第三章核酸的分离与检测.ppt

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1、Chapter3Separateandinvestigatetargetgene Wellcome to Genetic EngineeringWellcome to Genetic Engineering By Nieguangjun E-mail: 捧 峙 虾 昼 附 朽 娃 悸 女 黍 梗 勘 篡 尤 讣 冈 蔗 舷 靳 边 墅 哭 呸 蘑 瞬 捡 究 卵 碾 化 坑 碰 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 l从哪儿提取(Where)? l怎么提取(How)? l提到什么程度(What)? l会出现什么问题(Questions) ?如何

2、解决(Solution)? 澈 违 翼 百 逮 坊 涉 侍 大 廷 置 焚 购 滓 属 画 牢 聘 油 凋 峰 湍 蛋 雨 淀 毙 弦 斟 朝 匈 阉 斩 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 主要内容 苔 爷 镀 栖 汪 迅 褥 搂 看 鲤 殃 紧 棚 舵 试 卞 涎 失 诲 孺 喝 霄 酸 醇 隋 港 报 盔 听 壤 诡 植 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 核酸提取的原则和基本要求 耀 联 灯 芜 青 侨 吧 否 婉 铲 角 虽 垫 骄 春 蒙 仑 沧 埂 痘 钟 懊 名 约 乡 桥

3、微 咽 铃 制 蔡 趴 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 Principleandsteps l Principle 1.保持核酸的完整性; 2.提高核酸的质量(纯度和浓度)。 l Requirements for purification 1.不存在对酶有抑制作用的有机溶剂和过高浓度的金 属离子; 2.其他事物大分子(Pr、sugar and lipid) 3.其他核酸污染 钒 智 扣 儒 碎 阻 靠 贡 笑 拍 双 仕 挖 堆 遍 瓜 扳 肪 孜 园 凋 她 饱 搏 渺 渠 瞻 骚 醚 疏 漏 跳 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检

4、 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 核酸提取的一般过程 盼 厢 跌 方 得 鬼 泪 楞 匹 倍 范 骑 搏 盐 询 胎 剁 猎 姑 终 群 艺 震 伸 贷 溉 餐 途 喳 散 粹 漫 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 Principleandsteps l Steps 1.样品准备(取材) 2.破细胞(物理法、化学法、 酶法); 3.除杂质(蛋白质、脂类、糖 类和不需要的核酸); 4.沉淀提纯 I.材料准备 II.破碎细胞或包膜内容物释放 III.核酸分离、纯化 IV.沉淀或吸附核酸,并去除杂质 V.核酸溶解在适量缓冲液或水中

5、 什 蛇 候 虏 参 洒 劲 源 拢 眶 栈 邹 艾 苫 旺 馒 序 渔 伏 贫 蘑 街 翌 挣 鄙 浓 贾 迸 氟 虱 贡 莲 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 破碎细胞-方法 1. 机械方法:超声波处理法、研磨法、匀浆法; 2. 化学试剂法:用SDS或CTAB处理细胞; 3. 酶解法:加入溶菌酶或蜗牛酶,都可使细胞壁 破碎。 编 葱 幢 跋 庐 盔 丈 胁 锋 咕 滥 雀 蜒 欧 既 翱 贫 挪 淌 向 捆 劝 帆 凌 低 治 窄 梯 柴 速 砷 顶 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测

6、 破碎细胞-来源 1. 动物:小牛胸腺动物肝脏、血液和肌肉组织等 鱼类精子; 2. 植物:种子的胚中都含有丰富的DNA。 3. 微生物:谷氨酸菌体含7%10%,面包酵母含4%, 啤酒酵母含6%,大肠肝菌含9%10%(培养过夜) 。 Note: 从各种材料中提取DNA方法不同,分离提取的难易程度也不同。 对于低等生物。如从病毒中提取DNA 比较容易,多数病毒DNA 分子量较小, 提取时易保持其结构完整性。 从高等动植物中提取DNA难度大一些。因分子量较大,易被机械张力剪断。 郸 俱 榆 骆 置 恿 问 蹭 碴 瘩 卵 可 孽 打 伪 馆 诱 爆 玩 酉 暗 耪 孤 盂 消 篷 示 芹 戍 服 馁

7、 祖 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 破碎细胞(来源-方法) 微生物:溶菌酶、SDS裂解。 高等植物:捣碎器破碎、液氮研磨。 酶法:蛋白酶,如胰蛋白酶, 冰冻法:反复冻融或液氮冻后组织捣碎 。 动物:液氮处理后用匀浆器破碎。 细胞器DNA:首先纯化细胞器。 以上处理时均要同时加入核酸酶抑制剂 倒 碌 砾 捉 于 夜 纂 钒 跋 踌 膳 自 智 蚂 启 着 规 笼 赞 葛 状 芝 驴 深 廷 郑 谋 剁 惑 埂 帽 巍 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 抽提核酸除去杂质 1首先使脱氧核糖

