第33章核酸的降解和核苷酸代谢.ppt

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1、第33章 核酸的降解 和核苷酸代谢,第33章 核酸的降解和核苷酸代谢,核酸和核苷酸的降解代谢 核苷酸的生物合成 辅酶核苷酸的生物合成,一、核酸和核苷酸的降解,核酸,核苷酸,核酸酶,(磷酸二酯酶),核苷 + 磷酸,核苷酸酶,(磷酸单酯酶),戌糖-1-磷酸 + 碱基 (嘌呤或嘧啶碱),核苷磷酸化酶,一、核酸和核苷酸的降解,1、核酸的解聚,磷酸二酯酶 (核酸酶),核糖核酸酶 核酸内切酶,脱氧核糖酸酶 核酸外切酶,磷酸二酯酶 (核酸酶),也有非特异性的磷酸二酯酶,如蛇毒磷酸二酯酶和牛脾磷酸 二酯酶(均为核酸外切酶),对核糖核酸和脱氧核糖核酸均 能水解,但前者是从核苷酸链的3-端开始,逐个水解下来5 -

2、核苷酸,后者从核苷酸链的5-端开始,逐个水解下来3-核 苷酸。,一、核酸和核苷酸的降解,1、核酸的解聚,蛇毒磷酸二酯酶,牛脾磷酸二酯酶,一、核酸和核苷酸的降解,1、核酸的解聚,蛇毒磷酸二酯酶,牛脾磷酸二酯酶,5,3,一、核酸和核苷酸的降解,2、核苷酸的降解,磷酸单酯酶 (核苷磷酸化酶),3-核苷酸酶,也有非特异性的磷酸单酯酶,对一切核苷酸均能作用,无论 磷酸基在2、3或5位置均可被水解下来。,5-核苷酸酶,核苷 + 磷酸,核苷 + H2O,碱基 + 戌糖-1-磷酸,碱基 + 戌糖,核苷磷酸化酶,核苷水解酶,(对脱氧核糖核苷不起作用),一、核酸和核苷酸的降解,3、嘌呤碱的分解,嘌呤碱的分解首先是

3、在各种脱氨酶的作用下水解脱去氨基。,腺嘌呤核苷酸,腺嘌呤核苷,腺嘌呤,次黄嘌呤核苷酸,次黄嘌呤核苷,次黄嘌呤,核苷酸酶,核苷磷酸化酶,核苷酸酶,核苷磷酸化酶,腺嘌呤核苷酸 脱氨酶,腺嘌呤核苷 脱氨酶,腺嘌呤 脱氨酶,鸟嘌呤,黄嘌呤,鸟嘌呤脱氨酶,一、核酸和核苷酸的降解,3、嘌呤碱的分解,黄嘌呤和次黄嘌呤可继续被分解。,黄嘌呤氧化酶,尿酸氧化酶,次黄嘌呤,黄嘌呤,尿酸(排尿酸动物),黄嘌呤氧化酶,尿囊素 (除人猿外的哺乳动物),尿囊酸 (硬骨鱼类),尿囊素酶,尿素+乙醛酸 (鱼类、两栖类),尿囊酸酶,氨+二氧化碳 (低等动物),一、核酸和核苷酸的降解,4、嘧啶碱的分解,胞嘧啶需要先脱氨生成尿嘧啶

4、后才继续被分解。,胞嘧啶脱氨生成尿嘧啶,后 者经还原生成二氢嘧啶(DHU) 最后环开裂生成-脲基丙酸, 水解后生成-丙氨酸。,一、核酸和核苷酸的降解,4、嘧啶碱的分解,胸腺嘧啶分解与尿嘧啶相似,先 还原成二氢胸腺嘧啶,再环裂解 生成-脲基异丁酸,后者水解生 成-氨基异丁酸。,二、核苷酸的生物合成,1、嘌呤核糖核苷酸的生物合成,嘌呤环的元素来源,二、核苷酸的生物合成,1、嘌呤核糖核苷酸的生物合成,生物体是从5-磷酸核糖焦磷酸开始,经一系列酶促反应,生 成次黄嘌呤核苷酸,再转变成其它嘌呤核苷酸。,起始步骤:,5-磷酸核糖,5-磷酸核糖-1-焦磷酸(PRPP),焦磷酸激酶,二、核苷酸的生物合成,1、

