基因表达调控.ppt

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1、目录 生物化学与分子生物学生物化学与分子生物学 掷 墩 骏 萧 摈 蓄 乍 峡 垛 互 湘 仕 陌 糖 崭 棕 捷 骋 笑 印 赂 坪 铡 憋 石 博 邪 啥 抒 捕 脚 针 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 第十八章 基因表达调控 Regulation of Gene Expression 猿 没 追 锚 谢 窃 杜 畔 凋 碗 孵 邪 榜 椰 斑 失 缄 藉 溺 移 竖 挥 迁 不 氛 程 僧 洽 靠 含 磕 钞 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 第一节 基因表达与基因表达调控的 基本概念与特点 Basic Conceptions and Chara

2、cters of Gene Expression and its Regulation 妊 古 彪 峙 傲 捣 群 区 献 帐 浅 蜡 房 匠 面 盎 耶 鸳 燕 鼓 氢 陆 奥 垃 屠 筋 赁 迫 畅 搞 麻 曰 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 一、基因表达是基因转录和翻译的过程 是基因转录及翻译的过程,也是基因所 携带的遗传信息表现为表型的过程,包括基 因转录成互补的RNA序列,对于蛋白质编码 基因,mRNA继而翻译成多肽链,并装配加 工成最终的蛋白质产物。 基因表达(gene expression) 基因表达是受调控的。 今 课 窖 超 秸 殷 瞳 碉 盏 炉 啦

3、汛 菩 卒 乱 皂 媳 织 主 蔚 勾 皿 镶 庶 彰 细 肩 耶 氨 责 帕 伸 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 二、基因表达具有时间特异性和空间特异性 (一)时间特异性是指基因表达按一定的时间 顺序发生 按功能需要,某一特定基因的表达严格按一 定的时间顺序发生,称之为基因表达的时间 特异性(temporal specificity)。 多细胞生物基因表达的时间特异性又称阶段 特异性(stage specificity)。 丧 仓 叠 摇 练 猿 他 荔 瑶 歇 袜 磨 碱 惦 傍 缩 漆 圭 泉 样 拈 效 燕 隶 韦 霸 脑 阐 牛 壕 姚 孜 基 因 表 达 调

4、控 基 因 表 达 调 控 目录 (二)空间特异性是指多细胞生物个体在特 定生长发育阶段,同一基因在不同的 组织器官表达不同 在个体生长、发育过程中,一种基因产物在个体的 不同组织或器官表达,即在个体的不同空间出现, 这就是基因表达的空间特异性(spatial specificity)。 基因表达伴随时间或阶段顺序所表现出的这种空间 分布差异,实际上是由细胞在器官的分布所决定的 ,因此基因表达的空间特异性又称细胞特异性(cell specificity)或组织特异性(tissue specificity)。 脾 散 瓦 哄 扼 屈 沂 港 卡 秉 原 劲 珊 肛 蜒 彩 霞 捻 鄙 吉 霞 枯

5、 蜘 唱 休 贞 雹 壬 邵 克 逻 虞 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 三、基因表达的方式存在多样性 基因表达调控(regulation of gene expression ) 就是指细胞或生物体在接受内外环境信号刺激 时或适应环境变化的过程中在基因表达水平上做出 应答的分子机制,即位于基因组内的基因如何被表 达成为有功能的蛋白质(或RNA),在什么组织表 达,什么时候表达,表达多少等。 挟 纷 涨 蛆 矽 岗 五 灿 藩 喜 苹 黎 帅 度 豺 色 梨 秧 有 镀 病 报 玄 索 起 毫 意 惨 蜕 域 拱 郁 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录

6、按对刺激的反应性,基因表达的方式分为: 基本(或组成性)表达 诱导或阻遏表达 哗 涪 痈 舌 漳 抵 豪 蔗 扛 汛 燃 广 示 程 冉 鄂 串 襄 限 笨 坟 老 葡 号 么 漫 坚 弧 研 局 恫 草 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 (一)有些基因几乎在所有细胞中持续表达 某些基因在一个生物个体的几乎所有细胞中持续表达 ,不易受环境条件的影响,通常被称为管家基因 (housekeeping gene)。 管家基因的表达水平受环境因素影响较小,而是在生 物体各个生长阶段的大多数、或几乎全部组织中持续 表达,或变化很小。这类基因表达被视为基本(或组 成性)基因表达(con

7、stitutive gene expression)。 基本的基因表达水平并非绝对“一成不变”, 所谓“不 变”是相对的。 付 芦 糯 枣 敢 啊 隅 蛋 贬 制 寻 巧 谊 蛹 妓 丁 砰 毫 悲 鸭 兼 想 驶 椽 境 耐 惯 啸 剩 归 稼 凌 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 (二)有些基因的表达受到环境变化的诱导 和阻遏 在特定环境信号刺激下,相应的基因被激活 ,基因表达产物增加,即这种基因表达是可 诱导的。 可诱导基因(inducible gene)在一定的环境中 表达增强的过程,称为诱导(induction)。 如果基因对环境信号应答时被抑制,这种基 因是可阻

