参考Western-Blotting.doc

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1、Western blot 原理:通过电泳区分不同的组分,并转移至固相支持物,通过特异性试剂(抗体)作为探针,对靶物质进行检测,蛋白质的Western印迹技术结合了凝胶电泳的高分辨率和固相免疫测定的特异敏感等多种特点,可检测到低至15ng(最低可到10100pg)中等大小的靶蛋白。一、抗原的选择和制备A:样品的制备1 组织: 组织的处理方法:组织洗涤后加入3倍体积预冷的PBS,0研磨,加入5STOP buffer,180W,6mins,0超声波破碎,5000rpm,5mins 离心,取上清。加入-ME(9.5ml加入0.5ml),溴酚蓝(9.5ml加入0.5ml)煮沸10min,分装后于-20保

2、存,用时取出,直接溶解上样。2 细胞:细胞的处理方法: 离心收集细胞或者直接往细胞培养瓶内加入5STOP buffer,收集,180W,6mins,0超声波破碎,5000rpm,5mins 离心,取上清。加入-ME(9.5ml加入0.5ml),溴酚蓝(9.5ml加入0.5ml)煮沸10min,分装后于-20保存,用时取出,直接溶解上样。3 分泌蛋白的提取(特例):直接收集分泌液,加入-ME、溴酚蓝制样。B:蛋白的定量方法及影响蛋白定量原因1.双缩脲法:双缩脲法是第一个用比色法测定蛋白质浓度的方法。在需要快速,但不很准确的测定中,常用此法。硫铵不干扰显色,这对蛋白质提纯的早期阶段是非常有利的。双

3、缩脲法的原理是Cu2+与蛋白质的肽键,以及酪氨酸残基络合,形成紫蓝色络合物,此物在540nm波长处有最大吸收。双缩脲法常用于0.5g/L10g/L含量的蛋白质溶液测定。干扰物有硫醇,以及具有肽性质缓冲液,如Tris、Good缓冲液等。可用沉淀法除去干扰物,即用等体积10%冷的三氯醋酸沉淀蛋白质,然后弃去上清液,再用已知体积的1m NaOH溶解沉淀的蛋白质进行定量测定。2.Lowry法:此法是双缩脲法的进一步发展。他的第一步就是双缩脲反应,即Cu+与蛋白质在碱性溶液中形成络合物,然后这个络合物还原磷钼磷-磷钨酸试剂(福林-酚试剂),结果得到深蓝色物。此法比双缩脲法灵敏得多,适合于测定20mg/L

4、400mg/L含量的蛋白质溶液。其干扰物质与双缩脲法相同,而且受他们的影响更大,硫醇和许多其他物质的存在会使结果严重偏差。另外要注意的是,加入福林试剂时要特别小心,试剂只在酸性pH环境中才稳定,上述提到的还原反应只有在pH10时才发生,因此,福林试剂加入到碱性的Cu2+-蛋白质溶液中时,必须立刻搅拌,以使磷钼酸-磷钨酸试剂在未被破坏之前能有效地被Cu2+-蛋白质络合物所还原。3.紫外吸收法:大多数蛋白质在280nm波长处有特征的最大吸收,这是由于蛋白质中有酪氨酸,色氨酸和苯丙氨酸存在的缘故,因此,利用这个特异性吸收,可以计算蛋白质的含量。如果没有干扰物质的存在,在280nm处的吸收可用于测定0

5、.10.5mg/ml含量的蛋白质溶液。部分纯化的蛋白质常含有核酸,核酸在260nm波长处有最大吸收。4. Bradford比色法:Bradford比色法比Lowry法测定蛋白浓度更简单迅速。用脱氧胆酸/三氯乙酸沉淀蛋白可排除甘油、去污剂、2-巯基乙醇、乙酸、硫酸铵、Tris和一些碱性缓冲系统的干扰。分别在两组微量离心管中各加入0.5mg/ml牛血清白蛋白(5,10,15和20祃),以0.15mmol/l NaCl补足至100祃,同时以两管100祃的0.15mmol/l NaCl作空白对照。每管各加入1ml考马斯亮蓝染料溶液,振荡混匀,室温放置2分钟。用1cm光径的微量比色杯测A595,取A59

