蛋白质下游纯化工艺简介.doc

上传人:scccc 文档编号:12557492 上传时间:2021-12-04 格式:DOC 页数:23 大小:245KB
返回 下载 相关 举报
蛋白质下游纯化工艺简介.doc_第1页
第1页 / 共23页
蛋白质下游纯化工艺简介.doc_第2页
第2页 / 共23页
蛋白质下游纯化工艺简介.doc_第3页
第3页 / 共23页
蛋白质下游纯化工艺简介.doc_第4页
第4页 / 共23页
蛋白质下游纯化工艺简介.doc_第5页
第5页 / 共23页
点击查看更多>>
资源描述

《蛋白质下游纯化工艺简介.doc》由会员分享,可在线阅读,更多相关《蛋白质下游纯化工艺简介.doc(23页珍藏版)》请在三一文库上搜索。

1、蛋白质下游纯化工艺简介(总17页)-CAL-FENGHAL-(YICAI)-Company One 1CAL本页仅作为文档封面,使用请直接删除Downstream (下游)与上游相对的概念,一般而言,上游指基因克隆、细胞培 养等的产物表达工序,下游指从表达有H的产物的复杂的混合液中分离纯化 得到符合要求的H的产物的一系列步骤。美、日、欧等发达国家生物技术产品 丄业化的实践证明:生物技术产品的产业化高度依赖于基因工程下游工序技术 及设备的进步。一、纯化工艺常用衔接技术:1、盐析。常采用硫酸後、硫酸钠盐析,获得的盐析沉淀物在低温冰箱(<-20°C) 中可以长期保存。2、等电点沉淀。

2、根据蛋白质、多肽在等电点时溶解度最小的特点进行。3、有机溶剂沉淀。采用冷的丙酮、乙醇沉淀蛋白质。例如人血浆蛋白的乙醇分 级沉淀。4、透析。根据目的蛋白质、多肽的分子量,选取适宜的透析袋进行透析,可以 起到更换缓冲液以及去除一些低分子杂质的目的。5、超滤。根据目的蛋白质、多肽的分子量,选取适宜截留分子量(MWcutoff)的 超滤膜进行超滤。6、真空冷冻干燥。利用在低温和高真空条件下,冰不经融化为液态水而直接升 华为水蒸气的原理。可以很好地浓缩样品和保存蛋白质、多肽的生物活性。7、变性沉淀。根据LI的蛋白质、多肽对于温度或者酸碱性的耐受性,在较高的 温度或者较极端的pH条件下处理样品,使杂质去除

3、的方法。例如胸腺肽制备 中使用的热变性(80°C)去除杂蛋白。如果的蛋白、多肽本身热稳定性、酸碱 稳定性不高则不宜采用。8、离心沉淀。利用离心沉降力将不溶性颗粒物与溶液分离的技术,常采用高速 冷冻离心机进行。9、脱盐。透析、超滤可用于进行脱盐,Sephadex G25> G50常用于蛋白质脱 盐。10、过滤澄清过滤、除菌过滤(微米膜过滤)、超滤(1000-300000道尔顿)二、蛋白质、多肽液相色谱纯化方法简介chromatography,色谱,层析表1常用的液相色谱纯化方法及其原理方法分离原理??基于凝胶过滤(GF)?分子大小/形 状??分子形态离子交换色谱(IEX) ?分子

4、所带电荷??Asp、Glu、Lys、Arg> His 等带电氨基酸疏水作用色谱(HIC) ?表面疏水性??Trp、Phe、lie、Leu、Tyr> Pro Met> al、Ala等疏水性氨基酸反相色谱(RPC)?表面疏水性??Trp、Phe、lie、Leu、Tyr> Pro、Met、 al、Ala等疏水性氨基酸金属螯合色谱(IMAC)?分子与金属形 成配位键??His、Trp、Cys亲和色谱??特异生物识别 作用??抗原-抗体,酶-底物,酶-抑制剂等共价结合色谱??共价结合??疏基(Cys)1、纯化的一般标和方法首先,自然来源或者重组表达的蛋白质经过一些粗提的步骤(例如

