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1、经院哲学经院哲学的思维方法（形式逻辑的三段论推理），不仅是一种学术研究的方法，同时也是一种训练思维的方法和教学方法。以“试验和理性”的密切结合达到自觉阶段为成熟标志的近代科学思维方式脱胎的母体是中世纪的经院哲学。狭义的经院哲学指修道院中的职业神职人员从事的神学研究，广义的经院哲学则指11-13世纪的学术活动，既包括基督教神学院中神学研究，也包括中世纪大学内部的学术研究。经院哲学在本质上是神学，但它依赖的工具是“辩证法”和三段论的推理，表现在形式上就是将亚里士多德哲学（主要是逻辑学）引入神学体系，将神学与哲学加以调和，形成一种思辨体系。经院哲学所确立的思维的理性逻辑原则是是近代科学思维中的数理逻
2、辑原则的前提，近代科学思维的数理逻辑特点，在形式上表现为直接回到古希腊逻辑体系，但它的实际起点却是经院哲学的理性逻辑思维，同时近代科学思维中的实验观念也得到了经院哲学的培育。经院哲学不间断地运用逻辑思辨，维持和发展了以亚里士多德哲学为代表的古希腊逻辑分析系统，强化了神学对理性逻辑的依赖。正如费尔巴哈所说：“经院哲学力图证明和论证仅仅立足权威之上的信仰的对象，从而证明了虽然大部分违背它自己的理解和意志理性的权威，给世界引入一种与旧教会的原则不同的原则独立思考的精神的原则，理性的自我意识的原则，或者至少是为这一原则做了准备。”神学将理性思辨作为一种工具加以利用，是已经确定了的信仰内容变成思辨的对象。比如经院哲学内部经常谈论基督教义中末日审判时死者复活受审的问题，经院哲学家们进一步讨论：人的肉体是否复活？死后的人在什么年龄复活？复活时是作为儿童还是青少年？外貌如何？是胖子还是瘦子？这些问题的讨论方式是繁琐的，但作为一种思维训练，对于思维方式的形成无疑大有益处，而且这种刻意的挑剔性的诘问和辩难是逻辑思维发展的一个重要环节，更重要的是，这种激烈的论辩促使怀疑精神的产生。经院哲学思维也有自身的弱点，“在仅凭观察才能决定的事物上偏信推理，以及过分强调语言上的区别和其精微意义。”它把大部分智慧和大量闲暇时间花在不能证明的东西上，以至于陷入万劫不复的繁琐论证的泥潭而不能自拔。