蛋白酶催化蛋白质水解.doc

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1、蛋白酶催化蛋白质水解1、酶的重要性生命的最主要、最基本的特征在于生物体的新代谢,具体表现 为活体经常由外部摄取所需要的物质,以生物能为动力,经过体同 化、更新、异构化,并排出一些物质,发散热能至外界。机体或单 个细胞的所有这些化学反应,基本上是在催化剂作用下完成的。酶 是人体新代谢的催化剂,只有酶存在,人体才能进行各项生化反 应。人体酶越多,越完整,其生命就越健康。当人体没有了活性 酶,生命也就结束。人类的疾病,大多数均与酶缺乏或合成障碍有 关。2、酶的生物学功能在生物体,酶发挥着非常广泛的功能,具体功能如下:(1) 信号转导和细胞活动的调控都离不开酶。特别是激酶和磷 酸酶的参与。(2) 酶也

2、能产生运动。通过催化肌球蛋白上 ATP的水解产生肌 肉收缩,并且能够作为细胞骨架的一部分参与运送胞物质。(3) 参与在动物消化系统的工作。以淀粉酶和蛋白酶为代表的 一些酶可以将进入消化道的大分子(淀粉和蛋白质)降解为小分 子,以便于肠道吸收。淀粉不能被肠道直接吸收,而酶可以将淀粉 水解为麦芽糖或更进一步水解为葡萄糖等肠道可以吸收的小分子。 不同的酶分解不同的食物底物。(4)在代谢途径中,多个酶以特定的顺序发挥功能:前一个酶 的产物是后一个酶的底物;每个酶催化反应后,产物被传递到另一 个酶。有些情况下,不同的酶可以平行地催化同一个反应,从而允 许进行更为复杂的调控:比如一个酶可以以较低的活性持续

3、地催化 该反应,而另一个酶在被诱导后可以较高的活性进行催化。酶的存 在确定了整个代谢按正确的途径进行;而一旦没有酶的存在,代谢 既不能按所需步骤进行,也无法以足够的速度完成合成以满足细胞 的需要。实际上如果没有酶,代谢途径,如糖酵解,无法独立进 行。例如,葡萄糖可以直接与 ATP反应使得其一个或多个碳原子被 磷酸化;在没有酶的催化时,这个反应进行得非常缓慢以致可以忽 略;而一旦加入己糖激酶,在 6 位上的碳原子的磷酸化反应获得极 大加速,虽然其他碳原子的磷酸化反应也在缓慢进行,但在一段时 间后检测可以发现,绝大多数产物为葡萄糖 -6- 磷酸。于是每个细胞 就可以通过这样一套功能性酶来完成代谢途

4、径的整个反应网络。3、酶的分类酶可分为二类,第一类是所谓的单纯酶,其催化活性仅由酶蛋 白提供;第二类称为结合酶,除了蛋白质外,还需含有其他成分才 呈现催化活性。这些成分包括无机离子,Fe卄、Zn卄.Mn卄等或有机化合物,如硫胺素焦磷酸、黄素腺嘌呤二核苷酸等。这些化学组 分称为辅助因子,这类化合物称为辅酶。这类酶也称为全酶。按国际生化会的规定,将现已分离得到的 2000 多种酶按所催化 的反应类型分类,可分为以下六种。(1) 氧化还原酶用于催化氧化 - 还原反应和加氧反应、脱氢反应,如葡萄糖氧化 酶等。(2) 水解酶用于催化水解反应,包括酯、酰胺、肽和其他含 C一键的化合 物以及酸酐和糖甙等。如