6、5吸光值对标准蛋白浓度作图,画标准曲线,并测量待测样品的A595。从BSA标准曲线中确定待测样品的浓度。测定10-100礸的蛋白质,要在较大试管中将染料溶液体积增大5倍进行。样品浓度过高,可稀释后进行,或在10-100礸另作一标准曲线进行测定。5电泳估算法(我们选择此法):样品倍比稀释,SDS-PAGE电泳,同时做定量marker对照,可以估算样品大概浓度。以提取癌组织总蛋白为例: 取等量胰腺癌组织、癌旁组织及正常胰腺组织,用dH2O漂洗510次,再用预冷的1PBS洗涤3次,目的是去除样本中的血液。 每2克组织加入3ml 1PBS匀浆,保持在4条件进行。 加入5STOP Buffer缓冲液1m

7、l,混匀,4下超声碎化。再加入0.5ml -ME,0.5ml溴酚蓝,煮沸10mins,至此,制样过程完成; SDS-PAGE电泳,以BAS作为对照估计样品蛋白浓度。二、SDS-聚丙烯酸胺凝胶电泳(SDSPAGE)A:实际操作1. 做胶前的准备1)检查是否有足够的、干净的 spacer、comb 和架子。2)检查是否有新鲜的,足量10%APS,没有立刻重配。3)按将要检测的抗体对应的原始抗原的分子量大小,计算出胶的浓度,并算出分离胶各组分的用量。2. 制胶,电泳1)装好架子。2)按照下面配方配制分离胶。(单位:ml,Total: 8ml) 7.5 10 15%2Sep. buffer 4 4 4

8、30 Gel.sol 2.0 2.7 4ddH2O 1.9 1.2 0TEMED 8ul 8ul 8ul10%APS 80ul 0ul 80ul在胶上面加入一层蒸馏水,促进胶更好的凝集。 3)待分离胶凝集后,配制浓缩胶。(单位:ml,Total: 3.5ml)32Stacking. buffer 1.730 Gel.sol 0.35ddH2O 1.4TEMED 5ul10%APS 50ul倒好后插入预先准备好的梳子。4)待胶凝集好后,上样,电泳。 上层胶用60-80V电压,当样品至分离胶时,用100-120V电压。一般电泳时间在1.5小时左右。B :注意事项及常遇到的问题1)分离胶不要倒的太满

9、,需要有一定的浓缩胶空间,否则起不到浓缩效果。2)上样蛋白量不应超过30ug/mm2 (载荷面即:如果你的胶槽是5mm1mm,则载荷面为:1mm5mm=5mm2) 。3)gel通常在0.5-1h内凝集最好,过快表示TEMED、APS用量过多,此时胶太硬易龟裂,而且电泳时容易烧胶。太慢则说明两种试剂用量不够或者系统实际不纯或实效。4)混合搅拌速度太快产生气泡影响聚合,导致电泳带畸形。太慢不均匀,特别是甘油。5)电泳中常出现的一些现象: 条带呈笑脸状,原因:凝胶不均匀冷却,中间冷却不好。 条带呈皱眉状,可能是由于装置不合适,特别可能是凝胶和玻璃挡板底部有气泡,或者两边聚合不完全。拖尾:样品溶解不好

10、。纹理(纵向条纹):样品中含有不溶性颗粒。条带偏斜:电极不平衡或者加样位置偏斜。条带两边扩散:加样量过多。三、转移在电流的作用下,使蛋白质从胶转移至固相载体(膜)上。膜的选择:印迹中常用的固相材料有NC膜、DBM、DDT、尼龙膜、PVDF等。我们选用PVDF(聚偏二氟乙烯),其具有更好的蛋白吸附、物理强度,以及具有更好的化学兼容性。有两种规格:Immobilon-P(0.45um)和Immobilon-PSQ(0.2um for MW20kDa)。A 半干法即将凝胶夹层组合放在吸有转印缓冲液的滤纸之间,通过滤纸上吸附的缓冲液传导电流,起到转移的效果。因为电流直接作用在膜胶上,所以其转移条件比较