5、嘌呤核糖核苷酸的生物合成,Step 1:,5-磷酸核糖胺,PRPP,磷酸核糖焦磷酸 转酰胺酶,二、核苷酸的生物合成,1、嘌呤核糖核苷酸的生物合成,Step 2:,5-磷酸核糖胺,甘氨酰胺核苷酸 合成酶,甘氨酰胺核苷酸,二、核苷酸的生物合成,1、嘌呤核糖核苷酸的生物合成,Step 3:,甘氨酰胺核苷酸 转甲酰基酶,甘氨酰胺核苷酸,甲酰甘氨酰胺核苷酸,二、核苷酸的生物合成,1、嘌呤核糖核苷酸的生物合成,Step 4:,甲酰甘氨脒核苷酸 合成酶,甲酰甘氨酰胺核苷酸,甲酰甘氨脒核苷酸,二、核苷酸的生物合成,1、嘌呤核糖核苷酸的生物合成,Step 5:,氨基咪唑核苷酸 合成酶,5-氨基咪唑核苷酸,甲酰甘

6、氨脒核苷酸,二、核苷酸的生物合成,1、嘌呤核糖核苷酸的生物合成,Step 6:,氨基咪唑核苷酸羧化酶,5-氨基咪唑核苷酸,5-氨基咪唑-4-羧酸核苷酸,二、核苷酸的生物合成,1、嘌呤核糖核苷酸的生物合成,Step 7:,氨基咪唑琥珀基氨甲酰核苷酸 合成酶,5-氨基咪唑-4-(N-琥珀基) 氨甲酰核苷酸,5-氨基咪唑-4-羧酸核苷酸,二、核苷酸的生物合成,1、嘌呤核糖核苷酸的生物合成,Step 8:,腺苷酸琥珀酸裂解酶,5-氨基咪唑-4-(N-琥珀基) 氨甲酰核苷酸,5-氨基咪唑-4-氨甲酰核苷酸,二、核苷酸的生物合成,1、嘌呤核糖核苷酸的生物合成,Step 9:,氨基咪唑氨甲酰核苷酸转甲酰基酶

7、,5-甲酰胺基咪唑-4-氨甲酰核苷酸,5-氨基咪唑-4-氨甲酰核苷酸,二、核苷酸的生物合成,1、嘌呤核糖核苷酸的生物合成,Step 10:,次黄嘌呤核苷酸合酶,5-甲酰胺基咪唑-4-氨甲酰核苷酸,次黄嘌呤核苷酸,二、核苷酸的生物合成,1、嘌呤核糖核苷酸的生物合成,生物体内由次黄 嘌呤核苷酸经氨 基化或氧化分别 生成腺嘌呤核苷 酸和鸟嘌呤核苷 酸。,二、核苷酸的生物合成,1、嘌呤核糖核苷酸的生物合成,生物体内除了能以简单前体物质“从头合成”(de novo syn- thesis)核苷酸外,还能由预先形成的碱基与核苷合成核苷 酸,此称为“补救”途径(salvage)。,核苷 + 磷酸,碱基 +

8、戌糖-1-磷酸,核苷磷酸化酶,核苷 + ATP,核苷磷酸激酶,核苷酸 + ADP,腺嘌呤 + 5-磷酸核糖焦磷酸,磷酸核糖转移酶,核苷酸 + PPi,二、核苷酸的生物合成,1、嘌呤核糖核苷酸的生物合成,嘌呤核苷酸的从头合成受其二个终产物腺苷酸和鸟苷酸的 反馈控制。,二、核苷酸的生物合成,2、嘧啶核糖核苷酸的生物合成,嘧啶核苷酸的嘧啶环由氨甲酰磷酸和天冬氨酸合成的。 与嘌呤核苷酸合成不同的是,它首先形成嘧啶环,再与磷 酸核糖结合形成乳清苷酸,然后生成尿嘧啶,其它嘧啶核 苷酸则由尿嘧啶核苷酸转变而成。,二、核苷酸的生物合成,2、嘧啶核糖核苷酸的生物合成,氨甲酰磷酸的生成,二、核苷酸的生物合成,2、

9、嘧啶核糖核苷酸的生物合成,天冬氨酸转氨甲酰酶,二氢乳清酸酶,二氢乳清酸脱氢酶,乳清苷酸焦磷酸化酶,乳清苷酸脱羧酶,乳清苷酸,二、核苷酸的生物合成,2、嘧啶核糖核苷酸的生物合成,由尿嘧啶核苷酸转化成胞嘧啶核苷酸是在尿嘧啶核苷三 磷酸水平上进行的。即UMP在尿嘧啶核苷酸激酶下磷酸生 成UDP,后者在核苷二磷酸激酶下生成UTP。,胞嘧啶核苷合成酶,二、核苷酸的生物合成,2、嘧啶核糖核苷酸的生物合成,生物体也可利用已有的嘧啶碱与核苷合成嘧啶核苷酸。,UMP + PPi,尿嘧啶 + 5-磷酸核糖焦磷酸,UMP磷酸核糖转移酶,尿嘧啶 + 1-磷酸核糖,尿苷磷酸化酶,尿嘧啶核苷 + Pi,尿嘧啶核苷 + A