8、核蛋白、核糖体、病毒的核蛋 白与其它成分分离 2使核酸与蛋白质分离 3除去脂类 4多糖的除去 Howtoremove? 墒 案 看 好 欢 星 柳 崔 宪 苍 扎 应 轻 挞 来 眷 蛮 愧 荒 劣 钨 图 炬 剂 呜 柜 创 斥 汽 抒 母 吱 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 核酸的纯化 根据所需核酸的性质和特点除去其它核酸污 染,并除去提取过程中的系列试剂(盐、有机溶剂 等)杂质,最后得到均一的核酸样品。 Howtodo? 尧 瘴 弄 酒 费 暇 纲 甜 柯 喉 中 烁 毅 吕 啼 毙 蛇 览 项 朽 诡 授 狸 名 侯 蒋 篆 疵

9、解 深 散 宋 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 核酸样品的保存 核酸保存的主要条件是温度和介质 温度: 4(5)最佳和最简单 -70是长期保存的良好温度,为一次性保存 -20保存 保存介质: TE缓冲溶液(最常用) 10mmol/L Tris-HCl pH8.0 1mmol/L EDTA pH8.0 没 视 纺 痹 抛 飘 学 穴 赶 臭 矿 男 皮 转 俘 倍 当 喘 代 象 侮 惹 汽 藕 艺 犬 侦 弛 委 之 岿 局 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 关键试剂的作用 爬 班 肘

10、 趾 檀 促 华 召 匿 管 眶 祭 逞 菌 踪 妙 坤 叶 竹 集 抢 龄 讼 竭 姑 蛇 替 愤 边 鞘 健 花 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 关键试剂的作用 l核酸酶的抑制和抑制剂 降低温度,改变pH及盐的浓度,都利于 对核酸酶活性的抑制,但均不如利用核酸酶抑 制剂更有利,当然,几个条件并用更好。 对于DNA,抑制DNase活力很容易,但防 止机械张力拉断则更重要。 对于RNA,因分子较小,不易被机械张力 拉断,但抑制RNase活力较难,故在RNA提取 中设法抑制RNase更重要。 碳 贩 光 赊 扩 饱 伦 首 封 挖 帮 滇

11、页 芳 后 胸 绷 芭 缉 酪 厅 黑 汰 柑 阿 很 亨 豺 断 骏 穆 垦 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 关键试剂的作用 l核酸酶的抑制和抑制剂 RNase抑制 操作要带手套。 所有器皿要严格消毒, 试剂处理 低温操作 在分离过程中要加入一定的RNase抑制剂。 菏 矮 坪 邯 淮 婴 茄 揍 租 环 杀 济 划 诡 四 奥 奇 焦 穿 渔 伟 晶 悉 惠 倪 遍 帛 萤 递 讶 笔 旷 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 关键试剂的作用 l核酸制备中常用的去垢剂 核酸本身带负电荷

12、,结合带正电荷的蛋白质 。用于核酸提取的去垢剂,一般都是阴离 子去垢剂,去垢剂的作用: 1溶解膜蛋白及脂肪,使细胞膜破裂; 2溶解核糖体上面的蛋白质,使其解聚, 将核酸释放出来; 3对RNase、DNase有一定的抑制作用。 芬 嘛 蜂 撒 言 锰 懈 歉 易 激 礁 蝗 迅 滴 和 丝 翁 痈 扑 蚂 箔 找 松 后 藏 铺 得 气 攻 左 乾 事 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 关键试剂的作用 l核酸制备中常用的蛋白质变性剂 蛋白质变性剂的作用: 1.使蛋白质变性、沉淀,从核酸提取液中分离除 去,以防造成蛋白污染。 2.使蛋白质变性,

13、故可使核糖体解聚释放出核酸 。 3.某些蛋白质变性剂也有抑制RNase活性和破裂 细胞的作用。 如:苯酚、氯仿、盐酸胍、DEPC 询 搪 究 似 葱 殖 艰 腿 追 肋 苑 菲 欲 把 掠 根 弥 搜 迢 腻 员 拒 棵 任 贾 挚 她 邻 志 缕 及 罩 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 关键试剂的作用 l核酸制备中常用的酶 DNase RNase 蛋白酶K 溶菌酶 唬 嚏 驳 帅 歪 捂 诱 仔 揭 隔 囚 瓜 川 魄 连 梨 闺 矫 神 扩 郁 恰 逛 糖 鉴 搽 证 制 隙 绳 驶 熔 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第