8、遏基因(repressible gene)。可阻遏基 因表达产物水平降低的过程称为阻遏 (repression)。 尽 芦 码 掉 堰 畅 筷 呜 赎 垣 蔗 向 侄 恕 鸳 肘 饥 肋 小 勺 曹 烧 棋 黍 恨 从 丝 厌 纲 陡 超 族 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 在一定机制控制下,功能上相关的一组基 因,无论其为何种表达方式,均需协调一 致、共同表达,即为协同表达(coordinate expression),这种调节称为协同调节 (coordinate regulation)。 (三)生物体内不同基因的表达受到协调调节 伺 厦 惊 陷 读 苯 驳 欢 祁 凸

9、 质 包 峰 脸 涯 鸣 蜀 也 栈 谋 姨 苛 灰 伞 鉴 嘶 夸 泄 快 奋 守 详 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 四、基因表达调控受顺式作用元件 和反式作用因子共同调节 一般说来,调节序列与被调控的编码序列位 于同一条DNA链上,称为顺式作用元件(cis - acting element)。 调节序列远离被调控的编码序列,实际上是 其他分子的编码基因,只能通过其表达产物 来发挥作用,这些蛋白质分子称为反式作用 因子(trans-acting factor)。 药 沙 精 换 颊 肯 厕 诉 呈 喻 顺 气 辟 檄 大 幕 寿 贸 由 沙 善 诸 娇 稿 囱 诺 腆

10、 尺 配 剁 集 妒 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 五、基因表达调控呈现多层次和复杂性 首先,遗传信息以基因的形式贮存于DNA中 。 其次,遗传信息经转录由DNA传向RNA 过程 中的许多环节。(最重要、最复杂) 最后,蛋白质生物合成即翻译与翻译后加工。 豹 阉 废 线 厢 唤 规 卿 困 柏 郊 请 念 拾 霍 游 寡 戏 苗 欺 万 立 顷 漓 瓷 靖 底 寸 膜 章 眼 旷 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 六、基因表达调控为生物体生长、 发育的基础 (一)生物体调节基因表达以适应环境、维 持生长和增殖 生物体所处的内、外环境是在不断变化 的。

11、通过一定的程序调控基因的表达,可使 生物体表达出合适的蛋白质分子,以便更好 地适应环境,维持其生长和增殖。 须 插 至 罐 钠 彝 抑 锋 礼 别 跑 据 坤 吞 谐 汐 靡 鸽 题 殃 糕 替 疼 御 殉 铸 窃 景 辽 槛 乳 芽 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 (二)生物体调节基因表达以维持细胞 分化与个体发育 在多细胞个体生长、发育的不同阶段, 或同一生长发育阶段,不同组织器官内蛋白 质分子分布、种类和含量存在很大差异,这 些差异是调节细胞表型的关键。 如 卓 酒 便 肮 绅 咱 噪 蛾 熔 轨 砒 顶 净 盔 妒 移 袋 梢 巧 陡 志 砸 侯 囊 物 档 稠

12、抚 肪 辫 僵 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 第二节 原核基因表达调控 Regulation of Gene Expression in Prokaryote 床 孜 铭 钝 烦 漫 训 败 弦 务 独 架 冀 握 胶 科 贼 稿 沛 皆 经 生 唯 座 痹 叛 姿 蚤 恿 烦 纲 击 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 原核生物基因组结构特点 基因组中很少有重复序列; 编码蛋白质的结构基因为连续编码,且多为单拷 贝基因,但编码rRNA的基因仍然是多拷贝基因 ; 结构基因在基因组中所占的比例(约占50%)远 远大于真核基因组; 许多结构基因在基因组中以

13、操纵子为单位排列 原核生物基因组是具有超螺旋结构的闭合环状DNA分子 效 躇 凹 偿 傅 茫 肆 臃 艰 碾 悟 朗 质 巡 怒 借 忆 滇 哎 足 峦 艰 尊 秤 蔓 邮 澄 儿 受 子 脉 抹 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 原核生物大多数基因表达调控是通过操纵子机制 实现 一、操纵子是原核基因转录调控的基本 单位 蛋白质因子 特异DNA序列 编码序列 启动子 操纵元件 其他调节基因 (promoter) (operator) 渝 伏 赋 购 舞 胶 妻 搂 炯 特 乎 嗣 瞥 蹦 踩 挥 椎 庸 酞 胶 挖 士 吊 俊 饿 钒 扶 悬 表 馈 恶 嘎 基 因 表 达

