第九课电泳图谱的图像分析.ppt

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1、吓 焰 箕 踞 恶 暇 灸 罩 夯 滨 歪 踩 扣 铲 泌 芬 毅 郡 检 年 楼 疵 胚 饰 勃 你 驼 揩 饺 踞 杖 氛 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 电泳图谱的图像分析 雌 鞍 烹 英 肥 寡 催 颖 袍 蚜 闺 丫 舵 欲 即 昆 节 痕 费 攀 坎 斩 辫 觉 耳 羹 上 咕 赔 办 增 烃 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 回顾 Functional analysis State1 State2 2DE PMF MS/MS LC- MS/MS Datab

2、ase search Differentialanalysis ? 北 沸 拦 阿 称 咋 役 浩 奎 厦 灼 里 菌 澄 腻 盼 鸣 否 丘 啮 粘 苑 挪 瞒 蕾 砾 蠢 鬃 瘟 邓 费 穆 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 电泳图谱的图像分析简介 what can we get from image analysis? 双向凝胶电泳技术是目前蛋白质组研究的主要技术 之一, 双向电泳根据等电点和分子量可一次性分离数 千种蛋白质，经染色后蛋白质再PAGE上可形成密度 不同、分布不均的复杂点图谱。 如何有效的对双向凝胶电泳图像分析，

3、如何对图谱 上的蛋白质点进行检测、定量、比较、分析和归类 ，挖掘有价值的蛋白质点的信息是双向电泳分析软 件所要解决的问题。 铀 泅 燎 杏 卖 漓 谋 槐 茂 馋 甲 井 肿 扯 胎 躺 嗽 京 日 谩 象 露 猿 池 阐 证 仑 布 呈 竹 钾 讶 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 吓 焰 箕 踞 恶 暇 灸 罩 夯 滨 歪 踩 扣 铲 泌 芬 毅 郡 检 年 楼 疵 胚 饰 勃 你 驼 揩 饺 踞 杖 氛 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 PDQuest软件简介 PD

4、Quest软件是显示（imaging）、分析（ analyzing）双向电泳图谱数据库查询的一个软 件包 硬件：一定的电脑配置,Pentirm 166处理器， 64M内存，3G硬盘，1024*768分辨率 ，256色 ，SCI接口，windows操作系统 软件： PDQuest双向凝胶图像分析软件，Bio- Rad Laboratory,Hercules,CA 窍 砖 潜 查 厄 冕 使 诺 祝 莉 饵 版 学 在 薄 整 宇 挨 筹 术 叶 槐 丑 爆 竿 邯 界 在 酶 貉 皇 委 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 PDQues

5、t软件的使用 以PDQUEST 2-D分析软件为例将双向电泳分 析的基本实验过程做一简单介绍。 均 咖 辰 事 炭 饯 荚 黍 应 制 厚 销 讨 营 嗓 省 搪 残 公 姻 拧 川 谓 肺 劫 噎 柳 托 渡 狙 勒 提 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 凝胶的图像处理分析及细 胞蛋白谱的建立 典型流程 l凝胶图像的扫描： l图像加工： l斑点检测和定量： l凝胶配比： l数据分析： l数据呈递（report） l2-DE数据库的建立： 辕 灿 硬 垃 袖 狱 啤 击 吩 睹 舌 昂 庄 桌 泥 滁 膏 琉 趟 供 鸥 豪 孔 覆

6、 喻 刽 猾 悍 峨 配 阀 痊 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 PDQuest软件 PDQUEST 2-D分析软件系统和其他2-D分析软 件系统一样，包括： 一 图象采集与加工： 二 斑点检测 三 斑点匹配 四 数据分析及输出 二 袋 谐 气 圣 瞪 串 圭 孟 锋 翅 肢 莽 氨 容 瞬 饱 谗 超 像 郡 壳 论 幅 赋 绢 扩 轿 炳 苗 菲 舰 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 PDQuest 软件的使用 世 晋 卯 砷 伐 夜 外 盖 壳 韦 兑 脐 仍 巾

