医学课件真核基因表达调控模式.ppt

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1、第七章第七章 真核生物基因表达的调控真核生物基因表达的调控 教学目的: 掌握真核生物基因表达调控的层次及在不同水平 调控的方式 教学重点: 1.真核生物转录调控的复杂性 2.真核生物DNA水平的调控 3.DNA 转录水平的调控 教学难点: DNA 转录水平的调控 棠 韭 疼 浊 赁 熊 蜡 驹 蚌 淆 桅 迫 乍 关 姨 楔 娥 亥 岿 骏 诈 淋 劲 笔 指 硬 妈 绒 续 垒 科 屈 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真核生物基因表达的特点 基因组结构庞大 单顺反子 重复序列 断裂基因 染色体 转录调节区大 转录和翻译分别在不同的亚细胞区域 翻

2、译后需要加工 彦 弥 泳 锭 喷 策 声 铲 膘 哨 栖 绕 冠 顾 沛 视 乃 熊 磐 妻 愁 输 贴 膀 姨 茸 吸 莱 川 交 蹭 烹 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 多级调控 DNA水平 基因丢失 基因扩增 基因重排 甲基化修饰 染色质的结构状态 RNA水平 转录水平调控 RNA的转录后加工 mRNA向胞浆转运 mRNA稳定性 蛋白质 水 平 翻译过程 翻译后加工 蛋白质的稳定性 真核生物调控的特征真核生物调控的特征 基因表达以正调控为主基因表达以正调控为主 转录与翻译在不同的区域进行转录与翻译在不同的区域进行 无操纵子和衰减子 个体发育

3、复杂 受环境影响较小 螟 迭 陕 伴 极 费 睬 延 碾 辑 鞍 扭 亦 泞 鹰 乙 晒 擒 封 汲 牡 抄 营 之 崖 芹 价 悼 咯 代 旋 痈 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 基因家族(基因家族(gene familygene family) 定义: 真核基因组中来源相同,结构相似,功能相关的一组 基因.可能由某一共同祖先基因(ancestral gene)经重 复(duplication)和突变产生。 特点: 家族成员可以分布于不同染色体上 可集中于一条染色体上,串联排列在一起,形成基 因簇(gene cluster) 有些成员不产生有功

4、能的基因产物,这种基因称为 假基因(Pseudogene)a1:与a1相似的假基因 家 荧 嚣 斡 炮 蒸 竞 捌 日 挞 宙 弟 堪 址 寡 彝 藻 案 喉 诺 清 担 瘁 丑 万 贵 附 吨 抗 疼 盅 饥 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 简单基因家族简单基因家族 特点: 家族成员串联排列在一起 组成一个转录单位 代表: rRNA基因家族 (重复单元28S、18S、5.8s-rRNA) 瓮 舟 鸿 惦 蔽 粮 乾 陪 敞 拿 稽 黑 巧 摇 歹 恭 垃 很 烫 三 褪 唁 姻 止 汀 鹏 谤 完 访 憋 迎 谁 真 核 基 因 表 达 调 控

5、 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 复杂基因家族复杂基因家族 特点: 家族成员串联排列在一起 独立的转录单位 代表: 组蛋白基因家族 姑 形 音 棕 乱 绅 嫡 瓦 纶 邯 韭 参 课 亮 狸 池 武 卵 澄 里 镑 劳 剪 瘦 赡 净 易 昔 剂 趁 螺 糕 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 发育相关复杂基因家族发育相关复杂基因家族 特点: 分布在不同的染色体上 独立的转录单位 基因顺序与表达顺序相关 代表: 珠蛋白基因家族 沥 城 车 驱 干 成 兆 断 央 踏 漓 捅 肇 告 郡 棵 体 焙 蟹 魄 吓 呈 美 斟 敦 胚 园

6、卉 减 孪 梆 前 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 变 檀 捧 速 咕 梗 图 粟 晌 旗 匿 琳 疗 嘱 围 窥 婿 块 孺 泛 曾 邻 愿 裕 格 矣 宏 世 话 萎 臻 邪 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 曰 鬼 喻 尊 患 又 伙 沙 螟 索 葛 耍 害 锰 驻 江 垂 溯 暴 导 寅 过 萤 笔 耪 伞 初 支 却 骑 烈 愿 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 假基因假基因(Pseudogene)(Pseudogene) 核苷酸序列同其相应的正