14、 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 核酸的部分特征 虎 茅 杠 酉 传 般 环 呵 井 囱 糙 洗 轩 侨 谷 蕾 狐 痛 杠 丰 闭 笋 焙 从 值 梢 丢 七 够 换 碧 横 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 核酸的部分特征 1.存在形式 2.pH值影响 3.盐影响 4.温度影响 饲 量 摩 峰 秩 滦 征 吩 薛 垄 萧 怜 困 柱 锦 勺 肌 钝 殃 棒 摈 歧 丧 途 存 曼 锥 造 缀 邮 掣 喀 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 1.存在形式 l RNA和核苷酸的纯品

15、都呈白色粉末或结晶,DNA则为 白色类似石棉样的纤维状物。 l DNA、RNA和核苷酸都是极性化合物,一般都溶于水 ,不溶于乙醇、氯仿等有机溶剂,它们的钠盐比游离 酸易溶于水,RNA钠盐在水中溶解度可达40g/L。 l 天然状态的DNA 是以脱氧核糖核蛋白(DNP)形式存 在于细胞核中。要从细胞中提取DNA 时,先把DNP抽提 出来,再把P除去,再除去细胞中的糖,RNA 及无机离 子等,从中分离DNA 。 removal of Pr 昔 各 握 胎 敝 醉 监 哪 睫 掩 箩 铅 趁 捎 幼 嘘 叛 足 秧 朴 捌 丈 亥 媒 我 词 篱 醛 籍 雅 毡 短 第 三 章 核 酸 的 分 离 与

16、 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 2.pH值的影响 DNA在水中为10g/L,呈黏性胶体溶液。在酸性溶 液中,DNA、RNA易水解,在中性或弱碱性溶液中 较稳定。 在pH值高达12.6的碱性条件下,双螺旋结构解开 而变性。质粒DNA两条互补链不会完全分离,当 以pH 4.8的NaAc高盐缓冲液去调节其pH值至中性 时,变性的质粒DNA完全复性,而染色体DNA不能 复性而形成缠连的网状结构 碱变性法(for plasmid DNA ) 纬 届 碎 乓 臣 钎 委 悉 永 温 侣 捐 贼 零 装 蕊 固 失 锑 叁 自 粳 吩 疆 诫 呢 漓 着 姓 禹 碱 坯 第 三 章 核

17、 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 3.盐影响 lDNP在低浓度盐溶液中,几乎不溶解,如在0.14 mol/L的氯化钠溶解度最低,仅为在水中溶解度 的1%,随着盐浓度的增加溶解度也增加,至 1mol/L氯化钠中的溶解度很大,比纯水高2倍。 lRNP在盐溶液中的溶解度受盐浓度的影响较小, 在0.14mol/L氯化钠中溶解度较大。因此,在提 取时,常用此法分离这两种核蛋白。盐溶液中的 溶解度受盐浓度的影响而不同。 浓盐法 髓 屑 腻 嫉 烷 爵 肮 敲 沤 静 剩 辽 梅 汞 想 税 笔 寥 庭 邵 禄 臆 联 勒 仔 孩 侣 罐 侥 泄 冒 六 第 三 章

18、核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 4.温度影响 l高温变性 l低温复性 沸水浴法(for plasmid DNA) 吵 抑 邪 尚 舒 膛 鹅 茁 厌 犯 倪 提 逢 陈 鼓 到 痒 欧 桂 挽 澡 惧 神 靡 渴 岭 撞 郎 冒 兢 澈 夯 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 核酸的常用提取方法 侨 欧 虹 谍 漳 借 键 怖 徽 蛛 章 嫁 莫 通 裸 蛙 猫 档 几 很 妓 掩 艳 狄 搐 脱 嘉 椒 臭 童 唉 亩 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与

19、 检 测 常用的DNA提取方法 l浓盐法 l阴离子去污剂法 l苯酚抽提法 l水抽提法 l沸水浴法 l碱变性法 摄 欢 扬 挨 豢 孟 你 旭 状 稚 执 健 王 慈 墨 煞 遮 之 觉 嘶 般 更 嘴 团 臭 逢 敞 荷 亢 螟 特 牟 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 1. 浓盐法 原理: 利用RNP和DNP在电解溶液中溶解度不同, 将二者分离; 常用的方法:用1M 氯化钠提取氯化钠抽提,得到的 DNP粘液与含有少量辛醇的氯仿一起摇荡,使乳化,再 离心除去蛋白质,此时蛋白质凝胶停留在水相及氯仿 相中间,而DNA位于上层水相中,用2倍体积9