5、:匀浆、离 心、硫酸饮沉淀等)成为稳定的可以用于色谱分离的样品。然后进行捕获色谱(capture chromatography),主要LI标是浓缩和去除大量的 容易去除的杂质,此步最关心的是流速和载量,常采用高载量、快流速凝胶。经过浓缩的部分纯化的样品进行中级色谱(intermediate chromatography) , LI 的是去除较难去除的杂质,此步最关心的是分辨率,常采用高分辨率的细颗粒 凝胶。最后为了得到符合要求的最终产品,去除残存的杂质以及LI的蛋口的多聚物或 者降解片断,进行精制色谱(polishing chromatography),常采用具有高分辨 率的凝胶过滤凝胶进行凝

6、胶过滤色谱。2、纯化前的准备工作(1)样品稳定性试验a、测定样品在pH 2-9的稳定性;b、测定样品在0-4 mol/L NaCl及0-2 mol/L硫酸钱中的稳定性;c、测定样品在0-50%乙醇、甲醇中的稳定性;d、测定样品在4-40°C的稳定性;e、室温下静置过夜,测定对蛋口水解酶的稳定性。(2)样品预处理a、去除样品中颗粒物(微米膜过滤或者10000 g离心15分钟)b、去除样品中脂类(10000g离心15分钟或有机溶剂抽提)c、去除样品中核酸(加入核酸酶消化或者使核酸沉淀)d、抑制样品中蛋口水解酶(加入蛋口酶抑制剂、低温下快速第一步分离或在蛋 白酶缺陷宿主中表达重组蛋白)表2

7、样品中有害杂质及去除办法杂质??害处??预防措施颗粒 物?堵塞柱子,增大反 压力??微米膜过滤;10000 g离心10-15分钟;细胞匀 浆,4000-5000 g离心30分钟。脂类??封闭介质配基、导 致沉淀、导致非特异 吸附??10000 g离心10-15分钟;若目标分子稳定,用有 机溶剂抽提核酸??高粘度、封闭介质?加入核酸酶消化,或使核酸沉淀结合位点?蛋白酶降解目的蛋白??加入蛋口酶抑制剂:用亲和色谱除去蛋白酶;快速 进行第一步分离;低温下进行分离;在蛋口酶缺陷 的宿主中表达重组蛋白山于不同的色谱方法的原理不同,其对样品的要求也不相同,所以必须在进行 色谱之前,根据特定色谱方法的要求对

8、样品进行进一步的处理。如下表所示:表3不同色谱方法对于样品的要求样品参 数??离子交换色谱??疏水作用色谱??凝胶过滤色谱样品体 积??无限制??无限制?? 一般柱体积的1-5%样品量??最大理论载量的10-20%?最大理论载量的10-20%?仅受到样品粘度 限制样品粘 度??约 <50mg/ml?约 <50mg/ml?约 <50-100mg/mlpH值/ 盐浓度??同平衡缓冲液(低 盐)??同平衡缓冲液(高 盐)??仅受介质与样品 稳定性限制有机溶 剂??为减少非特异吸附,可加 入有机溶剂(30%)?分离后,可用有机 溶剂进行清洗??仅受介质与样品 稳定性限制(3)样品的保

9、存条件:短期储存(小于24小时)a、避免接近或超过样品的稳定极限防止蛋口质变性或沉淀b、在密闭容器中冰箱冷藏较长期储存(数天)8、b、同上C、加入适当的抑菌剂长期储存a、同上b、冰冻或者最好冻干(真空冷冻干燥)保存。3、对每一纯化步骤的评价相关方法的建立a、目的蛋口含量测定酶活性测定、生物活性测定、放射免疫、酶联免疫、免疫电泳、荧光。b、总蛋白含量测定紫外吸收法、Lowry法、Bradford染料结合法(考马斯亮兰G-250)等。c、样品复杂度检测HPLC (离子交换、凝胶过滤、反相)、SDS-PAGE.等电聚焦、毛细管电泳(CE)。4、蛋白质的来源(1)天然蛋白:天然产物中的目的蛋白一般含量

10、很少而且组分极复杂,在分 离过程中须采用多个步骤才能去除各种杂质,并应在整个过程中降低蛋口水解 酶的活性。(2)重组蛋白:重组蛋白则H标蛋白的丰度较高。重组蛋白主要有三种表达 定位:a、细胞质:在这种惜况下,必须破坏细胞结构才能得到口的蛋口质,同时伴随 着大量核酸和其它上千种宿主蛋白质的释放;在表达量较高的条件下,一般形 成包涵体,包涵体含有过表达LI的蛋白,且容易通过高速离心分离,但是包涵 体的溶解与复性是较复杂的。b、外周质:表达的蛋白质存在于细菌内膜与外膜之间,这样H的蛋白可以较 少地受到蛋白酶的作用并减少了宿主蛋白的污染。C、分泌到培养基:这种表达一般蛋口质浓度较低,主要受到培养基中的