7、常功能基因基本相同,但却不 能合成出功能蛋白质的失活基因。一般都不被转录,且 没有明确生理意义,可能是产生一种功能性非编码RNA, 调节来自其等位编码基因的mRNA的稳定性 根据其来源可分为 复制假基因 已加工假基因 完全缺失存在于功能基因中的间隔序列 无5端调控序列 3末端紧接着有多聚腺嘌呤尾 两端常被721bp的正向重复序列包围 哼 译 训 绢 毛 入 财 惰 唐 酚 路 涪 倒 供 锹 恳 金 拥 贡 价 卒 党 傲 骸 章 谷 新 希 买 手 赘 宫 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 酮 碌 涅 庞 痴 赔 场 半 岸 抖 贷 忘 柴 蚊

8、溺 慑 蘑 迈 鹰 摸 雁 椒 些 账 因 歧 储 伴 疚 哆 矾 翱 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 果蝇的sexlethal基因转移到小鼠体内,大多数小鼠表现正常, 但有一个品系的小鼠在幼年期全部死亡。研究发现,sexlethal 基因插入到makorin1p1假基因中部,破坏了该假基因的转录。如 果将假基因makorin1p1敲除,makorin1基因将被关闭。 皂 阀 奴 扎 桶 科 晌 尔 越 霓 肤 认 般 牌 宇 羞 刷 件 择 枣 仲 谤 融 掉 汲 汪 擅 丹 羔 诧 蒲 谗 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基

9、因 表 达 调 控 模 式 一、DNA水平调控 (一)染色质结构对基因表达的影响 染色体(chromosome):细胞在有丝分裂或减数分裂过程中,由 染色质聚缩而成的棒状结构。 染色质(chromatin):间期细胞核内由DNA、组蛋白、非组 蛋白及少量RNA组成的线性复合结构, 是间期细胞遗传 物质存在的形式。 常染色质(euchromatin):压缩程度低,伸展状态,着色浅 异染色质(heterochromatin):压缩程度高,聚缩状态,着色深 结构异染色质(constitutive heterochromatin) 兼性异染色质(facultative heterochromatin)

10、 亩 晦 戎 虾 墟 集 耶 河 珠 剐 贼 臆 昭 五 哇 回 愧 鸽 婿 晋 洗 圆 退 凋 巷 显 赡 僳 据 台 啸 懦 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 异染色质化 水蜡虫(Pseudococcus nipae)(2n=10) 雌性:10条都是常染色质 雄性:来自父本的5条染色体依次被异染色质化 哺乳动物的剂量补偿(dosage conpensation) 雌性哺乳动物X染色体的失活 巴尔小体(Barr body) L.Barr(1949年) 裸 勿 胀 挺 良 题 轴 游 眶 睁 焰 眨 甲 涟 父 靛 输 亭 嘶 湛 村 绰 漱 蛇

11、投 锁 篡 句 武 怕 闭 冶 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 1961,Mary Lyon提出了莱昂假说(Lyon hypothesiis) 巴尔小体是一个失活的X染色体; 在哺乳动物中,雌性个体细胞中的两个X染色体中有一个X染 色体在受精后的第16天(受精卵增殖到5000-6000,植入子 宫壁时)失活; 两条X染色体中哪一条失活是随机的; X染色体失活后,细胞继续分裂形成的克隆中,此条染色体都 是失活的; 生殖细胞形成时失活的X染色体可得到恢复。 1974年Lyon又提出了新莱昂假说 认为X染色体的失活是部分片段的失活 实验证据: 无汗性外

12、胚层发育不良(anhidrotic ectodermal dysplasia) 三色猫 G-6-PDH 怠 备 竹 溪 仲 蝎 韶 靠 砧 傈 频 去 劲 稽 沃 挥 御 皋 制 挑 临 忠 蟹 潮 酱 梁 扼 萨 傈 御 琼 九 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 怂 廊 王 爆 窒 玄 状 忠 粹 捷 茂 米 垦 胞 毯 姿 净 疮 选 狄 媚 稠 葫 奉 鸳 字 钞 弦 逐 钡 萤 楞 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 anhidrotic ectodermal dysplasiaanhidroti

13、c ectodermal dysplasia 无汗性外胚层发育不良无汗性外胚层发育不良 毛发稀少 牙齿异常 无汗/少汗 表皮和附件 异常 个 踢 亦 匆 饥 朔 需 兽 区 鸿 宛 率 进 岁 扳 敌 喻 朗 眨 搂 晌 动 怠 毛 其 脑 掣 琶 粱 进 拙 嫩 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 X b X B b 橙色 B 黑色 三色猫 三色猫 脊 贯 垮 接 惭 披 龚 弓 斋 捎 耽 俊 己 湖 蔫 架 棺 刚 捌 馅 阴 杠 竭 丝 顽 巴 俄 杭 叶 惊 寐 凹 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模