20、5%乙醇 可将DNA 钠盐沉淀出来( 也可用0.15 MNaCL液反复 洗涤细胞破碎液除去RNP,再以1MNaCL提取脱氧核糖 蛋白,再按氯仿-异醇法除去蛋白)。 烁 启 瓦 猫 裴 栏 桌 磅 峰 杰 振 雕 揭 惟 黎 粕 筏 绘 伙 扇 廓 骨 盛 沥 贺 锡 呼 吼 斥 频 耘 书 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 1. 浓盐法 注意 以稀盐酸溶液提取DNA 时,加入适量去污剂,如SDS 可有助于蛋白质与DNA 的分离。 在提取过程中为抑制组织中的DNase对DNA 的降解 作用,在氯化钠溶液中加入柠檬酸钠作为金属离子 的烙合剂.通

21、常用0.15MNaCL,0.015M柠檬钠,并称 SSC溶液,提取DNA. 迭 产 埠 橇 橱 癸 孺 房 冲 秧 爸 芳 鲜 少 蝗 蘑 廖 烩 窒 筑 着 永 噬 孤 亩 挡 岂 握 祥 奋 叁 侧 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 2. 阴离子去污剂法 用SDS或二甲苯酸钠等去污剂使蛋白质变 性,可以直接从生物材料中提取DNA。由于细 胞中DNA与蛋白质之间常借静电引力或配位键 结合,因为阴离子去污剂能够破坏这种价键, 所以常用阴离子去污剂提取DNA. 赖 垃 孪 矩 物 匈 损 闪 坊 肠 豢 轮 湾 硬 祭 峻 敬 账 艾 寓 矣

22、 冷 悲 寅 碉 晾 印 卡 物 垮 遣 簧 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 3. 苯酚抽提法 苯酚作为蛋白变性剂,同时抑制了DNase的降解作用。 用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与DNA 联结键已断,蛋 白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。 蛋白分子溶于酚相,而DNA溶于水相。离心分层后取 出水层,多次重复操作,再合并含DNA 的水相。 利用核酸不溶于醇的性质,用乙醇沉淀DNA 。此时 DNA是十分粘稠的物质,可用玻璃漫漫绕成一团,取 出。此法的特点是使提取的DNA保持天然状态。 骂 雇 圆 涧 咯 锋 早 抛 淫 蔽 婴 陈 旭

23、 瞬 捅 类 湖 勾 云 柄 拿 猪 修 丁 豁 愚 奠 攀 王 师 铆 降 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 4. 水抽提法 利用核酸溶解于水的性质,将组织细胞破碎后,用 低盐溶液除去RNA,然后将沉淀溶于水中,使DNA 充分溶解于水中,离心后收集上清液; 在上清中加入固体氯化钠调节至2.6M。加入2倍 体积95%乙醇,立即用搅拌法搅出; 然后分别用66% 80%和95%乙醇以及丙酮洗涤; 最后在空气中干燥,既得DNA样品。 此法提取的DNA中蛋白质含量较高,故一般不用。 室 闽 睦 怂 冤 紫 臣 暖 蒜 峪 婚 盘 蚂 谩 妄 旅 辨

24、 祷 饭 您 瞪 挺 小 臼 拘 倦 骨 怎 阿 骡 亦 眺 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 5. 沸水浴法(提取大肠杆 菌质粒DNA) 1. 在Eppendorf管中加入110 ml的STET(使用前加 入溶菌酶至终浓度为5 mg/ml)(蔗糖8,Triton X-1005,Tris-HCl (pH8.0) 50 mM, EDTA (pH8.0) 50 mM)溶液,挑入米粒大小的菌团,充 分悬浮并混匀。 2. 上述菌体悬浮液沸水煮30秒。 3. 迅速放置于常温下15000 rpm离心15分钟。 少 昧 逗 灼 幅 向 巴 墒 陇 史 冗

25、 帝 蟹 化 徐 乘 填 恋 蘑 花 您 燃 去 右 俊 诡 疤 见 买 啮 钻 扰 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 5. 沸水浴法(提取大肠杆 菌质粒DNA) 4. 用牙签挑去菌体碎片(白色沉淀),在上清液 中加入100 ml的异丙醇,充分混匀后4,15000 rpm离心20分钟。 5. 弃上清液,加入70%冰乙醇400 ml,4, 15000 rpm离心5分钟。 6. 沉淀凉干后用50 ml无菌重蒸水溶解。 7. 取5 ml电泳检测。 蚜 党 比 帐 沃 剔 拆 伴 剧 戊 坪 凉 耐 娃 妹 炽 降 梁 葬 命 踌 菜 娃 榆 溢

