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1、生物化学教学大纲开课院系 :海洋生命学院海洋生物系课程教学目标与基本要求:通过本课程的学习,要求生物科学及相关专业学生较全面了解生物体的基本化学组成,理解其主要组成物质的结构特点、性质和功能以及这些物质在体内的合成、 降解、 相互转化及调控等的代谢规律,深入了解这些代谢活动与各种重要生命现象之间的关系。掌握常用的生物化学研究方法,学会综合运用所学的基本理论知识和技术来解决一些实际问题,并为学习后续课程打好基础。授课内容与学时分配:教学内容教学目标授课方式课时章具体内容第一 章一、生物化学的含义理解生物化 学的涵义多2 学时绪二、生物化学的分类了解生物化 学研究内容媒 体第 1周论三、生物化学的

2、发展史通过学习生历史背景物化学发展生物化学的诞生简史明确生生物化学的建立物化学与其 发展中的生物化学它学科的关 系、生物化学 在整个生命 科学中的重 要地位四、中国对生物化学的贡献了解我国科 学家对生物 化学的贡献五、生物化学的应用了解生物化 学在工农业 生产中的应 用 明确生物化 学的学习方 法第二一、糖类化学概论了解糖的现4 学时章糖类的概念与分类代概念、分类多糖类生物化学糖类分布及重要性及生物功能媒体 讨论第 1-2 周二、单糖掌握单糖的、单糖的分子结构分子结构、性、单糖的性质质和几种重、单糖衍生物要单糖的分子结构三、寡糖、二糖了解常见寡、三糖糖的结构、性、寡糖链质四、多糖 概述掌握几种

3、常 同多糖见多糖的结、杂多糖构、性质和生 物功能五、结合糖、糖蛋白重点掌握糖、蛋白聚糖蛋白、蛋白聚、糖肽糖的概念、结 构、类型,寡 糖链的类型、 结构及生物 学特性和功 能了解糖肽的 结构、作用第三一、概论了解脂类的2 学时章、脂类的概念及生物学功能概念、分类和多、脂类的分类生物学功能媒第 2周脂类二、脂酰甘油类了解脂酰甘体化学、脂肪酸油类的概念、甘油三酯的物理与化学性质类型,甘油三 酯的类型和 性质三、磷脂类、甘油磷脂的结构掌握磷脂的、常见的甘油磷脂基本结构、常、醚甘油磷脂见磷脂的结、鞘磷脂构、性质和生 物功能四、萜类、类固醇类了解萜类、类 固醇的结构 和功能掌握糖脂、脂 多糖的概念、 性质

4、和功能, 了解脂蛋白 的类型和功 能、萜类、类固醇五、脂复合物糖脂 脂多糖 脂蛋白第四 章氨 基酸一、氨基酸基本结构掌握氨基酸 的结构特点,多媒体4 学时第 3周二、氨基酸的分类从各氨基酸 的结构特点 上理解氨基 酸的分类和 各自的生物 特性了解不 常见蛋白质 氨基酸和非 蛋白质氨基 酸、常见蛋白质氨基酸、不常见的蛋白质氨基酸、非蛋白质氨基酸三、氨基酸的酸碱化学掌握氨基酸 的理化性质, 重点掌握两 性电离与等 电点含义,、氨基酸的兼性离子形式、氨基酸的解离、氨基酸的等电点、氨基酸的甲醛滴定四、氨基酸的化学性质氨基酸参加 的化学反应, 特别是测链 基团的反应, 是多肽和蛋 白质合成、修 饰的基础

5、、 - 氨基参加的反应、 -羧基参加的反应、 - 氨基和 - 羧基共同参加的反应、侧链基团参加的反应五、氨基酸的光学活性和光谱性质了解氨基酸 的光谱学性 质、旋光性、光谱性质第五章 蛋白质的共价 结构一、蛋白质通论了解蛋白质 的化学组成、 分类、蛋白质 分子大小、结 构组织层次 和蛋白质生 物功能的多 样性多媒体 讨论4 学时第 4周、蛋白质的化学组成与分类、蛋白质分子的大小和分子量、蛋白质构象结构的组织层次、蛋白质功能的多样性二、肽了解肽、肽键 的概念、结构 和常见肽的 性质、作用、肽和肽键的结构、肽键的特点、肽的物理和化学性质、天然存在的活性肽三、蛋白质一级结构测定掌握蛋白质 一级结构的

