【优质文档】生物化学期末复习之名词解释.pdf

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1、学习必备欢迎下载 生物化学复习提纲之名词解释 等电点 :在某一PH 的溶液中,氨基酸或蛋白质解离成阳离子和阴离子的趋势或程度相等, 成为兼性离子,呈电中性,此时溶液的pH 成为该氨基酸或蛋白质的等电点。 肽键: 一分子氨基酸的 羧基和一分子氨基酸的 氨基脱水缩合形成的酰胺键,即 -CO-NH- 。 肽:肽是介于氨基酸和蛋白质之间的物质。两个或以上的氨基酸脱水缩合形成若干个肽键从 而组成一个肽,多个肽进行多级折叠就组成一个蛋白质分子。 蛋白质的一级结构:在每种蛋白质中氨基酸按照一定的数目和组成进行排列,并进一步折叠 成特定的空间结构前者我们称为蛋白质的一级结构。 蛋白质二级结构:指它的多肽链中有

2、规则重复的构象,限于主链原子的局部空间排列,不包 括与肽链其他区段的相互关系及侧链构象。 肽单位: 肽键的所有四个原子和与之相连的两个- 碳原子所组成的基团。 超二级结构 :也称之 基元 (motif ) 。是指在球状蛋白质分子的一级结构的基础上,相邻的二 级结构单位( 螺旋 折叠等)在三维折叠中相互靠近,彼此作用,在局部形成规则的二级 结构组合体,这种组合体就是超二级结构。 - 螺旋( -helix):蛋白质中常见的二级结构,肽链主链绕假想的中心轴盘绕成螺旋状, 一般都是右手螺旋结构,螺旋是靠链内氢键维持的。 折叠: 蛋白质的二级结构,肽键平面折叠成锯齿状,相邻肽链主链的N-H和 C=O之间

3、形成 有规则的氢键, 在- 折叠中, 所有的肽键都参与链间氢键的形成,氢键与 - 折叠的长轴呈 垂直关系。 结构域 :生物大分子中具有特异结构和独立功能的区域,特别指蛋白质中这样的区域。 蛋白质变性 :是指蛋白质在某些物理和化学因素作用下其特定的空间构象被改变,从而导致 其理化性质的改变和生物活性的丧失,这种现象称为蛋白质变性。 复性: 原有性质的意思。变性的生物大分子恢复成具有生物活性的天然构象的现象。变性 的一种逆转。 全酶 =酶蛋白 +辅因子 酶原: 某些酶在细胞内合成或初分泌时没有活性,这些没有活性的酶的前身称为酶原 共价催化: 个底物或底物的一部分与催化剂形成共价键,然后被转移给第二

4、个底物。许多酶 催化的基团转移反应都是通过共价催化方式进行的。 学习必备欢迎下载 酸-碱催化: 质子转移加速反应的催化作用。 酶的活性部位: 有些必需基团虽然在一级结构上可能相距很远,但在形成空间结构时彼此靠 近,集中在一起,形成具有一定空间结构的区域,并能与底物特异地结合,将底物转化为产 物。这一区域,称为酶的活性部位(Active site ) 。 米氏常数: 它的数值等于酶促反应达到其最大速度Vm一半时的底物浓度S 竞争性抑制作用:有些抑制剂和酶底物结构相似,可与底物竞争酶活性中心,从而抑制酶和 底物结合成中间产物。 非竞争性抑制作用:抑制剂既可以与游离酶结合,也可以与ES 复合物结合,

5、使酶的催化活 性降低。 反竞争性抑制作用:抑制剂只与酶-底物复合物结合,而不与游离酶结合的一种酶促反应抑 制作用。这种抑制作用使得Vmax ,Km都变小,但Vmax/Km比值不变。 辅助因子: 结合酶由蛋白质部分和非蛋白质部分组成,前者称为酶蛋白(apoenzyme),后者 称为辅助因子 (cofactor),酶蛋白和辅助因子结合形成的复合物称为全酶, 只有全酶才有催 化作用。 辅酶:是一类可以将化学基团从一个酶转移到另一个酶上的有机小分子,与酶较为松散地结 合,对于特定酶的活性发挥是必要的。辅酶中紧密共价结合的小分子有机物,与酶或蛋白质 结合的非常紧密,用透析法不能除去。 酶活力: 是指酶催

