《Local-Blast序列比对教程.pptx》由会员分享，可在线阅读，更多相关《Local-Blast序列比对教程.pptx（10页珍藏版）》请在三一文库上搜索。
1、BLAST序列比对,BioEdit使用简要介绍,1,2021/3/11,BioEdit安装,打开BioEdit7.0.9.0-setup.exe，next，直到选择安装目录,2,2021/3/11,BioEdit安装,选择完安装目录，next到最后一步，完成安装。,3,2021/3/11,导入query序列,打开BioEdit，导入Query_sequence.fasta文件。FileOpen注意文件类型选择All Files (*.*),4,2021/3/11,创建比对数据库,导入nirS_nucleotide.fasta核酸数据库和nirS_protein.fa蛋白数据库，分别创建本地的n
2、irS的核算数据库和蛋白数据库。Accessory ApplicationBLASTCreate a local nucleotide database file / Create a local protein database file,5,2021/3/11,Local Blast,Accessory ApplicationBLASTLocal BLAST,Program：blastn : 核酸核酸blastp : 蛋白蛋白tblastn: 蛋白翻译的核酸tlastx: 翻译的核酸蛋白tblastx: 翻译的核酸翻译的核酸,导入待比对的序列,如Query_sequence.fasta,选
3、择本地核酸/蛋白数据库,定义一个输出文件，txt文件即可,Blast的所有使用说明，命令行格式,期望值, e-value,6,2021/3/11,Local Blast,Accessory ApplicationBLASTLocal BLAST。选择blastn,在相应的输出文件目录下，找到blastn的相应结果，可以直接打开，查看比对结果,7,2021/3/11,Local Blast,Blastn比对结果,评分最高，E值最低的结果排在第一,8,2021/3/11,Local Blast,Accessory ApplicationBLASTLocal BLAST。选择blastx,在相应的输出文件目录下，找到blastx的相应结果，可以直接打开，查看比对结果,9,2021/3/11,Local Blast,Blastx比对结果,10,2021/3/11,