11、污染。表4不同来源的蛋口质样品概述来源目的蛋 白含量??复杂度??杂质类型??色谱前预处理天然??低??复杂?固体颗粒,杂蛋 白,核酸,蛋白 酶??去除固体颗粒与核 酸,抑制蛋白酶重组/细 胞质??较高?复杂?细胞碎片,宿主蛋 白,核酸,蛋白酶??去除固体颗粒与 核酸,抑制蛋口酶包涵体?很高?低主要为目的蛋白?高速离心分离,溶 解、复性?外周 质??高??中等?宿主蛋白,蛋白酶?去除固体颗粒?分泌??低?低,主要含 培养基蛋白?培养基,蛋口酶, 宿主蛋白??去除固体颗粒,抑制蛋白酶三、常用液相色谱纯化方法1、凝胶过滤(gel filtration, molecular siee chromat

12、ography 分子筛、size exclusion chromatography 大小剤乍阻色谱,gel permeation chromatography 疑月交渗 入色谱)。根据分子大小和形状进行分离的一种方法,分子量(Stroke半径)较大的先出 峰,分子量小的后出峰。最常用的经典凝胶为Sephadex G系列,此外还有 Sephacryl> Sepharose% Superose、Superdex等凝胶系列。凝胶过滤法方法简 单、重现性强,目前广泛应用。凝胶过滤具有很多不同分离范围的凝胶系列供选择。要点:采用细长(L/D20)的柱、选择合适的凝胶、上样体积较小、流速较慢。表5常

13、用凝胶过滤用凝胶及其基本参数系列??名称??分离范围??颗粒大小??应用Superdex prep grade系列??Superdex 30PG?小于 10000?2444 微术??小肽Superdex75PG?7300070000?2444 微米??一般蛋白Superdex200PG?10000600000?2444 微米??单抗、大 分子蛋白Superose 系 列??Superose6PG?750005000000?20-40 微 米??蛋白、多 糖、核酸、 病毒?Superose 12PG?1000300000?20-40 微米?蛋白、多 糖、核酸Sephacryl HR 系列??Se

14、phacryl S-100?7100010000?25-75 微米??肽类、小蛋口SephacrylS-200?75000250000?25-75微米?一般蛋白SephacrylS-300?7100001500000?25-75 微 米??抗体等较 大蛋白?Sephacryl S-400? ?25-75 微 米??多糖、蛋 白多糖、月旨 质体?Sephacryl S-500? ?25-75 微 米??<1078bp 的DNA片 断?Sephacryl S-1000?0?40-105 微 米??<20000bp 的质粒、巨 大多糖、病 毒Sepharose FF 系列??Sephar

15、ose 6 FF?100004000000?45165 微 米??质粒、病毒?Sepharose 4 FF?60000?45165 微 米??病毒, rHBsAg 等 巨大分子Sepharose xB (CL-xB )系 列??Sepharose 2B?70000?60-200 微米??大分子复合物?Sepharose 4B?60000?45-165 微 米??病毒等大分子?Sepharose 6B?100004000000?45-165 微大分子米?Sephadex LH 系列???Sephadex LH20?100-4000?730-100 微 米??天然产物?Sephadex LH60?

16、400-20000?40-120 微 米??天然产物Sephadex 系 列? ?Sephadex G-10?小于700?740-120?脱盐及更 换缓冲液用SephadexG-15?小于1500?40-120?Sephadex G-25 coarse?1000-5000?100-300Sephadex G25 medium?1000-5000?50-150?小蛋白、多 肽的分离Sephadex G-25 fine?1000-5000?20-80?Sephadex G25 superfine?1000-5000?10-40?Sephadex G-50coarse?1500-30000?100-

17、300?Sephadex G-50 medium?71500-30000?50-150?般蛋白的 分离Sephadex G50 fine?1500-30000?20-80?Sephadex G-50 superfine?1500-30000?10-40?Sephadex G75?3000-80000?40-120?Sephadex G-75 superfine?3000-70000?10-40?Sephadex G-100?4000-150000?40-120?较大蛋白 的分离Sephadex G-100 superfine?4000-100000?10-40?Sephadex G-150?5