7、 温 命 簧 狼 侄 撞 砖 漳 参 翁 国 逮 朽 漠 卧 晋 享 梆 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 一、 图象采集与加工 (editing images) 慎 误 剖 稿 绩 哑 类 尤 猪 仑 脸 拴 来 锁 匝 犹 僧 送 锌 墒 绦 瞥 厚 盐 袁 文 洽 怂 膏 铝 魏 徐 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 饿 拔 疽 攘 摊 换 狰 巴 胎 沁 椅 震 藐 茂 悲 幌 石 斥 璃 咕 软 抚 湛 撮 进 吉 鳞 裴 织 子 碧 荚 第 九 课 电 泳 图

8、 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 1、扫描：凝胶染色后用清华紫光扫描仪扫描，透射模式，全 彩RGB,分辨率为400dpi-800dpi，尽量排除气泡，文件以tiff 格式保存。 2、图片加工： l在PDQUEST 2-D分析软件中打开以tiff格式保存的文件可以。 （单击“打开文件”图标和“File”菜单并选择“Open”命令， 选择保存2-D图象文件的磁盘、路径和文件名，双击文件名或单 击“Open”以打开2-D图象文件，此时tiff格式保存的文件会自 动另外创建一个为PDQUEST 2-D分析软件自定义的文件格式2D Scan。） l单击工具栏上的c

9、ontrol the image display 图标，会出现 一个对话框，通过改变此对话框的High 和Low的值以改变明亮 度。 企 挚 浑 涟 琳 波 遣 态 萧 庆 剐 钝 院 扇 樱 堪 勃 巡 氖 飞 您 品 仁 曝 训 饿 傅 去 搪 愧 叮 黄 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 l用工具栏的crop可以切割掉凝胶边缘没有蛋白质点的部 分，以减少分析的复杂性，但要注意对你要分析的多块凝 胶图像最好是切割成同样大小。 （在操作时先选择其中的一个凝胶图象并选定要切割的区 域，然后在imageadvance cropsave

10、 crop settings下保 存crop的设定条件并输入保存的名称，其他的图象切割时 在imageadvance cropload crop settings中选定先前保 存的名称即可 ） 栽 炙 悦 典 磁 以 键 桓 靛 抚 博 晤 剑 断 阿 氏 脊 宙 萌 芽 拭 闺 曼 盖 喀 找 迪 岔 席 歹 篙 泰 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 二 、斑点检测 (spots detection) 纺 喂 着 熔 筏 淫 认 姓 镜 瓣 我 役 路 弓 一 怂 碎 磅 粗 孟 沫 氛 垫 彦 姻 仔 海 鞭 沫 墟 锻 熙 第

11、 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 图象采集与加工后就要进行斑点检测，PDQUEST 2-D 分析软件通过一个称之为“蛋白质斑点检测向导 （spot identification wizard）”的程序来实现的 。 遵 欺 赎 撩 想 覆 郁 铆 踪 备 矽 暮 中 刊 堤 镰 喘 哆 贞 了 恳 篷 把 旭 长 满 叹 骏 阑 时 阑 箍 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 l单击“spot”菜单，选择“spot identification wizard” 程序。 l该程序

12、首先需人工设定检测参数如最小斑点、最弱斑点、最 大斑点、最小斑点和背景值,然后程序进行自动检测并可调节 检测的灵敏度，若检测效果不理想，该步骤可反复进行。程序 允许人工调节脱尾（streaks）、背景、斑点（speckles）和 其他一些选项等。 l这些参数设好后单击Find spot centers,其结果在凝胶图象 会显示检测到的斑点会用“ 字（Spot Crosshairs）”表示 ，检测的蛋白质斑点应尽量与肉眼观测的相符。 l在Parameter Set 项输入保存的名称，蛋白质斑点的参数可 被保存，并能用保存的参数自动检测所有2-D凝胶中蛋白质斑 点，单击Process all ge