10、TP,尿苷激酶,UMP + ADP,二、核苷酸的生物合成,2、嘧啶核糖核苷酸的生物合成,嘧啶核苷酸生物合成的反馈调节,二、核苷酸的生物合成,3、脱氧核糖核苷酸的生物合成,脱氧核糖核苷酸由相应的核糖核苷酸还原形成。,核糖核苷酸还原酶,Arthur Kornberg won the 1959 Nobel Prize in Medicine for his discovery of the mechanism in the biological synthesis of deoxyribonucleic acid (before Watson and Crick won theirs!),二、核苷酸

11、的生物合成,3、脱氧核糖核苷酸的生物合成,核糖核苷酸还原酶 由R1和R2二个亚基组成,它们分开时没有酶活性; R1亚基酶活性调节位点影响整个酶活性,ATP结合使酶活化,dATP结合使酶抑制; R1亚基第二个调节位点是底物特异性位点,当ATP和dATP结合有利于UDP和CDP的还原,当dTTP或dGTP结合时分别促进GDP和ADP的还原; R2的二条亚基各有一个酪氨酰基和一个双核铁(Fe3+)辅因子; 通常核糖核苷酸是在核苷二磷酸水平上被还原的。,二、核苷酸的生物合成,3、脱氧核糖核苷酸的生物合成,核糖核苷酸还原酶,二、核苷酸的生物合成,3、脱氧核糖核苷酸的生物合成,核糖核苷酸还原需要二个氢,其

12、最终的给体是NADPH,硫氧还蛋白,谷氧还蛋白,二、核苷酸的生物合成,3、脱氧核糖核苷酸的生物合成,胸腺嘧啶脱氧核苷 酸( dTMP)由尿 嘧啶脱氧核糖核苷 酸(dUMP)甲基 化而成。,三、辅酶核苷酸的生物合成,1、烟酰胺核苷酸的生物合成,烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD)和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸 磷酸(NADP)在生物氧化中起氢传递体的作用。由烟酸 合成烟酰胺腺嘌呤二核苷酸需要三步反应。,烟酸 + 5-磷酸核糖焦磷酸,烟酸单核苷酸 + PPi,烟酸单核苷酸 焦磷酸化酶,烟酸单核苷酸 + ATP,脱酰胺-NAD + PPi,脱酰胺-NAD 焦磷酸化酶,NAD+Glu + AMP + PPi,脱酰胺

13、-NAD + Gln +ATP,NAD合成酶,三、辅酶核苷酸的生物合成,1、烟酰胺核苷酸的生物合成,烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD)和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸 磷酸(NADP)在生物氧化中起氢传递体的作用。由烟酸 合成烟酰胺腺嘌呤二核苷酸需要三步反应。,NAD + ATP,NADP + ADP,NAD激酶,三、辅酶核苷酸的生物合成,2、黄素核苷酸的生物合成,黄素单核苷酸(FMN)和黄素腺嘌呤二核苷酸(FAD)在 生物氧化中起氢和电子传递体的作用。,核黄素 + ATP,FMN + ADP,黄素激酶 Mg2+,FMN + ATP,FAD + PPi,FAD焦磷酸化酶,三、辅酶核苷酸的生物合成,3、辅酶A

14、的生物合成,CoA的四个组成部分: -巯基乙胺 泛酸 磷酸 腺苷酸,三、辅酶核苷酸的生物合成,3、辅酶A的生物合成,CoA的合成步骤: 泛酸4-磷酸泛酸 4-磷酸泛酰半胱氨酸 4-磷酸泛酰巯基乙胺 脱磷酸辅酶A CoA,三、辅酶核苷酸的生物合成,3、辅酶A的生物合成,Step 1:,ATP,ADP,泛酸激酶,泛酸,4-磷酸泛酸,三、辅酶核苷酸的生物合成,3、辅酶A的生物合成,Step 2:,Cys+ATP,ADP+Pi,磷酸泛酰半胱氨酸合成酶,4-磷酸泛酰半胱氨酸,4-磷酸泛酸,三、辅酶核苷酸的生物合成,3、辅酶A的生物合成,Step 3:,CO2,磷酸泛酰半胱氨酸脱羧酶,4-磷酸泛酰半胱氨酸,4-磷酸泛酰巯基乙胺,三、辅酶核苷酸的生物合成,3、辅酶A的生物合成,Step 4:,PPi,焦磷酸化酶,脱磷酸辅酶A,4-磷酸泛酰巯基乙胺,ATP,三、辅酶核苷酸的生物合成,3、辅酶A的生物合成,Step 4:,ADP,脱磷酸辅酶A激酶,脱磷酸辅酶A,ATP,辅酶A,

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