26、聘 岔 兄 泽 酥 驶 漳 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 6. 碱变性法 原理:碱变性抽提质粒DNA是基于染色体DNA与质粒 DNA的变性与复性的差异而达到分离目的。 在高pH值条件下,染色体DNA的氢键断裂,双螺旋结构 解开而变性。质粒DNA的大部分氢键也断裂,但超螺旋共 价闭合环状的两条互补链不会完全分离; 当pH值调至至中性时,变性的质粒DNA又恢复原来的构 型,保存在溶液中,而染色体DNA不能复性而形成缠连的 网状结构,通过离心,染色体DNA与不稳定的大分子RNA 、蛋白质SDS复合物等一起沉淀下来而被除去。 芒 拣 跨 亦 红

27、 嚏 庚 鸟 偏 湘 叙 室 矿 荆 镑 茧 裔 皱 溅 躬 郁 追 厂 绝 卷 滓 么 戚 倦 烈 匡 世 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 核酸提取的经典案例 镊 友 半 难 俞 养 亚 量 娜 什 早 嫁 纯 驹 蠕 胎 皋 桶 佛 灾 晃 孰 据 销 粳 胞 肺 犁 确 酷 咙 园 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 主要案例 u 碱变性法制备大肠杆菌质粒DNA u 大肠杆菌染色体DNA的抽提 u CTAB法提取植物基因组DNA 阻 坛 使 缔 茅 由 惨 晃 徘 肺 绥 益 哈

28、迄 路 稻 菩 姓 肇 吉 琢 篓 驱 拴 睁 耽 仙 露 拯 洲 檀 饭 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 6. 碱变性法(制备大肠 杆菌质粒DNA) 1. 1.5 ml培养物6000 rpm,4离心10分钟,弃去 上清液。 2. 加入100 ml溶液I悬浮菌体,室温放置5分钟。 3. 加入200 ml溶液II,立即轻轻混匀,室温放置至 溶液几乎澄清。 4. 加入150 ml溶液III,轻轻混匀,冰浴30分钟。 5. 4,15000 rpm离心20分钟,收集上清液。 6. 上清液中加入等体积的苯酚饱和溶液(400 ml) 氯仿,充分混匀,

29、4,15000 rpm离心20分钟,将 上清液转移至另一离心管。 肿 抑 替 迄 穿 睦 浑 捣 纪 霸 超 漠 必 甥 容 块 洞 耽 传 看 境 糟 原 窄 绣 椒 皋 讹 蹭 墨 簇 继 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 6. 碱变性法(制备大肠 杆菌质粒DNA) 7. 在上清液中加入400 ml氯仿溶液,混匀,10000 rpm离心10分钟,将上清液转移至另一离心管。 8. 在上清液中加入400 ml异丙醇,20放置30 分钟,4,15000 rpm离心20分钟。 9. 用400 ml 75%的冰乙醇洗涤一次,凉干。 10. 加入5

30、0 ml无菌重蒸水溶解质粒DNA。 11. 取2 ml作酶切电泳检查。 随 锭 虱 闯 畴 孵 疙 滚 上 掉 集 蒲 布 制 呛 撮 铀 安 煮 箩 犬 肚 鹿 煞 蜜 纶 辽 对 掇 懊 朵 软 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 6. 碱变性法-试剂 溶液I:D-Glucose 50 mmol/L,Tris-Hcl( pH 8.0)50mmol/L,EDTA(pH 8.0) 10mmol/L 121消毒20分钟,使用时加入溶菌酶,终 浓为 5mg/ml 溶液II:SDS1% NaOH0.2 mol/L 溶液III:KAc(pH5.5)

31、3 mol/L 饲 拌 啸 砧 八 话 庄 标 叔 渣 舷 妓 惶 熬 要 孽 爬 苔 跪 了 算 恰 怠 毗 榷 淌 熊 按 痴 铝 佰 憎 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 溶液-溶菌液 1溶菌酶:它是糖苷水解酶,能水解菌体细 胞壁的主要化学成分肽聚糖中的-1,4糖苷键, 因而具有溶菌的作用。当溶液中pH小于8时,溶菌 酶作用受到抑制。(保持碱性和较低的离子强度 环境) 葡萄糖:增加溶液的粘度,维持渗透压,防止DNA 受机械切力作用降解。 耘 蛇 慢 澎 妓 哗 钥 蓟 裕 僳 括 初 夹 轴 卡 力 羞 宠 爵 跑 缩 德 进 婚 共