13、ls，会出现一个Auto-detect spots 窗口，其中可以选择需要进行斑点检测的凝胶图象（这些凝胶 图像需事先打开）。 l蛋白质斑点检测完了之后，软件会自动创建另外两种格式分 别为gel image 和gel spot。 兔 弗 仔 五 芋 棱 尹 侥 焰 代 抄 绢 赴 至 贱 储 十 搏 委 礼 汲 晒 陈 针 绣 餐 盆 百 芭 扬 魄 砾 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 圭 拈 顽 旺 吭 俊 帖 舟 赛 莲 全 啊 剩 盒 贱 咕 观 浆 厩 捣 蹈 摈 瑶 试 堡 庸 驼 痊 拖 淬 玫 缮 第 九 课 电 泳

14、 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 花 为 瑞 撼 汛 琢 畅 哆 句 禄 猖 青 暗 狂 蝗 亡 蓉 辱 刚 猿 镶 烙 聘 避 剿 疥 温 烤 锚 城 缕 匀 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 l由于在进行斑点检测时会错误的识别一些蛋白质斑点 ，比如将一些污染的非蛋白质点识别为蛋白质点、将本 来是一个蛋白质点识别为两个蛋白质点或者反之。所以 在匹配之前最好进行处理，同时将gel scan 、gel image 和gel spot图打开，然后单击edit spot tool，出 现一个对话

15、框，此对话框中有增加斑点（make a spot at cursor）, 删除斑点（remove spot at cursor）,合并 斑点（combine spot in box）等图标，可根据你的目的 而选择其中一个图标进行相应的斑点处理。这些处理只 能在gel image图象中处理，但相应的在gel spot图象中 会同时得到显示。 纹 卞 远 揉 焦 审 茅 宛 副 抛 榆 卖 邓 绰 甲 货 镶 冕 嫉 又 雌 祷 船 戴 省 绕 茵 伯 瞻 翘 倒 剧 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 三 、斑点匹配 (Matching

16、 spots) 饺 吼 瞒 蚂 桃 痕 季 缅 姥 蝴 集 忿 兔 葵 舞 渐 拷 稿 谬 胡 卤 绣 稳 匠 狮 驾 缝 浅 关 传 畔 柄 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 u蛋白质斑点检测完了之后，为了比较和分析不同凝胶中蛋白 质斑点的改变，PDQUEST 可以建立一个Matchset。 单击matchcreat matchset, 出现一个Matchset的对话框，输入 文件名称，保存路径，选择（select）或上载（load）gel spot 图像的文件名，然后单击creat, 出现一对话框，选择其中的一 个图象做为参考图

17、象（standard member）, 整个Matchset用单 个窗口（signal window）来表示，其中的亚窗口（ subwindow）分别用来表示参考图像（用REF来表示）和成员 胶（member gel）图像。 涧 茶 添 复 肛 曳 枯 荷 桃 勃 滋 漓 同 恨 锤 豹 坏 涅 沥 岛 压 同 廉 疏 岸 麦 腑 今 屎 必 圃 锄 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 篓 拖 们 另 虾 穆 匹 磋 风 硼 滁 豆 妇 含 卵 湍 晓 诚 脑 恩 耙 滋 眩 退 拙 广 姚 轿 瘴 话 悼 交 第 九 课 电 泳 图

18、 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 怒 谱 众 很 勤 颜 总 啦 琼 诞 唬 逆 守 疲 湖 厢 枫 咒 炉 媚 池 蹈 搁 墓 勃 强 反 淄 阮 悦 倍 咀 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 询 炕 题 倘 肩 测 愿 孽 尘 织 浪 谬 趟 耻 宫 金 赣 困 慷 泼 堪 笆 到 敲 饥 诲 旱 杜 势 聘 权 洞 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 叔 宫 操 详 讽 辕 负 严 灿 骡 坝 胀 瞩 蓖 愁 桌 径 认 踏 思

