别 I 启动子包括核心 启动子和上游控制元件两部分,需要 UBF1 和 SL1 因子参与作用.类别 II 启动子包括四类控 制元件:基本启动子,起始子,上游元件和应答元件.识别这些元件的反式作用因子由通用 转录因子,上游转录因子和可诱导的因子.类别 III 启动子有两类:上游启动子和基因内启 动子,分别由装配因子和起始因子促进转录起始复合物的形成和转录.47、Enhancer的基本特征答远距离效应无方向性1顺式调节2无物种和基因的特异性3具有组
36、织特异性4有相位性有的增强子可以对外部信息产生反应48、通用转录因子（General Transcription Factors）有哪些？请叙述RNA Pol 转录起始过程。答转录因子为第五章第四节49、转录因子结构域结构有哪两部分？DNA结合域（DNA-binding domain） 有哪些？Transcription activation domain (转录活化结构域)有哪些？转录阻抑的方式有哪些？答1、In addition, Dimerization domains (二聚结构域) and Ligand-binding domains (配体结合结构域)2、The helix-tur
37、n-helix domain （螺旋转折螺旋结构,H-T-H ） The zinc finger domain（锌指结构）The basic leucine zipper motif（碱性亮氨酸拉链）即bZIP结构The basic helix-loop-helix（碱性螺旋环螺旋）bHLH结构Dimerization domains (二聚结构域) leucine zippers motif 亮氨酸拉链 The helix-loop-helix domain 螺旋环螺旋3、Acidic activation domains (high proportion of acidic amino a
38、cids) (酸活化结构域)Glutamine-rich domains (富谷氨酰胺结构域)Proline-rich domains (富脯氨酸结构域)50、转录阻抑的方式有哪些答Blocking the activator DNA-binding siteFormation of a non-DNA-binding complexMasking(屏蔽) of the activation domain 51、SP1：一个广泛存在的转录因子，包含三个锌指结构和两个富含谷氨酸氨转录激活结构域Singnal transduction:信号传递，许多激素往往不能直接进入细胞起作用而是先与靶细胞表面
39、的受体结合再将信号传递给细胞内的相应蛋白质这一传递过程称之为信号传递Hemeohox:同源盒。是编码螺旋转角-螺旋DNA结合蛋白结构的一段保守DNA序列Homeodomain:同源域。由同源盒编码的螺旋转角螺旋的DNA结合蛋白的结构域起着转录因子的作用52、简述甾类激素调控（steroid Hormonal regulation）的受体蛋白调节机制。答甾类激素调节许多与发育有关的生理过程，它们可以靠简单扩散进入细胞内，然后与细胞内受体结合后引起其构象变化，增加与DNA的亲和力，最终起调节基因转录活性的作用。甾类激素-受体复合体可以识别并结合到专一的DNA序列上，从而诱导基因转录活性。甾类受体调
40、节的基因活化常常是分两步进行的：对少数基因转录活性的直接诱导作用称为初级反应；由这些基因产物继而激活其它基因，称为延缓性次级反应，它对初始激素效应起到了扩增作用。另外部分初级反应产物反馈调控，阻遏了初级反应基因进一步转录。53、简述STAT 蛋白激活的信号传导调控机制。答Many hormones bind to cell-surface receptors and pass a signal to proteins within the cell through a process called signal transcuction.Signal transduction often in
41、volves protein phosphorylation. 54、简述HIV Tat激活的转录延长调控机制。答TAT蛋白是前进中的HIV表达所必须的激活因子，它可以结合到HIVRNA的5撇端的段成为TAR的序列上（位于转录起始位点之后）如果没有TAT的结合HIV的转录就会过早终止，tat-art复合体在启动子处激活转录起始复合体中的TFIIH导致RNA聚合酶II羧基端域的磷酸化是聚合酶的全程转录成为可能55、热激蛋白基因表达机制答在没有受热或其他环境胁迫时，HSF主要以单体的形式存在于细胞质和核内。单体HSF没有DNA结合能力，Hsp70可能参与了维持HSF的单体形式。受到热激或其他环境胁