14、 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 操纵子模型的普遍性 多顺反子(polycistron):mRNA分子携带了几个多肽链 的编码信息。 启动子是RNA聚合酶和各种调控蛋白作用的部位,是 决定基因表达效率的关键元件。 各种原核基因启动序列特定区域内,通常在转录起始 点上游-10及-35区域存在一些相似序列,称为共有序列 。 E.coli及一些细菌启动序列的共有序列在-10区域是 TATAAT,在-35区域为TTGACA 共有序列决定启动序列的转录活性大小。 蚂 豢 纬 竞 质 逸 沽 皋 校 腐 宫 溅 丽 个 丝 大 谰 依 千 过 气 风 膊 外 情 翻 圣 盗 露 责 兹 禽 基 因

15、表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 图18-1 5种E.coli启动序列的共有序列 近 棍 敏 茬 系 燃 召 岸 堆 荐 待 孤 费 颐 杜 转 皆 括 疹 糕 趟 缴 溜 莉 灌 侍 滇 穆 汪 妄 搬 瞧 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 基因表达有正调控和负调控 调节原核生物基因表达的效应蛋白可分: 阻遏蛋白-负调控因素 激活蛋白-正调控因素 赶 帜 拂 宦 价 愤 呻 月 场 滴 桃 洲 宝 渐 车 耍 淫 跟 谣 私 靠 堆 民 铁 茁 印 篇 蒜 慕 浆 欠 憨 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 调节基因(regulatory g

16、ene)编码能够与操纵 序列结合的调控蛋白,可以分为三类:特异因子 、阻遏蛋白和激活蛋白。 调控蛋白的作用分别是 特异因子决定RNA聚合酶对一个或一套启动序列的 特异性识别和结合能力; 瞻 锈 曲 氓 斤 称 咎 侗 脚 蹭 洁 妈 貉 林 淘 坍 钵 强 病 兢 羽 虽 盎 鸡 当 洗 氛 胃 摔 璃 啮 疥 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 阻遏蛋白可以识别、结合特异DNA序列操纵序列,抑 制基因转录,所以阻遏蛋白介导负调节(negative regulation)。阻遏蛋白介导的负性调节机制在原核生物 中普遍存在; 激活蛋白可结合启动序列邻近的DNA序列,提高RNA聚

17、 合酶与启动序列的结合能力,从而增强RNA聚合酶的转 录活性,是一种正调控(positive regulation)。 碟 浇 语 蠢 埃 形 卒 吸 纺 劣 涡 窒 伎 散 萍 凝 孽 铅 眨 方 笔 樊 秃 壶 惶 耶 渺 佰 嘴 籽 斧 五 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 二、乳糖操纵子是典型的诱导型调控 (一)乳糖操纵子(lac operon)的结构 调控区 CAP结合位点 启动序列 操纵序列 结构基因 Z: -半乳糖苷酶 Y: 透酶 A:乙酰基转移酶 ZYAOP DNA 娘 砖 垛 北 翻 美 碱 违 测 瞳 滥 拟 欲 畅 避 躇 侍 甚 化 呜 棱 至 监

18、集 厨 醚 窟 棘 胶 复 腮 嫡 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 图18-2 lac 操纵子与阻遏蛋白的负性调节 庇 蜀 夫 西 债 虽 涟 慷 束 矮 蹲 脾 堆 脾 衷 姿 婆 缄 笆 执 墩 嵌 渍 税 狱 裴 闸 捞 州 踢 煎 峙 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 mRNA 阻遏蛋白 I DNA ZYAOP pol 没有乳糖存在时 (二)乳糖操纵子受阻遏蛋白和CAP的双重调节 阻遏基因 1.阻遏蛋白的负性调节 洞 钉 邑 傅 朱 肇 袄 敝 衅 迭 凹 旁 纂 忻 途 允 遣 查 吝 冀 卫 铜 稠 螺 犬 仰 三 矿 授 保 橡 幂 基

19、因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 mRNA 阻遏蛋白 有乳糖存在时 I DNA ZYAOP pol 启动转录 mRNA 乳糖别乳糖 -半乳糖苷酶 图18-4 lac 操纵子与阻遏蛋白的负性调节 有 组 汗 弹 愁 膏 魄 卤 景 呜 漫 掩 谐 错 然 镍 舀 棺 修 韭 搬 嘘 香 几 刁 售 臭 鄂 誓 拽 悼 澎 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 + + + + 转录 无葡萄糖,cAMP浓度高时 有葡萄糖,cAMP浓度低时 2. CAP的正性调节 ZYAOP DNA CAP CAP CAPCAP CAP CAP 蓟 形 遏 句 锨 顷 顶 血 域 舒

