常见提取总DNA,RNA的方法与注意事项.docx

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1、常见提取总DNA, RNA的方法与注意事项-CAL-FENGHAL-(YICAI)-Company One 1提RNA,可是电泳后什么条带都没有,用的是REDzol,是因为细胞太少了还是别的什么原因,在加了氯仿后没有出现3层,只有沉淀和上清,是不是因为加氯仿到离心隔的时间太久了?参考见解:1、样品量太小;2、操作时没有严格按照提RNA的要求做,一般需要带手套,最好带 上口罩,所有塑料用品需要用DEPC处理并高压,要在超净台上 操作, 尽量不让外源的RNA酶降解RNAo3、RNA电泳的电泳液和胶必须现配现用,并且要用DEPC处理,电泳 槽、制胶板先用蒸馅水洗涤然后用75%的酒精处理,还有,要单独

2、一个槽子跑,不要和其他胶一起跑。跑胶时间控制在10分钟左 右。4、在加了氯仿后没有出现3层,只有沉淀和上清,可能是加的氯仿 量不合适,一般是按氯仿/mlTrizol加氯仿的。从加氯仿到离心隔的时 间对这个应该没有影响。5、在提完RNA后可以测OD值,如果OD值在之间,说明提的RNA 比较纯。RNA提取可不可以不用DEPC处理,多次灭菌(而不是长时间灭 菌) 也可以比较有效地灭活RNAse,这种方法确实可行吗?参考见解:DEPC主要目的是防止RNA酶,其实还有很多其他的方法处理器皿的,如氯仿冲洗,NaOH处理,高温烘烤等另外两次灭菌也可以代替DEPC处理提RNA的关 费在于:防止内源性或外源性R

3、Nase降 解RNA对付外源性RNase有两种办法:能烤者烤,能泡者泡。比起其他的核酸实验来说,就多这么一步。其二、RNase分子内部存在二硫键,一般条件变性后很快即可复性,所以极为稳定;而且 其作用 条件“简单、快捷 一一与绝大多数DNase不同,不需要二价阳离子即可迅速发挥酶切作用。所以,要想长期保存RNA标本,DEPC处理溶液、Tip头等都是必不可少的。RNase一般高压不能灭 活,如果不用DEPC的话,快速提取,快速使用,不能贮藏。3 个关于乙醇单词:ethanol; alcohol; mercaptoethanol,他们的主要区别是什么,可以互相代替吗?参考见解:ethanol是乙醇

4、的专业名 词,是用在医学,工业等方面,主要是指工业酒精。alcohol也是乙醇,酒 精的意思,但是主要是用 在饮食行业的名词。mercaptoethanol是蔬基乙 醇,不同于前两种,是另外一种物质,是一种还原剂。RNA提取中DNA是怎么去掉的在哪一步呢?参考见解:在加入氯仿离心吸取上清的时候,注意不要吸到中间层。一般都要用DNase处理,即使吸不到中间层,也可能有DNA污染。组织已经低温保存了一年多了,用来提RNA可以吗?参考见解:液氮中保存应该可以,但如果是在 70C低温冰箱中则可 能降解,建议在液氮中保存时尽量将组织块切小,最好直径在1CM之内,有利于保存并方便下一步RNA提取操作。当然

5、如果条件允 许,可以将组织块放入RNAIater后低温保存,只要普通冰箱即可,方便且效果很好。提取血细胞的RNA,但血凝很快,应该注意什么问题是不是要加EDTA用什么方法会更好?参考见解:全血提DNA或RNA要用抗凝血,可以用医院里采血管,里面 已经加 了抗凝剂,或是自己配EDTA、ACD等来抗凝。EDTA抗凝用%的溶液,与 血液之间体积比一般是1: 10 OACD配方:单结晶水柠檬酸(分子量),柠檬酸三钠(分子 量),单结晶 水D 葡萄糖(分子量),顺次溶于蒸馆水中,定容 至1000ml,过滤除 菌。分装后一 20七保存。抗凝血要用淋巴细胞分离液分离,得到单核细 胞后,再加入trizol等提

6、取RNA,步骤可按 试剂盒操作进行。如果不分离单 核细胞,血里面的红细胞对提取有影响,把红细胞破坏掉也可以。7采用淋巴细胞分离液分离外周血中的有核细胞,经细胞裂解液处理, 上清提取RNA,沉淀提取DNA,用分离液分离所得红细胞沉 淀制备血红蛋白 溶液。本法能从少量外周血中同时分离RNA、DNA及血红蛋白,高效易操 作,值得推广。怎样能更有效的降低材料的降解?参考见解:1、新鲜细胞:如果试剂没有问题,且外源性污染也可以排除,那么降解 几乎都来自裂解液的用量不足。如果将裂解液直接加入培养皿中裂解细胞,定要使裂解液能覆盖住细胞。2、新鲜组织:某些富含内源核酸酶的样品(如肝脏,胸腺等),即使 使 用电

7、动匀浆器匀浆也不能避免RNA的降解。更可靠的方法是:在液氮条 件下将组织研碎,并且匀浆时使用更多裂解液。3、冷冻样品:样品取材后应立即置于液氮中速冻,然后移至 70七冰箱保存。样品决不能未经液氮速冻而直接保存于 70七冰箱中。冷冻样 品,即使是冷冻细胞,如果不在液氮条件下研磨碎,而直接加入裂解液中 匀浆,RNA也比新鲜样品更容易降解。样品在与裂解液充分接触前决不能 出现融化,所以研磨用具必须预冷,在碾磨过程中要及时补充液氮。样品 研碎后,在液氮刚刚挥发完时,将样品迅速转移到含裂解液的容器中,立 即混匀匀浆。4、外源RNA酶的污染:试剂,器械及实验环境中的RNA酶进入实验系 统。5、内源RNA酶

8、的污染:抑制剂失效或者用量不够,实验样品过多;匀浆 时温度过高。OD260/OD280比值偏低?参考见解:1、蛋白质污染:确保不要吸入中间层及有机相。减少起始样品量,确保 裂解完全、彻底。加入氯仿后首先要充分混匀,并且离心 分层的离心力和 时间要足够。如果所得RNA的OD260/OD280比值 偏低,则用氯仿重新抽 提一次,再沉淀,溶解。2、苯酚残留:确保不要吸入中间层及有机相。加入氯仿后首先要充分混 匀,并且离心分层的离心力和时间要足够。3、多糖或多酚的残留:一些特殊的组织和植物中,多糖、多酚含较多,这些残留也会导致。D260/OD280比值偏低。因此,从这 类材料 中提取RNA时,需要注意多糖、多酚杂质的去除。4、设备限制:测定OD260及OD280数值时,要使OD260读数在 之间。此范围线性最好。用水稀释样品:测0D值时,对照及样品稀释液请使用lOmMTris,。用水作为稀释液将导致比值偏低。RNA提取得率低?参考见解:1、该组织或者细胞中RNA含量偏低:不同细胞和组织中RNA的丰度不同,如肝脏,胰腺,心脏等是高丰度组织(总RNA含量24Pg/mg),脑,胚胎,肾脏,肺,胸腺,卵巢等是中丰度组织(总RNA含量pg/mg),膀胱,骨,脂肪等是低丰度组织(总RNA含量pg/mg)o

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