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1、我国汉坦病毒基因型和基因亚型的分布研究 王世文, 杭长寿, 王华, 解燕乡, 马本江 (中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所, 北京 ! “ “ “ # $) 摘要: 为了搞清全国汉坦病毒的基因型和亚型的分布情况, 广泛收集了全国各地汉坦病毒毒株、 阳性病人血清和阳 性鼠肺, 并应用% :, 可能是一个新型病毒。 关键词: 汉坦病毒; 基因型; 亚型; 分布 中图分类号: % 6 8 6 9 2 文献标识码: ? A B C D C E F A G) 汉坦病毒属 (, A ? H A B C D I) , 为分节段的单股负链 % . M(+ 0 1 /) 型 病毒 $ 3 。虽然目前我国流行的
2、, /仍然主要是 , 卷第6期 $“$年2月 病毒学报 ) , N . 0 + 0X 1 Y % . . ? (A) 3 ?( . , $ . , $ B (A) / C( ( E : ; (!) / ( ( E G ; (!) / ( . 9 (A) . 9. 0 H. I. I ( D $ J (A) . 9. 0 H. G. G O ! 病毒“ # $的提取用/ H N提取试剂0 !+无 / H N酶的去离子水溶解,1 G ; 保存备用。 % “ !+去离子水中,1 F ; 保存。 * 核苷酸序列测定和分析序列测定使用N W G E H N自 动测序仪, E H N ( 0 N /软件分
3、析比较测核苷酸序列。 结果 + 全国, -基因型和基因亚型分布 目前我国流行的. A仍然为. 0 H A和( F株其7和 (片段分属. B和. F亚型, 可能是一个自然存在的 基因重排病毒。 ! 全国, -的进化分析 在我国流行的. A中, . 0 H A可分为B个亚 型, ( ) 。但 H # : Q G株在种系发生上与其它. 0 H A明显不同, 比 较核苷酸序列发现, 其7片段与其它. 0 H A的同 源性在G : a# G Q G a之间, (片段则只有U F a # U G I a, 提示可能是一个新型病毒。 F:F 病毒学报 : I卷 图!我国“ #的基因型和基因亚型分布 $ %
4、临床诊断及分型的 需要, 加之有的病毒很难形成空斑, 而有的病毒则极 难分离, 因此: ; 疫区的“ #毒株、 病人血清及宿主动物阳性 鼠肺进行了基因分型研究, 并对“ #各基因型和基 因亚型在我国的分布情况以及其种系发生作了初步 探讨。研究中分别使用“ = C D #E和型 特异性引物, 共测定了F B株“ #的部分E片段和 ! G株“ #的部分片段的核苷酸序列, 基本摸清了 “ #各基因型和基因亚型在我国的分布情况, 其中 汉滩型疫区分别为黑龙江、 浙江、 安徽、 四川、 贵州、 陕西、 甘肃、 宁夏, 汉城型疫区为吉林、 内蒙古、 河北、 河南、 山西、 广东、 海南、 江西、 云南,
5、混合型疫区为北 京、 山东、 上海、 江苏、 福建、 湖北, 但其亚型分布不甚 相同。当然由于有的疫区标本较少, 尚有待于进一 步研究。 从“ #的种系发生情况来看, “ = C D #可分为H!I个亚型, 并且具有明显 的地区聚集现象, 许多疫区都存在着其各自的优势 “ #基因型或亚型, 这可能是因为“ #与本疫区的 优势自然宿主共进化造成的 ! ! 。从致病性上看, “ = C D #中 !、 K亚型均有病例分布, 与“ $ ; 发病关系密切, 而 其它亚型尚未发现对人有致病性, 特别是基因重排 病毒L K J株和可能的新型病毒 4 4 , 5 ? ,“ 6 2 ,0 4 $ W Z,A Y MZ W O Z . + 1 + H C= O Y M = Z O ? * 0 F * G A E * H C 8 “ 病毒学报 ; 卷