6、概念,蛋白质 一级结构的 测定方法与 思路,能根据 实验结果分 析简单多肽 的氨基酸顺 序、测定蛋白质的一级结构的要求、蛋白质测序策略、测定步骤、蛋白质测序举例、蛋白质序列数据库四、蛋白质的氨基酸序列与生物功能了解蛋白质 一级结构和 生物功能的 关系、同源蛋白质的物种差异与生物进化、同源蛋白质具有共同的进化起源、一级结构的局部断裂与蛋白质激活第六章蛋白质的三维结构一、研究蛋白质构象的方法了解研究蛋 白质构象的 方法多媒体 讨论5 学时第 5周二、稳定蛋白质三维结构的作用力掌握稳定蛋 白质三级结 构的作用力 的类型、形成 机理和作用、氢键、范德华力、疏水作用、离子键、二硫键三、多肽主链折叠的空间

7、限制了解多肽链 折叠的空间 限制、酰胺平面与 - 碳原子的二面角、可允许的 和 值四、二级结构掌握蛋白质 二级结构的 概念、类型、 结构特点多媒体 讨论5 学时第 5周、 - 螺旋、 -折叠片、 - 转角和 - 凸起、无规则卷曲五、纤维状蛋白质了解纤维蛋 白的结构特 点和功能、角蛋白、胶原蛋白六、超二级结构和结构域掌握超二级、超二级结构结构、结构、结构域域、三级结构 的概念、类 型、结构特点七、球状蛋白质与三级结构掌握三级结、球状蛋白质的分类构的概念、类、球状白分子三维结构的特征型、结构特点八、膜蛋白的结构、膜内在蛋白、脂锚定蛋白掌握膜蛋白的类型、结构 特点和功能九、蛋白质折叠和结构预测了解蛋

8、白质、蛋白质的变性折叠的热力、氨基酸序列规定蛋白质的三维结构学、动力学和、蛋白质折叠的热力学蛋白质结构、蛋白质折叠动力学预测的规则、蛋白质的结构预测十、亚基缔合和四级结构了解蛋白质、有关四级结构的一些概念四级缔合的、四级缔合的驱动力概念、作用、亚基相互作用的方式力、方式和优、四级结构的对称性越性、四级缔合在结构和功能上的优越性第七一、肌红蛋白质的结构与功能掌握肌红蛋4 学时章、肌红蛋白质的三级结构白结构特征;多、辅基血红素氧结合的动媒第 6周蛋白、氧与肌红蛋白的结合力学特征及体质结、氧的结合改变肌红蛋白的构象对结构的影构与功能的关系、肌红蛋白氧结合曲线响讨论二、血红蛋白的结构与功能掌握血红蛋、

9、血红蛋白的结构白的结构特、氧结合引起的血红蛋白构象变化征;氧结合的、血红蛋白的氧结合曲线动力学特征 及对结构的 影响;血红蛋白运输氧高 效性的特点;三、血红蛋白的分子病了解血红蛋、镰刀状细胞贫血病白分子病和、地中海贫血病结构变异对 功能的影响四、免疫球蛋白结构与相关生化技术了解免疫球 蛋白的结构、免疫球蛋白的结构、免疫球蛋白的类别类型,掌握、基于抗体- 抗原作用的生化分析方法western blot和免疫印迹技术的原理和用途第八一、酶催化作用的特点了解酶作为多3 学时章、酶和一般催化剂的比较生物催化剂第 7周酶通、酶作为生物催化剂的特点的特点,媒论二、酶的本质、分类与命名酶的化学本体、酶的化学