18、000-300000?740-120?大蛋白的 分离Sephadex G-150 superfine?5000-150000?10-40?Sephadex G-200?5000-600000?40-120?大蛋白的Sephadex G-200 superfine?75000-250000?10-40?分离2 离子交换色谱(ion exchange chromatography)蛋白质、多肽均属于两性电解质,在缓冲液pH小于其等电点时,带净正电 荷,而在缓冲液pH大于其等电点时,带净负电荷。阴离子交换凝胶本身带有 正电荷基团,阳离子交换凝胶本身带负电荷基团。III于静电相互作用而使样品 结合到凝

19、胶上,再采用盐浓度梯度或者更换缓冲液的pH值进行洗脱对于等电点小于的酸性蛋白质,推荐使用阴离子交换,对于等电点大于的碱性 蛋白质,推荐使用阳离子交换。两种模式:一种使LI的蛋口结合凝胶,通过梯度洗脱;一种使LI的蛋白不结合 凝胶,而大部分杂质结合凝胶,则穿过液中含有目的蛋白。column chromatography (柱色谱)batch chromatography (批色谱)c、疏水作用色谱利用蛋口质、多肽在高盐存在下,可以结合疏水凝胶,而在盐浓度降低时乂可 以解脱的原理实现分离。d、亲和色谱利用蛋白质、多肽与某些配基的特异性相互作用而进行分离。例如:酶-底物, 酶-抑制剂,糖蛋口-凝集素

20、,抗原-抗体等。近来发展了金属螯合亲和色谱,用 于纯化表面含色氨酸、酪氨酸、组氨酸等的蛋口质以及(His)6-tagged &组蛋 白。亲和色谱分为特异性亲和色谱和组别亲和色谱两类。肝素、凝集素、染料、金 属螯合亲和色谱均为组别亲和色谱(同一配基可以结合许多种蛋白质)。e、反相色谱常用于蛋白质、多肽的HPLC分析,以及多肽的精细制备分离,分辨率极高,可 以分离两种仅相差一个氨基酸的多肽。如血管紧张素(angiotensin)的儿个亚 型通过反相色谱可以很好地分离。同一个样品在同一 Source 30 RPC柱上进行分离,由于色谱条件进行了改变,色 谱图截然不同,说明反相色谱具有高度的选

21、择性。四、应用举例例一、一种抗HI gpl20单克隆抗体的Fab片断(中表达)分子量:50 kD等电点:11表达定位:周质(periplasmic)纯化策略:渗透压休克提取周质,阳离子交换去除大部分杂质,疏水作用色谱 进一步去除杂质,最后用凝胶过滤分离。例二、重组表达的*淀粉酶分子量:kD;等电点:6先采用阴离子交换,再进行疏水作用色谱,最后进行凝胶过滤。例三、重组表达的乙型肝炎表面抗原的分离1、史克公司:(酵母细胞表达)破碎细胞,表面活性剂抽提,离心沉淀、超滤,再经凝胶过滤、阴离子交换, 超速离心纯化,脱盐,除菌过滤,吸附,分装。2、Merck公司:(酵母细胞表达) 破碎细胞,去碎片,抗原用

22、多孔硅玻璃吸附,洗脱,凝胶过滤,屮醛处理,明 矶吸附,疫苗。3、巴斯德研究所:(CHO细胞表达)培养上清液,离心去碎片,50%硫酸钱沉淀,离心,50%KBr处理,脱盐、超滤 浓缩、Sepharose CL-4B凝胶柱分离。4、Below, M. Bioseparation. 1(1991). 397 工艺破细胞,去碎片,加硫酸钱至一定浓度后,直接上Butyl-Sepharose 4 FF疏水 柱,脱盐后上DEAE-Sepharose FF,超滤浓缩后上Sepharose 4 FF凝胶过滤柱。例四、尖吻蝮蛇毒凝血酶样酶的分离(注射用降纤酶)分子量:38 kD;等电点:原工艺:阴离子交换,凝胶过滤