20、弱 腰 岳 允 式 羔 耽 孟 宇 哺 涅 朽 慌 疼 契 泛 孰 非 琉 骑 昨 蚕 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 3. 协协同调节调节 当阻遏蛋白封闭转录时,CAP对该系统不能 发挥作用。 如无CAP存在,即使没有阻遏蛋白与操纵序 列结合,操纵子仍无转录活性。 单纯乳糖存在时,细菌利用乳糖作碳源;若 有葡萄糖或葡萄糖/乳糖共同存在时,细菌首 先利用葡萄糖。葡萄糖对 lac 操纵子的阻遏作 用称分解代谢阻遏(catabolic repression)。 孵 莎 评 抚 先 灌 舶 室 然 予 带 绷 学 菠 悍 嘿 永 门 椭 钡 爽 枚 菩 胶 筏 糕 苯 竞 壹

21、叫 罕 姓 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 mRNA 低半乳糖时高半乳糖时 葡萄糖低 cAMP浓度高 葡萄糖高 cAMP浓度低 RNA-pol OO OO 钝 湘 嘶 膝 惯 场 蚂 峡 完 业 爸 谱 执 乃 褂 招 槛 躇 藤 酋 喊 旅 该 效 摹 舷 钾 抛 泊 贤 慰 锈 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 图18-3CAP、阻遏蛋白、cAMP和诱导剂对lac操纵子的调节 椭 擞 田 拳 符 竹 创 矩 浪 辗 嗡 蜂 鞠 有 鞋 爹 捐 赊 撕 踞 哭 涣 舍 埋 巡 簿 孔 蘸 奎 抖 知 绩 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控

22、 目录 三、色氨酸操纵子通过转录衰减的方式 阻遏基因表达 色氨酸操纵子的作用原理 Trp Trp 高时 Trp 低时 mRN A OP trpR 调节区 结构基因 RNA聚合酶 RNA聚合酶 操纵子关闭 癣 牧 沏 原 彻 勋 恶 册 埃 受 鳖 崎 衙 恒 船 徒 降 能 番 划 壶 脯 皖 匆 酝 给 拎 薄 洛 拇 链 秉 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 四、原核基因表达在转录终止阶段 有不同的调控机制 (一)不依赖赖Rho因子的转录终转录终 止 (二)依赖赖Rho因子的转录终转录终 止 常见于噬菌体中,结构特点不清楚。 两段富含GC的反向重复序列,中间间隔 若干核

23、苷酸; 下游含一系列T序列。 终止子结构特点: 旁 矽 绞 聂 脱 精 壬 炳 圭 雄 造 肄 费 端 醛 抬 苑 遣 脖 诽 志 扶 槛 浚 艘 轴 壳 插 双 晤 害 惠 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 五、原核基因表达在翻译水平的多个环 节受到精细调节 (一)转录与翻译的偶联调节提高了基因表 达调控的有效性 衰减是转录-翻译的偶联调控 色氨酸操纵子(trp operon)除了产物阻遏 负调控外,还有转录衰减(attenuation)调控方 式。 屑 该 疡 乍 屏 守 鳃 胶 串 唯 担 氏 夫 涅 缆 扶 闭 搐 蹋 凤 囚 处 翁 村 贤 汰 淮 碾 蠕 符 健

24、 纱 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 图18-4 色氨酸操纵子的结构及其关闭机制 垫 匹 呀 譬 狰 母 盂 弯 完 儿 骚 软 苯 例 讯 弥 棍 寓 莹 油 咱 仿 毯 誉 资 钢 雁 屁 寸 坝 迂 逛 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 (二)蛋白质分子结合于启动序列或启动序列 周围进行自我调节 调节蛋白结合mRNA靶位点,阻止核蛋白体识 别翻译起始区,从而阻断翻译。 调节蛋白一般作用于自身mRNA,抑制自身的 合成,称自我控制(autogenous control)。 蛮 褒 蹄 羞 俞 保 雍 搓 廊 酌 蚌 逃 绢 援 忱 蔷 咎 蚤 忽

25、换 烧 睡 室 葛 啥 堤 闰 逃 竿 若 朽 钦 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 (三)翻译阻遏利用蛋白质与自身mRNA的 结合实现对翻译起始的调控 编码区的起始点可与调节分子(蛋白质或RNA )直接或间接地结合来决定翻译起始 调节蛋白可以结合到起始密码子上,阻断与核 糖体的结合 翠 嗜 玖 男 点 褪 拐 茵 圈 酿 脯 绦 蚊 抨 慌 蔓 脂 产 谊 眉 疼 剪 春 歼 乳 荤 舵 烬 桩 省 绣 歌 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 (四)反义RNA结合mRNA翻译起始部位的 互补序列对翻译进行调节 可调节基因表达的RNA称为调节RNA。 细菌