6、化一定化学反应的能力。 激活剂: 能提高酶活性的物质。 抑制剂: 滞或降低化学反应速度的物质,作用与负催化剂相同。它不能停止聚合反应,只是 减缓聚合反应。借以抑制或缓和化学反应的物质。 酶的专一性: 对所作用的底物有严格的选择性。一种酶仅能作用于一种物质,或一类分子结 构相似的物质,促其进行一定的化学反应,产生一定的反应产物。 中间产物学说:酶促反应中,酶首先和底物结合成不稳定的中间配合物(ES ),然后再生成 产物( P),并释放出酶。反应式为S+E=ES E+P ,这里 S代表底物, E代表酶, ES为中间 产物, P为反应的产物 醛糖: 一类单糖,该单糖中氧化数最高的C原子(指定为C-1

7、)是一个醛基,有醇和醛的性 质。 酮糖: 一类单糖,该单糖中氧化数最高的C原子(指定为C-2)是一个酮基。 变旋: 一个吡喃糖、呋喃糖或糖苷伴随着它们的 -和 -异构形式的平衡而发生的比旋度变 化。 学习必备欢迎下载 糖苷: 糖半缩醛羟基与另一个分子(例如醇、糖、嘌呤或嘧啶)的羟基、胺基或巯基缩合形 成的糖衍生物。 糖苷键: 一个环状单糖半缩醛(或半缩酮)羟基与另一个分子(例如醇、糖、嘌呤或嘧啶) 的羟基、 胺基或巯基之间缩合形成的缩醛键或缩酮键,糖苷键是连接提供半缩醛羟基的糖和 与之缩合的“非糖”部分的化学键。 还原糖 :指具有还原性的糖类。在糖类中, 分子中含有游离醛基或酮基的单糖和含有游

8、离醛 基的二糖都具有还原性。 同多糖: 一种单糖缩合形成的多糖。 必需脂肪酸 :机体生命活动必不可少,但机体自身又不能合成,必需由食物供给的多不饱和 脂肪酸( PUFA) 。 磷脂: 是含有磷酸的脂类,属于复合脂。磷脂组成生物膜的主要成分。 脂肪酸: 是指一端含有一个羧基的长的脂肪族碳氢链,是有机物, 直链饱和脂肪酸的通式是 C(n)H(2n+ 1)COOH 。 生物膜: 镶嵌有蛋白质和糖类(统称糖蛋白)的磷脂双分子层,起着划分和分隔细胞和细胞 器作用生物膜, 也是与许多能量转化和细胞内通讯有关的重要部位,同时, 生物膜上还有大 量的酶结合位点。细胞、细胞器和其环境接界的所有膜结构的总称。 流

9、体镶嵌模型: 所有的生物膜都是连续的脂双分子层,里面埋着各种膜蛋白。脂层是流动的, 脂分子能够在自己所在的单层中迅速扩散,但是很少翻转到另一层。蛋白质以各种方式跟脂 结合, 可分为内嵌蛋白和外周蛋白。蛋白质分子也能水平扩散运动。细胞膜中蛋白质所带的 糖链远远多于脂分子结合的糖链,糖链都伸向质膜外表面。 被动转运 :物质或离子顺着浓度梯度或电位梯度通过细胞膜的扩散过程,其特点是不需要细 胞提供能量。是细胞膜的物质转运作用其中的一种。包括简单扩散、滤过和易化扩散三种。 主动转运: 些物质(如钾离子、钠离子)以细胞膜特异载体蛋白携带下,通过细胞膜本身的 某种耗能过程,逆浓度差或逆电位差的跨膜转运称为