14、 式 6-磷酸葡糖脱氧酶(G-6-PD)的测定 颖 爵 降 陶 虏 倒 私 伎 磷 附 纷 儡 喀 总 艘 辰 籽 胡 寿 温 胞 出 椿 水 症 闷 闯 两 五 暮 工 淫 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 (二)DNase的敏感性和基因表达 含有转录活性基因的染色质区域对DNase降解的敏感性要比 无转录活性区域高得多。这是由于此区域染色质的DNA蛋白质 结构变得松散,DNase易于接触到DNA之故 鸡的珠蛋白和卵清蛋白系统: 鸡胚红细胞 珠 蛋 白 基因 + - 卵清蛋白基 因 - + 鸡输卵管细胞 超敏感区域(hypersensitive

15、region)或超敏感位点( hypersensitive site)一般在转录起始点附近,即5端 启动子区域,少部分位于其它部位如转录单元的下游。 珠 拢 二 镀 星 补 茹 蛋 唉 丈 靠 泊 稼 鳖 偶 依 炳 矮 散 挥 糠 粪 厌 迈 财 心 俏 臆 谈 淘 至 已 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 (三)端粒位置效应(telomere position effect ,TPE) 端粒处核小体的堆积紧密,导致该处附近的基因不表达 基因在染色体的位置不同,表达的效果也不同 奶 假 滨 冀 撤 平 翟 誓 皇 郁 底 策 拘 镶 桓 七 骋

16、魁 千 守 缔 国 娶 典 赁 仓 毫 晋 枯 赣 弛 梆 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 术 冠 夺 系 尉 蜗 浆 猜 鲸 很 羹 梨 飞 蛆 旬 靡 膳 汇 弦 喷 绎 轩 邱 群 球 盯 侥 舌 孟 伶 绸 聚 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 (四) DNA的甲基化与去甲基化 DNA甲基化是最早发现的修饰途径之一,可能存在于所有高等生物 中,DNA甲基化能关闭某些基因的活性,去甲基化诱导了基因的重 新活化和表达 DNA甲基化的主要形式: CpG 配 岗 耍 拧 闻 悲 的 沮 淡 苇 挛 驼

17、 的 磕 绘 钎 距 淡 吗 福 翼 瘸 菱 睦 营 理 擎 抱 诌 媒 莎 踏 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 用同裂酶((isoschizomers) )可检测CCGG上C的甲基化状态 MspI 可切割CmCGG或CCGG,HapII可切割未甲基化CCGG HapII 惧 腾 栋 钵 块 俗 舆 悠 戚 册 橱 笨 踊 隙 熄 妒 农 酋 右 摊 掂 抿 试 兑 朽 壶 僚 阉 伺 汪 绢 痪 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 CG islands 高等真核生物中包含未甲基化CpG双核甘酸序列远低

18、于 其理论值.通常成串出现在随时准备好转录或转译的脱 氧核糖核酸中 甲基化酶 日常型(mainteance): 从头合成型( de novo synthesis) 抬 僚 沈 伏 呼 酣 推 烛 亮 五 对 爸 嫌 崎 俘 胳 士 师 芯 竞 辕 齐 裙 馏 烈 氓 绩 瞻 柴 泉 簧 匣 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 在一些不表达的基因中,启动区的甲基化程度很高, 而处于活化状态的基因则甲基化程度较低。 去甲基化又可使基因恢复活性。 5-氮胞苷没有游离的5-H,因而 不能接受甲基,若将它掺入DNA取 代胞苷是可以改变基因的甲基化状 态,而达到

19、去甲基化。 雀 搽 除 膜 征 牌 蜡 士 春 阔 蟹 爱 宫 沸 项 暇 啦 喝 拿 令 抖 紫 沂 庇 腿 为 腊 穆 滚 披 晓 韩 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 冲 揣 帆 瓦 绍 国 止 瞒 酬 漂 跑 惦 患 巴 院 择 琴 硼 蛰 诀 锦 更 梨 华 锁 鸟 话 商 抢 硝 垂 吐 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 5-磷酸核糖-1-焦磷酸(PRPP) 次黄嘌呤核苷一磷酸(HMP) 次黄嘌呤核苷(HR) GMPAMP 尿嘧啶核苷一磷酸(UMP) 胸腺嘧啶核苷一磷酸(TMP) 胸腺嘧啶核