26、中含有与特定mRNA翻译起始部位互补 的RNA,通过与mRNA杂交阻断30S小亚基对 起始密码子的识别及与SD序列的结合,抑制 翻译起始。这种调节称为反义控制(antisense control)。 龟 毛 镊 钻 频 地 蓄 课 搀 费 翠 卸 惜 浙 次 命 勒 柿 喜 夺 鲜 氟 晴 繁 尾 征 漆 裳 追 缴 趾 台 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 (五)mRNA密码子的编码频率影响翻译速度 当基因中的密码子是常用密码子时,mRNA的 翻译速度快,反之,mRNA的翻译速度慢。 捅 陡 钉 蓑 涛 踢 篷 桑 娱 争 胖 厘 援 驹 义 桃 酮 溉 区 版 莽 抚

27、铸 赚 染 懦 介 暖 问 剑 十 褒 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 第三节 真核基因表达调控 Regulation of Gene Expression in Eukaryote 尾 丈 纱 聋 未 镣 玖 硒 斗 沼 芬 符 僻 十 屈 擦 驳 婚 灿 们 易 拉 姬 掀 是 胰 竿 蟹 做 又 偶 快 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 一、真核细胞基因表达的特点 真核基因组比原核基因组大得多 原核基因组的大部分序列都为编码基因,而哺 乳类基因组中只有10%的序列编码蛋白质、 rRNA、tRNA等,其余90%的序列,包括大量 的重复序列功能至今还

28、不清楚,可能参与调控 真核生物编码蛋白质的基因是不连续的,转录 后需要剪接去除内含子,这就增加了基因表达 调控的层次 旦 喇 猖 役 我 寿 揣 晌 汉 帽 摧 底 捆 烯 束 易 港 椎 兽 距 鸥 殊 谐 调 寂 缓 谐 讼 诸 威 戈 诸 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 原核生物的基因编码序列在操纵子中,多顺反子 mRNA使得几个功能相关的基因自然协调控制; 而真核生物则是一个结构基因转录生成一条 mRNA,即mRNA是单顺反子(monocistron) ,许多功能相关的蛋白、即使是一种蛋白的不同 亚基也将涉及到多个基因的协调表达 施 牢 城 掩 噪 沈 质 系 镇

29、 位 韶 巍 障 猴 章 妈 获 便 陷 仰 漆 劲 骑 叛 毙 擦 班 乏 狡 谱 叠 苏 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 真核生物DNA在细胞核内与多种蛋白质结合构 成染色质,这种复杂的结构直接影响着基因表 达; 真核生物的遗传信息不仅存在于核DNA上,还 存在线粒体DNA上,核内基因与线粒体基因的 表达调控既相互独立而又需要协调。 剪 偏 困 阑 膀 铁 圭 陋 昼 先 画 挖 庶 科 彻 沃 阻 诉 呵 袋 酬 籍 址 炎 仗 扰 腹 翰 蝶 律 耍 歌 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 图18-5 真核生物基因表达的多层次复杂调控 疮 稚 碴

30、 颜 伸 叫 匈 噬 奠 纶 拭 惧 判 沤 粥 沪 钦 表 慌 虐 搔 纹 砧 坑 迹 惑 曝 村 隙 釉 河 躯 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 二、染色质结构与真核基因表达密切相关 活性染色质 (active chromatin) 具有转录活性的染色质 超敏位点(hypersensitive site) 当染色质活化后,常出现一些对核酸酶( 如DNase I)高度敏感的位点 (一)转录活化的染色质对核酸酶极为敏感 幕 崭 起 电 杭 字 鳃 嘘 逮 佐 咳 摸 戮 哎 谬 冤 玛 愚 熏 资 佑 然 妊 答 连 拦 呸 签 哮 懈 雪 杭 基 因 表 达 调 控 基

31、 因 表 达 调 控 目录 (二) 转录活化染色质的组蛋白发生改变 组蛋白结构及其化学修饰 (a)组蛋白与DNA组成的核小体;(b)组蛋白的氨基端伸出核 小体,形 成组蛋白尾巴;(c)四种组蛋白组成的八聚体 眶 碉 伯 政 耙 拆 写 岿 副 饶 妻 旗 鸽 阴 藉 申 痪 糟 竞 匣 渡 埂 清 蛔 膨 鞭 麦 湾 嚼 晒 互 驶 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 组蛋白修饰对于基因表达影响的机制也包括 两种相互包容的理论。即:组蛋白的修饰直 接影响染色质或核小体的结构,以及化学修 饰征集了其他调控基因转录的蛋白质,为其 他功能分子与组蛋白结合搭建了一个平台。 这些理论构

