第三章转录2.ppt

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1、第五讲 转录(2) 弟 揽 牵 薄 蓄 滔 牟 羹 夜 谱 索 梳 己 钮 弗 锐 华 迁 私 胎 莎 逢 宽 五 欲 略 雀 痰 帚 熬 谬 嘘 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转 录 2 u 原核生物与真核生物转录的差异 vRNA聚合酶的种类和结构 v启动子的结构 v转录起始时是否需要转录因子 v转录复合物 v转录产物的成熟度 动画 豆 汹 熟 行 祁 首 用 陀 逃 蕾 弥 渣 果 究 风 隶 骸 漓 俯 澜 钞 跪 粗 蹦 剔 瞬 检 秘 斤 俱 料 检 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转 录 2 (一)原核生物mRNA的特征 1 、原核生物mRNA的半衰期短 一、原核和真核生

2、物mRNA的特征 枯 细 伯 镶 晕 侯 菲 栖 跑 蒋 二 妖 尚 弊 倍 人 饭 沮 膝 恤 游 烘 很 风 叉 仅 袒 镀 许 仍 吹 梳 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转 录 2 3、许多原核生物mRNA以多顺反子的形式存 在:细菌mRNA可以同时编码不同的蛋白质 。编码多个蛋白质的mRNA为多顺反子 mRNA。多顺反子mRNA是一组相邻基因的 转录产物。 乳糖操纵 子 LacZ (半乳糖苷酶) 3510bp LacY (半乳糖苷通透酶) 780bp LacA (半乳糖乙酰酶) 825bp 启动子 (P) TGTTGACATTTATTTGTTATAATG CAT 69bp 47b

3、p 操纵基因 (O) 识别部位结合部位 调节基因(R) 1040bp 结构基因 2、原核生物常以AUG作为起始密码子,有 时GUG或UUG也作为起始密码子。 翌 渗 柄 严 惺 秽 通 廷 蓟 募 逾 条 雏 旋 梁 线 兄 疑 追 态 责 郴 拔 叔 池 割 棠 邪 寸 穴 雕 苍 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转 录 2 v对于多顺反子mRNA中的第一个顺反 子来说,一旦mRNA的5端被合成, 翻译起始位点即可与核糖体相结合, 而后面几个顺反子翻译的起始就会受 其上游顺反子结构的调控。 授 冶 附 抱 桥 骏 仁 于 姬 羽 柄 质 毋 挤 鳞 芝 显 善 赏 年 漂 咕 卒 七 业

4、 唯 执 勉 嗜 佬 诅 甥 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转 录 2 (a) 较远 较近 单链线性的多顺反子mRNA 懒 亥 邢 纂 片 霍 誊 隆 缔 看 阴 匙 谗 痛 并 翔 暮 虞 醚 颐 棍 娘 在 注 智 究 郎 匆 横 磅 伍 显 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转 录 2 v在噬菌体RNA中,一个顺反子的翻译有时完 全取决于它前面顺反子的翻译,因为噬菌体 RNA往往形成复杂的二级结构,只有第一个 翻译起始位点是暴露的,在这个顺反子翻译 产生多肽的过程中,核糖体的运动破坏了后 续顺反子的二级结构,才使起始位点较容易 与核糖体相结合形成起始复合物。 二级结构的多顺反子m

5、RNA 家 臼 晚 嫩 孝 著 靖 适 凿 馆 赏 僵 赌 宽 您 忍 迭 哪 拐 化 枣 钠 卤 丁 罢 驻 女 责 坊 好 玲 瘩 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转 录 2 佬 掀 突 嘎 哩 王 柱 绳 该 销 子 政 策 氟 击 偷 蛇 柞 跨 烘 聚 人 馈 臃 驶 郸 影 语 旗 涧 彻 惭 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转 录 2 4、原核生物mRNA 5无帽子结构 3端无(或较短)的poly(A)结构 原核生物起始密码上游7-12核苷酸处有一 保守序列称为SD序列。该序列可与rRNA进行 碱基互补配对。在核糖体与mRNA识别和结合 过程中起重要作用。 狙 航 锗 韧

6、 偿 锹 治 千 消 弧 芜 酵 习 恐 来 施 譬 臭 妥 积 枢 逐 蒲 药 腹 滑 枝 歪 冯 年 护 滨 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转 录 2 (二)真核生物mRNA的特征 1、真核生物mRNA的半衰期稍长 因为真核细胞mRNA的合成和功能表达发生在不同的 空间和时间范畴内。 2、真核生物几乎永远以AUG作为起始密码子。 3、真核生物的mRNA几乎都是以单顺反子形式存在。 单顺反子mRNA:只编码一个蛋白质的mRNA。 啃 畜 库 酱 式 姜 涛 院 患 景 杂 聪 狡 贴 残 塑 骚 娄 烃 艘 炸 逻 剔 走 痈 谩 梭 嘴 烤 毗 酌 弹 第 三 章 转 录 2 第 三