23、,第二次阴离子交换,凝胶过滤达到95%以上纯度,产量6000-10000单位/克蛇毒。俩周)新工艺:亲和色谱,阴离子交换,凝胶过滤,亲和色谱(一周)纯度达到以上,产量达20000-25000单位/克蛇毒。尖吻蝮蛇毒经过五个步骤的分离纯化后,获得了单成分降纤酶组分,电泳为一 条带,HPLC为单峰。如上图所示,由于每一个步骤均会带来一定的损失,故在可能的情况下应尽量 减少下游纯化的步骤(在保证达到所需纯度的前提下)。重组蛋口纯化的基本策略一、融合表达蛋口的纯化:融合表达蛋tl可以在原口标分子之外带有GST肽段或(His) 6肽段,从而使得 可以分别用Glutathione Sepharose凝胶或

24、Chelating Sepharose凝胶进行亲和色 谱分子,一步可以达到90%的纯度,经过特异蛋白酶切后,再进行离子交换及 高分辨凝胶过滤一般便可以达到所需的纯度(9599%) o二、包含体表达蛋口的纯化:在系统表达重组蛋白,表达量高时,常形成包含体,包含体易于与细胞其他组 分分离,但需要注意的是蛋口复性的步骤。一般采用盐酸弧溶解包含体蛋口 后,用稀释的办法进行复性,也可以利用凝胶过滤色谱进行复性(已有多种凝 胶可以促进蛋白质的复性的报道)。以下以rhGM-CSF (重组人粒细胞-巨噬细 胞集落刺激因子)的下游纯化工艺为例:细胞,超声破碎,离心收集包含体,用7mol/L盐酸弧溶解包含体蛋口,

25、作1: 70稀释使蛋白复性,加硫酸鞍至一定浓度后,上样于Phenyl-Sepharose 6 FF(high sub)色谱柱,活性组分再上Q-Sepharose FF进彳亍离子交换,最后上 Superdex 75 prep grade凝胶进行凝胶过滤色谱,最终获得了纯度较高的rhGM- CSF, 同时,DNA及内毒素去除率均很高。如下表所示:步骤??体积(ml)? 蛋白(mg) ?内山素(EU/ml) ?DNA(pg/ml)起始(复性样品)??4344?490?421?180HIC疏水柱?880?220?243?AIEX阴离子交换??620?88?251?GF凝胶过滤??1045?62?9 三

26、、周质表达的蛋口的纯化:可用渗透压休克方法,使周质释放,然后利用扩张床技术将含有菌体的悬液直 接上柱(STREAMLINE系列凝胶),菌体穿过而表达的蛋白上柱。各种色谱的上要影响因素一、凝胶过滤色谱:一般来说,凝胶过滤色谱的结果好坏直接取决于凝胶柱的柱效(每米多少理论 塔板数),而影响柱效的因素主要有:1、凝胶本身性质:每一种凝胶均有其合适的分离范围,应选择合适的凝胶进行分离。同样分离范 围的凝胶颗粒越细的,柱效越高。2、色谱柱装填的好坏:凝胶过滤色谱柱装填完后,一般可以用丙酮(或NaCl)测定柱效和峰对称性, 一般对于平均颗粒直径在3034微米的Superose PG、Superdex PG

27、系列凝胶, 柱效应在9000以上,而颗粒平均直径在90微米的Sepharose FF凝胶柱效应在 3000以上。通常,越是分辨率高的细颗粒凝胶对于装柱的技术要求越高。除了柱效以外,影响分离的因素主要有:a、色谱柱的长短,一般较长的柱分离较好,L/D>20o但一般商用色谱空柱长 100cm左右,最多可以装到9095cm高左右,如果仍不能取得满意的分辨率, 可以用两根相同的凝胶柱,用SRTC-2接头连接后,可以提高分辨率40%。分离度正比于柱长的平方根。b、样品浓度,在蛋口浓度小于50mg/ml并且粘度小于5cP (厘泊)的条件下, 样品浓度对于分辨率影响较小。c、上样体积:上样体积越小分辨

28、越好,不同的凝胶具有不同的推荐上样体积,如下表:凝胶类型??推荐上样体积(t)Sephadex?2-5%Sepharose?2-5%Sephacryl HR?l-2%Superdex PG?l-2%Superose PG?l-2%Superdex?%Superose?%对于利用Sephadex G25进行蛋口质脱盐的特殊情形,样品量达到柱体积的25% 仍可以保证蛋白与盐分开。d、洗脱流速:般较低的流速下(510cm/h)分辨率较高,但Superdex PG, Sepharose FF等 新型凝胶可以在较高的流速下分离而不致损失分离度。二、离子交换色谱:a、凝胶本身的性质:分辨力 Sepharo