32、成了“组蛋白密码”的假说。 踊 葡 坚 气 苛 腑 涝 柑 幕 咎 她 计 潜 兢 梢 赚 嘻 唇 蛾 火 猾 含 寿 茧 窗 汀 舜 泅 职 袁 家 获 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 组组蛋白氨基酸残基位点修饰类饰类 型功 能 H3Lys-4甲基化激活 H3Lys-9甲基化染色质浓缩质浓缩 H3Lys-9甲基化DNA甲基化所必需 H3Lys-9乙酰酰化激活 H3Ser-10磷酸化激活 H3Lys-14乙酰酰化防止Lys-9的甲基化 H3Lys-79甲基化端粒沉默 H4Arg-3甲基化 H4Lys-5乙酰酰化装配 H4Lys-12乙酰酰化装配 H4Lys-16乙酰酰化核

33、小体装配 H4Lys-16乙酰酰化Fly X激活 组蛋白修饰对染色质结构与功能的影响 鲸 克 丽 煎 孜 蹲 滩 妄 抑 酝 淆 猎 镜 浸 爷 砰 星 呜 蛤 镜 遥 鞍 雹 冯 柳 虹 阮 衬 娠 炒 凭 绎 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 (三) CpG岛岛甲基化水平降低 CpG岛(CpG island) :甲基化胞嘧啶在基因组中并 不是均匀分布,有些成簇的非甲基化CG存在于整个 基因组中,人们将这些GC含量可达60%,长度为300 -3000bp的区段 表观遗传(epigenetic inheritance) :染色质结构对 基因表达的影响可以遗传给子代细胞,其机

34、制是细胞 内存在着具有维持甲基化作用的DNA甲基转移酶, 可以在DNA复制后,依照亲本DNA链的甲基化位置 催化子链DNA在相同位置上发生甲基化 啄 谓 喇 牺 枫 如 只 穆 霸 气 躁 二 狡 张 习 烧 侗 份 呼 窘 豆 契 咐 烂 煎 罚 西 沾 圭 注 访 袱 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 三、基因组中的顺式作用元件是转录起 始的关键调节部位 順式作用元件 指可影响自身基因表达活性的DNA序列 播 请 打 抄 陡 屋 构 晓 自 钵 舟 戏 果 佬 月 挫 惭 寻 哇 核 搔 研 都 做 贮 壁 划 彩 毫 女 伦 割 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达

35、 调 控 目录 图18-7顺式作用元件 A、B分别代表同一基因中的两段特异DNA序列。B序列通过一定机制影 响A序列,并通过A序列控制该基因的转录起始的准确性及频率。A、B 序列就是调节这个基因转录活性的顺式作用元件 碟 卿 磊 好 价 流 渭 锄 兹 砒 枷 啮 燎 耘 超 抓 眩 敬 毯 怕 踢 秽 坍 竖 嘿 盯 被 妮 锣 孩 蓑 怀 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 (一)真核生物启动动子结结构和调节远较调节远较 原核 生物复杂杂 真核基因启动子是RNA聚合酶结合位 点周围的一组转录控制组件,至少包括一 个转录起始点以及一个以上的功能组件。 TATA盒 GC盒 C

36、AAT盒 赡 崇 镇 广 员 皋 割 附 望 次 铸 霸 你 韦 耙 蜀 咯 部 谗 捌 舅 打 柴 鳞 蔓 绘 晚 馆 恳 付 创 四 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 CCAAT盒GC盒TATA盒 转录起始点 高等真核生物 上游激活序 列(UAS) TATA盒 转录起始点 酵母 真核基因启动子的典型结构 穆 滑 萧 鬼 珍 葱 噎 眠 涵 匹 棍 凑 哑 沼 遂 划 五 戒 强 炎 烫 孝 随 戏 舱 贮 赊 蒂 广 耗 浙 喘 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 (二)增强子是能够够提高转录转录 效率的顺顺式 调调控元件 增强子的功能及其作用特征如下

37、: 与被调控基因位于同一条DNA链上,属于 顺式作用元件。 是组织特异性转录因子的结合部位 不仅能够在基因的上游或下游起作用,而且 还可以远距离实施调节作用 作用与序列的方向性无关 需要有启动子才能发挥作用 例 彤 翔 锄 积 缄 椽 耀 茹 卯 芽 毛 晴 抿 蓖 桑 竭 倾 踪 录 隆 诉 铰 铆 寻 投 更 华 密 钮 憾 皂 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 (三)沉默子能够够抑制基因的转录转录 沉默子是一类基因表达的负性调控元件, 当其结合特异蛋白因子时,对基因转录起 阻遏作用 浇 潦 陌 待 撼 损 娠 戏 郝 濒 倘 忻 肯 孤 城 胺 大 剑 豫 蛇 辫 祝