10、本质质、分类和命、蛋白酶的分类名原则、蛋白酶的命名三、酶作用专一性机理掌握酶的专、锁与钥匙学说一性及其机、“三点结合”的催化理论理、诱导契合学说四、酶的活力测定和分离纯化掌握酶活力、酶活力测定比活力、总活、酶活力测定实例力的概念和 测定方法五、核酶掌握核酶、抗、核酶的概念体酶的概念,、核酶的种类、核酶研究的意义及应用前景六、抗体酶了解核酶的 类型和抗体 酶的诱导原 理。七、酶工程简介了解酶工程、化学酶工程的概念和研、生物酶工程究范畴,常见 酶工程的技 术第九一、化学动力学基础了解化学反1 学时章、反应速率及其测定应的动力学多酶促 反应、反应分子数和反应级数基础媒 体第 7周动力二、底物浓度对酶

11、反应速度的影响重点掌握酶讨学、中间络合物学说促反应动力论、酶促反应的动力学方程式( 单底物)学:米氏方程、酶促反应的动力学方程式( 多底物)推导过程米 氏方程 掌握过渡态 理论含义,了 解过渡态底 物类似物对酶的抑制作 用。三、酶的抑制作用掌握三种可、抑制程度的表示方法逆抑制作用、抑制作用类型的动力学特、可逆抑制的动力学点、一些重要的抑制剂四、温度对酶反应速度的影响掌握温度对 酶反应速度 的影响五、 pH 对酶反应速度的影响掌握pH 对酶反应速度的 影响六、激活剂对酶反应速度的影响掌握激活剂 对酶反应速 度的影响第十一、酶的活性部位理解、掌握酶3 学时章、酶的活性部位的特点活性部位的多第 8周

12、酶的 作用、研究酶活性部位的方法相关概念和 特点媒 体机制 和酶二、酶催化反应的独特性质掌握酶催化 反应的性质讨的调三、影响催化效率的有关因素掌握酶催化论节、底物和酶的邻近效应与定向效应高效性的相、底物的形变和诱导契合关机理、酸碱催化、共价催化、金属离子催化、多元催化和协同效应、活性部位的微环境的影响四、催化反应机制的实例了解几种酶、溶菌酶的催化机制,、胰核糖核酸酶A理解结构和、丝氨酸蛋白酶功能的适应、天冬氨酸蛋白酶性了解酶活 性的调节方 式,五、酶活性的调节控制掌握酶活性、别构调控的别构调节、酶原激活可逆共价调、可逆的共价修饰节和酶原激、同工酶活调节方式 及生物代谢 中的作用第十一、维生素概

13、论了解维生素1 学时一章、维生素的概念的分类及各多、维生素的发现种维生素的媒第 8周维生 素和结构、生物功 能以及缺陷体辅酶症讨论二、脂溶性维生素了解脂溶性维生素的结构和功能、维生素A 族、维生素D 族、维生素E、维生素K三、水溶性维生素重点掌握维、维生素B1 和硫胺素焦磷酸生素B 与辅酶、维生素PP 和烟酰胺辅酶的关系以及、维生素B2 和黄素辅酶在代谢中的、维生素B3(泛酸)和辅酶A催化作用、维生素B6和磷酸吡哆醛、磷酸吡哆胺、维生素B12(氰钴胺素)及辅酶、维生素B7(生物素)、叶酸和四氢叶酸、硫辛酸、维生素C四、作为辅酶的金属离子了解金属离、概论子作为辅酶、金属酶类和金属激活酶类的意义第

14、十一、离心机掌握离心机4 学时二章、离心机的种类的原理和应多第 9周生化、原理和相关概念用媒分离、离心技术类型体技术二、层析掌握层析技及应、概述术的原理和讨用、分配层析技术应用论、吸附层析技术、疏水作用层析、凝胶过滤层析技术、离子交换层析法、亲和层析、高效液相层析和快速蛋白液相层析三、电泳掌握电泳技、概述术的原理和、电泳的基本原理应用、聚丙烯酰胺凝胶电泳四、蛋白质的性质了解蛋白质 蛋白质的酸碱性质的物理性质、蛋白质的沉淀及沉淀机理掌握蛋白质分离纯化的一般步骤和原则,能根据 特定条件设 计分离纯化 方案五、蛋白质分离纯化掌握蛋白质 含量、纯度和 分子量的测 定方法和原 理、概述、蛋白质混合物纯化