29、se FF<Sepharose HP<Source 30<Sourcel5 (基架)DEAE:弱阴离子Q:强阴离子选择性有差异CM:弱阳离子S:强阳离子选择性有差异b、工作缓冲液的pH值:离子交换依赖于分子所带的电荷,故pH对其影响较大,往往pH的改变就足 以改变色谱结果,具体对于分离某一种蛋白,那一个pH最合适,需要进行大 量的实验摸索。c、上样量:一般保持在结合最大容量的20%以下可以获得较好的分辨率。但对于样品体积 无限制。d、梯度形状:梯度越平缓,分辨率越高,但同时样品越稀。c、流速:影响不大。三、疏水作用色谱:a、疏水凝胶本身的性质:基架:Sepharose FF&

30、lt;Sepharose HP< Sourcel5取代基疏水性:Phenyl苯基、Octyl正辛烷基、Butyl正丁基、Ethyl乙基、Iso异 丙基均不相同,选择性也不同。相同的取代基,不同的取代程度:如Phenyl Sepharose 6 FF (Low sub)与 Phenyl Sepharose 6 FF (High sub)疏水性不同,选择性也不同。b、盐类:一般常使用硫酸镀、硫酸镀,其他盐类也可使用,具体应根据实验情况决定。c、温度:温度升高,疏水作用增强。d、pH值:在接近中性的范围内,影响不大。e、样品体积:无影响。f:流速:在压力许可下,无明显影响。即样品浓度:在粘度不

31、超过5cP下,无影响。h、梯度:较缓的梯度分辨较好。四、一些蛋口质的分子量与Stokes半径:蛋白质??分子量(kD) ?Stokes 半径(nm)乳清蛋白?核糖核酸酶 ?肌红蛋白? 大豆胰蛋口酶抑制剂? 碳酸酹酶?辣根过氧化物歧化酶??40?卵清蛋白??45?血红蛋白(人)? 牛血清白蛋白??70?酵母醇脱氢酶??150?血浆铜蓝蛋白??151?谷氨酸脱氢酶??258?甲状腺球蛋白??670?芜菁花叶病毒??3500?凝胶过滤色谱柱装填完后,一般可以用丙酮(或NaCl)测定柱效和峰对称性, 一般对于平均颗粒直径在3034微米的Superose PG、Superdex PG系列凝胶, 柱效应在

32、9000以上应该这样test儿点补充:1、凝胶柱,假如进行的仅是“组别分离",则不测柱效也没关系,比如采用 Sephadex G-25对蛋白样品脱盐,或者U的蛋白与杂质分子量相差10倍以上。2、需要高分辨的分离,杂质和LI的蛋口相差2倍以下,则柱效高才有分离很好 的把握。3、测量柱效的方法,一般采用1%丙酮或lmol/L NaCl作为样品,进行分离(上 样体积与所用凝胶种类相关),AKTA系列液相色谱仪可以自动在积分后得岀每 米的塔板数。我在做一个包含体复性的蛋口纯化,用的是GST purification Glutathione sepharose 4B.可是发现:在蛋口和凝胶哺育

33、半小时装柱后,我的蛋口还是很多 在没来及用elution buffer,只用pbs洗柱子的时候就脱下来了,不知道是怎么 回事啊,是不是盐浓度太低?儿点补充:1、凝胶柱,假如进行的仅是"组别分离",则不测柱效也没关系,比如采用 Sephadex G-25对蛋白样品脱盐,或者U的蛋白与杂质分子量相差10倍以上。2、需要高分辨的分离,杂质和LI的蛋白相差2倍以下,则柱效高才有分离很好 的把握。3、测量柱效的方法,一般采用1%丙酮或lmol/L NaCl作为样品,进行分离(上 样体积与所用凝胶种类相关),AKTA系列液相色谱仪可以自动在积分后得出每 米的塔板数。液相色谱仪还有塔板数

34、什么的东东是什么样的我用的AKTA的柱子和介质但 好像没有那个东东。另外怎么使一个凝胶柱装的比较好呢比如说superose 12PG , 装的是16*40的柱子! !wenlee wrote,我在做一个包含体复性的蛋口纯化,用的是GST purification Glutathione sepharose 4B.可是发现:在蛋口和凝胶哺育半小时装柱后,我的蛋 白还是很多在没来及用elution buffer,只用pbs洗柱子的时候就脱下来了,不 知道是怎么回事啊,是不是盐浓度太低?你复性后的样品buffer是什么呢?盐浓度应该不会影响binding的。pH 般, 所以常用的pBS都可以bind

