原核基因表达调控1-6-刘青波.ppt

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1、第六章 基因的表达与调控(上) 原核基因表达调控模式 目的与要求 掌握基因表达的概念。 掌握原核基因表达调控的基本原则及乳糖操纵 子。 掌握Trp操纵子的工作原理。 熟悉转录后调控的种类及原理。 了解半乳糖操纵子的作用机制、了解阿拉伯糖 操纵子的作用机制。 第一节 基因表达调控概述 基因表达(gene expression) 概念:通过转录和翻译,使遗传信息转变成 各种功能性蛋白质的过程。 D NA 蛋 白质 翻 译 R NA 转 录 基因表达的时间性及空间性 (一)时间特异性 按功能需要,某一特定基因的表达严格按 特定的时间顺序发生,称之为基因表达的时间 特异性(temporal speci

2、ficity)。 多细胞生物基因表达的时间特异性又称阶 段特异性(stage specificity)。 (二)空间特异性 基因表达伴随时间顺序所表现出的这种分 布差异,实际上是由细胞在器官的分布决定的 ,所以空间特异性又称细胞或组织特异性(cell or tissue specificity)。 在个体生长全过程,某种基因产物在个体 按不同组织空间顺序出现,称之为基因表达的 空间特异性(spatial specificity)。 在个体各个生长阶段的大多数或几乎全部 组织中持续表达,或变化很小。区别于其他基 因,这类基因表达被视为组成性基因表达 (constitutive gene expr

3、ession)。 基因表达的方式 按对刺激的反应性,基因表达的方式分为: (一)组成性表达 管家基因(housekeeping gene)。 某些在一个个体的几乎所有细胞中持续表 达的基因。 管家基因 (二)诱导和阻遏表达 在特定环境信号刺激下,相应的基因被激 活,基因表达产物增加,这种基因称为可诱导 基因。 可诱导基因在特定环境中表达增强的过程 ,称为诱导(induction)。 DNA损伤 修复酶基因激活 1.可诱导基因与诱导 2.可阻遏基因与阻遏 如果基因对环境信号应答是被抑制,这种基 因是可阻遏基因。 可阻遏基因表达产物水平降低的过程称为阻 遏(repression)。 在一定机制控制

4、下,功能上相关的一组基 因,无论其为何种表达方式,均需协调一致、 共同表达,即为协调表达(coordinate expression) 。 基因的协调表达 基因表达的调控 概念: (gene regulation or gene control) 对基因表达过程的调节。 一般规律: 机体需要基因表达开始(on) 机体不需要基因表达停止 (off) 可能有本底水平的基因表达:每个细胞只合成 1或2 个mRNA分子和极少量的蛋白质分子。 基因表达调控的分类 (1)转录水平上的调控 (2)转录后水平上的调控 mRNA加工成熟水平上的调 控 翻译水平上的调控 原核与真核生物转录及翻译的总特点 扫描图片

5、 二、原核基因表达调控机制的 类型与特点 原核基因表达调控主要发生在转录水平上。 负 转录调 控 正转 录调控 调节基因的产物是 阻遏蛋白 调节基因的产物是激 活蛋白 调节物结合到 DNA上 正调节负调节 是开启关闭 否关闭开启 编码序列 调节序列 启动序列 (promoter) 操纵序列 (operator) 激活蛋白 阻遏蛋白 阻遏蛋白与激活蛋白 阻遏蛋白 负 转 录 调 控 正 转 录 调 控 正控 阻遏 正控 诱导 负控 阻遏 负控 诱导阻 遏蛋白 + 诱 导 无活阻 遏蛋白+ 阻 遏 无活激 活蛋白+ 诱 导 激 活蛋白 + 效 应 物 效 应 物 效 应 物 效 应 物 诱 导因

6、子 诱 导因 子 共 阻遏 物 共 阻遏 物 阻 遏 负 转 录 调 控 正 转 录 调 控 正控 阻遏 正控 诱导 负控 阻遏 负控 诱导阻 遏蛋白 + 诱 导 无活阻 遏蛋白+ 阻 遏 无活激 活蛋白+ 诱 导 激 活蛋白 + 效 应 物 效 应 物 效 应 物 效 应 物 诱 导因 子 诱 导因 子 共 阻遏 物 共 阻遏 物 阻 遏 Lac O I 阻遏物 阻遏 诱导 失活的阻遏物 负控 诱导 mRNA Trp O 无活的阻遏蛋白 辅-阻遏物 阻遏 基因表达 负控 阻遏 正 控 诱 导 活化的激活蛋白 失活的活性蛋白 诱导物 基因不表达基因表达 活化的激活蛋白 辅-阻遏物 基因表达 阻