15、方法、蛋白质的含量测定与纯度鉴定、蛋白质相对分子量的测定方法、酶的分离提纯第十一、核酸概论了解核酸的3 学时三章、核酸的发现和研究简史种类、分布多、核酸的种类别和分布媒第 10核、核酸的生物功能掌握核酸的体周酸生物功能,特别是RNA的生讨物功能论二、酸的结构掌握几种重、核苷酸要核苷酸的、核酸的共价结构结构和性质,、DNA 的高级结构核酸的一级、核糖核酸(RNA)的高级结构二级和高级结构及特征三、核酸的物理化学性质掌握核酸水、核酸的水解解、紫外吸、核酸的酸碱性质收、变性、复、核酸的紫外吸收性等的理化、核酸的变性、复性及杂交性质四、核酸的研究方法掌握核酸常、核酸的分离、提纯和定量测定见研究方法、核

16、酸的超速离心和原理、核酸的凝胶电泳、核酸的核苷酸序列测定、DNA 聚合酶链反应(PCR)、DNA 的化学合成第十一、基本概念了解代谢的1 学时四章基本概念多第 10代谢二、代谢的基本特点媒周总论、代谢途径是系列酶促反应体、代谢总轮廓、分解代谢和合成代谢途径通常不重和 , 存在重要的差异掌握代谢的 基本特征、代谢途径存在区隔化、ATP是代谢反应中能量转移的重要载体、细胞代谢是经济而精密的调节过程三、新陈代谢研究方法了解新陈代 谢研究方法四、学习方法了解代谢的 学习方法第十 五章糖酵 解一、糖酵解研究简史了解糖酵解 的研究历史,多媒体 讨论4 学时第 11 周二、糖酵解全过程掌握糖酵解 的十步反应

17、 过程三、糖酵解的反应机制掌握、参与的 酶和反应机 理,能量代 谢,生理作用 和代谢调节四、糖酵解全过程总结掌握糖酵解 全过五、糖酵解的生理作用掌握糖酵解 的生理意义六、糖酵解作用的调节掌握糖酵解 作用的几种 调节方式七、其他六碳糖进入糖酵解途径其他六碳糖 单糖进入糖 酵解的方式八、丙酮酸去路掌握丙酮酸 去路第十 六章柠檬 酸循 环一、柠檬酸循环概貌掌握柠檬酸 循环概念多媒体 讨论2 学时第 12 周二、柠檬酸循环的反应机制掌握柠檬酸 循环的过程三、柠檬酸循环总结掌握柠檬酸 循环的机理、 能量代谢过 程四、柠檬酸循环的生理意义掌握柠檬酸 循环的生理 意义五、柠檬酸循环的调控掌握柠檬酸 循环调节

18、方 式六、柠檬酸循环的回补反应了解柠檬酸 循环的回补 反应七、乙醛酸途径了解乙醛酸循环途径第十七章一、生物氧化概论了解生物氧 化的概念多4 学时生物 氧化二、生物氧化体系的类型了解生物氧 化体系的类 型媒 体第 12-13 周三、电子传递链的组成和性质掌握电子传讨、NADH-Q还原酶递链的组成论、辅酶Q成分的结构、琥珀酸-Q 还原酶和电子传递、细胞色素还原酶过程、细胞色素C、细胞色素氧化酶四、电子传递的抑制剂了解电子传 递抑制剂和 氧化磷酸化 解偶联剂类 型和作用点五、氧化磷酸化掌握ATP合酶、氧化磷酸化假说的结构、氧化、ATP合酶结构磷酸化的机、结合变化学说制和电子传、电子传递和氧化磷酸化机