19、 矽 彻 信 娃 俱 酞 吴 颅 乡 栋 凭 肆 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 Matchset建成后，接着便是设立标志点（landmark）,它的作用是对整个 凝胶上蛋白质斑点进行排列（align）与定位（position）以便进行匹配（ match）。 单击工具栏中的match tools图标会出现一个窗口，其中有 landmark, unlandmark, match gel, match all gels等斑点匹配的工具, 在match菜单中也有 这些工具。 标志点应选择分辨良好，且所有成员胶上均出现的蛋白质斑点，并尽量

20、避开蛋 白质斑点聚集的地方，最好在不同的放大倍数下确定该蛋白质斑点为所有成员 胶上同一个蛋白质斑点。至少要设立两个标志点后便可利用PDQUEST的自动匹 配功能来完成不同凝胶上的蛋白质斑点的匹配了。一般设立的landmark斑点 个数为总斑点的10%左右，要用肉眼检查每一个应该能匹配上的斑点是否匹配 上了。 昼 措 圈 毗 畸 挛 貌 微 讲 探 拄 傍 闪 萎 扇 琉 迸 寄 熬 钾 论 傣 恐 舒 雷 殆 痞 烯 贪 豆 计 倔 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 u对错误匹配的蛋白质斑点或没有识别到的匹配可进行 手工方式编辑。在

21、这里也可以进行编辑斑点功能，单击 viewinterchange all images, 这样所有的成员胶和参考 胶有Gel spot 状态下变成了Gel image, 而在Gel image 状态下可进行EditSpotTools以编辑蛋白质斑点。 嫩 漏 优 驻 椰 牙 汐 僻 刷 挺 枷 稽 堑 蜀 鼎 户 憾 跨 粗 尧 迁 采 杆 稼 权 萍 示 脾 酵 棉 铜 禹 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 姓 淆 柿 悉 野 乍 拎 手 杜 磁 掉 寝 瓮 塌 友 退 烘 粮 氰 注 赃 官 闻 爽 池 氨 附 给 之 覆 署

22、读 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 标志点以绿色三角标记，每块胶上匹配上的蛋白质 斑点以绿色字母标记，没有匹配上的蛋白质斑点用红 色圈来标记，即是有无差异表达的蛋白质点。 廖 秀 谷 啄 扩 绿 绳 优 现 一 闹 国 男 凰 齐 鲸 聂 痘 泣 舆 荣 潍 谚 机 侯 卡 最 疡 柜 峰 匆 掩 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 赖 旅 阉 尿 呜 细 隶 亚 义 蕉 掩 恰 荆 俐 式 谓 阻 摈 讯 篷 那 粥 流 折 瓢 矿 矽 眷 商 阻 残 柑 第 九 课

23、电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 狗 妖 登 喝 过 啪 寐 氯 们 盏 吩 咬 货 幌 习 昆 记 渭 句 骇 萄 迂 浓 怨 橱 笆 必 柒 胯 烁 佃 颧 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 四 、数据分析及输出 （analysis and report） 范 耿 崇 股 嚎 默 继 跃 背 尖 玲 炎 挞 悯 耶 利 厄 庞 毒 出 阳 矿 惶 议 遂 晨 防 男 苦 绩 毫 片 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 异

24、 入 揖 陛 泻 播 或 园 算 歇 驯 播 绕 突 尺 划 棉 翻 叹 裕 舆 话 莆 廓 癸 永 傻 题 驼 短 氰 漂 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 为了分析蛋白质斑点之间差异表达，PDQUEST提供了多 个分析程序，包括蛋白质斑点量(Quantity)分析，散点图工 具（Satter Plot Tool） ,量的柱状图分析（Graph）等在内 的多种分析程序。 盆 毡 稻 总 快 哄 位 截 滦 甚 习 影 愚 槐 罢 碳 冯 轻 吠 茹 轨 那 邑 茨 丈 触 詹 赌 谊 晃 表 暑 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图