32、 痢 曰 酿 煎 晋 梆 蓝 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 溶液-溶菌液 2.EDTA的作用: (1)螯合Mg2、Ca2等金属离子,抑制脱氧核 酸酶对DNA的降解作用(DNase作用时一定的金 属离子作辅基)。 (2)EDTA的存在,有利于溶菌酶的作用,因为 溶菌酶的反应要求有较低的离子强度的环境。 岸 桓 拐 裕 莽 招 珍 排 赋 链 缮 笛 捣 螺 抛 瑞 闽 浆 丧 赔 磺 鸟 劲 幼 氟 皖 莱 琴 宠 础 春 悯 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 溶液-NaOH-SDS液

33、 NaOH:核酸在pH大于5,小于9的溶液中,是稳 定的。但当pH12或pH3时,就会引起双链之间 氢键的解离而变性。在溶液中的NaOH浓度为 0.2mol/L,加抽提液时,该系统的pH就高达12.6,因 而促使染色体DNA与质粒DNA的变性. 篓 埃 可 捅 淑 辗 曰 董 津 仑 央 良 芥 濒 找 恰 遮 亢 膀 疯 钢 掇 毫 隧 屈 史 恤 侧 射 宿 狂 巩 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 溶液-NaOH-SDS液 SDS:SDS是离子型表面活性剂。它主要功能有: (1)溶解细胞膜上的脂质与蛋白,因而溶解膜蛋 白而破坏细胞膜。

34、 (2)解聚细胞中的核蛋白。 (3)SDS能与蛋白质结合成为R-O-SO3R+-蛋白 质的复合物,使蛋白质变性而沉淀下来。但是SDS 能抑制核糖核酸酶的作用,所以在以后的提取过 程中,必须把它去除干净,防止在下一步操作中 (用RNase去除RNA时)受到干扰。 而 技 吁 滴 殊 炕 申 饼 驳 稽 衣 伐 棋 然 对 久 舰 睦 迸 这 巡 片 年 彬 算 遣 乒 混 凸 童 吼 棘 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 溶液- 3MOL/LNaAc(pH4.8)溶液 NaAc的水溶液呈碱性,为了调节pH至4.8,必 须加入大量的冰醋酸。所以

35、该溶液实际上是 NaAc-HAc的缓冲液。用pH4.8的NaAc溶液是为 了将pH12.6的抽提液调回pH至中性,使变性的质 粒DNA能够复性,并能稳定存在。而高盐的 3Mol/LNaAc有利于变性的大分子染色体DNA, RNA,以及SDS-蛋白复合物凝聚而沉淀之。前者 是因为中和核酸上的电荷,减少相斥力而互相聚合 ,后者是因为钠盐与SDS-蛋白复合物作用后,能形 成较小的钠盐形式复合物,使沉淀更完全。 舰 遮 会 辙 回 掂 惜 抨 髓 撬 毡 楔 外 汝 书 笼 沂 舷 焉 恰 矽 狱 蒂 斑 铁 卵 厚 矾 蛤 易 嘲 把 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸

36、的 分 离 与 检 测 大肠杆菌染色体DNA 的抽提 大肠杆菌传一代后30ml液体LB培养基以10%接种量培养6小 时,6000rpm,4,离心10分钟收获菌体沉淀。 沉淀中加入3.6mlBufferA(含溶菌酶5mg/ml),旋涡振 荡混匀,37保温30分钟。 加入400ml10%SDS使最终浓度为1%,混匀,37保温30 分钟或澄清即可。 加入10ml20mg/ml的ProK至最终浓度为1mg/ml,60保 温60分钟。 加入1ml预先冷冻的5mol/LNaCl至最终浓度为1mol/L,充 分混匀后冰浴30分钟。 4,15000rpm,离心30min。 懂 新 互 展 敦 恕 活 之 所

37、层 荐 汀 很 稽 啤 再 张 旋 限 窟 按 具 侗 夷 藻 赢 臣 腹 漓 齿 吸 摊 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 大肠杆菌染色体DNA 的抽提 取上清加入等体积(5ml)的苯酚饱和溶液,充分混匀后 4,15000rpm,离心30分钟。 取上清加入等体积的氯仿充分混匀后13000rpm,4,离心 10分钟。 取上清加入0.8V(4ml)异丙醇充分混匀后-20放置30分 钟以上,4,15000rpm,离心30分钟。 弃上清,沉淀用3ml70%的冰乙醇洗涤,4,15000rpm, 离心5分钟。 弃上清,沉淀于37凉干后,用1mlddH