11、严酷,但是其转移时间短,效率高。1 实验条件的选择电流1mA-2mA/cm2,我们通常100mA/膜,按照目的蛋白分子大小、胶浓度选择转移时间,具体可以根据实际适当调整。目的蛋白分子大小(kDa) 胶浓度 转移时间 80-140 8% 1.5-2.025-80 10 1.515-40 12 0.75=膜=胶?2)滤纸、胶、膜之间千万不能有气泡,气泡会造成短路。3)因为膜的疏水性,膜必须首先在甲醇中完全浸湿。而且在以后的操作中,膜也必须随时保持湿润(干膜法除外)。4)滤纸可以重复利用,上层滤纸(靠膜)内吸附有很多转移透过的蛋白质,所以上下滤纸一定不能弄混,在不能分辨的情况下,可以将靠胶滤纸换新的

12、。5)转移时间一般为1.5 小时,( 1mA-2mA/cm2,10% gel),可根据分子量大小调整转移时间和电流大小。1)在叠膜、胶、纸三明治时候,操作于盛有转膜Buffer的大平皿中进行,叠好后,再将三者平行转移至转膜装置,切勿再移动,因为在buffer中操作,已经完全排除了气泡存在的可能,无需再赶气泡2)关于转膜时间:半干转的话,20 V30min即可B 湿法我们基本上不用此方法,这里暂不做介绍。C 转移后效果的鉴定1染胶用考马斯亮兰染色经destain脱色后,看胶上是否还有蛋白来反映转移的效果。2染膜有两类染液选择,可逆的和不可逆的。可逆的有ponceau-s red 、Fastgre

13、en FC、CPTS等,这类染料染色后,色素可以被洗掉,膜可以用做进一步的分析用。但是不可逆的染料,如考马斯亮兰、india ink、Amido.black 10B等,染色后膜就不能用于进一步的分析。四、封闭(block)封闭是为了使我们的抗体仅仅只能跟特异的蛋白质结合而不是和膜结合。常用的封闭液有bovine serum albumin(BSA),non-fat milk,casein,gelatin,tween-20等,我们一般用non-fat milk。在转移结束前配好5%的Milk(TBST溶解)。转移结束后将膜放入milk中block(一定要放在干净的容器里,避免污染而且要足以覆盖膜

14、),并清洗整理好用过的滤纸,以便下次使用。 Block 4C O/N,或 RT 1小时。封闭后可以不洗膜,让膜的一角在吸水纸上接触,把封闭液控一下即可五、孵育一抗A. 先将需要检测的抗体准备好,并决定好它们的稀释度。B. 配好5%的Milk(TBST溶解),按要求稀释好抗体。注意,如需高比例稀释,最好采用梯度稀释。C. 将稀释好的抗体和膜一起孵育。 一般采用RT 1小时,可根据抗体量和膜上抗原量适当延长或缩短时间。注意:为了便于后面分析结果,我们一般会选用已确定分子量大小而且纯度高的抗体作为marker与一抗同时孵育。六、洗涤 用 TBST先快速洗三次,把milk尽快的wash掉。然后5min

15、s 5。洗涤是为了洗去一抗与抗原的非特异性结合,洗涤的效果直接影响结果背景的深浅。七、孵育二抗孵育 RT1 小时。 一般采用HRP标记的二抗,稀释比例为1:5000。二抗的稀释比例不能太低,否则容易导致非特异性的结合。注意二抗的选择有多种,要根据一抗来选择抗兔、抗鼠或者抗羊的二抗,以及根据后面的显色条件来选择HRP、AP或者GOD(葡萄糖氧化酶)酶链的二抗或者标志其他探针(如核素等)的。八、洗涤用 TBST先快速洗三次,把milk尽快的wash掉。 然后5mins 5。洗涤是为了洗去二抗的非特异性结合,洗涤的效果直接影响结果背景的深浅,所以洗涤一定要干净。九、显色(HRP酶)1增强化学发光法(

16、ECL)Ecl 显色原理:氨基苯二酰肼类主要是鲁米诺及异鲁米诺衍生物,是最常用的一类化学发光剂。鲁米诺(luminol,5-氨基-2,3-二氢-1,4-酞嗪二酮)的分子结构及化学反应式如下:鲁米诺在免疫测定中既可用作标记物,也可用作过氧化物酶的底物。在Ecl底物中,含有H2O2和鲁米诺,在HRP(辣根过氧化物酶)的作用下,发出荧光来。试验步骤:1)将两种显色底物1:1等体积混合(一般各1ml/membrane)。2)将混合物覆盖在膜表面,1-2分钟,摇晃使均匀。3)用保鲜膜把膜包起来,放入夹板中。4)在暗室中将X光片,覆盖在膜的上面,夹好夹子,曝光1min。5)显影、定影。6)根据结果调整曝光