5、淀粉酶、蛋白酶、脂肪酶、果胶酶、核糖 核酸酶及纤维素酶等。(3) 异构酶用于催化多种类型的异构化反应。 、如双键位移、顺反异构和消 旋化反应。如葡萄糖异构酶等。(4) 裂解酶用于催化C一 C C一 0、C一 N键裂解反应。如脱羧酶等。(5) 连接酶也称为合成酶。用于催化形成 C一 C C一 0、C一 N键以及磷 酸酯键。这类酶一般指有腺苷三磷酸(ATP)参加的合成反应,关系着 许多重要生命物质的合成、 ,如蛋白质、核酸等。4、蛋白酶4.1 蛋白酶的基本信息中文名称 :蛋白酶 ( 枯草杆菌 )中文别名 : 蛋白酶 A.S1398; 枯草溶菌素 ; 蛋白酶 2709; 蛋白酶 A.S 1398;英

6、文名称 :bacillopeptidaseb4.2 蛋白酶的定义蛋白酶又称蛋白水解酶,是催化肽键水解的一类酶。其参与了 生物体的多种生物过程。它们不仅能催化底物水解,更能调节蛋白 质的定位与活性,调节蛋白质与蛋白质的相互作用,参与胞信号传 导以及新的生物活性分子的生成。4.3 蛋白酶的分类(1) 按其水解多肽的方式,可以将其分为肽酶和外肽酶两类。 肽酶将蛋白质分子部切断,形成分子量较小的短肽。外肽酶从蛋白 质分子的游离氨基或羧基的末端逐个将肽键水解,而游离出氨基 酸,前者为氨基肽酶后者为羧基肽酶。( 2)按活性中心可将蛋白酶分为四类 : 丝氨酸蛋白酶、天门冬 氨酸蛋白酶、半胱氨酸蛋白酶、金属蛋

7、白酶。(4)按其反应的最适pH值,分为酸性蛋白酶、中性蛋白酶和碱性蛋白酶。4.4 蛋白酶的应用(1) 蛋白酶用于洗涤剂。(2) 蛋白酶用于制革工业。(3) 蛋白酶在裘皮工业上的应用。(4) 蛋白酶用于明胶工业。(5) 蛋白酶用于丝绸脱胶。(6) 蛋白酶在食品工业上的应用。5、蛋白酶催化蛋白质水解机理5.1 酶与底物间的作用力在酶催化过程中,酶与底物之间普遍存在着三种力。即离子 键、氢气和德华力。离子道指的是底物上的一个带电荷的基团与酶 上一种带相反电荷的基团间的静电作用。如带负电荷的底物能与带 正电荷的精氨酸或赖氨酸残基上带正电荷的侧链形成离子健。氢键 则存在于底物和酶蛋白的两个负电性较大的原

8、子之间。德华力指两 个原子相间 0.3-0.4nm 的普遍存在的一种非专一性的吸引力。尽管 这种力很小,但对于以水溶液为介质的酶催化反应来说,却是十分 重要的。5.2 酶催化的基元反应酶催化反应可以分为广义酸碱催化、共价催化和金属离子催化 几类。在酶催化过程中有的酶是作为一个质子供与体或质子受体促 进反应速度的,称为广义酸碱催化。如羰基加成为酮基和烯醇的互 变异构、酯的水解和氨解等反应就属于广义的酸碱催化反应。当酶 与底物形成的酶 -底物共价化合物 (或复合物 )是由酶上带有亲核电子 进攻底物形成时,称为亲核催化;反之,由酶上带有亲电基团进攻 底物形成时,则称为亲电催化。胰凝乳蛋白酶是通过亲核

9、机理实现 水解肽健的过程,而以磷酸吡哆醛为辅酶的天门冬氨酸基转移酶、 丙氨酸消旋酶则是通过亲电机理进行的。以金属离子为辅酶的酶催 化剂,金属离子参与催化的作用与酸相似。此外金属离子有络合效 应,可将底物固定到酶上。第一步、多肽碎片 (底物) 被酶特殊部分以氢键、静电引力、非极性基团作用等方式固定。这些部位还有其催化作用的氨基酸侧链。第二步、底物Gly基羰基取代原本含Zn2+的活性中心的配体水 分子、羰基向中心与底物羧基成盐、羟基与底物肽键 -NH-形成氢键 固定、减弱N-C间电子云密度。第三步、配位后活化的羰基受到侧 基羧基的亲核进攻,肽键断裂,从附近羟基取得氢成氨基酸。侧基 羧基形成混酐,水