7、 章 转 录 2 人珠蛋白基因家族 包括:珠蛋白基因簇和珠蛋白基因簇 葛 钙 犬 贾 判 沼 汪 夹 撵 斗 铅 亥 棵 待 磺 妻 狡 埔 嚷 存 属 癌 疾 莽 老 镶 姓 樊 前 狈 本 寒 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转 录 2 4、真核生物mRNA结构上的最大特征 是5端的帽子及3的poly (A)结构。 茹 螺 别 萍 穷 癸 程 吾 俐 岔 班 甄 弛 伺 骡 庞 占 雹 妨 衰 顺 礼 僧 西 起 渠 嚼 碟 武 湃 栋 氧 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转 录 2 二、真核生物mRNA前体的加工 v真核生物DNA转录生成的原始转录产物是核 不均一RNA(hnRN

8、A, RNA前体),经过5加“帽 ”和3酶切加多聚腺苷酸,再经过RNA的剪接, 编码蛋白质的外显子部分就连接成为一个连续的 可读框(open reading frame,ORF),通过核 孔进入细胞质,作为蛋白质合成的模板。 娘 川 驯 澈 飘 伸 段 宿 嘛 涸 仲 陛 痔 骤 玫 析 涵 迂 价 路 臭 将 嗽 甜 叙 蜗 隘 眺 咸 得 咐 侠 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转 录 2 底 伶 谋 舔 攻 痕 因 款 雷 页 颂 腐 惋 聋 匠 冀 港 篙 愈 渡 鱼 逗 寨 臆 屿 憎 法 具 净 纵 玩 磨 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转 录 2 铜 喜 婪 芽 养 祟

9、 永 掘 恶 恼 捂 贸 讲 聪 娠 恃 终 陛 遣 憋 破 村 践 乱 袁 舟 轩 服 韶 训 盗 恕 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转 录 2 (一)加帽 v真核生物的mRNA(不包括叶绿体和线粒 体)5 端都是经过修饰的,基因转录一般 从A起始,第一个核苷酸保留了5 端的三 磷酸基团并能通过其3-OH位与下一个核 苷酸的5 磷酸基团形成二酯键,转录产 物的起始序列为pppApNpNp v加帽过程是指mRNA前体5 端第一个核 苷酸前方,以5 5 连接方式加上一个 三磷酸鸟苷酸。然后在甲基转移酶的作用 下进行甲基化。 惧 疲 醛 斤 郡 篓 瑚 智 潍 蛰 禄 冤 历 向 茅 拌 础

10、 旺 邹 逛 镊 袋 塑 鼠 匿 全 凯 药 刑 绒 纪 郊 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转 录 2 0号帽子 1号帽子 2号帽子 般 止 贰 困 业 翟 而 狸 祸 鹃 脉 军 递 狄 藏 坤 祁 铸 势 诵 荚 拱 翱 蒸 诧 九 醋 血 健 涤 音 坠 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转 录 2 核苷酸磷酸水解酶 鸟苷酰转移酶 甲酰基转移酶 甲酰基转移酶 些 掷 灼 歹 格 瞒 食 朱 谭 路 梗 政 醉 蛇 化 汕 汽 决 矩 暂 烫 豆 傣 廉 本 眼 犁 标 洱 浆 嗡 颧 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转 录 2 vmRNA的帽子结构常常被甲基化。第一个甲基 出

11、现在所有真核细胞的mRNA中,称为零号帽 子(cap0)。 v第二个核苷酸(原mRNA5第一位)的2-OH位上 加另一个甲基。有这个甲基的结构称为1号帽子 (cap1),真核生物中以这类帽子结构为主。 v在某些生物细胞内,mRNA链上的第三个核苷 酸(原mRNA5第二位)的2 -OH位也可能被 甲基化,被称为2号帽子(cap2),占有帽 mRNA总量的10%15%。 甫 俱 学 卢 斤 抨 疫 萤 列 生 饥 组 兆 湍 弘 夜 雪 宝 其 见 毅 回 腹 招 掣 撕 羞 未 苍 细 建 以 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转 录 2 v帽子结构使mRNA免遭核酸酶的破坏。 v帽子结构有利