17、时间和曝光区域,得到最佳结果。注意:荧光在一段时间后会越来越弱。2.DAB显色DAB(3,3二氨基联苯胺)和HRP反应产生棕色的不溶终产物。这种棕色沉淀不溶于酒精和其它有机溶剂,对于必需使用传统复染和封固介质的免疫组化染色应用特别理想。对于AP标记的二抗我们选用BCIP and NBT 显色,它们在碱性磷酸酶(AP)作用下反应可生成一种不溶性黑紫色沉淀的强信号。Western显色ECL灵敏度比DAB高不少杂带多的原因无非是几点:1、你的一抗如是多克隆抗体,可以试着降低一抗的浓度,如一抗是单抗,可适当降低二抗的浓度2、还有最重要的是确保封闭的充分,封闭最好时间长点,至少2小时室温封闭,时间允许可

18、4度过夜封闭3、就是洗膜一定要充分,我们一般PBST 10分钟三次,还有看你是DAB 显色吧,背景过深,DAB显色时间不要过长,一般2分钟足够。做一个好的阴性和阳性对照。这样出来的带该在哪个位置,不该在哪个位置一目了然十、分析结果及其判断常见问题原因分析及处理方法: 见附录一、二。附录一:Troubleshooting Blotting Problems (P4348)附录二:Western Blotting Troubleshooting Logic Tree (P390394)附录三:试验中所用到的试剂和缓冲溶液1) 5x Stop Solution (Sample buffer) pH6

19、.7:Stock: to use:20% Glycerol 100ml take 9.5ml stock 10% SDS 50g or 250ml 20% SDS add BME 0.5ml250mM Tris 15.14g bromphenol blue or total 475.00ml pyronine 4 to taste2) Gel solution (30% w/v acrylamide mix):0.8 bis-acrylamide 0.8g29.2% acrylamide 29.2gtotal 100ml3) 2x Laemmli Separation Buffer: 0.75

20、M Tris-HCl 90.825g0.2% SDS 10ml 20% SDStotal 1000mlpH8.84) 2x Laemmli Stacking Buffer:0.25M Tris 15.14g0.2% SDS 1g total 500mlpH6.85) 10x Laemmli Running Buffer:250mM Tris 60.55g1.9M Glycine 285.27g1% SDS 20g total 2 literspH8.36) Transfer Buffer:48mM Tris base 5.81g39mM Glycine 2.93g0.037% SDS 0.37

21、5g20% MeOH 200mltotal 1000ml 7) TBST: 10mM Tris-HCl, 1.21g100mM NaCl0.2% Tween-20Total 1000mlpH7.48) Coomassie Stain :40%MeOH 400ml10%HAc 100ml0.1%BBR 1g Brilliant Blue Rtotal 1000ml9) Destain:30%MeOH 300ml 7.5%HAc 75mltotal 1000ml10) 10丽春红染液配方:丽春红 2g磺基水杨酸 30g三氯醋酸 30gtotal 100ml11)DABDAB 50mg0.05mol

22、/L TB (PH7.6) 100ml30%H2O2 30-40ul先配成2-5倍的储存液,过滤后分装,-20避光保存,H2O2在工作液中终浓度0.01不显影不一定是抗原性丧失,Western blot 环节多,一抗和二抗原因是wb中比较难掌握准的环节。Western Blot详解(原理、分类、试剂、步骤及问题解答)Western免疫印迹(Western Blot)是将蛋白质转移到膜上,然后利用抗体进行检测。对已知表达蛋白,可用相应抗体作为一抗进行检测,对新基因的表达产物,可通过融合部分的抗体检测。本文主要通过以下几个方面来详细地介绍一下Western Blot技术:一、原理二、 分类i.放射

23、自显影ii.底物化学发光ECLiii.底物荧光ECFiv.底物DAB呈色三、 主要试剂四、 主要步骤五、 实验常见的问题指南1.参考书推荐2.针对样品的常见问题3.抗体4.滤纸、胶和膜的问题5.Marker的相关疑问6.染色的选择7.参照的疑问8.缓冲液配方的常见问题9.条件的摸索10.方法的介绍11.结果分析一、 原理与Southern或Northern杂交方法类似,但Western Blot采用的是聚丙烯酰胺凝胶电泳,被检测物是蛋白质,“探针”是抗体,“显色”用标记的二抗。经过PAGE分离的蛋白质样品,转移到固相载体(例如硝酸纤维素薄膜)上,固相载体以非共价键形式吸附蛋白质,且能保持电泳分