38、 凰 螺 医 削 发 橱 莽 并 砧 羽 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 四、转录因子是转录调控的关键分子 真核基因的转录调节蛋白又称转录调节因子或 转录因子(transcription factor, TF)。 绝大多数真核转录调节因子由其编码基因表达 后,进入细胞核,通过识别、结合特异的顺式 作用元件而增强或降低相应基因的表达。 转录因子也被称为反式作用蛋白或反式作用因 子。 肥 丸 溺 汲 吐 邀 陵 缠 弊 碾 泉 暴 锨 硼 鬃 突 噎 疡 蹄 氮 渍 凤 董 娩 碍 桌 邯 龚 枯 砖 肝 斧 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 真核基因的调

39、节蛋白 还有蛋白质因子可特异识别、结合自身 基因的调节序列,调节自身基因的表达 ,称顺式作用。 由某一基因表达产生的蛋白质因子,通 过与另一基因的特异的顺式作用元件相 互作用,调节其表达。这种调节作用称 为反式作用。 反式作用因子(trans-acting factor) 烧 尘 盏 缚 疗 校 源 赞 枕 疡 擅 遍 蚤 搂 胎 有 咖 岗 卑 详 赃 择 怀 恫 炭 镀 陕 霉 啪 腊 萎 瞧 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 图18-8 反式与顺式作用蛋白 慕 绅 熬 乳 宝 整 掳 骡 群 酒 游 遥 曲 插 污 伴 惨 浸 瓶 非 膛 咀 酪 忻 雁 莆 铣 模

40、鳞 害 刽 叭 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 通用转录因子(general transcription factors) 是RNA聚合酶结合启动子所必需的一 组蛋白因子,决定三种RNA(mRNA、 tRNA及rRNA)转录的类别。 1. 转录调节因子分类 (按功能特性) 通用转录因子 特异转录因子 卑 峪 形 导 躇 诵 祷 圈 点 鹰 灿 最 翱 砒 铂 额 均 鸥 审 怕 乒 筐 宁 影 按 砸 包 鞠 罚 韵 沾 果 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 特异转录因子(special transcription factors) 为个别基因转录所必

41、需,决定该基因 的时间、空间特异性表达。 转录激活因子 转录抑制因子 向 挡 兔 拦 堆 渺 淡 劲 琅 振 杠 衅 钎 操 芝 缆 笔 厕 忆 儡 限 疚 迷 茎 属 痴 荒 萎 辨 轻 柬 猾 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 2. 转录调节因子结构 DNA结合域 转录激活域 TF 蛋白质-蛋白质结合域 (二聚化结构域) 谷氨酰胺富含域 酸性激活域 脯氨酸富含域 超 镶 层 躲 纸 舱 嚎 婴 刷 炸 烛 侈 索 痊 村 见 靖 磕 无 作 湍 屈 汲 愉 言 凹 哟 刀 爆 爱 长 嵌 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 最常见的DNA结合域: 1.

42、 锌指模体(zinc finger) 常结合GC盒 C=半胱氨酸;H=组氨酸;F=苯 丙氨酸;L=亮氨酸;Y=酪氨酸 ;Zn=锌离子 图18-9锌指结构 知 发 昭 氦 丙 矩 华 较 濒 褐 停 朝 窗 捷 娠 俞 厦 按 膀 峡 稽 壶 以 著 涎 炒 微 铭 挨 躁 粉 砍 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 2. 碱性螺旋-环-螺旋( basic helix-loop- helix,bHLH) (a)独立的碱性螺旋-环-螺旋模体结构示意 图;(b)bLHL模体二聚体与DNA结合的 示意图。两个-螺旋的碱性区分别嵌入DNA 双螺旋的大沟内 常结合CAAT盒 尺 婿 喘

43、帽 殆 昏 委 辉 盖 椰 瓦 蚤 姚 符 筑 颠 千 殉 亭 演 摈 愁 玩 夫 温 崎 喂 虑 亭 饱 忠 斧 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 常结合CAAT盒 3.碱性亮氨酸拉链(basic leucine zipper, Bzip) (a)碱性亮氨酸拉链模体结构示意图;(b)bZIP模体与DNA结合的示意图。 两个-螺旋上的亮氨酸残基彼此接近,形成了类似拉链的结构,而富含碱性氨 基酸残基的区域与DNA骨架上的磷酸基团结合 羡 丰 缉 邪 堑 愁 签 杯 揖 纲 滥 钥 壬 龄 祖 讼 它 豹 菩 妻 魄 酚 盾 艳 昨 奋 价 巳 恬 豺 嫂 峨 基 因 表 达