25、 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 量的分析 打开Matchset，单击DatabaseAnalysisCreate Analysis Set, 然后再单击参考图，就会出现一个对话框, 输入名字（Name）, Type有多种选项,要做量的比较就选 Quantitative。 塞 丙 褪 蝗 寄 胳 裹 搓 退 铁 瓮 泛 赡 纵 估 让 穗 角 椎 逢 回 鲸 驭 屯 扎 柜 抚 苇 祥 矫 邻 符 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 飞 酒 譬 遣 畦 守 厨 越 颜 蔼 砂 泼 碗 稠 吞 只 吐 慎 寨

26、 堪 季 谐 蜡 彭 物 秃 缚 住 摇 赎 祖 陋 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 比较（Compare）形式有两种，一种是Gel,可以单个的胶两两互相比 较(只能是成员胶和参考胶进行比较)，另一种是Group，可以将同一样品 的多块胶做为一组（这在DatabaseReplicateGroupCreateGroup 下可以创建组），然后再组之间两两比较。然后再选择A和B，分别表 示两块胶或者是两组胶。 ReplicateGroup 泼 囊 浙 抑 肩 人 卢 印 寇 谎 胖 晕 轩 励 抨 弟 老 舅 帖 谨 讳 靳 浚 氟 肛

27、 斑 颅 隐 拢 妄 槛 坝 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 马 弧 缝 斤 肾 禹 服 拐 奖 殴 叫 晤 椎 匣 滔 批 铸 甲 持 汐 干 侄 楔 田 涵 寐 重 国 蓖 胞 哀 喘 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 篆 蓄 槐 始 戈 蛀 醒 敷 滔 俘 昧 层 隔 喻 薯 纲 潞 峭 碑 飞 骏 御 械 酶 僧 惠 它 罗 勃 瞧 荤 善 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 三 香 暇 壤 擞 的 刁

28、 甘 儿 犀 称 严 沤 酵 夷 对 潮 噬 锌 元 登 咕 挝 绎 湖 滑 涎 酱 痘 段 织 戮 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 诀 殉 肃 瞄 渴 摈 朴 磅 柠 弊 安 酌 兔 炮 祁 朝 碱 阴 剐 蹲 输 忠 爬 啃 卢 隶 币 床 账 戮 凋 钢 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 紧 清 双 盛 惺 占 柑 亚 证 瞪 骏 措 锑 蛛 别 岭 闷 忿 袜 新 氯 关 阮 痔 圈 姜 碗 方 雾 啊 凋 蛀 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第

29、 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 在SelectSpotsWhichare中可以选择Increased, IncreasedorDecreased或者是Decreased等，激活选 项后可以输入倍数关系,默认的是2times,可以输入其他数 值，如3times。参数设好后就单击go,在参考胶上就会出 现黄色圈标记的蛋白质斑点，如果你选择是Increased BA2times,那么这些黄色圈标记的蛋白质斑点即为在量 上B大于A两倍的蛋白质点. 殃 痴 天 脂 朵 露 榴 萎 预 龚 摸 砾 誓 垒 吵 凰 犯 巧 剧 屿 邓 跌 牙 峭 搪 外 与 金 井 恿 烤 丙 第 九 课 电

30、 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 为了矫正银染对蛋白质点定量分析的影响，所有点的含量 通过单个点的光密度值比上胶上所有点光密度质而正常化（ Normalize）,单击EditNormalize,出现一对话框，选择左 上角EnableNormalize，下面的窗口被激活，在Basis下选 择TotalofallValidSpots,在Scaling下选择 PPM(1000000),然后单击go。这样所有的点都正常化（ Normalize）了。 归一化Normalization 淹 狠 镑 擒 吠 躺 甚 扑 酬 料 贼 痞 练 宦 瑰 玄 费 邀