24、离的多肽类型及其生物学活性不变。以固相载体上的蛋白质或多肽作为抗原,与对应的抗体起免疫反应,再与酶或同位素标记的第二抗体起反应,经过底物显色或放射自显影以检测电泳分离的特异性目的基因表达的蛋白成分。该技术也广泛应用于检测蛋白水平的表达。 二、分类现常用的有底物化学发光ECL和底物DAB呈色,体同水平和实验条件的是用第一种方法,目前发表文章通常是用底物化学发光ECL。只要买现成的试剂盒就行,操作也比较简单,原理如下(二抗用HRP标记):反应底物为过氧化物+鲁米诺,如遇到HRP,即发光,可使胶片曝光,就可洗出条带。 三、主要试剂1、 丙烯酰胺和N,N-亚甲双丙烯酰胺,应以温热(以利于溶解双丙稀酰胺

25、)的去离子水配制含有29%(w/v)丙稀酰胺和1%(w/v)N,N-亚甲双丙烯酰胺储存液丙稀酰胺29g,N,N-亚甲叉双丙稀酰胺1g,加H2O至100ml。)储于棕色瓶,4避光保存。严格核实PH不得超过7.0,因可以发生脱氨基反应是光催化或碱催化的。使用期不得超过两个月,隔几个月须重新配制。如有沉淀,可以过滤。2、 十二烷基硫酸钠SDS溶液:10%(w/v)0.1gSDS,1mlH2O去离子水配制,室温保存。3、 分离胶缓冲液:1.5mmol/LTris-HCL(pH8.8):18.15gTris和48ml1mol/LHCL混合,加水稀释到100ml终体积。过滤后40C保存。4、 浓缩胶缓冲液

26、:0.5mmol/LTris-HCL(pH6.8):6.05gTris溶于40mlH2O中,用约48ml 1mol/L HCL调至pH6.8加水稀释到100ml终体积。过滤后40C保存。这两种缓冲液必须使用Tris碱制备,再用HCL调节PH值,而不用Tris.CL。5、 TEMED原溶液N,N,NN四甲基乙二胺催化过硫酸铵形成自由基而加速两种丙稀酰胺的聚合。PH太低时,聚合反应受到抑制。10%(w/v)过硫酸胺溶液。提供两种丙稀酰胺聚合所必须的自由基。去离子水配制数ml,临用前配制.6、 SDS-PAGE加样缓冲液:pH6.8 0.5mol/L Tris缓冲液8ml,甘油6.4ml,10%SD

27、S 12.8ml,巯基乙醇3.2ml,0.05%溴酚蓝1.6ml,H2O 32ml混匀备用。按1:1或1:2比例与蛋白质样品混合,在沸水终煮3min混匀后再上样,一般为20-25ul,总蛋白量100g。7、 Tris-甘氨酸电泳缓冲液:30.3gTris,188g甘氨酸,10gSDS,用蒸馏水溶解至1000ml,得0.25mol/L Tris-1.92mol/L甘氨酸电极缓冲液。临用前稀释10倍。8、 转移缓冲液:配制1L转移缓冲液,需称取2.9g甘氨酸、5.8gTris碱、0.37g SDS,并加入200ml甲醇,加水至总量1L。9、 丽春红染液储存液:丽春红S 2g 三氯乙酸30g 磺基水

28、杨酸 30g 加水至100ml 用时上述储存液稀释10倍即成丽春红S使用液。使用后应予以废弃。10、 脱脂奶粉5%(w/v)。11、 NaN3 0.02% 叠氮钠(有毒,戴手套操作),溶于磷酸缓冲盐溶液(PBS)。12、 Tris缓冲盐溶液(TBS):20mmol/LTris/HCL(pH7.5),500mmol/LnaCl。13、 Tween20(15)鼠抗人-MMP-9(16)鼠抗人-TIMP-1。14、 过氧化物酶标记的第二抗体。15、 NBT(溶于70%二甲基甲酰胺,75mg/ml)。16、 BCIP(溶于100%二甲基甲酰胺,50mg/ml)。17、 100mmol/LTris-HC