35、ing的。在样品加到胶上前,胶需用PBS平衡至少3次,然后再加样品。如果你的样品处理过程或是样品buffer会影响GST-tag的构象,就有可能影响 binding,我的感觉是GST胶效率并不是非常高。你说PBS可以洗下来,那么用GSH的elution buffer洗下来了么跑SDS-PAGE看 目的蛋白在wash buffer里,elution buffer里各占多少呢如果用GSH仍可以洗下来一部分口的蛋白,那么前面的损失可以考虑延长 incubate的时间,或是在上一次胶,如果不结合,那说明这部分蛋白的GST构 象不对,这样就需要考虑你的样品提取以及复性过程是否有要改进的地方了。Amers

36、ham的AKTA系列蛋口纯化仪就是一台中低压的制备色谱仪,包括泵, U/is, pH probe, cond 等组件,流速比 HPLC 的要大很多,purifier-100 和 explorer- 100主要用于实验室规模的制备,有时也可用于某种分析应用,最高压力 lOMpa,用于常规的蛋白质纯化是足够用了。塔板数的概念很容易找到,就是借鉴化工中精馆的思想,把传质的概念运用到 色谱中,这样可以在某种条件下,衡量色谱填装的好坏,也就是柱效的高低, 其实色谱是个经验性很强的东东,而且Acetone测定的柱效并不能完全反映大 分子在柱内的不断分配和平衡,比如腺病毒大分子用XL的胶分离反而比FF和 H

37、P的胶有更高的柱效。AKTA制备层析仪的工作站Unicorn可以根据采集到峰图数据,自动计算塔板 数,非常方便,可以通过HETP和As对于装柱进行指导,还是很有意义的。Bio-Rad也有类似的仪器,还包括早期的phamacia &LKB的仪器,其实原理都差 不多,只是现在做得越来越方便,功能越来越多。你没有仪器,可以用国产的恒流泵或蠕动泵来做,不过前者压力可以较高(北 京卫星厂的可以到8MPa),蠕动泵耐受压力较小。然后接上国产的U和记录 仪来做。测柱效方法是一样的,不过要用尺子在记录纸上量了,加快走纸速度 可以减小误差。也可以买一套较便宜的N2000工作站,带数据釆集卡的,也可以。你

38、的SEC柱用16/40柱子不大合适,短了些,建议用的柱子,至少16/70, 保证较好的分辨率。装柱要先把胶在室温平衡,混匀,脱气后,一次性倒入柱 中,不要有气泡,amersham的录像可以看看作参考。儿点补充:1) AKTAexplorer系列非常适合做工艺开发、中试,甚至是某些产品的大规模生 产。假如某些药一个剂量在ug水平的话。小龙最近开发了某二类新药的大规模纯化工艺,使用AKTAexplorerlOO,年产能 可以达到5001000万剂。2)一般常规液相色谱,凝胶柱需要比较注意装柱效果和柱效,而离子交换柱、 亲和柱、疏水柱、反相柱则一般装均匀就可以了。但是HPLC的反相柱、离子交 换柱等

39、还是柱效越高峰分离越好。3)Superose 12 PG为常规凝胶过滤介质中价格比较高、性能比较好的品种(400多美金/125ml),对于装柱要求比较严格。其比较好的分离范圉为 1000300000 Da (对蛋白,对核酸完全不同),完全排阻分子量为200万。理 论上说这样粒径在30微米左右的胶,每米的理论塔板数达到1万以上才算柱子 装得比较好。装在16/40的柱子内,柱高最多30多厘米(借助装柱器),对于 一般的凝胶过滤来说,柱高稍微短了一些,除非你有把握柱子装得非常好,柱 效非常高,或者分离本身不需要很高的分辨力,否则建议使用较高的柱子,比 如XK16/70或XK16/100o (安玛西亚