7、遏 正控 阻遏 第二节 乳糖操纵子与负控诱导系统 一、原核基因表达的操纵子模型 操纵子(operon)的概念: 功能相关的基因成簇地串连、密集于染色 体上,共同组成的转录单位。 操纵子的组成: 编码序列 调控区 1个启动序列(promoter,P) 二、乳糖操纵子调节机制 (一)乳糖操纵子的结构(lac operon) 调控区 CAP结合位点 启动序列 (promotor) 操纵序列 (operator) 结构基因 Z: -半乳糖苷酶 Y: 透酶 A:乙酰基转移酶 ZYAOP DNA mRNA 阻遏蛋白 I DNA ZYAOP po l 没有乳糖存在时 (二)阻遏蛋白的负性调节 阻遏基因 mR

8、NA 阻遏蛋白 只有乳糖存在时 I DNA ZYAOP pol 启动转录 mRNA 乳糖异构乳糖 -半乳糖苷酶 无葡萄糖,cAMP浓度高时 有葡萄糖,cAMP浓度低时 (三)CAP(catabolite gene activation protein) 的正性调节 ZYAOPDNA CAP CAP + + + + 转录 CAP CAP CAP CAP结合位点 cAMP CAP 葡萄糖对 lac 操纵子的阻遏作用称分解代谢阻遏 (一)操纵子(operon) 概念:功能相关的基因成簇地串连、密集 于染色体上,共同组成的转录单位。 二、乳糖操纵子调节机制 (一)乳糖操纵子的结构(lac operon

9、) 调控区 CAP结合位点 启动序列 (promotor) 操纵序列 (operator) 结构基因 Z: -半乳糖苷酶 Y: 透酶 A:乙酰基转移酶 ZYAOP DNA I 阻遏蛋白 二、乳糖操纵子调节机制 ZYAOP DNA I mRNA 阻遏蛋白 1.阻遏蛋白的负性调节 RNA-Pol 没有乳糖存在时 有乳糖存在时 -半乳糖苷酶 异构乳糖 转录 ZYAOP DNA 无葡萄糖,cAMP浓度高时 有葡萄糖,cAMP浓度低时 (三)CAP(catabolite gene activation protein) 的正性调节 CAP CAP CAP CAP CAP CAP结合位点 CAP RNA-

10、Pol 转录 内容回顾 操纵子的概念: 乳糖操纵子的结构 乳糖操纵子的表达调控 阻遏蛋白的负 性调控 CAP的负性调 控 CAP P O TTTACA -35区 TATGTT -10区 CAP结合位点 5-ATTAAT GTGAGTTAGCTCACTCATTAGG-3 CAP中央对称序列 CAP Binding Bends DNA promotor CAP Binding site (四)协调调节 当阻遏蛋白封闭转录时,CAP对该系统不能 发挥作用; 如无CAP存在,即使没有阻遏蛋白与操纵序 列结合,操纵子仍无转录活性。 单纯乳糖存在时,细菌利用乳糖作碳源; 若有葡萄糖或葡萄糖/乳糖共同存在时

11、,细 菌首先利用葡萄糖。 低半乳糖时 高半乳糖时 葡萄糖低 葡萄糖高 OO A D A B C D mRNA RNA-pol O C O B 1.A基因及其生理功能 2.lac基因产物数量上的比较 3.操纵子的融合与基因工程 lac操纵子中的其他问题 1.A基因及其生理功能 -半 乳糖苷 - 半乳糖苷 衍生物 生 长抑 制 乙酰酰-半乳糖苷 -半乳糖苷乙酰基转移 酶 乙 酰酰 CoA CoA -半乳 糖苷酶 A基因 2.lac基因产物数量上的比较 ZYAOPDNA 1: 0.5: 0.2 (1) Lac mRNA 与翻译过程中的核糖体脱 离 (2) Lac mRNA A基因更容易受到内切酶的

12、作用发生降解 第三节 色氨酸操纵子与负阻遏系统 色氨酸操纵子(tryptophan operon)的 代谢特点: 1.参与 trp 的生物合成而不是降解。 2.环境中有充足的 trp 时,不(低)表达。 3.环境中缺乏 trp 时,高表达。 4.它不受葡萄糖 c-AMPCRP调控。 5.(辅)阻遏蛋白的负调控调控。 6.弱化子的负调控调控。 邻氨基苯甲酸合酶 邻氨基苯甲酸磷酸核糖转移酶 磷酸核糖邻氨基苯甲酸异构酶 吲哚甘油磷酸合酶 色氨酸合酶 Trp E Trp D TrpC Trp A Trp B trpR ABCDEopLa trpR trpPtrpO trpE trpD trpC trp