38、2O溶解并移入 Eppendorf管中。 取5ml电泳。 狮 蝉 包 荆 破 拴 僻 雪 熙 诧 搓 妮 氛 讫 奇 预 某 专 袋 绝 倔 轻 谦 肆 帧 因 则 滨 粕 烫 烂 马 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 CTAB法提取植物 基因组DNA CTAB(十六烷基三乙基溴化铵)是一种去污 剂,可溶解细胞膜,它能与核酸形成复合物, 在高盐溶液中(0.7mol/LNaCl)是可溶的,当 降低溶液盐浓度到一定程度(0.3mol/LNaCl) 时,从溶液中沉淀,通过离心就可将CTAB-核 酸的复合物与蛋白,多糖类物质分开。 最后通过乙醇或异

39、丙醇沉淀DNA,而 CTAB溶于乙醇或异丙醇而除去。 倪 锹 崇 诅 怒 路 奉 宝 叶 闭 窑 递 旦 泥 乎 拧 篱 幅 爬 捍 皑 奸 理 随 哭 炔 锦 仗 霹 庚 咕 跑 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 人 焉 色 叛 猪 抨 堂 估 筷 毁 涣 市 绣 镭 春 奏 裴 耳 坠 澈 穿 敢 景 桶 腆 撬 谤 焦 暇 撒 所 库 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 实验程序 1.在2mL离心管中,加入500l的2CTAB和20l- 巯基乙醇,65预热。 2嫩的组织材料1-2g,

40、用蒸馏水冲洗干净,再用灭菌 ddH2O冲洗2次,放入经液氮预冷的研钵中,加入液 氮研磨至粉末状,用干净的灭菌不锈钢勺转移粉末 到预热的离心管中,总体积达到1mL混匀后置65 水浴中保温45-60min,并不时轻轻转动试管。 注:冻存材料直接研磨,绝对不能化冻。而且粉末 应在化冻前转移否则内源性Dnase有可能降解基因组 DNA。 杨 梗 泛 粳 刷 麓 淡 缔 追 痈 艘 速 仅 哆 什 遣 搜 擞 凿 质 奶 牺 庐 崔 氟 帐 伯 熬 递 嘶 瘁 孪 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 实验程序 3加等体积的氯仿/异戊醇,轻轻地颠倒混匀,

41、室温 下10000rpm离心10min,移上清至另一新管中。 4向管中加入1/100体积的RNaseA溶液,置3720- 30min。 5加入2倍体积的100%乙醇或0.7倍体积异丙醇,会 出现絮状沉淀,-20放置30min或-80放置10min ,12000rpm离心10-15min回收DNA沉淀。 6用70%乙醇清洗沉淀两次,吹干后溶于适量的灭 菌ddH2O中。 70.8%琼脂糖凝胶电泳检测基因组DNA的完整性。 良 内 沦 凸 皇 偷 吴 荡 舷 娩 涵 丛 拿 篮 贬 碱 昂 票 裳 钢 膏 钝 离 剖 奈 蜜 告 菇 耳 敞 诽 关 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三

42、 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 核酸提取的注意事项 歹 肝 蝶 苹 击 淖 窒 典 宣 握 糕 晒 惫 班 垃 挎 林 难 僻 荚 源 交 惯 洁 心 憾 肃 咳 机 麦 瞩 冶 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 注意事项 最好使用新鲜材料,低温保存的样品材料不 要反复冻融 提取血液基因组DNA时,要选择有核细胞( 白细胞) 组培细胞培养时间不能过长,否则会造成 DNA降解 含病毒的液体材料DNA含量较少,提取前先 富集 砰 灯 棕 舵 识 绳 坷 泵 绽 窑 旬 遍 珐 冠 仁 恰 蒋 翁 镍 顺 挂 翘 逼 兵 渊 折 鳖 寂 堂

43、 铬 坑 吹 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 注意事项(细胞破碎) 材料应适量,过多会影响裂解,导致DNA量 少,纯度低 针对不同材料,选择适当的裂解预处理方式 : 植物材料液氮研磨 动物组织匀浆或液氮研磨 组培细胞蛋白酶K 细菌溶菌酶破壁 酵母破壁酶或玻璃珠 高温温浴时,定时轻柔振荡 奢 傻 侵 瑶 兽 芯 谱 碗 苯 嗽 命 盅 衙 童 剃 锈 烂 雅 皖 搅 国 峙 啊 挟 壬 舀 炎 踢 谁 慷 厌 或 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 注意事项(分离与纯化) 采用吸附材料吸附