20、苷(TR) 嘌呤核苷酸生物合成途径嘧啶核苷酸生物合成途径 次黄嘌呤磷酸 核糖转移酶 (HPRT)(TK) 胸腺嘧啶 核苷激酶 氨基喋呤(AP) 氨基喋呤(AP) 从头合成途径 补救合成途径 崎 敲 侈 窘 肮 韦 括 辩 锨 知 撒 诈 宣 坚 惯 撩 出 核 芥 他 局 袋 储 胺 挽 忿 侯 诬 行 奴 洁 擦 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 冲 揣 帆 瓦 绍 国 止 瞒 酬 漂 跑 惦 患 巴 院 择 琴 硼 蛰 诀 锦 更 梨 华 锁 鸟 话 商 抢 硝 垂 吐 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模

21、 式 含有胸腺嘧啶核苷激酶(TK)编码基因缺陷的受体细胞(tk -) 不能在含有次黄嘌呤核苷、氨基喋呤、胸腺嘧啶核苷的培养基 上(HAT培养基)生长,载体上的标记基因tk能与之遗传互补 含有次黄嘌呤磷酸核糖转移酶(HPRT)编码基因缺陷的受体细胞 (hprt -) 不能在含有次黄嘌呤核苷、氨基喋呤、胸腺嘧啶核苷的培养基上 (HAT培养基)生长,载体上的标记基因hprt与之遗传互补 星 中 凶 捆 獭 亭 淆 阻 炸 质 蚂 彻 盾 深 分 肉 年 躲 残 蜡 凯 展 充 扬 逆 豆 疼 尧 尖 颈 肇 耶 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 档 椎

22、佣 戌 沿 兆 刮 混 侈 蚊 册 苑 琐 敦 淹 北 罪 寇 岭 尚 洽 侯 给 撮 儒 噎 刽 采 艰 讫 捕 月 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 DNA甲基化抑制基因转录的机制 甲基化抑制基因转录的直接机制 甲基化抑制转录的间接机制 MeCP1 (methylCpG-binding protein1) MeCP2 (methylCpG-binding protein1) 玄 纤 憾 导 藻 恨 釉 词 应 贸 介 论 搔 鹅 决 夸 粗 克 豫 侈 肢 玉 门 飞 皮 雷 恃 蹋 虐 殉 忱 浴 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真

23、核 基 因 表 达 调 控 模 式 DNA甲基化的生物学效应 X染色体失活 亲本印迹 肿瘤发生 个体发育 CpG甲基化 讥 卵 宠 踪 晶 务 怕 塘 挪 铆 暖 唯 串 诀 押 锯 镰 甜 底 再 犹 滥 蹈 挞 但 搭 蓑 奖 耗 励 卡 些 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 DNA甲基化与X染色体失活 X染色体失活中心(X-chromosome inactivation center,Xic) X染色体上存在一个与X染色体失活有密切联系的核心部位, 定位在Xq13区(正好是Barr氏小体浓缩部位)。 Xi-specific transcrip

24、t (Xist)基因 只在失活的X染色体上表达 产物是一功能性RNA 没有ORF却含有大量的终止密码子 Xist RNA分子能可能与Xic位点相互作用,引起后者构象变化 , 易于结合各种蛋白因子,最终导致X染色体失活 接 平 颠 蓬 诸 沟 淤 捣 义 豪 庙 藏 颐 枣 隔 芹 肤 您 洋 霍 馁 瑞 晃 而 柏 剂 池 囊 名 陵 碗 权 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 堕 点 颗 厄 蛮 耗 吉 闺 歹 履 缠 镜 寨 醉 共 你 问 吹 歧 援 立 憨 磨 佯 溉 棱 歌 品 丽 味 兰 然 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核

25、 基 因 表 达 调 控 模 式 请 赦 氰 履 禾 慑 促 访 秽 卢 翁 内 娄 皂 宙 字 逝 迹 芋 湃 酪 氨 甸 乃 鳞 杏 垂 努 唬 冈 臆 酪 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 亲本印记(imprinting) 来源于父母本的一对等位基因表达不同。 如源于父本的IGF- (胰岛素样生长因子)基 因可表达,而源于母本的则不能表达。 选择性甲基化 睦 摄 措 霜 彭 东 赤 妓 奖 草 耗 看 米 贰 著 善 茁 圾 煌 太 旷 不 邹 录 咆 愉 辫 廉 稚 赣 柔 第 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达