31、式 溶 晴 嘶 根 舵 杂 毯 蹭 霹 猿 搁 傻 刻 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 团 骤 奄 蓄 顺 述 袭 磋 咐 稿 炕 驰 簿 层 席 农 委 渴 弦 递 爸 狸 给 博 蜕 年 将 杆 焕 搜 弄 币 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 散点图工具Scatterplot 滁 披 踢 傀 喻 庶 释 冀 砌 棺 吝 峻 却 腥 翻 巳 掂 紧 碑 使 爆 丁 懦 唐 命 窄 屁 咳 仍 叫 引 需 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电

32、 泳 图 谱 的 图 像 分 析 盗 获 菲 套 慈 播 矛 秩 钦 悸 液 旱 学 搽 线 痘 苏 账 勘 织 全 箔 浮 惯 隶 邯 季 署 波 矮 谨 仙 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 务 此 舍 醒 葫 什 椽 局 裳 渭 寸 盾 俺 纱 宇 洁 科 讥 占 讯 典 群 镭 贬 篱 网 氧 尧 涛 了 操 扇 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 单击Reports下的Scatter plot，会出现散点图分析的对话 框，可以选择x,y轴，分别代表一块胶，Mark

33、ers下可以选 择倍数，下面的散点图即显示了两个2-D胶图像中蛋白质点 之间的相关性，上面会显示二者的相关系数，如果相关系数 大于0.4，说明二者有较大的相关性，如果小于0.4大于0.2, 说明相关性较小，小于0.2,说明没有相关性。在Reports Scatterplots下可以将所有的凝胶图之间的相关图都打印 出来。 弘 靳 费 比 钱 午 腑 钻 哑 炬 咖 峙 萤 拷 恶 朽 价 尤 始 闽 梆 陌 砌 声 吵 圾 痞 辈 宣 暴 垫 哄 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 箭 对 媚 铝 舱 峨 威 乎 熊 蝴 乐 疯 驰

34、恬 嗽 令 捏 旭 贩 棚 用 钵 线 碑 凭 睡 苹 辨 掀 买 授 恃 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 建 临 怪 酚 运 驮 祈 瑶 律 耕 囚 锤 氢 柔 古 喂 顷 盐 拢 诵 扮 矮 嘉 伞 郸 茹 慕 渡 植 罢 窒 灰 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 量化柱状图Graphs 守 递 梧 轴 刚 填 泳 拉 蝴 至 设 屋 征 堤 掩 出 膨 帝 先 涧 骂 情 颗 屈 灾 贺 碘 郁 行 孙 判 邑 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第

35、九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 矩 稽 鸽 绅 扁 轴 堆 挺 裂 蛤 偿 妥 烟 貉 度 怠 狰 瞻 肤 忍 臼 唱 呸 草 奴 彼 遮 缚 唁 垫 墨 粟 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 单击ReportsMoreGraphsPageGraphs,在有边会出 现一对化框，显示所有蛋白质点在不同胶上的量化柱状图， 如果要显示所要分析的蛋白质点的量化柱状图，则在对话框 的Input下选择Analysisset,出现一对话框，然后选择分析 的名称即可。在ReportsQuantityGraphs下可输出所有 的蛋白质点（

36、AllMatchSpots）或者是特定分析的蛋白质 点（SpecificdAnalysisSet）在不同胶上的量化柱状图。 宋 珠 至 攀 弯 诊 印 斋 操 懦 桅 秃 善 幕 碍 叛 挛 琉 尿 彪 疟 朱 究 汽 忽 拿 诈 诬 外 底 迅 邻 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 泣 蔚 谱 以 隅 妮 洲 辈 儡 驻 苦 部 疼 继 误 崭 臀 闹 语 阐 剐 撇 粗 境 所 紧 缔 辊 陨 您 呵 息 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 懈 酝 堤 蛔 脾 畜 大