10、主动转运。 协同运送: 可以通过一个转运蛋白进行同一方向(同向转运)或反方向(反向转运)转运。 酸败 :油脂在贮藏时由于与空气等作用发生氧化而进一步分解产生异臭味的现象。 核苷酸: 一类由嘌呤碱或嘧啶碱、核糖或脱氧核糖以及磷酸三种物质组成的化合物。 磷酸二酯键:指一分子磷酸与两个醇(羟基)酯化形成的两个酯键。 DNA 双螺旋: 是一种核酸的构象,在该构象中,两条反向平行的多核苷酸链相互缠绕形成 一个右手的双螺旋结构。 学习必备欢迎下载 DNA 变性 :指核酸双螺旋碱基对的氢键断裂,双链变成单链,从而使核酸的天然构象和性 质发生改变。 融解温度: 热变性中光吸收达到最大吸收(完全变性)一半(双螺

11、旋结构失去一半)时的温 度。对 DNA 加热时,二条链的氢键断开变成单链状态,把引起这种变化的温度称为融解温 度( Tm) 。 增色效应: 指因高分子结构的改变,而使摩尔吸光系数(molar extinction coefficient) 增大的 现象。 生物化学减色效应:指:若变性DNA 复性形成双螺旋结构后,其260nm 紫外吸收会降低, 这种现象叫减色效应。 分子杂交: 确定单链核酸碱基序列的技术。其基本原理是待测单链核酸与已知序列的单链核 酸(叫做探针)间通过碱基配对形成可检出的双螺旋片段。 呼吸电子传递链: 由一系列可作为电子载体的酶复合体和辅助因子构成,可将来自还原型辅 酶或底物的

12、电子传递给有氧代谢的最终的电子受体分子氧。 氧化磷酸化:是物质在体内氧化时释放的能量供给ADP 与无机磷合成ATP 的偶联反应。 化学渗透假说: 是解释氧化磷酸化作用机理的一种假说。电子传递链像一个质子泵,电子传 递过程中所释放的能量,可促使质子由线粒体基质移位到线粒体内膜外膜间空间形成质子电 化学梯度,即线粒体外侧的H+浓度大于内侧并蕴藏了能量。 P/O 比: 一对电子经呼吸链传给O2 的过程中所产生的ATP 分子数。实质是伴随ADP 磷酸 化所消耗的无机磷酸的分子数与消耗分子氧的氧原子数之比。 高能化合物 :体内氧化分解中,一些化合物通过能量转移得到了部分能量,把这类储存了较 高能量的化合

13、物称为高能化合物 它们是生物释放,储存和利用能量的媒介,是生物界直接的 供能物质。 生物氧化 :生物体内, 从代谢物脱下的氢及电子通过一系列酶促反应与氧化合成水并释 放能量的过程。也指物质在生物体内的一系列氧化过程。主要为机体提供可利用的能量。 呼吸链阻断剂:能够阻断呼吸链中某一部位电子流的物质称为电子传递阻断剂或呼吸键阻断 剂。已知的阻断剂及阻断部。 解偶联剂: 氧化磷酸化的一类抑制剂,使氧化与磷酸化脱离,虽然氧化照常进行,但不能生 成 ATP,则 P/O 比值降低,甚至为零。 糖酵解 :指在氧气不足条件下,葡萄糖或糖原分解为丙酮酸或乳酸的过程,此过程中伴有少 量 ATP 的生成。 学习必备

14、欢迎下载 发酵 :无氧等外源氢受体的条件下,底物脱氢后所产生的还原力H 未经呼吸链传递而直接 交某一内源性中间代谢物接受,以实现底物水平磷酸化产能的一类生物氧化反应。 乳酸发酵: 指糖经无氧酵解而生成乳酸的发酵过程,乙醇发酵同为生物体内二种主要的发酵 形式。 底物水平磷酸化:物质在生物氧化过程中,常生成一些含有高能键的化合物,而这些化合物 可直接偶联ATP 或 GTP 的合成,这种产生ATP 等高能分子的方式称为底物水平磷酸化 三羧酸循环:是用于将乙酰CoA 中的乙酰基氧化成二氧化碳和还原当量的酶促反应的循环 系统,该循环的第一步是由乙酰CoA 与草酰乙酸缩合形成柠檬酸。 磷酸戊糖途径:葡萄糖

