华大HPV基因分型检测.ppt

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1、华大基因 HPV 基因分型检测,深圳华大基因研究院,内容提要,华大基因简介,华大基因,华大基因是全球最大的基因研究中心,建立了大规模测序、 生物信息、克隆、健康、能源、农业基因组等技术平台。 华大基因已逐步将基因组领域的最新研究成果应用于临床,同时将最新的基因检测技术应用于分子诊断中。,深圳华大基因研究院 临床检验中心,深圳华大基因临床检验中心成立于2007年,隶属于深圳华大基因健康事业部,同年获得医疗机构执业许可证。 华大基因临床检验中心的临床基因扩增实验室于2008年成功获得卫生部临检中心的准入验收。 华大基因临床检验中心为独立的第三方医学检测实验室,有出具医学检验报告资质。 华大基因临检

2、中心于2009年正式开展临床检测服务。,人类乳头瘤病毒(HPV)与宫颈癌,人类乳头瘤病毒 (Human Papillomaviruses, HPV),双链DNA无包膜病毒 环状DNA,约8Kb; 病毒颗粒直径为50-55nm; 依靠宿主细胞进行复制、 转录和翻译; L1区是既保守又特异的区域,可作为HPV基因分型的目标区域。,1995年IARC专题讨论会:高危型HPV持续感染是宫颈癌的主要病因。 2008年: Harald zur Hausen因发现HPV和宫颈癌的关系而获得诺贝尔生理学或医学奖。,宫颈癌是目前唯一病因明确,可以早发现、早预防的癌症。,哪些型别属于高危型HPV?,低危型:6、1

3、1、42、43、44、53、81 高危型:16、18、26、31、33、35、39、45、 51、52、53、56、58、59、66、68、73、82(2005年IARC专题讨论会),来自世界各国的宫颈癌组织标本研究发现,高危型HPV16、18型在宫颈癌患者中的感染率最高,约占64%。但是做HPV检测时,只检测16、18型是远远不够的,还有约36%的宫颈癌是由其他型别的HPV病毒引起的。,基因检测早于细胞!,高危型HPV的持续感染导致宫颈癌发生,(能精确到DNA水平),基因水平检测方法,(只能精确到细胞水平),HPV基因检测比传统的宫颈癌筛查方法更早发现宫颈癌前病变,可以起到预防的作用,这样有

4、利于宫颈癌癌前病变的早发现、早诊断、早治疗。,非分子水平检测方法,HPV不同亚型感染与许多疾病具有相关性,我国宫颈癌的现状,我国宫颈癌的现状,发病率世界第二,发病率(1/10万),我国宫颈癌的现状,发病率世界第二,发病率逐年升高,数据来源:2009中国卫生统计年鉴,我国宫颈癌的现状,发病率世界第二,呈现年轻化趋势,(资料来源:中国预防医学杂志),发病率逐年升高,华大基因HPV基因分型检测服务,目前常用的宫颈癌检测技术,基因水平检测不但可以对HPV病毒进行分型检测,而且还可以起到预防和警示作用,这样有利于HPV感染的早发现、早诊断、早处理。,HPV 基因分型检测的临床意义,宫颈病变风险提示,AS

5、CUS和低度病变的分流,术后随诊手段,疫苗接种前的有效性指导,降低筛查成本,The PCR-MS Base Method,PCR技术: 1993年诺贝尔化学奖,飞行时间质谱技术: 2002年诺贝尔化学奖,华大基因HPV基因分型技术,该检测方法的最大特点是将两种先进的检测技术整合起来,从而形成巨大的技术优势。,MALDI-TOF-MS原理简介,MassARRAY平台的核心技术为MALDI-TOF-MS,即基质辅助激光解析电离飞行时间质谱技术。,通过测定离子的质量电荷之比(M/Z)与离子的飞行时间成正比进行检测,MALDI-TOF-MS,准确 特异性高于目前经典的检测方法 灵敏 能检测到的病原体最

6、小拷贝数为10 精确分型 对全部14种高危HPV型别,及两种生殖道疣的主要致病病毒(6、11)的精确分型 高通量、集成检测 日检测量可达10000份样本 科研服务 可根据需求增加HPV检测型别,最多可以检测200多种亚型,华大基因HPV 基因检测特点,现行HPV 基因检测技术比较 (基于真实临床样本检测数据),N/A :不可用,成功案例,参与了由深圳女医师协会发起,北大医院、美国克利夫兰临检中心联合开展的万人宫颈癌筛查项目。华大基因质谱技术获得了一致好评,被认为独具优势,值得大力推广。 与北京肿瘤研究所合作并开展河南安阳地区食管HPV检测项目,累计进行了万余人份的筛查。,服务内容: HPV D

7、NA检测主要用于妇科宫颈筛查, 也可用于其他临床或者科研目的的人体样本检测 提供全部14种高危型HPV及两种生殖道疣的主要致病病毒(6、11)的精确分型检测服务 亦可根据临床需求增减检测型别 提供临检中心出具的检测报告 接受样本类型: TCT液基细胞学保存液保存的宫颈脱落细胞 宫颈脱落细胞样本(华大提供宫颈刷和细胞保存管) 活检组织样本 皮肤拭子,生殖道拭子等,Genital Warts,华大基因HPV 基因分型检测服务,服务流程: 临床样本接收样本入库PCR-PEX-MS分型检测数据分析临床检测报告 服务时间: 珠三角地区从样本接受日到检测报告发出,仅需3个工作日(根据具体地域不同,服务时间稍有差异,详情请咨询客服。),

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