26、 调 控 模 式 目前在人类和鼠身上已辨明了20种印迹基因。 猎 润 注 姑 捉 栅 屎 挑 江 暑 雾 谩 域 修 纵 彤 傈 竖 龙 页 筏 挑 醒 骗 夫 曰 呻 内 糙 撰 肛 烤 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 印记基因与疾病印记基因与疾病 印记丢失(印记丢失(loss of imprintingloss of imprinting) 非印记基因失活非印记基因失活 观 炳 吵 傀 撩 氧 复 寂 庚 誊 品 刨 君 麦 料 典 仔 沁 炉 扬 房 凿 污 己 丧 崎 阐 摹 橙 瑟 脱 弃 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核

27、 基 因 表 达 调 控 模 式 肿瘤发生肿瘤发生 抑癌基因甲基化抑癌基因甲基化 不表达不表达 祥 门 汲 啊 姆 喝 吞 拈 越 螺 辉 口 蛰 佛 拜 缘 侄 跨 匣 漳 疑 挨 迂 楚 倔 抽 刘 捶 框 锣 鞍 棒 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 (二)染色体(质)丢失(chromosome diminution ) 有的生物个体发育早期在体细胞中要丢失部分染色体, 而在生殖细胞中保持全部的基因组 马蛔虫(Parascaris equoorum) 斧 脏 绒 咋 掉 粮 巾 焰 什 古 漳 桑 必 牵 沛 赤 晰 棉 剔 漱 葱 杀 母

28、屎 囚 猎 话 梆 麦 桑 初 牌 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 第一次卵裂是横裂,产生上下两个子细胞 第二次卵裂时下面的子细胞仍进行横裂,保持着原有的基因组,而 上面的子细胞却进行纵裂,丢失了部分染色体 长此下去最下面的子细胞总是保持了全套的基因组,将发育成生殖 细胞,其余丢失了部分染色体片段的细胞分化为体细胞。 此可能是由于在植物极中有特殊的物质的存在,这种物质具有保护 染色体不受削减的功能。 郡 泞 泻 褪 熟 怖 绎 渡 想 妓 缆 煮 援 棵 陡 戈 宏 缨 凤 案 揍 洒 埔 滴 坯 刊 磺 廷 厕 脆 幽 磺 真 核 基 因 表

29、达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 小表瘿蚊(Mayetiole destructor)受精卵的细胞核分裂,而受精 卵不分裂,形成合胞体(syncytium)。当核第3次分裂后,有两核 移向卵后端的一个特殊区域,叫做极细胞质,在极细胞质中的核保 持了全套的染色体(2n =40),将来分化为生殖细胞。而在一般的 细胞质中,染色丢失了32条,只保留8条,将来分化为体细胞 腔 波 摘 果 桅 锣 庭 侥 蚌 逊 姚 抿 彬 坝 土 聚 麓 胶 娄 派 噬 慷 支 孩 藉 庶 扭 乓 铣 抱 炽 股 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式

30、 (三)基因扩增 定义 细胞内某些特定基因的拷贝数专一性的大量增加 作用 满足特定阶段生命活动的需要 例子: 组织中整个染色体组都进行扩增: 在双翅目昆虫如果蝇(D.melanogaster)的唾腺 中,细胞不分裂但染色体却多轮复制,产生巨大的多 线染色体(polytenne chromosomes)(含多于1000条 染色单体) 发育中的编程扩增 特定的基因簇的染色体外扩增 特定的基因簇原位扩增 哺乳动物培养细胞中定向基因的应激性扩增 搭 划 甭 署 旭 坏 眯 末 筐 锑 贬 逢 雏 辐 诚 贷 钞 屑 坝 蹿 捷 呛 缘 泄 溉 优 讲 尤 氏 抱 舵 慰 真 核 基 因 表 达 调 控

31、 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 polytenne chromosomes 飞 别 汀 叙 惋 蔬 习 旋 牢 衡 锣 皂 金 翱 瞻 哄 壹 丛 咀 封 确 行 艰 氦 彰 冰 沙 感 牡 悯 拔 又 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 特定的基因簇的染色体外扩增 两栖类和昆虫卵母细胞rRNA基因的扩增 非洲爪蟾的18S、5.8S 和28SrDNA的串联重复单位,它们 成簇存在,形成核仁形成区。可是在卵母细胞中rDNA串联 重复单位被剪切下来后环化,以滚环复制的形式进行扩增 ,使拷贝数扩大了1000倍以上。 迄 舷 补 阮 颊 扯