42、迫时，细胞内变性蛋白增多，它们都与HSF竞争结合Hsp70，从而释放HSF，使之形成三体并输入核内。HSF一旦形成三体，便拥有与HSE特异结合、促进基因转录的功能。这种能力可能还受磷酸化水平的影响，因为热激以后，HSF不但形成三体，还会迅速被磷酸化。HSF与HSE的特异性结合，引起包括Hsp70在内的许多热激应答基因表达，大量产生Hsp70蛋白。随着热激温度消失，细胞内出现大量游离的Hsp70蛋白，它们与HSF相结合，形成没有DNA结合能力的单体并脱离DNA第五章第五节56、RNPS：核糖核蛋白由RNA和蛋白质形成的复合物。RNA的剪接splicing:在真核生物mrna前体加工过程中打断编码
43、区的内含子序列，使其被切除，然后两侧的外显片段相连接。RNA的剪辑：是某些RNA特别是MRNA的加工方式，它导致了DNA所编码的遗传信息的改变因为经过编辑的mrna序列发生了不同于模版DNA的变化57、Types of RNA processing. 答Removal of nucleotidesAddition of nucleotidesModification of certain nucleotides58、核糖体 (Ribosomes)的基本组成。 答5S rRNA 细菌5S rRNA，有两个高度保守的序列，CGAAC是5S rRNA与tRNA相互识别的序列。另一序列GCGCCGAA
44、UGGUAGU，是5S rRNA与50S核糖体大亚基相互作用的位点，在结构上有其重要性。 16S rRNA 结构十分保守，3端GCCUCCUUA序列与mRNA 5端翻译起始区富含嘌呤的序列互补，在16S rRNA靠近3 端处还有一段与23S rRNA互补的序列，在30S与50S亚基的结合中起作用。 23S rRNA 存在与序列tRNAMet互补的片段，可能与tRNAMet (甲硫氨酸)的结合有关。另有与5S rRNA作用序列。 5.8S rRNA 真核生物核糖体大亚基特有，含CGAAC序列，与原核生物5S rRNA具有类似功能。 59、Processing of eukaryotic hnRN
45、A involves 4 events答加帽反应：mRNA从细胞核向细胞质运转，翻译起始。加poly A反应：转录终止，翻译起始和mRNA降解。RNA的剪接：从mRNA、tRNA和rRNA分子中切除内含子。RNA的切割：从前体RNA中释放成熟tRNA和rRNA60、原核生物和真核生物mRNA特征比较。n 答原核生物的特征 A. 原核生物mRNA半衰期短 绝大多数细菌mRNA的半衰期短得令人吃惊，其降解紧随蛋白质翻译过程发生。一般认为，转录开始1分钟后，就降解了，这就是说，当一个mRNA的5端开始降解时，其3端部分可能仍在合成和翻译。mRNA降解速度大概只有转录或翻译速度的一半。B. 许多原核生
46、物mRNA以多顺反子的形式存在 细菌mRNA可以同时编码不同的蛋白质，我们把只编码一个蛋白质的mRNA称为单顺反子，把编码多个蛋白质的mRNA称为多顺反子。多顺反子mRNA是一组相邻或相互重叠的基因的转录产物，这样一组基因可被称为一个操纵子。C. 原核生物mRNA的5端没有帽子结构，3端没有或只有较短的poly（A）结构 原核生物起始密码子AUG上游7-12个核苷酸处有一被称为SD序列(Shine-Dalgarno)的保守区，因为该序列与16S rRNA 3端反向互补，所以被认为在核糖体-mRNA的结合过程中起作用。真核生物特征真核生物mRNA的5端存在“帽子”结构 A. 帽子结构是GTP和原
47、mRNA 5三磷酸腺苷（或鸟苷）缩合反应的产物，新加上的G与mRNA链上所有其它核苷酸方向正好相反，像一顶帽子倒扣在mRNA链上，故而得名。B. mRNA的帽子结构常常被甲基化。第一个甲基出现在所有真核细胞mRNA中，由尿苷酸-7-甲基转移酶催化，称为零号帽子。帽子结构的下一步是在第二个核苷酸的2-OH位上加另一个甲基，一般把有这两个甲基的结构称为1号帽子，真核生物中以这类帽子结构为主。在有些生物中，mRNA链上的第三个核苷酸的2-OH位也可能被甲基化，因为这个反应只以带有1号帽子的mRNA为底物，所以被称为2号帽子。有2号帽子的mRNA只占有帽mRNA总量的10%-15%。C. 除组蛋白基因外，真核生物mRNA 3端都具有poly（A）序列，其长度因mRNA种类不同而变化，一般为40-200bp左右。Poly（A）序列是在转录后加上去的。D. 研究表明，几乎所有真核基因的3末端转录终止位点上游15-30bp处的保守序列AAUAAA对于初级转录产物的准确切割和加poly（A）是必需的。加带有poly（A）时需要由内切酶切开mRNA 3端特定部位，然后由poly（A）合成酶催化多聚腺苷酸的反应。E. poly（A）是mRNA由细胞核进入细胞质所必