29、L(pH9.5)。18、 100mmol/L NaCl。19、 50mmol/LTris-HCL(pH7.5),5mmol/L EDTA。(可以参看分子克隆) 四、主要步骤生物秀为您搜集了现阶段几乎网上所有的Western Blot的中英文资料,仅供实验参考,可以根据自己实验的实际情况进行调整:Western Blot PROTOCOL:点击查看所有相关文章五、 实验常见的问题指南根据问题的类型主要分成以下几类(以下资料权作参考,请勿盲目模仿!):1. 参考书推荐A. 对初学者看什么资料比较好?解答:抗体技术实验指南和Antibodies(a laboratory manual, wrote

30、by Ed Harlow ,david lane)两本书不错。2. 针对样品的常见问题B. 做线粒体膜UCP2蛋白的Western Blot (以下简写成Western Blot),提取线粒体后冻存(未加蛋白酶抑制剂),用的博士德的一抗,开始还有点痕迹,现在越来越差,上样量已加到120g,换了个santa cloz的一抗仍不行。是什么原因?蛋白酶抑制剂单加PMSF行吗?解答:怀疑是样品问题,可能是:1,样品不能反复冻融;2,样品未加蛋白酶抑制剂。同时,建议检查Western Blot过程, 提高一抗浓度。对于加蛋白酶抑制剂来说,一般加PMSF就可以了,最好能多加几中种蛋白酶抑制剂。E. 同一蛋

31、白样品能同时进行两种因子的Western Blot检测吗?解答:当然可以,有的甚至可以同时测几十种样品。F. 如果目标蛋白是膜蛋白或是胞浆蛋白,操作需要注意什么?解答:如果是膜蛋白和胞浆蛋白,所用的去垢剂就要温和得多,这时最好加上NaF去抑制磷酸化酶的活性。G. 我的样品的蛋白含量很低,每微升不到1微克,但是在转膜时经常会发现只有一部分蛋白转到了膜上,就是在转膜后染胶发现有的孔所有的蛋白条带都在,只是颜色变淡了,有什么办法可以解决?解答:你可以加大上样量,没有问题,还有转移时你可以用减少电流延长时间,多加510甲醇。 H. 想分离的蛋白是分子量260kd的,SDS-PAGE电泳的分离胶浓度多大

32、合适?积层胶的浓度又该用多少?这么大分子量的蛋白容易作Western Blot吗?解答:260kd的蛋白不好做, 分离胶用6, Stacking Gel 3.5。I. 如果上样量超载,要用什么方法来增加上样量?如果需要加大上样量使原来弱的条带能看清楚。解答:可以浓缩样品,也可以根据你的目标分子量透析掉一部分小分子蛋白。一般地,超载30是不会有问题的。如果已经超了不少了,而且小分子量的也要,可以考虑加大胶的厚度,可以试试1.5mm的 comb。J. 蛋白变性后可以存放多久?解答:80,一两年没有问题。最关键两条:不要被蛋白酶水解掉;不要被细菌消化掉(也是被酶水解了)。K. 我所测定的蛋白分子量是

33、105KD,按理说分离胶应当采用7.5%,但我所查资料却要求分离胶和浓缩胶均采用11的配方,不知为何?解答:上述您提到的两种凝胶均可以使用,因为105的蛋白在上述两种胶的线性分辨范围内,但需注意条带位置。L. 接下来我准备采用DAB显色技术,二抗是生物素化的多克隆抗体,三抗是亲和素生物素体系,不知采用这样的方案后,封闭液是否要作调整,能否再用5的脱脂奶粉呢?好像有资料说脱脂奶粉会影响亲和素生物素的生成,是吗? 解答:不能使用脱脂奶粉,因为脱脂奶粉中含生物素,用代替应该好一点M. 还有一问题,一般一次上样的蛋白总量是多少,跟目的蛋白的表达量有关系吗?解答:Western Blot一般上样3010

34、0微克不等,结果跟目的蛋白的丰度、上样量、一二抗的量和抚育时间都有关系,也与显色时间长短有关。开始摸条件时,为了拿到阳性结果,各个步骤都可以量多一点时间长一点,当然背景也就出来了。要拿到好的结果,如果抗体好的话比较容易,抗体不好的话就需要反复地试了,当然有的不适合Western Blot的怎样做也不行。所以拿到好的结果不容易。N. 做组织样品的western的时候,处理样品有什么诀窍吗?还有,您用过大牛血清做封闭剂吗?浓度如何?效果是不是比BSA好一点?解答:必须进行研磨、匀浆、超声处理,蛋白质溶解度会更好,离心要充分,膜蛋白需用更剧 烈的方法抽提,低丰度膜蛋白可能还要分步抽提(超速离心)。还