10、解。第四步、水解产物脱离。6、酶催化反应的特点61 降低活化自由能从本质上讲,酶催化同化学催化一样,是通过改变反应机理起 降低活化自由能的作用。在韭催化条件下进行的化学反应,反应物 一般都要越过一个较高的能峰,才能完成反应,如果反应物没有足 够的部能量,使其跃迁到这个能峰,反应就无法进行。采用化学催 化剂催化反应进行时,由于催化剂能与反应物 (底物)或产物形成某 种过渡状态,从而改变反应途径,降低反应所需的活化自由能。酶催化同化学催化一样,只降低从反应物到过渡状态所需要的 活化自由能,但不改变反应中总的自由能。催化剂之所以能加速反应,是由于其巨大的表面使反应分子 S 接触时键受扭曲降低化学反应

11、的能垒水平,从而加速反应的速度。 酶分子的特点在于它具有高度特异的接触点微结构,能够定性、定 位、定向地扭曲底物分子的某一个化学键,从而大大降低能量高 度。与化学催化剂相比,酶催化剂的催化效率要高 615个数量 级。6.2 加快反应速度酶催化反应的速度是非酶催化过程的 6-15 个数量级。加速酶催 化反应过程的原因有以下几个方面 :(1) 反应的邻近效应和定向效应在通常情况下,对于一个双分子反应,反应物 A.B 是靠在稀溶 液中两个分子随机碰撞而发生反应,如果改用酶催化,则可以通过 结合部位把两个底物结合在活性中心上,彼此靠近,并使其有一定 的取向。这样就把一个分子间的反应变成了一个近似的分子

12、反应, 由于底物与酶的多点结合,大大降低了活化能,因而在热力学上也 是有利的,从而加速了反应的进行。(2) 多元催化 在酶催化过程常酶的各个基团分别发挥不同的催化作用,同时 进行多个基元反应。多元催化相互配合并行,从而加速了酶催化反 应速度。(3) 微环境 一般地,酶蛋白分子部是一个非极性占优势的区域,侧链残基 接近于烃类,而分子的表面则是极性占优势区。但这个表面是无规 的,不均一的,由于酶分子表面是镶嵌式的,各点有差别,可能存 在极性区、非极性区和强极性区,因而酶分子表面存在不同的微环 境。(4) 酶和底物的诱导契合及底物的变形 当酶和底物结合时,酶蛋白发生扭曲使酶的构象产生一定的的 变化,

13、让催化基处于被作用键的恰当位置,即酶被激化,产生活 性;另二方面。酶和底物的结合,还可以使底物分子中的敏感健发 生变形(或产生力 ) ,促使敏感键更易于断裂,加速了反应速度。6.3 酶催化反应的专一性( 1)结构专一性 : 表现为键专一性、基团专一性的绝对专一 性。健专一性的酶、要求作用于一定的键,对键两端的基团无严格 的要求。这是一种相对专一性,对底物的要求最低。具有基团专一性的酶,不仅对酶作用的健有一定的要求,对所 催化的键一侧的基。团也有所选择。而绝对专一性的酶只能作用于 一种底物,脲酶就是这种酶的一个例子,它只能催化尿素的水解反 应。(2)立体化学专一性:立体化学专一性是从酶催化底物的主体 化学性质来考虑的一种专一性。又分为光化学异构专一性和几何异 构专一性二个方面。当酶催化反应的底物中具有旋光异构体 ( 即底物分子中含有手性 碳原子时,酶只选择性地催化其中一种对映体,而对另一种对映体 无催化作用。具有几何异构专一性的酶,只催化底物中某一种立体结构的物 质,而对其几何异构体不发生催化作用。酶的结构专一性和几何专一性决定了酶催化反应过程的高选择 性的特点。

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