32、 仪 淖 汽 孔 悼 赤 迟 杯 澈 双 椒 漳 珠 粥 统 扫 除 瑟 迢 饯 晨 粮 熏 劳 肝 停 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 特定的基因簇原位扩增特定的基因簇原位扩增 在黑腹果蝇的发育中,卵壳蛋白基因不被剪切,在表达之 前,通过复制的重叠环而被扩增。 卵泡细胞中选择性扩增来满足在短期中对卵壳蛋白的大量需要 引 盂 颅 入 揍 养 恕 仟 柱 腊 辙 埃 嗅 硼 拘 鹿 沦 斧 尝 勺 挥 泵 孟 起 沤 暮 沧 炒 烛 嘘 辱 料 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 哺乳动物培养细胞中定向基

33、因的应激性扩增哺乳动物培养细胞中定向基因的应激性扩增 某些试剂可使那些对其产生抗性的基因大量扩增 dhfr 基因 二氢叶酸还原酶(DHFR) 氨甲喋呤( methotrexate) 均染色区(homogeneously staining region, HSR) 双微体(double-minute chromosomes) 褐 茅 咸 谤 硷 仪 绒 啪 滇 鸡 妆 阁 摹 抖 否 仔 吃 戴 巴 报 恢 值 锑 冉 叫 慎 履 抹 矩 齐 缄 退 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 均染色区(均染色区(homogeneously staining

34、region, HSRhomogeneously staining region, HSR) 在高抗性细胞的染色体中,可以观察到扩增区域形成一延伸的染色 体带称均匀染色区(homogeneously staining region,HSR) 依 鸡 期 贿 啥 稳 庚 佛 狂 俞 甫 充 雹 迫 庸 涡 醒 久 居 武 庚 欢 醛 夷 冷 克 应 轨 嘿 耙 豺 文 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 双微体双微体(double-minute chromosomes)(double-minute chromosomes) 赂 氢 软 民 床 玫 务

35、代 当 氨 铱 辱 徽 磋 诺 柿 个 蚊 帽 钨 褂 解 洽 逼 忙 矿 易 漠 娠 捆 体 紧 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 努 榜 虫 曼 榔 湛 主 犯 陪 禾 殃 密 扣 瓦 吴 韵 柑 端 鞍 肩 乔 滤 刹 躲 砂 毗 买 辩 擅 绿 办 稿 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 染色体外的拷贝是怎样产生? 两种可能: 复制的附加环可能在dhfr基 因附近起始,然后通过dhfr 拷贝之间的非同源重组而产 生 或是等位基因之间的非同源 重组来起始这个过程。额外 的拷贝可能是通过类似于重 组的

36、事件将其从染色体释放 出来 乃 囱 五 姑 垦 胰 激 暗 垄 百 鄂 绷 廊 修 甜 碗 镐 植 厕 主 瞻 鳃 棕 临 痉 剥 腺 瀑 狸 忱 宰 试 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 产生抗体 B细胞 体液免疫 经法氏囊(Barsa of Fabricius) 细胞分裂 骨髓 经胸腺 调节免疫应答 T细胞 细胞免疫 杀伤抗元 (Thymus) 孽 鸿 纶 游 瘟 颅 乔 样 耀 荣 蛙 剃 清 硬 伶 搜 挚 呛 椿 键 济 贵 隙 省 道 夯 臆 俭 废 剁 外 保 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模

37、 式 (四)基因重排 定义 改变基因组中有关基因序列结构 (片断水平的拼接), 使相距很远的片断靠近 作用 调控基因差别表达 例子: B淋巴细胞基因重排 涂 盗 说 绸 桐 狡 出 芋 而 踢 儒 肾 鼓 裳 盲 临 雍 胖 程 掐 饯 矢 研 芥 劝 远 豹 獭 说 尘 钦 踞 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 抗体有100万种以上,但一种淋巴细胞只产生一 种抗体 指令学说:上世纪40年代由Pauling提出 克隆选择学说:1957年 Burnet提出 一种浆细胞只能产生一种抗体 抗原可选择某一淋巴细胞克隆 体细胞重组学说:上世纪60年代提出 认

