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1、病原物的侵染和侵染概率,1,第四章 病原物的侵染和侵染概率,病原物的侵染和侵染概率,2,此类病害多为种传或土传的全株性或系统性病害，其自然传播距离较近，传播效能较小。病原物可产生抗逆性强的休眠体越冬，越冬率较高，较稳定。 小麦散黑穗病病穗率每年增长410倍，如第一年病穗率仅为0.1%，则第四年病穗率将达到30%左右，造成严重减产。,单循环病害（monocyclic disease），指在一个生长季节中没有再侵染的病害，如麦类黑粉病、水稻恶苗病、稻曲病、大麦条纹病、棉花枯萎病和黄萎病等。,病原物的侵染和侵染概率,3,病原物的侵染和侵染概率,4,多循环病害(polycyclic disease)，
2、指在一个生长季节中有多次再侵染的病害，如水稻稻瘟病、麦类锈病、玉米大、小斑病、马铃薯晚疫病等气流和流水传播的病害等。,这类病害绝大多数是局部侵染的，寄主的感病时期长，病害的潜育期短。病原物的增殖率高，但其寿命不长，对环境条件敏感，在不利条件下会迅速死亡。病原物越冬率低而不稳定，越冬后存活的菌量（初始菌量）不高。,病原物的侵染和侵染概率,5,以马铃薯晚疫病为例，在最适天气条件下潜育期仅34天，在一个生长季内再侵染10代以上，病斑面积约增长10亿倍，个田间调查实例表明，马铃薯晚疫病菌初侵染产生的中心病株很少，在所调查的4669地块内只发现了1株中心病株，10天后在其四周约1000面积内出现了1万余
3、个病斑，病害数量增长极为迅速。,病原物的侵染和侵染概率,6,病原物的侵染和侵染概率,7,病原物的侵染和侵染概率,8,在现代流行学中用得较多的是单利病害(simple interest disease)和复利病害(compound interest disease)或者单年流行病害(monoetic epidemic)和积年流行病害(polyetic epidemic)。,病原物的侵染和侵染概率,9,4.1 侵染链和侵染环,侵染链(infection chain)是Gamann(1946)提出的，是指侵染物体从寄主到寄主的一系列的传播，其中包含多个环节，已被侵染的植物称为散布体，将被侵染的植物称
4、为接受体。侵染链中的各个环节称为“侵染环”。,侵染环(infection cycle) 指由一次侵染到下一次侵染之间各个阶段所组成的一个周期，是侵染链中的一个环节，相当于“世代”。,病原物的侵染和侵染概率,10,病原物的侵染和侵染概率,11,4.2 病原物的传播和侵染,传播单位 病原物的一个传播和存活的结构称为传播单位。能被视觉识别和计数。一个传播单位可以是病原真菌的单一孢子、一群孢子、一个菌丝片段、或为此目的而形成的专门菌体或其它结构。,病原物的侵染和侵染概率,12,2. 侵染单位 当一个传播单位与一个适当的植物感病部位接触，给以合适的环境条件，一个传播单位变成为一个侵染单位。一个侵染单位可
5、引致植物的一次侵染。,病原物的侵染和侵染概率,13,Heald(1921)：孢子负荷量 Horsfall(1932)：接种体势能 Gaeumann(1950)：侵染数限 多于一个的接种体才能实现一次侵染,3. 接种体数量与病害数量的关系,病原物的侵染和侵染概率,14,Vanderplank(1975) 侵染实体 (infection entity) ： 起作用的病原体是一个自足的单位，称为侵染实体。这个实体可能是一个由若干孢子组成的传播单位（如小麦条锈菌夏孢子常多个粘成一团），也可能是单一的真菌孢子、细菌细胞或病毒质粒。 在复合的侵染实体内部，可能有兼性的协同现象（如孢子释放的物质互相刺激萌发
6、），不论其中有几个孢子萌发和侵染，但只一个侵染。,病原物的侵染和侵染概率,15,传播单位和侵染实体是不同的概念，“实体”含有“自足”的意义，自足是一种遗传的、内在的品质；传播单位没有自足的含义。 侵染实体是独立地起着侵染作用的，各实体之间没有专用的协同作用。因此Vanderplank 提出了一个“侵染实体的独立作用原理”,病原物的侵染和侵染概率,16,实验的原点定律 用一个微型操作器，把一个个单孢子分别移植到一张叶片上，将接种引致的病痕数对侵染实体数作图，可得到一条通过原点（0,0）的直线，从而证明造成一个侵染只需要一个而不是多个侵染实体。这样的实验结果可以从不少文献资料中获得。Vanderp
