三、核酸1.ppt

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1、第三章 核酸的结构与功能,Chapter 3 Structure and Function of Nucleic Acid,核酸是存在于细胞中的一类大分子酸性物质,包括核糖核酸(RNA)和脱氧核糖核酸(DNA)两大类。,一、Whats nucleic acid?,二、核酸的分类及分布,(DNA),(RNA),脱氧核糖核酸,核糖核酸,RNA和DNA都是以单核苷酸为基本单位所组成的多核苷酸长链。,Section 1 The Chemical Component and Primary Structure of Nucleic Acid,第一节 核酸的化学组成 及一级结构,核酸的水解产物:,核酸,核

2、苷酸,磷酸,核苷,戊糖,含氮碱,核糖,脱氧核糖,嘌呤碱,嘧啶碱,嘧啶碱:,一、核苷酸中的碱基与戊糖,尿嘧啶 胞嘧啶 胸腺嘧啶 Uracil,U Cytosine,C Thymine,T,嘌呤碱:,3,1,2,4,5,6,7,8,9,腺嘌呤(adenine, A),鸟嘌呤(guanine, G),戊糖:,核苷:,核苷是由戊糖与含氮碱基经脱水缩合而生成的化合物。 在大多数情况下,核苷是由核糖或脱氧核糖的C1-羟基与嘧啶碱N1或嘌呤碱N9进行缩合,生成的化学键称为糖苷键。,腺苷(AR) 脱氧胞苷(dCR),1,1,N9,N1,OH,核苷:AR, GR, UR, CR 脱氧核苷:dAR, dGR, d

3、TR, dCR,核苷酸: AMP, GMP, UMP, CMP 脱氧核苷酸: dAMP, dGMP, dTMP, dCMP,核苷酸的结构与命名,核苷(脱氧核苷)和磷酸以磷酸酯键连接形成核苷酸(脱氧核苷酸)。,3,5-磷酸二酯键的形成,核苷酸的命名及缩写符号,体内重要的游离核苷酸及其衍生物,含核苷酸的生物活性物质: NAD+、NADP+、CoA-SH、FAD 等都含有 AMP,多磷酸核苷酸:NMP,NDP,NTP,环化核苷酸: cAMP,cGMP,AMP,ADP,ATP,cAMP,多核苷酸链,核酸就是由许多核苷酸单位通过3,5-磷酸二酯键连接起来形成的不含侧链的长链状化合物。 核酸是具有方向性的

4、长链状化合物,多核苷酸链的两端,一端称为5-端,另一端称为3-端。,C,G,A,二、核酸的一级结构,定义 核酸中核苷酸的排列顺序。由于核苷酸间的差异主要是碱基不同,所以也称为碱基序列。,书写方法,5 pApCpTpGpCpT-OH 3,5 A C T G C T 3,第二节 DNA的空间结构与功能,Section 2 Dimensional Structure and Function of DNA,一、DNA的二级结构双螺旋结构模型,DNA双螺旋结构是DNA二级结构的一种重要形式,它是Watson和Crick两位科学家于1953年提出来的一种结构模型(获1962年度诺贝尔奖)。,James

5、Watson (L) and Francis Crick (R), and the model they built of the structure of DNA,Chargaff 研究小组的贡献,19501953,Chargaff研究小组对DNA的化学组成进行了分析研究,发现: DNA碱基组成有物种差异,且物种亲缘关系越远,差异越大; 相同物种,不同组织器官中DNA碱基组成相同,而且不因年龄、环境及营养而改变; DNA分子中四种碱基的摩尔百分比具有一定的规律性,即A=T、G=C、A+G=T+C。这一规律被称为Chargaff规则。,B型DNA双螺旋结构模式图,碱基配对及氢键形成,B型双螺旋

6、DNA的结构特征,1. 为右手、反平行双螺旋,形成大沟及小沟相间。 2. 主链位于螺旋外侧,碱基位于内侧; 3. 两条链间存在碱基互补:A与T或G与C配对形成氢键,称为碱基互补原则(A与T为两个氢键,G与C为三个氢键); 4. 螺旋的稳定因素为氢键和碱基堆砌力; 5. 螺旋的螺距为3.4nm,直径为2nm。,B型双螺旋DNA的结构特点:,“大沟”、“小沟”的功能,沟状结构与DNA、蛋白质间的相互识别有关。,目前已知DNA双螺旋结构可分为A、B、C、D及Z型等数种,除Z型为左手双螺旋外,其余均为右手双螺旋。,(二)DNA双螺旋结构的多样性,(二)DNA双螺旋结构的多样性,A-DNA B-DNA

7、Z-DNA,二、DNA的超螺旋结构及其在染色质中的组装,超螺旋结构(superhelix 或supercoil) DNA双螺旋链再盘绕即形成超螺旋结构。 正超螺旋(positive supercoil) 盘绕方向与DNA双螺旋方向相同。 负超螺旋(negative supercoil) 盘绕方向与DNA双螺旋方向相反。,绝大多数原核生物的DNA都是共价封闭的环状双螺旋。如果再进一步盘绕则形成麻花状的超螺旋结构。,(一)原核生物DNA的高级结构:,(二)DNA在真核生物细胞核内的组装,真核生物染色体由DNA和蛋白质构成,其基本单位是核小体(nucleosome)。,核小体的组成 DNA:约200