38、为在浆细胞成熟的过程中,染色体发生 了重排,多个区基因中的一个和基因 组合,产生一条DNA。 1976年由利根川进证实 祟 冈 苔 赠 酒 粕 斯 喳 三 浮 势 城 熟 煤 疤 禁 幅 怒 义 缓 墟 黔 卢 岩 花 陋 枚 渭 晚 遇 戚 睁 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 它们用分子杂交的方法发现在胎鼠细胞中编码区和区的DNA顺序 相隔较远。但在成熟的抗体细胞中(淋巴瘤细胞)这两个区域却紧 密相连;表明在淋巴细胞分化过程中,免疫球蛋白基因曾发生过体 细胞重组。 在任何动物中每家族的V基因和C基因都隔开一段距离,这种排列的 方式称为胚系(ge

39、rm line)模式,在生殖细胞中和除了免疫系统 外的所有体细胞中都是按此排列。 操 瑰 涕 打 所 辐 销 沼 蛀 著 椎 曼 犯 郡 雅 瘫 嗅 瞅 荧 弦 仲 勒 憋 藐 衣 众 漱 灶 倒 仆 晶 苯 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 当B细胞发育时,一个特殊的L-VK片段和其中一个JK连接,再和CK 连接,然后转录,切除内含子,成为成熟的mRNA 耿 传 莹 娠 端 制 婿 樟 乌 断 联 捻 细 蛙 瓶 鄂 偏 剑 膛 噪 态 恋 毖 岸 即 惕 佑 迎 慕 桔 健 火 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调

40、 控 模 式 户 雁 泅 擅 棠 暇 始 瞎 剐 悸 桥 祝 共 钠 不 骡 奄 整 思 汕 坡 惭 沃 玫 摩 匡 索 辊 察 闷 糠 既 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 在所有的胚系片段的分界线处都有相同的保守序列,这些 序列参与连接反应。每一个一致序列都含有七聚体( heptamer)和九聚体(nonamer),中间被12bp或23bp的 间隔序列所分开; 诈 娄 绢 曲 阴 戏 酵 恨 探 誉 咱 左 荆 郁 懈 翱 草 沁 成 意 萌 蛛 础 曝 蓬 拴 窘 慕 吃 肆 蔗 帝 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表

41、 达 调 控 模 式 在七聚体靠近编码单位的一端双链断裂,将V基因和J-C基因之间 的完整片段释放出来,这个片段被剪切的末端被称为信号端( signal ends)V和J-C座位的剪切末端称为编码端(codig ends )。两个编码端共价连接形成编码连接(codig joint),将V和 J片段连接起来,如果两个信号端也相连接,那和以这个被切下 来的片段也会形成环状分子 油 丰 淤 苹 虏 奈 蚀 新 陆 君 气 昼 祷 钦 托 坞 豪 暂 恤 跳 浩 杀 希 婶 土 盂 桨 产 氖 瀑 啊 迄 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 连接反应导致序列

42、的改变,影响到L链上V-J连接处或H链上的V-D及 D-J连接处的氨基酸编码。这种改变是酶在起作用,使DNA断裂和重 接。在以上的重组过程中会产生碱基的丢失或插入, 厘 妇 化 胖 壬 贪 浑 肢 赦 心 券 芦 机 的 将 怨 砚 围 欣 亲 芯 蚌 刘 抒 檬 掷 繁 脊 邯 崩 隘 瓜 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 酵母的变配型的转变 酵母的交配型(mating-type) 不同交配型(mating-type)的菌株相互接合才能产生 二倍体的合子。相同的交配型之间是不能接合的 细胞的交配型是由MAT(mating)座的遗传信息决定的 。在

43、此座位上带有MATa等位基因的细胞就叫做a型细胞 ;同样带有MAT等位基因的细胞就称为型细胞 交配型的转换 某些品系的酵母具有转换(switch)交配型的能力,即 从a型变成为型,或从型转变为a型。这些品系带有 显性等位基因HO,并频繁地改变它们的交配型(常常每 代改变一次),带有隐性等位基因ho的品系有一个稳定 的交配型,其交配型改变的频率仅约10-6。转换的存在 表明所有的细胞都含有MATa和 MAT型的潜在信息, MAT和MATa同在一条染色体上,HML位于MAT的左边, MHR位于MAT的右边。 逊 饮 蚜 起 判 蚊 吠 犊 芽 君 姿 饭 挖 附 稠 盛 卤 戳 宗 练 痪 蔑 群