7、lank 根据这些结果，总结出一个实验定律：“当以病害对接种体（两者都在算术比例上）作图时，其曲线在原点(0,0) 开始”。,病原物的侵染和侵染概率,17,4. 关于侵染的概率观点-侵染的根本原理 一个传播单位从受病部位传播到感病部位，要经过释放、传播、降落的过程，并不是所有传播单位都能到达感病部位。已经到达感病部位的传播单位，并不是全部都能变成侵染单位或侵染实体。因此，有效的传播单位只是那些已经产生的大数量的一个分数。因此，对于病原物的侵染，可以用概率的术语来思考，这是方便和现实的。,病原物的侵染和侵染概率,18,病原物的侵染和侵染概率,19,例如，TMV 如果平均要100万个质粒才能侵染一
8、株烟草，则任何一个质粒的侵染概率是百万分之一。Buller 估计某些担子菌每个子实体产生1091012个孢子；在这些稳定的真菌种群中，任何一个孢子的侵染概率属于10-1210-9数量级。 一般气传的真菌病害，其病原物侵染概率之小和繁殖材料浪费之大都是惊人的。,病原物的侵染和侵染概率,20,4.3 侵染概率,侵染概率(infection probability) 是指病原物的一个传播体着落于寄主体表后，在一定条件下得以侵染成功，引致发病的概率。,在一般的研究中，用侵染概率较为简便直观，它把菌量和发病数量的关系直接表达出来。但在较更细致的系统分析和模拟中，常将侵染过程分为侵入、扩展、显症、产孢等子
9、过程，这就要求应用侵入率的概念。,病原物的侵染和侵染概率,21,侵入率=侵入点数/接种的传播体个数 侵染概率=发病点数/接种的传播体个数 侵染概率=侵入率*定殖成功率（引致显症） 在定量流行学上，每一概念最好都能定量、能测量，而且要便于分析和综合，这是我们采用侵染概率这一概念的出发点，由此入手，先研究在一定条件下： 病害数量=菌量*侵染概率,病原物的侵染和侵染概率,22,再研究侵染概率因病原物致病性、寄主抗病性和环境条件而变的定量关系，从而得到在任一环境条件下病害数量的表达式： 病害数量=菌量*侵染概率 侵染概率=F（致病性，抗病性，环境条件）,病原物的侵染和侵染概率,23,在田间工作中，传播
10、体的绝对数是难以估算的，只好采用间接的方法，用亲代病情来代表相对菌量，一定数量的亲代病情在一日之内传播侵染引致一定数量的子代病情，亲代病情和子代病情采用同一计量单位，这样算出的侵染概率为相对侵染概率，即通常所说的病害日传染率： 相对侵染概率（病害日传染率）=子代病点数/亲代病点数/日 病情日传染率尽管较粗略，但在研究大面积病情发展时，观测、计算和应用均较简便。,病原物的侵染和侵染概率,24,此外，在许多病害中，特别是对土壤病害的研究，接种量常按单位面积或每克土壤所含传播体数量计，病情常按病株率计，从而导出接种量（或密度）-发病数量曲线（Inoculum Density-Disease Inci
11、dence Curve），简称ID-DI曲线，曲线上各点的斜率便反映了各点上的侵染概率。,病原物的侵染和侵染概率,25,1. 最简单的情况 在接种体一定数量范围内，发病点数和接种体数量成正比，而且呈直线关系，直线从原点开始，斜率即侵染概率，当斜率等于1时，侵染概率等于100%，但这种情况极为罕见。,病原物的侵染和侵染概率,26,接种量或接种密度不断加大，寄主面积或群体一定，侵染位点有限。 重叠侵染,病原物的侵染和侵染概率,27,2. 在同一位点同时或先后遭受不只一次的侵染，这不只一次的侵染最终造成一个发病点数。结果造成随着接种量的不断加大，发病点数的增长逐渐缓慢，直至停止，ID-DI曲线斜率渐
12、小，直至水平。这一变化可用数学模型去拟合，这就是下述的“重叠侵染”模型，实质上就是泊松分布的应用。,病原物的侵染和侵染概率,28,假定寄主体的全部位点在感病性上是均匀一致的，再假定病原物传播体着落和侵染某一位点是随机的，那么，寄主的位点中，遭受0、1、2 和n次侵染的位点的概率可按泊松分布估计，即： P(x=n)= m为单个位点遭受侵染次数的平均值。,病原物的侵染和侵染概率,29,其展开各项为： 这就是用于描述发生概率很低的事物分布的泊松分布，其总和为1。 由上可知，位点不受侵染的概率为e-m。,病原物的侵染和侵染概率,30,如以y代表发病位点的百分率，当位点总数量大时，它用于代表位点发病 的
13、概率，则得：,所以,这就是重叠侵染转换公式(Gregory,1948),利用它可以根据目测到的发病位点百分率倒推出实际发生了的侵染次数。,病原物的侵染和侵染概率,31,例如：当y=0.5时 m=ln(1-0.5)=0.693 这就是说，假如1000个位点中发病500个，则可估计实际发生了693次侵染，其中有693-500=193次侵染是重叠在其他侵染点上。,病原物的侵染和侵染概率,32,表4-1 若干对y, m 对应值，,由上可见，当病害发生已重时，每再增加一定量的发病率需要的菌量比病轻时多得多，这一点已由不少实验证实，不仅气传病害，而且土传病害方面均获得了重叠侵染的证据。,病原物的侵染和侵染