35、有一点就是组织中的蛋白酶活性更强,需要注意抑制蛋白酶的活性(加入和蛋白酶抑制剂cocktail),封闭剂一般5%脱脂奶粉较常用。如果一抗为多克隆抗体,使用也是不错的选择。O. 您是否可以介绍一下大分子量蛋白200KD,在做western要注意什么呢?解答:做200kd蛋白的Western Blot时要注意,分离胶最好选择7%的;剥胶时要小心;转移时间需要相应延长;要做分子量参照(否则出现杂带不知道如何分析)。P. 有什么方法可以提高上样量?解答:可以浓缩样品;增大上样体积来增大上样量。Q. 我要检测的目的蛋白是分子量大概为42kd的膜蛋白,膜蛋白提取可不可以不用到超速离心机,有没有直接用低温高

36、速离心机就可以的提到膜蛋白的方法,42kd的蛋白分子量算不算大?解答:如是需要提取膜蛋白,(而不是只需要提取膜蛋白),可以用Ripa buffer提取膜蛋白和胞浆蛋白,用这个做Western Blot就可以了。如果是非要只提取膜蛋白就要用到超速离心机。42kd 不算大,也不算小,所以,可以按照一般的转移方法实施。R. 蛋白的上样量有没有什么具体的要求?解答:上样量要根据实验的要求来定, 如果要求是定量和半定量的Western Blot 则上样量要均等, 如果只是要定性,则没有太大的关系, 尽量多上就行了, 但是不要超过0.3g/mm2。S. 一抗,二抗的比例是否重要?解答:比较重要,调整好一抗

37、,二抗的比例,可以去掉部分非特异的本底。 3. 抗体T. 做细胞信号传导,要做磷酸化某因子Western Blot,其二抗有何要求?解答:对二抗无要求,要看你实验条件来选择,一般推荐用HRP标记的二抗。U. 同一公司的另外抗体用这个稀释度做出来效果很好,所以没做预试,怕费时间,用什么样的稀释度比较好呢?我用的ELL+plus试剂盒显色。转膜过夜,一抗孵育也是过夜的,若封闭也过夜的话就要四天才看的到结果了。解答:不同抗体,即使是同一公司的抗体,其最佳的抗体稀释度也是不一样的,需要你实验摸索。我觉得转膜过夜好像没有必要吧,转膜的目的也就是将蛋白转到膜上就行啦,何必浪费时间呢。至于具体的转膜时间,还

38、要看你的目的蛋白分子量的大小;转膜的设备,是半干式,还是湿式。一抗当然可以过夜,如果你想所短Western Blot时间的话,可以增高一抗的孵育温度,我们实验室一般37度,两小时就足够了;你可以参照抗体说明书。至于一抗和二抗得稀释度,你可以一抗1:1500;二抗1:20000试试。另外建议你洗膜时,多洗几次,最好是在封闭;一抗和二抗后至少是5x5min,跑一张好膜不容易,多尽点心吧,这样不会浪费你的时间,只会节省你的时间!V. 免疫组化和Western Blot可以用同一种抗体吗?解答:免疫组化时抗体识别的是未经变性处理的抗原决定簇(又称表位),有些表位是线性的,而有的属于构象型;线性表位不受

39、蛋白变性的影响,天然蛋白和煮后的蛋白都含有;构象型表位由于受蛋白空间结构限制,煮后变性会消失。如果你所用的抗体识别的是蛋白上连续的几个氨基酸,也就是线性表位,那么这种抗体可同时用于免疫组化和Western,而如果抗体识别构象形表位,则只能用于免疫组化。一般抗体说明书上都有注明此种抗体识别的氨基酸区间。(限于单抗)W. Western Blot 中抗体的重复应用问题解答:抗体工作溶液一般不主张储存反复使用,但是如抗体比较珍贵,可反复使用23次。稀释后应在23天内使用,4度保存,避免反复冻融。4. 滤纸、胶和膜的问题X. NC膜 PVDF膜 尼龙膜怎样鉴别?解答:尼龙膜是较理想的核酸固相支持物,有