15、氧化分解的一种方式。由于此途径是由6-磷酸葡萄糖( G6P)开 始,故亦称为己糖磷酸旁路。 糖异生作用:由简单的非糖前体转变为糖的过程。 底物循环: 一对催化两个途径的中间代谢物之间循环的方向相反、代谢上不可逆的反应。 糖的有氧氧化无氧氧化:萄糖在有氧条件下,氧化分解生成二氧化碳和水的过程称为糖的有 氧氧化 (aerobicoxidation) ,并释放出能量。有氧氧化是糖分解代谢的主要方式,大多数组织 中的葡萄糖均进行有氧氧化分解供给机体能量。无氧氧化是指在缺氧或供氧不足的情况下, 组织细胞内的糖原,能经过一定的化学变化,产生乳酸和水或乙醇和二氧化碳和水,并释放 出一部分能量的过程,也称糖酵

16、解。 酰基载体蛋白: 从头合成脂肪酸, 是由含有多种酶的复合体的脂肪酸合成系统的催化下进行 的,而在它的酰基缩合的阶段,酰基CoA 不是作为直接底物,而是被转移至复合体中的酰 基载体蛋白起反应的。 肉毒碱穿梭系统:由于酸的 -氧化作用是在线粒体的基质中进行的,而在细胞液中形成的 长链脂酰CoA 不能通过线粒体内膜,需要内膜上的载体肉碱携带,以脂酰基的形式跨越内 膜而进入基质。 尿素循环: 肝脏中 2 分子氨和1分子 CO2 生成 1 分子尿素的环式代谢途径。 氧化脱氨基作用:是指氨基酸在酶的作用下伴有氧化的脱氨基反应。 转氨: 一个 -氨基酸的 -氨基借助转氨酶的催化作用转移到一个 -酮酸的过

17、程。 生糖氨基酸:能通过代谢转变成葡萄糖的氨基酸。 联合脱氨基作用: 转氨基与谷氨酸氧化脱氨或是嘌呤核苷酸循环联合脱氨,以满足机体排泄 含氮废物的需求。 学习必备欢迎下载 半保留复制:一种双链脱氧核糖核酸(DNA )的复制模型,其中亲代双链分离后,每条单 链均作为新链合成的模板。 复制叉: 是 DNA 复制时在DNA 链上通过解旋、 解链和 SSB 蛋白的结合等过程形成的Y 字 型结构称为复制叉。 DNA 聚合酶:DNA 聚合酶, 以 DNA 为复制模板,从将DNA 由 5端点开始复制到3端的 酶。 DNA 聚合酶的主要活性是催化DNA 的合成(在具备模板、引物、dNTP 等的情况下) 及其相

18、辅的活性。 前导链: 与复制叉移动的方向一致,通过连续的5-3聚合合成的新的DNA 链。 滞后链: 与复制叉移动的方向相反,通过不连续的5 -3聚合合成的新的DNA 链。 冈崎片段: 相对比较短的DNA 链(大约1000 核苷酸残基),是在 DNA 的滞后链的不连续 合成期间生成的片段。 单链结合蛋白:于螺旋酶沿复制叉方向向前推进产生的单链区,防止新形成的单链DNA 重 新配对形成双链DNA 或被核酸酶降解的蛋白质。 转录 : 遗传信息由DNA 转换到 RNA 的过程。作为蛋白质生物合成的第一步,转录是 mRNA 以及非编码RNA (tRNA 、rRNA 等)的合成步骤。 核心酶: 大肠杆菌的