14、概率,33,3. 关于侵染数限（侵染阈值）问题,当接种量低到一定程度以后，发病数量便往往呈现为零，这就会使人想到“侵染数限”（numerical threshold of infection）问题，即在某些病害中，是否单一传播体不能引致侵染，必须某一定数量以上的传播体才能引致一个位点发病。这个概念最初是高又曼（Gaumann, 1946）提出的。他以马铃薯癌肿病为例，根据试验数据（图4. 1），认为每克土壤中孢子囊数必须达到200个以上才能引致侵染。,病原物的侵染和侵染概率,34,每克土壤中孢子囊数 每克土壤中孢子囊数 图4.1 Gaumann 提出侵染数限假说所据的 图4.2 马铃薯癌肿病接
15、种量与侵染 试验数据马铃薯癌肿病接种量和发病点 数量的关系（Vanderplank 据Glynne 数的关系，Glynne, 1925) 1925年资料改制）,0 200 500 1000 0 1000 2000,发病点数,3,2,0,病原物的侵染和侵染概率,35,Vanderplank 认为侵染数限的假说是缺乏证据的。许多病害中单孢接种，甚至细菌的单细胞接种，可以引致发病，便是有力的反证。他还把Gauman 所据(Glynne, 1925)重新加工，将发病百分率进行重叠侵染转换，以估计侵染点数和接种量作图（图4.2）。可以看出：在试验误差允许范围内，侵染数量与菌量呈直线关系，直线通过原点，即
16、并未指出有侵染数限的存在。,病原物的侵染和侵染概率,36,Vanderplank 认为，在算术分格的坐标纸上，ID-DI曲线通过原点，这是一条试验法则。他认为如果单孢子不能侵染，即单个孢子侵染概率为零，那么多个孢子的侵染概率仍为零，除非存在着必要的协生作用，而这种必要的协生作用是不存在的。,病原物的侵染和侵染概率,37,通常出现的只有接种量达到一定程度后才能引致发病，可能是由于侵染概率很低，而且由于种种遭遇使这一很低的侵染概率未能成为现实。例如侵染概率为 0.1%, 则用几个接种体接种当然极难成功，要用到1000个以上才较易接种成功。如此说来，Gaumann 的所谓侵染数限乃是侵染概率的一种表
17、现。,病原物的侵染和侵染概率,38,4. 高接种量下的协生作用和拮抗作用,A. 协生作用 B.自我抑制作用或拮抗作用,病原物的侵染和侵染概率,39,5数据转换和模型建立,半对数（或单对数）转换(semilogarithmic transformation) 横坐标为接种量或接种体数量（个数），纵坐标为原始数据病情百分率经重叠侵染转换后所得的侵染点数。在很多场合下，这种转换可使ID-DI直线化或近似于直线，直线的斜率便是侵染概率。如有协生或拮抗作用，曲线的上端便会上升或下降。,病原物的侵染和侵染概率,40,对数-对数（或双对数）转换（Log-log transformation） 横坐标为lnI
18、D(或logID，下同) 纵坐标为ln- ln(1-y) ，即经重叠侵染转换后所得估计侵染点数的对数。,对数-概率转换（logarithmic-probability or probit transformation） 概率单位（probit）是把病情百分率按正态分布推算出的转换值，纵坐标为病情百分率的概率单位值，横坐标为接种量的对数值，这就是对数-概率转换。,病原物的侵染和侵染概率,41,6. 侵染概率因寄主感病性、病原物致病性和环境条件而异,侵染概率是由寄主抗病性、病原物致病性和环境条件共同决定的。可以通过试验，建立侵染概率因寄主、病原、环境条件而变的数学模型。这是流行学研究的中心内容之一
19、。,7. 土传病害的ID-DI模型,病原物的侵染和侵染概率,42,4.4 侵染速率(infection rate),所谓病害的侵染速率，就是指病害数的量增长，在某种意义上讲，也就是后面要重点介绍的流行速率。在流行学中一般用“r”表示，它表示在单位时间内病害数量增长的比例，是定量流行学中的一个十分重要的参量。 后面介绍的几种计算r值的公式，是根据各类病害的流行特性建立起来的，在理论上和数学上都是比较严谨的。,病原物的侵染和侵染概率,43,第四章 思考题,1. 名词： 单循环病害 多循环病害； 单年流行病害 积年流行病害； 单利病害 复利病害； 侵染位点 重叠侵染 侵染概率 2. 病情百分率经重叠侵染转换后，得出的估计侵染点数与接种的量呈何关系？有无特殊情况？为什么？ 3. 病情百分率经单对数转换后对时间作图为何得到的是倒“J”形曲线？,