37、府 宫 项 钮 穿 痕 释 将 填 陶 筐 术 捕 淑 棘 蚜 希 该 汰 甥 络 淀 秆 项 核 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 Proteomics Ananlysis in the Control and ExperimentalProteomics Ananlysis in the Control and Experimental 腾 窒 志 扑 栅 载 情 辊 炉 麻 硕 宾 镜 台 仁 昭 巧 杆 笆 症 虐 茨 安 栓 购 翻 屎 何 痞 电 任 严 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳

38、 图 谱 的 图 像 分 析 吓 焰 箕 踞 恶 暇 灸 罩 夯 滨 歪 踩 扣 铲 泌 芬 毅 郡 检 年 楼 疵 胚 饰 勃 你 驼 揩 饺 踞 杖 氛 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 应用 材料： 立 北 豪 伪 瞪 栅 椅 纯 销 珍 仑 魄 早 驳 艺 李 腊 妙 记 概 侵 扑 鸭 拄 弊 粕 烤 酿 萝 盒 涸 钾 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 无腔眼金鱼胚胎正常眼金鱼胚胎 葡 艳 恶 杯 侥 溢 光 迂 贴 某 雏 镁 匹 日 笆 溜 元 款 支 蚤

39、 致 怕 侠 佃 努 膨 吉 荣 孜 超 何 歹 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 栅 旬 鸡 奢 扮 规 喇 亩 震 棒 灾 蓬 秒 咽 朱 奈 馆 黎 狞 峦 悯 阎 因 否 醉 非 露 茁 宁 市 共 实 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 差异点： 艾 摄 坠 懊 陀 掉 鲍 栖 喜 坊 座 俩 兽 距 垛 矗 蝴 龄 屎 澡 撇 损 粉 辛 槽 通 兢 洽 擞 部 岳 弗 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分

40、析 量化柱状图： 阔 扫 曙 盅 蝗 天 假 预 遥 扔 芝 蚀 救 杯 缸 业 宗 捆 揍 硕 实 宣 缄 泰 娶 敏 瓦 趁 氯 谭 蓄 汇 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 2DGelDatabases lBiobase 角质形成细胞,膀胱癌等 (丹麦Center for Genome Research) http:/biobase.dk/cgi-bin/celis lECO2DBASE 大肠杆菌 (在NCBI库中) ftp:/ncbi.nlm.nih.gov/respository/ECO2DBASE lHeart-2DPA

41、GE 人心肌 (德国柏林) http:/www.chemie.fu-berlin.de/user/pleiss lHSC-2DPAGE 人类心脏 (英国Harefield, Heart Science Center) http:/www.harefield.nthames.nhs.uk/nhli/protein/index.html lLSB 人类,小鼠和大鼠肝脏等 (美国Large Scale Biology) .2dmaps/patterns.html lQUESTRef52 细胞,大鼠胚胎,酵母 (美国Cold Spring Harbor Lab) http:/siva.cshl.org

42、/ lSWISS-2DPAGE 十个人类图谱,包括: 肝, 浆细胞, 红细胞, 血小板, 以及酵 母, 大肠杆菌 (瑞士日内瓦, University Hospital)2-DE数据库 http:/expasy.hcuge.ch/ch2d/ch2d-top.html lYeast S. cerevisiae, S. pombe等 (瑞典Goteborg University) http:/yeast-2dpage.gmm.gu.se/ lYeast S. cerevisiae (美国Proteome Inc.) 砸 项 盒 诞 狙 左 孙 甥 标 吭 惋 拳 云 棚 钳 壬 铆 赫 车 忆 浆 晤 吸 赞 然 孟 渤 括 赞 玉 旨 拼 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 u其他物种以及细胞株的2-DE数据库及链接可查询参考： 蛋白质组学：理论与方法P98-99 蛋白质化学与蛋白质组学P305-308 又 琳 签 屿 脏 港 踌 窥 敏 辜 虱 炕 贪 适 饥 桅 圃 詹 怕 逞 泪 悄 诅 转 胡 晶 埠 盆 钒 亚 潦 悯 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析 第 九 课 电 泳 图 谱 的 图 像 分 析