40、预装的30厘米高的Superose 12柱,柱高 仅30厘米,不过柱效达到40000/米以上,故分辨能力极佳,可以用于代替一 般的HPLC凝胶柱)5)另外,假若多次试验表明柱子分离你的样品得到很好的分离,纯度满足你的 要求,则无需关心你的柱子柱效是多少,够用就行了。可否见告你所使用什么泵带柱子要分离的U的物和杂质分子量的基本情况谢谢两位的帮助!哇塞,Superose 12 PG那么贵呀,我是从我们科室一大箱 子乱乱的药品中发掘出来的,呵呵,大发现呀!:):)to小龙:泵带柱子?不好意思我不明口是什么,我使用的是那种恒流泵,柱子 是Amersham的带套管的,装好后的确就35cm 了,LI的蛋白

41、是万左右的分子 量,在SDS-PAGE观察的杂蛋白大约万的有几条吧,都很淡,是经过DEAE- Sepharose FF分离后得到的。的确如你所说过了 Superose 12 PG后效果不是太 好!但这个柱子还是借的人家的哪,好象再长的就没了吧,我原来用G75做 过,效果也好差,这样装才能装的好呢? 再次感谢您们的帮助! 按照你说的情况,目的蛋白万,杂蛋白6万,则Superose 12 PG非常不合适, 比较合适的凝胶是Superdex 75 PG (较贵)或Sephacryl S-100 HRoSephadex G-75也是可以的,只是柱效稍低,但是你的问题是柱子咼度太小,最 小也得在6070

42、厘米左右,我一般做凝胶柱都是用柱高100厘米的空柱装到 9095厘米柱床高度。国产的仿制安玛西亚的空柱好像儿口元一根,虽然我感觉不好用,但是装90厘 米总比装30多厘米分辨率要高吧。安玛西亚XK16/100的柱子价格大约数百美元,而且要装好还需要同样需要儿白 美元的装柱器。此外,SDS-PAGE上目的蛋白分子量和杂蛋白分子量差别大,有时不一定凝胶柱 能够分离很好,因为在natie状态,存在分子聚合的很大可能。有条件,你跑一个非还原-SDS-PAGE和natie-PAGE假若口的带和杂蛋白带仍然 明显分开,则凝胶柱分离分开的可能就很大了。你说12 PG的分离范圉对于我的蛋白的情况不适合是吗G 7

43、5的流速要求是不是 非常低16mm内径的柱子,流速才左右对吧(3cm/h)柱高75cm左右的话一个柱 体积岂不要25个小时! !以前我用G75的时候没有注意流速的要求,可能都 达到了 15cm/h 了吧,流速的要求很严格吗多谢您多次的帮助!Sephadex G-75流速达到1015cm/hour,只要你的泵能够达到这个流速并保持 稳定,此外柱床高度保持稳定(柱顶不被压下),则是可以接受的(分辨力可 能稍有下降)。其说明书介绍的最大线流速为77cm/h,当然可能是在很低的柱床高度下测定 的。假如是Sephadex G75 superfine,则流速要低许多。假如采用自然流速,一次典型的凝胶柱分离

44、耗时十儿20小时是很正常的。我的经验Superdex 75 PG,流速达到2030cm/hour,分辨率尚很好。你好小龙,请问你是否知道关于Dextran T70的一些常识,看着包装是 phamasia的,但查了法马西亚的资料档案,没有Dextran T70的说明书。我的 蛋白情况和liugy04的很相近,(訂的蛋白万,朵蛋口 45万左右,)不知道 用Dextran T70合适不合适Dextran T70不是用于分离纯化蛋口质的。据我手头的少许资料来看,他是一种 平均分子量为70000左右的Dextran (由部分水解后分离得来)。其用途基本为:"For use as media s

45、upplements* in enhancing rosette formation, in enhancing immune precipitation and in cryoprotection of cells".大约是一种细胞培养使用的培养基添加物。我没有使用过。具体你可到安玛西亚的网站上搜索其使用说明书。 你的H的蛋tl万,杂蛋白主要45万,假若H的蛋口在natie状态下不形成二聚 体,应该还是可以较好分离的。凝胶可以选用Sephadex G-75 (最便宜)、 Sephacryl S-100 HR Superdex 75 PG (最贵)。你应根据你实验室的具体条件来选择最合适的凝胶(性价比)。1KD 等于 1000 dalton.我的意思是:以Sephrose CL4B为例,测定某个大分子的KD值KD=(e-o)/(t-o)假 如说KD二时的分子大小是多少Dal

展开阅读全文
相关资源
猜你喜欢
相关搜索

当前位置:首页 > 社会民生


经营许可证编号:宁ICP备18001539号-1