19、制递和氧化磷 酸化的耦联 机制,六、细胞溶胶内NADH的再氧化细胞溶胶内 NADH再氧化 途径,七、葡萄糖彻底氧化产生ATP会计算葡萄 糖等物质完 全氧化能量 代谢第十一、葡萄糖异生作用掌握葡萄糖4 学时八章、糖异生的前体异生作用途多第糖的、糖异生途径径、生理意义媒13-14其他、糖异生的生理意义和调节体周代谢、糖异生的调节途径二、戊糖磷酸途径掌握磷酸戊讨、戊糖磷酸途径研究史糖途径代谢论、戊糖磷酸途径主要反应过程,意义和、代谢调节调节,特别是 该途径与糖 酵解、糖异生 途径共同适 应不同细胞代谢状态的 调节三、淀粉和糖原代谢掌握糖原分、淀粉分解代谢解和合成相、糖原分解代谢关酶及调节、糖原的生物

20、合成、糖原代谢的调节四、复合糖糖链的合成了解复合糖 寡糖链的合 成过程第十一、甘油三脂的分解代谢了解甘油三1 学时九章、体内甘油三脂的分解酯的分解代多脂肪酸的分解代谢、甘油的代谢谢媒体 讨论第 14 周二、脂肪酸的氧化掌握脂肪酸、饱和脂肪酸的 - 氧化的氧化过程、不饱和脂肪酸的氧化能量代谢、脂肪酸的 -和 -氧化三、磷酸甘油脂的分解代谢(略)了解磷脂的 分解代谢第二 十章脂肪一、脂肪酸的来源了解体内脂 肪酸的来源多媒体1 学时第 14 周酸的二、脂肪酸的合成掌握脂肪酸合成、软脂酸的生物合成的生物合成讨、脂肪酸碳链的延长途径和能量论、碳链的去饱和代谢、脂肪酸降解和合成的调节脂肪酸合成 和分解的异

21、 同点和调节三、甘油三脂的合成了解甘油三 脂的合成四、磷脂类的生物合成了解磷脂的 生物合成第二一、蛋白质的降解了解蛋白质2 学时十一、内源蛋白质的降解的降解过程多章、外源蛋白质的降解媒第 15蛋白质分解和、氮平衡体 讨论周氨基二、氨基酸的分解代谢掌握氨基酸酸代、氨基酸氨基的转移的去氨基途谢、氨基酸的脱羧基作用径、尿素循环、氨的命运、尿素循环、氨基碳骨架的氧化途径三、氨基酸的合成(略)了解氨基酸 碳骨架的代 谢和氨基酸 合成的主要 路线第二一、核酸的解聚和核苷酸的降解了解核酸降2 学时十二解过程多第 15章核二、碱基降解掌握嘌呤碱媒周酸降和嘧啶碱基体解和降解过程核苷、嘌呤碱的分解掌握核苷酸、讨酸

22、代、嘧啶碱脱氧核糖核论谢三、核苷酸的生物合成苷酸合成与、嘌呤核糖核苷酸的合成调节、嘧啶核糖核苷酸的合成、脱氧核糖核苷酸的合成、核苷酸代谢调控第二一、DNA的半保留复制了解DNA的半2 学时十三保留多第 16章二、DNA复制的起点和方式掌握复制的媒周起点和方式体DNA三、DNA的半不连续复制掌握半不连的复续复制讨制四、DNA复制有关的酶和蛋白质重点掌握DNA论、DNA聚合酶复制相关酶、拓扑异构酶和蛋白质、解螺旋酶、引物合成酶、DNA连接酶、复制相关蛋白五、大肠杆菌DNA复制过程掌握大肠杆菌 DNA复制过程,特别是起始过程和调节;六、真核生物DNA复制真核生物DNA、真核生物DNA复制复制的特点、

23、真核生物端粒复制及与原核生 物的异同了解真核生 物端粒复制第二一、DNA指导下RNA合成了解RNA合成多2 学时十四、概述的范畴,启动章、DNA指导下的RNA聚合酶子、转录因媒第 16RNA、启动子和转录因子子、终止子和体周、终止子和终止因子终止因子的讨论的生、转录过程概念物合、RNA生物合成的抑制剂成和加工二、RNA的转录后加工掌握RNA聚合、原核生物RNA的加工酶的特性和、真核生物RNA加工转录过程,特 别是转录起 始和终止三、RNA指导下的RNA合成掌握RNA转录后加工的方式和过程四、RNA指导下的DNA合成掌握逆转录 过程和逆转 录酶第二一、蛋白质合成的分子基础了解蛋白质2 学时十五、