8、bp 组蛋白:H1 H2A,H2B H3 H4,核小体的结构,核小体、染色质与染色体,三、DNA的功能,DNA的基本功能是作为遗传信息的载体,为生物遗传信息复制以及基因信息的转录提供模板。,DNA分子中具有特定生物学功能的片段称为基因(gene)。 一个生物体的全部DNA序列称为基因组(genome)。,第三节 RNA的结构与功能,Section 3 Structure and Function of RNA,RNA通常以单链形式存在,但也可形成局部的双螺旋结构。 RNA分子的种类较多,分子大小变化较大,功能多样化。 主要的RNA种类有rRNA、mRNA、tRNA、HnRNA。,RNA的种类、

9、分布与功能,一、mRNA的结构与功能,mRNA可形成局部双螺旋结构的二级结构。 mRNA在真核生物中的初级产物称为HnRNA。,内含子(intron)编码序列,外显子 (exon)编码序列,大多数真核成熟的mRNA分子具有典型的5-端的7-甲基鸟苷二磷酸(m7GTP)帽子结构和3-端的多聚腺苷酸(polyA)尾巴结构。,真核生物mRNA 3-端的polyA结构,mRNA分子中每三个相邻的核苷酸组成一组,在蛋白质翻译合成时代表一个特定的氨基酸,这种核苷酸三联体称为遗传密码(coden)。 mRNA分子中带有遗传密码,其功能是为蛋白质的合成提供模板(templet)。,真核细胞,二、tRNA的结构

10、与功能,tRNA是分子最小,但含有稀有碱基最多的RNA,其稀有碱基的含量可多达20%。 tRNA是单链核酸,但其分子中的某些局部也可形成双螺旋结构。,(二)tRNA的二级结构(三叶草形),二、转运RNA的结构与功能,DHU环 反密码环 TC环 附加叉 氨基酸臂,三环四臂一叉,(三)tRNA的三级结构 倒L形,(四)tRNA的功能 活化、搬运氨基酸到核糖体,参与蛋白质的翻译。,(二)tRNA的三级结构:,三、rRNA的结构与功能,rRNA与蛋白质一起构成核蛋白体,作为蛋白质生物合成的场所。,* rRNA的种类(根据沉降系数),真核生物 5S rRNA 28S rRNA 5.8S rRNA 18S

11、 rRNA,原核生物 5S rRNA 23S rRNA 16S rRNA,大肠杆菌16S rRNA的二级结构,四、其他小分子RNA及RNA组学,第四节 核酸的理化性质、变性和复性,Section 4 The Physical and Chemical Characters, Denaturation and Renaturation of Nucleic Acid,需要解决的问题:,核酸具有哪些理化性质? 什么是核酸的变性和复性? 什么是核酸的分子杂交?,核酸具有酸性;能吸收紫外光,最大吸收峰为260nm。 故常用紫外分光光度法测定核酸的含量。,一、核酸的一般理化性质,二、DNA的变性,引起D

12、NA变性的因素主要有:高温, 强酸强碱,有机溶剂等。,定义:在某些理化因素作用下,DNA双链解开成两条单链的过程。,DNA变性的本质是双链间氢键的断裂,增色效应:指DNA变性后对260nm紫外光的光吸收度增加的现象;,DNA变性后的性质改变:,加热DNA溶液,使其对260nm紫外光的吸收度突然增加,达到其最大值一半时的温度,就是DNA的解链温度(熔点,melting temperature, Tm)。,DNA的解链温度,Tm的高低与DNA分子中G+C的含量有关,G+C的含量越高,则Tm越高。,三、DNA的复性与分子杂交,DNA复性的定义 在适当条件下,变性DNA的两条互补链可恢复天然的双螺旋构

13、象,这一现象称为复性。,减色效应 DNA复性时,其溶液OD260降低。,热变性的DNA经缓慢冷却后即可复性,这一过程称为退火。,不同来源的DNA变性后,在一起复性,只要核酸分子的核苷酸序列含有可以形成碱基互补的片段,彼此间就可以形成局部双链,即形成杂化双链,这一过程称为杂交。,核酸杂交可以是DNA-DNA,也可以是DNA-RNA杂交。,DNA 分子的变性、复性与杂交,DNA-DNA杂交示意图,DNA-RNA杂交示意图,掌握 1DNA和RNA分子组成的异同; 2掌握核苷酸之间的连接方式及多核苷 酸链的方向性; 3掌握DNA双螺旋结构模型要点 4掌握核酸的紫外吸收性、DNA变性、 Tm、复性及杂交的概念。 熟悉 1核酸的分类、细胞分布及生物学功能; 2熟记常见的核苷酸的缩写符号; 3熟悉mRNA、tRNA的结构特点及功能。,蛋白质与核酸结构比较,

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