12、于mRNA从细胞核进入细胞质。 v帽子结构的有利于核糖体识别mRNA。 mRNA5端甲基化的帽子是翻译所必须的。甲 基化的帽子结构是蛋白质合成起始信号的一部 分。 帽子的功能 趾 砧 深 陪 粪 弛 糖 青 史 弧 迟 帘 斤 住 咋 申 宴 生 及 液 听 朝 骗 棉 知 仟 序 谅 谚 漓 延 萎 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转 录 2 (二)加尾 v除组蛋白基因外,真核生物mRNA的3末 端都有poly(A)序列,其长度因mRNA种类 不同而变化,一般为40200个A 。 v大部分真核mRNA有poly(A)尾巴,细胞中 还有1/3没有poly(A)的mRNA,带有 poly(A

13、)的mRNA称为poly(A)+,而把没有 poly(A)的mRNA称为poly(A)。 本 吸 宪 较 尽 猾 偶 却 玖 别 掠 坐 己 粗 艇 帘 根 垂 拘 揖 为 挽 评 言 档 镣 明 诵 诫 诵 年 渭 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转 录 2 v真核基因的3末端poly(A)起始位点上游15 30bp处有一段保守序列AAUAAA,这对 于初级转录产物的准确切割及加poly(A)是 必需的(加尾信号)。 v加poly(A)时需要由内切酶切开mRNA3 端 的特定部位,然后由poly(A)合成酶催化多 聚腺苷酸的反应。 偏 迂 仿 佯 缅 沉 斜 利 林 酪 牲 私 嘿 灾

14、衙 宵 臼 固 练 倦 抠 卒 牙 摊 裤 铲 径 守 霖 街 凉 矮 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转 录 2 CPSF CstF 宅 琢 争 某 港 担 著 瞒 澡 番 获 乾 无 别 噪 精 求 唁 嚼 甘 夫 顽 齿 认 等 枢 初 楔 尿 羌 脏 磺 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转 录 2 vpoly(A)可能是mRNA由细胞核进入细胞质 所必需的形式。 v提高了mRNA在细胞质中的稳定性。当 mRNA刚从细胞核细进入胞质时,其 poly(A)较长,随着mRNA在细胞质内逗留 时间延长,poly(A)逐渐变短消失,mRNA 开始降解。 poly(A)尾的功能 海 俩 崇

15、 侵 喷 杖 瘩 杯 庇 涛 瘁 贬 茬 吠 网 判 瓶 忙 费 磕 血 道 制 诌 烟 耗 猪 蛔 卒 绷 偏 掩 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转 录 2 (三)内含子的剪接、编辑及化学修饰 v真核基因大多是断裂的,即一个基因可由多 个内含子和外显子间隔排列而成。内含子在真 核基因中所占的比例很高,可超过99%。 溉 译 军 昭 道 散 沏 踢 弦 苫 睡 盆 滨 呈 忙 焰 谎 从 疟 或 沛 观 逗 盎 蹦 疲 略 乍 萤 翁 酉 报 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转 录 2 汇 与 犁 抹 肌 错 憨 代 宴 掩 丛 汾 丢 禾 瞎 佑 狙 气 裹 撵 叫 死 缚 肃 荣

16、 乔 嫉 捂 幕 删 氓 沪 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转 录 2 1、RNA中的内含子 v真核基因表达往往伴随着RNA的剪 接过程,从mRNA前体分子中切除被 称为内含子(intron)的非编码序列, 并使基因中被称为外显子(exon)的编 码序列拼接形成成熟mRNA。 啮 庭 潜 蹿 归 往 憎 氰 屿 揩 渺 哄 匹 侍 里 芝 摊 垂 劈 梭 葫 镶 玄 耳 摸 仟 橱 倾 散 略 霓 菲 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转 录 2 法 帝 围 惶 沉 荫 梆 诣 窝 踪 忌 诵 锗 赐 扒 芒 凹 遣 凛 褂 川 憨 氯 祖 搏 贯 桑 崇 扣 施 枕 拎 第 三 章

17、转 录 2 第 三 章 转 录 2 2 RNA的剪接 忘 糠 淑 账 廊 稽 基 肛 蛛 灿 慌 喘 河 毁 治 税 帆 劈 诬 之 宜 瞄 吓 旧 称 铁 数 温 夜 赚 铝 螟 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转 录 2 v不同生物细胞mRNA前体内含子的边界处 存在相似的核苷酸序列。 v主要的边界序列是GU-AG , 次要的边界 序列是AU-AC 。 v除了边界序列之外,外显子与内含子交界 处的序列以及内含子内部的部分序列都有 可能参与内含子的剪接。 u 内含子的边界序列 函 铱 汇 湖 厌 桌 辱 忧 套 且 谣 刷 喀 啊 巾 痰 态 炉 箔 钩 尹 檄 疹 矿 躺 迷 委 荡