24、mRNA是蛋白质合成的模板合成的分子多第 17章、遗传密码基础和作用媒周、 tRNA 转运活化的氨基酸体蛋白、核糖体是蛋白质合成的工厂质合讨成和二、蛋白质合成过程掌握蛋白质论转运、氨酰tRNA 合成酶催化形成氨酰tRNA合成的过程,、原核生物蛋白质合成的起始氨酰tRNA酶、原核生物蛋白质合成的延伸特性、原核和、蛋白质合成的终止真核生物蛋、真核生物起始复合物的形成白质合成起、蛋白质合成的抑制剂始复合物形 成了解蛋白质 合成的抑制 剂三、蛋白质合成的修饰和定向转运了解蛋白质合成后的修 饰和定向转 运过程第二一、物质代谢途径的相互联系掌握整个代1 学时十六、糖代谢与脂代谢的联系谢途径间的多第 17章

25、代、糖代谢与氨基酸代谢的关系相互关系媒周谢调、氨基酸代谢与脂代谢的关系体控、核苷酸代谢与糖、脂、氨基酸的关系讨二、物质代谢的特点掌握物质代论、TCA是中心环节谢的特点、分解合成途径往往分开, 非简单逆反应、ATP是通用的能量载体、分解为合成提供还原力和能量、分解、合成受不同方式调节三、代谢调节理解酶活性、酶水平的调节调节、细胞结、细胞水平的调节构、神经和激、激素水平的调节素对整个代谢过程的调节作用生物化学实验课程教学大纲撰 写 人 :刘晨光于乐军撰写时间 : 2006 年 9 月 1 日开课院系:海洋生命学院课程编号:073102102207课程名称:生物化学实验英文名称:General Bi

26、ochemistry Laboratory推荐使用教材:生物化学实验编者 :陈钧辉等出版社 :科学出版社出版时间及版次: 2003年第三版课程总学时: 34总学分 : 1周学时 :3学期安排 : 2006-2007 学年第一学期实验、实习场所(校内、野外、海上等):校内课程教学目标与基本要求:生物化学实验是生物化学教学的重要组成部分,与理论教学既有联系又相对独立的组成部分。本课程以构成生物机体的主要有机物质如糖类、蛋白质、脂肪、核酸及其相关研究技术为主线,选择实验内容。通过实验教学一方面可以使学生巩固和加深生物化学的基础理论知识,而更重要的是通过实验培养学生动手能力和从事相关科研工作的能力,进

27、一步加强学生独立分析问题和解决问题、综合设计及创新等方面的能力。经过实验训练后,学生应达到下列要求:1. 巩固和加深对生物化学基本知识的理解,掌握生物化学实验的基本知识和基本操作技能,并掌握仪器操作原理。2. 提高观察问题、分析问题和解决问题的能力。通过独立思考,深入钻研有关问题,具有初步解决生物化学实验问题的能力。3. 能独立设计实验,利用所学知识准确分析实验结果。考核方式 :考查课程内容与学时分配:项目序号实验、实习授课内容学时(周 )基础性实验综合性实验研发性实验1实验一蛋白质的颜色反应3学 时2实验二蛋白质的沉淀反应3学 时3实验三用Folin-Wu 法定量测 定血糖的含量3学 时4实验四肝糖元的提取和鉴定3学 时5实验五双缩脲法测定蛋白质的浓度3学 时6实验六氨基酸的纸层析法3学 时7实验七醋酸纤维薄膜电泳法分离牛血清蛋白3学 时8实验八酵母RNA的提取及鉴定3学 时9实验九维生素C的定量测定(2, 6-二氯靛酚滴定法)3学 时10实验十DNA的定量测定 -二苯胺法3学 时11实验十一聚丙烯酰胺凝胶盘状电泳法分离牛血清蛋白4学 时学习参考书(编者,出版社,出版时间及版次):1 基础生物化学实验. 王秀奇 . 高等教育出版,1999 年第二版

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