40、多种类型;硝酸纤维素膜是目前应用最广的一种固相支持物,价格最便宜;PVDF膜介于二者之间。就结合能力而言:尼龙膜结合DNA和RNA能力可达480600g/cm2,可结合短至10bp的核酸片段;硝酸纤维素膜结合DNA和RNA能力可达80100g/cm2,对于200bp的核酸片段结合能力不强;PVDF膜结合DNA和RNA能力可达125300g/cm2。就温度适应性而言:尼龙膜经烘烤或紫外线照射后,核酸中的部分嘧啶碱基可与膜上的正电荷结合;硝酸纤维素膜依靠疏水性相互作用结合DNA,结合不牢固;PVDF膜结合牢固,耐高温,特别适合于蛋白印迹。就韧性而言:尼龙膜较强;硝酸纤维素膜较脆,易破碎;PVDF膜

41、较强。就重复性而言:尼龙膜可反复用于分子杂交,杂交后,探针分子可经碱变性被洗脱下来;硝酸纤维素膜不能重复使用;PVDF膜可以重复使用。Y. 在做Western Blot时,PBDF膜用甲醇浸泡的目的?解答:PVDF膜用甲醇泡的目的是为了活化PVDF膜上面的正电基团,使它更容易跟带负电的蛋白质结合,做小分子的蛋白转移时多加甲醇也是这个目的。Z. 检测磷酸化的JNK 和非磷酸化的JNK可以在同一张膜上吗?解答:可以。AA. 转膜后经丽春红染色的条带,为什么大蛋白分子的一端(即点样空的一侧)的转膜好象不是很好,为什么?解答:这是正常的,大分子的蛋白转移的慢, 你延长转移时间和电流,大分子一端就会好的

42、多,但是小分子的就有可能会变淡。BB. 我想问您裂解细胞用三去污裂解法,还是用上样缓冲液?解答:用上样缓冲液,这样有几个好处,可以提取总蛋白,同时又可以让磷酸化酶失活。CC. 采用tank system有什么讲究?解答:建议低电压,长时间,(一般tank System 用衡压好点),如 28V 1416hrs。DD. 做HSP WESTEN定量,同样的抗体免疫组化能做出,而WESTEN却不能?解答:这多半是抗体的问题,要看抗体的说明,是否能做Western Blot和IHC。EE. 膜一般要如何处理?解答:一般用甲醇泡泡就可以了。FF. 如果是68转印膜,要加多少一抗?解答:一抗的稀释度是有说

43、明的,根据你的一抗看看就知道了,但是那么大的膜孵育体积一般最少为35ml。 GG. 上下槽缓冲液有何要求,怎样才能达到最佳效果。解答:无要求。HH. 跑电泳的时候配的胶总是“缩”是什么原因呢?是有的成分不对吗?解答:没什么问题,就是你胶里的水分被蒸发了。过夜时拿保鲜膜包起来,在里面加点水保持湿度就可以了。如果过夜,胶里的水分被蒸发,采用保鲜膜包上也可以;也可能母液(30%聚丙酰胺)有问题,你可以重新配制一份观察;能够替换的试剂,尽量换一下,选用好的试剂,避免找问题麻烦。脱色液中甲醇的含量太高也会造成胶缩。 II. 膜、滤纸、胶大小有何讲究?解答:如果是用的是半干转,顺序为:阴极滤纸胶膜滤纸。滤

44、纸的长宽分别比胶小12mm,而膜的长宽分别比胶大12mm。绝对禁忌:上下两层滤纸因为过大而相互接触,这样会短路,电流不会通过胶和滤纸。JJ. 蛋白质的分子量跨度很大,如要分离小21KD,中至66KD,大至170KD,可以一次做好吗?解答:这么广的分布不好转移,一般建议:21kd和66kd可以一起转,12SDS-PAge, 湿转36V , 35hrs就可以了, 可以根据你实验室的经验调节;170kd 用7%SDSpage, 48V 10hrs16hrs。KK. 不能很好地将大分子量蛋白转移到膜上, 转移效率低怎么样解决?解答:可以考虑:转移缓冲液中加入20%甲醇(是指终浓度)(优化的转移缓冲液,可以参考蛋白质技术手册),因为甲醇可降低蛋白质洗脱效率,

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