44、 茫 姜 澡 呐 陕 操 傅 岛 五 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 暗箱模型(cassette model) MAT是活性暗盒(active cassette),可以是型,也 可以是a型.HML和HMR是沉默暗盒(silent cassettes) , 都不能表达,通常HML带有暗盒,而HMR带有a暗盒,所 有的暗盒都带有编码交配型的信息,但只有MAT可以表 达。当活性暗盒信息被沉默暗盒信息所取代时就发生了 交配型转换。新“装进”活性暗盒的信息就可以表达。 谚 寓 眷 讲 荧 诉 卓 赏 挡 铸 怎 魔 盆 黄 链 矗 歧 醉 咎 视 箱 遗

45、听 句 昼 锄 奸 轩 桂 秘 镍 吾 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 仿 谜 雹 绎 刽 杖 驱 琴 住 施 坝 戊 笺 鄙 地 肠 彭 长 院 又 畏 殃 梭 陇 并 纹 怀 攒 轻 箍 灼 宿 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 图18-11 MAT MAT a 每种暗盒都有共同的序列,侧翼序列W,X和Z夹着一个中心区Y。 在a和型暗盒中仅Y区域是不同的,分别称之为Ya和Y。中心区 的两侧区域本质上都是相同的,仅HMRa缺少了W区。 稗 捶 诫 脆 娜 覆 鲍 驹 乐 玲 疮 剃 榨 刃 专 梆

46、直 骏 椰 警 汕 留 栖 原 螟 幅 猫 起 湛 冀 汾 耸 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 原推测HML和MHRa之所以“沉默”是由于它们缺乏启动子,但发现 MAT和MATa特异性mRNA的转录是在Y片段的内部起始的,而沉默暗 盒和MAT暗盒中的Y序列是相同的,必定具有相同的启动子。 遗传学家们发现了4个不连锁的沉默信息调节基因SIR(silent information regulator)1、2、3和4,这些基因产物共同起反式作 用(它们并不在同一条的染色体上)来阻止沉默暗盒中的基因表达 。若这4个SIR基因中任何一个基因失去作用的话,那

47、么HML和HMRa 基因同样可转录。 烂 柜 徒 嘶 讣 便 田 辜 低 哎 缨 倔 扔 丛 效 郑 烃 贸 喀 啦 忽 统 彬 但 尝 躲 寝 爬 懊 钩 腑 颅 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 E沉默子和I沉默子,或EL(near HML)和ER(near HMR) 具有负的增强子的作用,它们能对远隔25Kb的启动子发挥作 用,而且没有方向性,所以它们被称为沉默子(silencers) 可能具有复制起点作用的ASR序列相联 温度敏感sir突变体的表达被用于研究HML和HMR的阻遏与DNA复制之 间的关系。带有sirts突变的细胞在高温下培养,

48、HML和HMR得到表 达,然后降低温度使SIR活性的恢复,当细胞被阻断G1期时,HML和 HMR仍持续表达。但当DNA复制时,HML和HMR就被抑制了,这表明与 E元件相连的ASR序列对于建立HML和HMR的阻遏是必须的。这是一种 阻遏的新形式,现在我们还不知其分子机制是怎样的。 迹 揍 兢 萤 差 宵 蒋 宴 俐 蚂 怨 璃 廉 筏 写 赚 沦 印 悠 桅 川 设 易 榜 男 洗 诉 攻 泅 淮 荫 获 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 转换按DNA链断裂重组的模式进行 重组的起始需要HO酶的切割。MAT的Y区被降解直到Y区左侧的同源 区。MAT

49、的左、右两侧是可以和HML或HMR 配对的。以HML或HMR的Y 区为摸板拷贝出新的序列取代了MAT被降解的区域,配对座位再彼 此分离 艳 匿 猴 尧 古 孙 冗 蛤 悼 慕 灵 玛 匡 利 丛 腹 详 源 布 轻 砷 缀 啄 柳 糖 秤 近 璃 告 缴 栗 余 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 真 核 基 因 表 达 调 控 模 式 二、参与基因调控的顺式作用元件和二、参与基因调控的顺式作用元件和 反式作用因子反式作用因子 (一)(一) 顺式作用元件顺式作用元件 真核生物真核生物DNADNA序列(非编码序列)序列(非编码序列) 和被转录的结构基因距离较近和被转录的结构基因距离较近 和转录调控有关和转录调控有关 启动子(启动子上游近侧序列)启动子(启动子上游近侧序列) 增强子增强子 沉默子沉默子 慑 念 烤 厢 句 贾 撑 茬 滨 钥

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