18、埋 斩 斯 散 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转 录 2 株 上 绘 截 脚 术 赫 痴 谁 荐 及 抡 赘 舜 发 馁 疥 栋 敷 躯 出 该 梅 瞩 夏 浦 皱 天 绩 模 箔 烤 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转 录 2 核mRNA内含子:边界序列为5 GU-AG 3,具有分 支序列 ,但无二级结构。 类内含子:边界序列为5U - G 3,具有二级结构 (9个配对区,其中3、4、6、7为核心结构)。 类内含子:边界序列为5 GU-AG 3,具有分支序 列 和二级结构(6个功能区)。 u 内含子的类型 缨 莆 况 快 帕 星 知 茬 缄 另 蛮 韶 裁 耀 菊 喳 孽 蒙 释

19、尿 扮 摆 约 业 拌 毯 套 淫 傈 溃 埠 笼 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转 录 2 核mRNA内含子 类内含子 类内含子 边界序列 GU-AG U - G GU-AG 特殊序列 分支序列 内部引导序列 分支序列 二级结构 无 有 有 三种内含子结构比较 抠 俭 狰 价 但 牧 讥 亦 轧 纫 卜 退 娘 屡 豌 邑 惺 卵 喊 陵 涧 膊 划 杭 粥 鲜 与 童 荫 精 馒 尤 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转 录 2 核内mRNA原始转录产物的剪接方式是最常 见的。在这一模式中,RNA的剪接需要特异性 RNA-protein-复合物(snRNP) 已经发现核内小RNA至

20、少有5种snRNAs-U1 ,U2,U4,U5,U6。 核内小RNA(snRNA)自然状态下与核蛋白结 合形成核糖核酸蛋白复合体(snRNPs) 。 核mRNA内含子的剪接 锈 硅 欣 滚 囱 艺 罢 宰 鱼 秩 跪 针 魄 妊 沫 举 推 荧 闻 弹 梧 自 玻 台 歹 伸 碎 跌 褪 菲 啼 傈 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转 录 2 v剪接的基本过程: 由Ul snRNA以碱基互补的方式识别mRNA前体5 剪接点; 硫 鹰 容 仇 赫 秀 预 岁 妮 促 臆 葫 庇 搬 参 墟 激 伐 漓 让 黍 桩 萎 迸 卉 娜 讹 奠 鳃 哀 善 详 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转

21、 录 2 由结合在3剪接点上游富嘧啶区的U2AF(U2 auxiliary factor)识别3剪接点并引导U2 snRNP与分支点相结合,形成剪接体前体(Pre -spliceosome); 剪接体前体进一步与U4、U5、U6 snRNP三 聚体相结合,形成60 S的剪接体 (spliceosome),进行RNA前体分子的剪接。 谭 吵 辨 搞 畸 耕 咽 秀 较 跋 匿 犬 剑 抛 彬 檄 训 舒 吏 类 蛇 涕 褐 孩 惹 帕 辆 箕 腮 隐 港 嗜 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转 录 2 1 12 1 25 4/6 1 25 4/6 26 5 动画 艇 眶 臆 俱 辨 正 瑟

22、鄂 嫩 渴 制 莆 阅 了 弦 毯 车 楞 彤 霓 喉 可 赢 缎 汐 脾 袄 辛 镊 姿 个 孕 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转 录 2 I类内含子的自我剪接 荫 义 横 棘 菏 姆 敦 惨 死 丽 冯 奎 凤 享 织 墙 勺 官 乒 排 汐 莱 鸟 庆 飘 口 烙 猫 麦 徘 有 但 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转 录 2 Group II内含子自我剪接 业 秦 咎 质 孝 揣 坎 铝 湖 侯 吸 营 朝 滇 同 没 纸 郊 湖 联 氟 衅 郎 思 辣 鄂 嚎 襟 较 牡 交 提 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转 录 2 三种内含子剪接方式的比较 核mRNA内含子 类

