《计算化学中软件的应用课件.ppt》由会员分享，可在线阅读，更多相关《计算化学中软件的应用课件.ppt（26页珍藏版）》请在三一文库上搜索。
1、计算化学中软件的应用,1,计算化学中 常用软件的简单介绍,计算化学中软件的应用,2,工程,数学,计算机科学,化学,狭义：量子化学,广义：计算化学是一门涉及多种学科的边缘学科,计算化学,什么是计算化学？,计算化学中软件的应用,3,计算化学中软件的应用,4,计算过程,5计算结果的分析和整理,1文献调研,2 确定计算目的,3 计算模型的构造,4 计算方法的选取,计算化学中软件的应用,5,计算化学所需的条件,计算化学中软件的应用,6,GaussView 的简单介绍,GaussView是一个专门设计与高斯配套使用的软件。,其主要用途有两个:构建高斯的输入文件和 以图的形式显示高斯计算的结果 。,计算化学
2、中软件的应用,7,特点：,通过计算机进行图形绘制和空间分子模拟，能给人增加真实感。,计算化学中软件的应用,8,计算化学中软件的应用,9,GaussView基本功能的演示,计算化学中软件的应用,10,如何使用UE编辑作业： 以丙氨酸为例,UltraEdit 是一套功能强大的文本编辑器,计算化学中软件的应用,11,Gaussian作业的格式：以丙氨酸为例,作业名称，运行内存，运行核数,计算执行路径行，包括方法, 基组,任务类型,title部分，标识和说明作用,分子说明部分,电荷和自旋多重度,计算化学中软件的应用,12,Route Section（计算执行路径行）,Route Section主要由方
3、法，基组，任务类型三部分组成,1.方法的选择,计算化学中软件的应用,13,2.基组的选择,计算化学中软件的应用,14,intrinsic reaction coordinate内禀反应坐标,3.Gaussian程序能完成的任务类型,计算化学中软件的应用,15,Gaussian 09 的简单介绍,程序界面,点击此处即可上传作业,计算化学中软件的应用,16,分子说明 部分,电荷与 多重度,标题行,计算执行 路径,返回主单 并运行,返回主菜单,保存,放弃任务,检查计算 执行路径,Gaussian09 上传作业界面,计算化学中软件的应用,17,举例,1.分子轨道 2.原子电荷,计算化学中软件的应用,1
4、8,1.如何查看分子轨道？,在UE中编辑输入文件时需要在计算执行路径行加 pop=full 关键词,1，3 丁二烯,注意：计算结束后，输入命令 formchk xxx.chk xxx.fchk ，再用GaussieView打开fchk文件,计算化学中软件的应用,19,计算化学中软件的应用,20,1，3 丁二烯HOMO轨道,计算化学中软件的应用,21,1，3 丁二烯LUMO轨道,计算化学中软件的应用,22,Isatins,猜想：如果此物质要和金 属配位，应该首会和哪个位点配位呢？,2.如何查看原子电荷?,在UE中编辑输入文件时需要在计算执行路径行加 pop=nbo 关键词（即NBO电荷分析）,计算化学中软件的应用,23,计算化学中软件的应用,24,计算化学中软件的应用,25,实验给现象，理论供解释！,计算化学中软件的应用,26,谢谢大家！,