一代测序结果峰图的基本知识.docx

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1、一代测序结果峰图的基本知识1、一代测序结果测序公司发送的测序结果一般有一个峰图文件和一个序列文件,峰图文件为ABI格式,用chromas软件(网上可下载)打开。峰图用卜种颜色的波形代表四种碱基的信号强度;正常的峰图,波峰与波谷清晰,峰与峰之间的距离均匀;比较理想的测序结果在底部应该 有杂峰干扰;的+的 享常曲 诚杵即 1=等寓 明派在 表与麋 代舞专 3 的海的 色塔黑 商争耳 国五比度之塔 摄埠以 一,身有2、起始序列说明 1)测序结果的前几十bp不能用(下图中黄色区域标出的区域),在拼接序列或序列比对时需要先去除这部分不太可靠的数据,以免影响分析结果;2)在使用PCR引物测序时由于PCR引

2、物上的碱基是不带染料的,所以检测不到信号,在测序结果中也找不到引物的序列,如连接川到载体使用载体上的通用引物测序则可以找到 PCR引物;他净门果叫我几-1年刊征用空的是、修意包口阴北匕的芷量用吊片,叫同口再比;叶茗先工阵辽和评工”根.以.*葡州-珀解峭PGR产恻触T时由于FCR引的工时发基是不等!都折喇蚓卷徜号. 荏厘FM畀中砒K到中期的不刑.忸孟斐为契博曼邛卷心r:i#用引物剧序如可以让到7CEqti.3、有效读长测序公司给出的峰图在10001200bp之间,但超过800bp后的各种波之间有重叠,波峰有钝化现象,碱基与碱基间的距离有时突然加大(此图中的812bp813bp ),这些现象都会影响结果的准确性,所以只能做为参考.所以说有效片段为800bp左右.-V .;善胃带墓费.莅坛有好化现象,侬与格河的距胃音时夹愁 刘大(就图甲船初飞,辽些现事群皆孰津鼎的理梅 性r肮瞅江Ife做F翱/朋或说为岐片假海通法石.4、SNP位点SNP位点为纯合时成单峰,若主杂合子时,会形成套峰现象;测序公司给的结果序列文件通常只读主峰 一一即序列文件不会报告SNP

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