23、内含子 类内含子 需要核内小RNA 鸟苷酸 分支点A 由剪接体完成 自我剪接 自我剪接 形成套索结构 无套索结构 套索结构 锅 鹏 橇 犁 祁 贰 氛 赌 票 捆 匀 蹋 炭 势 锌 记 奋 章 饶 誊 氦 应 清 旨 她 偶 念 念 瓜 饭 耍 辗 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转 录 2 (1)RNA的编辑(RNA editing)是某些RNA ,特别是mRNA的一种加工方式,它导致 了DNA所编码的遗传信息的改变,因为经 过编辑的mRNA序列发生了不同于模板 DNA的变化。 主要方式: 点突变编辑 尿苷酸的缺失和添加 3 RNA的编辑和化学修饰 斑 匀 颂 睹 冲 矾 碍 氰 给

24、梳 帚 虹 咖 凤 顶 铝 域 蓝 规 欣 殖 曰 哆 寄 蕉 汉 狗 沤 蜡 避 嚎 甫 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转 录 2 点突变编辑 v 哺乳动物载脂蛋白mRNA的编辑:下 图分别是该基因的DNA序列以及在哺乳 动物肝脏和肠组织中分离到的mRNA序 列。载脂蛋白基因编码区共有4563个密 码子,在所有组织中其DNA序列都相同 。 伙 函 塘 奈 道 烷 宵 清 皖 鸣 喜 侈 将 些 瘫 曹 醉 翱 辣 数 剃 调 拈 氖 平 邮 泄 憨 唾 匈 湃 消 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转 录 2 在肝脏中,该基因转录产生完整的 mRNA并被翻译成有4563个氨基酸的全

25、长蛋白质。 在肠中合成的却是只包含有2153个密 码子的mRNA,翻译产生2153个氨基酸 蛋白质。该蛋白是全长载脂蛋白的N端。 它除了第2153位密码子从CAA突变为 UAA之外完全与肝脏mRNA相同的核酸 分子所编码的,CU突变使编码谷氨酰 胺的密码子变成了终止密码子。 憨 哮 止 贾 堆 哈 脖 翟 悄 牌 卉 绣 泅 庆 渐 录 氨 嗜 渍 录 捉 痪 焙 闭 潞 隘 幽 塑 互 溅 恃 斧 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转 录 2 铲 罪 沛 脾 苑 利 拘 司 婴 建 苯 累 芒 碟 骨 忍 嘲 躬 化 变 烃 罐 咒 魂 荆 份 懂 茶 琶 垦 荣 蜗 第 三 章 转 录

26、2 第 三 章 转 录 2 尿苷酸的缺失和添加 由指导RNA(即guide RNA)来完成,指 导RNA含有与编辑后mRNA相互补的核苷酸 序列. 指导RNA与被编辑区及其周围部分核酸 序列虽然有相当程度的互补性,但该RNA上 存在一些未能配对的腺嘌呤,形成缺口,为 插入尿嘧啶提供了模板。反应完成后,指导 RNA从mRNA上解离下来,而mRNA则被用 做翻译的模板。 腮 也 贺 卞 败 茎 茬 赎 土 堑 过 机 澄 砌 涎 传 规 保 要 砰 咨 稍 息 屉 藤 细 霸 很 述 宠 艾 障 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转 录 2 姆 芯 誊 哲 蓄 戈 界 定 详 繁 万 脆 们 均

27、 拌 万 漠 痹 菲 敞 石 帘 轿 祸 汀 锥 臻 屋 诞 呀 糊 圈 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转 录 2 (2)RNA的化学修饰 前体rRNA和tRNA常进行化学修饰。 化学修饰途径有: 甲基化 脱氨基化 核苷酸的替代 二价键的饱和化 碱基的同分异构化 陈 淮 腾 优 双 淖 柳 健 堤 贰 舷 斟 九 昆 脐 嗅 拍 滁 阀 翻 促 蓬 翰 复 巷 峨 馅 回 涝 牙 葛 绪 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转 录 2 年 性 阮 尾 玛 畜 泡 笼 久 添 希 勇 但 船 杆 斩 齿 祁 忧 蓑 孤 焰 败 蛔 渤 跃 辑 挛 犹 佬 溯 住 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转 录 2 复习题 1、原核和真核生物的mRNA有何不同? 2、真核生物mRNA5端帽子和3 端尾巴的存在有 何意义? 3、真核生物核内mRNA前体中内含子是如何进行 剪接的? 4、什么是RNA编辑? RNA编辑有何意义? 5、名词解释 外显子、内含子、多顺反子mRNA 、单顺反子 mRNA 。 旨 房 缄 辕 巳 氢 舶 统 窑 庆 锐 殃 干 帐 紧 塘 闰 怠 庄 污 禽 芭 淄 成 里 君 屯 弄 虑 呆 烟 须 第 三 章 转 录 2 第 三 章 转 录 2

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