19、RNA聚合酶全酶由5 个亚基组成( 2 ,),没有 基的酶叫核 心酶。 内含子: 在转录后的加工中,从最初的转录产物除去的内部的核苷酸序列。 模板链: 可作为模板转录为RNA 的那条链,该链与转录的RNA 碱基互补( A-U ,G-C) 。 在转录过程中,RNA聚合酶与模板链结合,并沿着模板链的3 5; 方向移动,按照5 3 方向催化 RNA 的合成。 编码链: DNA 中,不能进行转录的那一条DNA 链,该链的核苷酸序列与转录生成的RNA 的序列一致(在RNA 中是以 U 取代了 DNA 中的 T) 。 聚合酶链式反应:简称 PCR,于放大扩增特定的DNA 片段。可看作生物体外的特殊DNA

20、复制。 中心法则: 指遗传信息从DNA 传递给 RNA ,再从 RNA 传递给蛋白质,即完成遗传信息的 转录和翻译的过程。也可以从DNA 传递给 DNA ,即完成 DNA 的复制过程。这是所有有细 胞结构的生物所遵循的法则。在某些病毒中的RNA 自我复制(如烟草花叶病毒等)和在某 些病毒中能以RNA 为模板逆转录成DNA 的过程(某些致癌病毒)是对中心法则的补充。 学习必备欢迎下载 翻译 是根据遗传密码的中心法则,将成熟的信使RNA 分子 (由 DNA 通过转录而生成) 中“ 碱 基的排列顺序 ” (核苷酸序列)解码,并生成对应的特定氨基酸序列的过程。 遗传密码 决定蛋白质中氨基酸顺序的核苷酸

21、顺序,由 3 个连续的核苷酸组成的密码子所构 成 。由于脱氧核糖核酸(DNA )双链中一般只有一条单链(称为有义链或编码链)被转录 为信使核糖核酸(mRNA ) ,而另一条单链(称为反义链)则不被转录,所以即使对于以双 链 DNA 作为遗传物质的生物来讲,密码也用核糖核酸(RNA )中的核苷酸顺序而不用DNA 中的脱氧核苷酸顺序表示。 起始密码子:被认为对应于AUG 。其中原核生物的起始密码子AUG 翻译对应的是甲酰甲 硫氨酸( fMet) ,真核生物的起始密码子AUG 翻译对应的是甲硫氨酸(Met) 。 密码子:信使 RNA 链上决定一个氨基酸的相邻的三个碱基。 信号肽: 常指新合成多肽链中

22、用于指导蛋白质的跨膜转移(定位)的N-末端的氨基酸序列。 外显子: 是真核生物基因的一部分,它在剪接 (Splicing) 后仍会被保存下来,并可在蛋白质生 物合成过程中被表达为蛋白质。外显子是最后出现在成熟RNA 中的基因序列,又称表达序 列。既存在于最初的转录产物中,也存在于成熟的RNA 分子中的核苷酸序列。 反馈抑制: 是指最终产物抑制作用,即在合成过程中有生物合成途径的终点产物对该途径的 酶的活性调节,所引起的抑制作用。 前馈激活: 代谢途径中一个酶被该途径中前面产生的代谢物激活的现象。是指在一反应序列 中,前面的代谢物可对后面的酶起激活作用,促使反应向前进行。对其后催化某一反应的酶

23、其激活作用。 共价修饰: 蛋白肽链上的一些基团可与某种化学基团发生可逆的共价结合,从而改变酶的活 性。 第二信使: 能将细胞表面受体接受的细胞外信号转换为细胞内信号的物质称为第二信使。 限速酶: 整条代谢通路中催化反应速度最慢的酶,它不但可以影响整条代谢途径的总速度, 还可以改变代谢方向 级联系统: 在连锁代谢反应中一个酶被激活后,连续地发生其它酶被激活,导致原始调节信 号的逐级放大,这样的连锁代谢反应系统称为级联系统。 操纵子: 指启动基因、操纵基因和一系列紧密连锁的结构基因的总称。 操纵基因: 结构基因编码区之前的DNA 区段,它可结合阻遏物或活化物。操纵基因位于基 因的启动子后面或与启动子重叠,可控制一个邻近基因或基因群的表达。 阻遏物: 与 DNA 或 RNA 结合来阻止转录或翻译的一类蛋白质。

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