13、B trpA E. coli 色氨酸操纵子模型 Trp合成途径还存在色氨酸操纵子中衰减子所引起的衰 减调节。 前导区mRNA 前导肽( 14AA) 衰减子 123 4 4 2 3 1 mRNA Trp codons 终止密码 UUUUU UUUUU 弱化子调控的意义 在大量外源色氨酸存在时,及时快速阻止先 导mRNA的链的合成,使避免物质与能量的浪费 。 备用 四、半乳糖操纵子(galactose operon) 大肠杆菌半乳糖操纵子(galactose operon)包括3个结构 基因 异构酶(UDP-galactose-4epimerase,galE), 半乳糖-磷酸尿嘧啶核苷转移酶(ga

14、lactose transferase, galT) , 半乳糖激酶(galactose kinase, galk)。 这3个酶的作用是使半乳糖变成葡萄糖-1-磷酸。可以作为 唯一碳源供细胞生长。 GalR与galE、T、K及操纵区O等离得 很远,而galR产物对galO的作用与lacI- lacO的作用相同。 Lac Z 操纵子 细胞壁合 成的前体 GalR与galE、T、K及操纵区O等离得很 远,而galR产物对galO的作用与lacI-lacO的 作用相同。 它有两个启动子,其mRNA可从两个不 同的起始点开始转录; 它有两个O区,一个在P区上游-67-53, 另一个在结构基因galE内

15、部。 A2 mRNA:组成型表达。 cAMP-CAP抑制RNA聚合酶与S2的结合。 A1 mRNA生成:半乳糖、CAP和较高浓度的cAMP。 差向异构酶 葡萄糖UDP- 葡萄糖UDP- 半乳糖细胞壁 -76 -47 gal R O2CAP PO1gal Egal Tgal K A1 A2 阿拉伯糖操纵子 (arabinose operon) araD araA AraC 具有正、负调节因子双重功能。 有葡糖,有或无阿拉伯糖 无葡糖,阿拉伯糖 1、翻译起始的调控 2、稀有密码子对翻译的影响 3、重叠基因对翻译的影响 4、翻译的阻遏 5、魔斑核苷酸水平对翻译的影响 转录后水平上的调控翻译水平上 的

16、调控 1.翻译起始的调控 含义: 通过SD序列的结构及其与起始密码 AUG之间的距离调节蛋白质翻译的水平。 AUG 53 mRNA 410为佳, 9个最佳 SD序列 AGG GAGG GGAGG AGGAG UCCUCCA 16S rRNA 53 U A G A U C 2.稀有密码子对翻译的影响 稀有密码子:是在一般的编码中利用频率很低的密 码子。 稀有密码子对翻译的影响 稀有密码 AUA UAU UAG UAA OrpsU dnaGrpoD 核糖体小亚 基S21蛋白 引物酶RNA聚合酶 因子 rpsU 操纵子中3个基因产物的拷贝数的差异 4万/细胞50/细胞 2,800/细胞 1% 032

17、% 1%AUA 重叠基因对翻译的影响 5、翻译的阻遏 例:大肠杆菌RNA噬菌体Q(+RNA) 的蛋白质合 成。 大肠杆菌RNA噬菌体Q基因图 含义:蛋白质抑制翻译的 现象。 成熟蛋白(A)外壳 蛋白 RNA复制酶 1 62 1322 134517442353 41204220 53 成熟蛋白SD 外壳蛋白SD RNA复制酶SD 5 3 (+)RNA RNA复制酶 RNA复制酶 3 5 5 ()RNA 成熟蛋白 魔斑核苷酸水平对翻译的影响 魔斑: 当细菌演技生长过程中,遇到氨基酸全面 缺乏时,细菌将会产生一个应急反应,停止全部 基因的表达。这种现象称作严紧控制(rel+,编码 RelA蛋白-严紧因子)。 松散控制(rel-):蛋白质合成下降,但RNA合 成并不下降。 产生这严紧控制反应的信号是鸟苷四 磷酸(ppGpp)和鸟苷五磷酸(pppGpp)。 魔斑核苷酸的作用 1.影响RNA聚合酶与启动子的结合,阻止转录 开始。 2.使转录中的RNA聚合酶停顿,转录终止。 魔斑核苷酸的生成 L11 无活RelA蛋白 活性RelA蛋白 ATP-GTP-3-焦磷酸转移酶 ATP+GTP pppGpp+AMP ppGpp

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