44、调 控 基 因 表 达 调 控 目录 五、转录起始复合物的动态构成是 转录调控的主要方式 (一)启动序列/启动子与RNA聚合酶活性 (二)调节蛋白与RNA聚合酶活性 启动序列或启动子的核苷酸序列会影响其与 RNA聚合酶的亲和力,而亲和力大小则直接影响 转录起始的频率 真核RNA聚合酶II不能单独识别、结合启动 子,而是先由基本转录因子与RNA聚合酶II形成 一个功能性的转录前起始复合物。 馁 促 铲 敲 驮 雹 纺 洱 请 通 圈 定 悔 库 菱 疤 蛊 罢 姆 扦 巾 娱 凄 沽 栓 厚 京 诽 隶 妓 企 豫 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 图18-12 转录起始复合

45、物的形成 真核RNA聚合酶在转录因子帮助下, 形成转录起始复合物。 Pol TFHTAF TFF TAF TAF TFA TFB TBP DNATATA EBP TBP 咆 坞 举 侣 丰 碗 镀 内 郡 桌 腊 串 冈 低 援 锰 羽 过 允 砖 撒 枢 酒 唬 陪 逞 又 赡 蜜 祈 隆 力 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 六、转录后调控主要影响真核mRNA 的结构与功能 (一)mRNA稳定性的影响真核生物基因表达 1. 5-端的帽子结构可以增加mRNA的稳定性 2. 3-端的poly(A)尾结构防止mRNA降解 RNA无论是在核内进行加工、由胞核运至胞浆,还 是在胞

46、浆内停留(至降解),都是通过与蛋白质结合形 成核蛋白颗粒(ribonucleoprotein, RNP)进行的。 富 涌 堆 跳 蝉 托 纳 享 躬 盏 颤 瓶 格 没 野 荣 秘 篓 命 遥 爱 慢 蝎 姚 谚 泼 扯 椎 讨 淳 叭 掺 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 与原核基因表达调节一样,某些小分子RNA也可调节真核 基因表达。 这些RNA都是非编码RNA(noncoding RNA, ncRNA)。 如:具有催化活性的RNA(核酶)、细胞核小分子RNA (snRNA)以及核仁小分子RNA(snoRNA) 目前人们广泛关注的非编码RNA有miRNA和siRNA。

47、小分子RNA对基因表达的调节十分复杂, (二)一些非编码小分子RNA可引起转录后 基因沉默 划 宾 咒 己 乎 各 呢 莫 浊 莲 歉 鸥 欠 绝 矣 白 持 锑 锄 传 两 幢 哀 态 病 阶 柞 唬 汝 笺 脚 夸 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 (三)mRNA前体的选择性剪接可以调节真 核生物基因表达 真核生物基因所转录出的mRNA前体含有交替 连接的内含子和外显子。通常状态下,mRNA 前体经过剔除内含子序列后成为一个成熟的 mRNA,并被翻译成为一条相应的多肽链。但 是,参与拼接的外显子可以不按照其在基因组 内的线性分布次序拼接,内含子也可以不完全 被切除,由此

48、产生了选择性剪接 盂 漾 语 埃 娇 思 德 挂 母 因 啡 痊 横 布 善 违 云 浩 归 苟 准 狠 骸 庸 齐 珐 乓 耐 颁 瞬 五 盔 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 七、真核基因表达在翻译以及翻译后 仍可受到调控 (一)对翻译起始因子活性的调节主要通过磷 酸化修饰进行 蛋白质合成速率的快速变化在很大程度上取 决于起始水平,通过磷酸化调节翻译起始因子( eukaryotic initiation factor, eIF)的活性对起始 阶段有重要的控制作用。 1翻译起始因子eIF-2的磷酸化抑制翻译起始 栖 挎 筹 荤 败 郁 尔 液 须 宛 膏 拿 异 啃 肠

49、鹿 跃 齿 犬 蜂 檬 初 绍 鸡 仪 奎 籽 腕 储 一 玛 竖 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 2eIF-4E及eIF-4E结合蛋白的磷酸化激活翻译起始 帽结合蛋白eIF-4E与mRNA帽结构的结合是翻译 起始的限速步骤,磷酸化修饰及与抑制物蛋白的 结合均可调节eIF-4E的活性。 磷酸化的eIF-4E与帽结构的结合力是非磷酸化 的 eIF-4E的4倍,因而可提高翻译的效率。 钝 竹 掖 兽 趣 借 勤 谭 镁 舍 饰 荒 堑 咆 货 轰 檄 停 仕 忿 五 均 符 幌 慧 袭 迭 会 截 恨 帅 句 基 因 表 达 调 控 基 因 表 达 调 控 目录 (二)RNA结合蛋白参与了对翻译起始的调节 RNA结合蛋白(RNA binding protein, RBP), 是指那些能够与RNA特异序列结合的蛋白质。 基因表达的许多调节环节都有RBP的参与,如 前述转录终止、RNA剪接、RNA转运、RNA胞 浆

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