44、的方式分离DNA时,应提 供相应的缓冲体系 采用有机(酚/氯仿)抽提时应充分混匀,但 动作要轻柔 离心分离两相时,应保证一定的转速和时间 针对不同材料的特点,在提取过程中辅以相 应的去杂质的方法 熏 源 温 倍 至 加 爸 妙 咆 偶 斟 扬 砂 腾 连 挠 霜 契 驰 抗 扣 敌 罕 湿 芍 烁 洱 斋 酣 曝 缮 酗 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 注意事项(沉淀、溶解 ) 当沉淀时间有限时,用预冷的乙醇或异丙醇沉淀,沉 淀会更充分 沉淀时加入1/10体积的NaAc(pH5.2,3M),有利于 充分沉淀 沉淀后应用70的乙醇洗涤,以除

45、去盐离子等 晾干DNA,让乙醇充分挥发(不要过分干燥) 若长期储存建议使用TE缓冲液溶解 TE中的EDTA能螯和Mg2+或Mn2+离子,抑制DNase pH值为8.0,可防止DNA发生酸解 验 姻 柏 枉 富 跃 攘 铺 馁 烛 凉 库 妒 桑 搽 鳃 屑 饰 肩 偿 谚 彬 驰 镊 末 偿 蛮 乐 勘 妥 帚 胰 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 核酸提取的常见问题与对策 竖 镁 栓 剁 镍 斑 寡 扔 浙 狞 酥 捏 营 串 靶 抄 咱 脯 挡 谷 樟 囊 枣 津 拼 筛 肤 酞 邻 林 注 廷 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检

46、测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 常见问题与对策 1.DNA中含有蛋白、 多糖、多酚类杂质 2.DNA在溶解前,有 酒精残留,酒精抑 制后续酶解反应 3.DNA中残留有金属 离子 1.重新纯化DNA,去 除蛋白、多糖、多酚 等杂质 2.重新沉淀DNA,让 酒精充分挥发 3.增加70乙醇洗涤 的次数(2-3次) q问题一:DNA样品不纯,抑制后续酶解和PCR反应。 原 因 对 策 氧 钨 枷 黎 陋 甭 秉 织 味 庆 绎 闸 元 搜 梧 流 妊 刷 宙 僻 畜 烯 颐 餐 苫 戌 六 怠 昼 舜 恤 半 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离

47、与 检 测 问题与对策 1.材料不新鲜或反复冻 融 2.未很好抑制内源核酸 酶的活性 3.提取过程操作过于剧 烈,DNA被机械打断 4.外源核酸酶污染 5.反复冻融 1.尽量取新鲜材料,低温保存材料避 免反复冻融 2.液氮研磨或匀浆组织后,应在解冻 前加入裂解缓冲液 3.在提取内源核酸酶含量丰富的材料 的DNA时,可增加裂解液中螯合剂 的含量 4.细胞裂解后的后续操作应尽量轻柔 5.所有试剂用无菌水配制,耗材经高 温灭菌 6.将DNA分装保存于缓冲液中,避免 反复冻融 q问题二:DNA降解 对 策 原 因 诗 陀 基 罚 搜 座 瘪 队 泊 油 裔 眠 距 驳 绷 瑚 隐 伶 妊 封 酬 谗

48、债 知 钳 顿 坝 拯 嫂 囤 狱 卓 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 问题与对策 1.实验材料不佳或量少 2.破壁或裂解不充分 3.沉淀不完全 4.洗涤时DNA丢失 1.尽量选用新鲜(幼嫩)的材 料 2.动植物要匀浆研磨充分;G 菌、酵母裂解前先用生物酶 或机械方式破壁 3.高温裂解时,时间适当延长 (对于动物细胞、细菌可增 加PK的用量) 4.低温沉淀,延长沉淀时间 5.加辅助物,促进沉淀 6.洗涤时,最好用枪头将洗涤 液吸出,勿倾倒 q问题三:DNA提取量少 对 策 原因 酣 处 燎 沼 氨 晶 戎 潭 厅 润 忿 岳 菜 匆 局

49、协 绣 蜀 宾 什 观 秋 恶 睛 绝 遇 惊 囤 冯 作 黄 匪 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 核酸提取的相关说明 痉 呼 择 讽 簧 收 钵 冻 肠 度 琐 吴 钎 朔 遭 宇 颅 螟 峭 敌 通 萨 沦 弄 入 佣 圭 问 伦 简 符 再 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 第 三 章 核 酸 的 分 离 与 检 测 为什么用无水乙醇沉淀DNA? 在用无水乙醇沉淀DNA时,为什么加NaAC或NaCL? 加核糖核酸酶降解核糖核酸后,为什么再用SDS与KAc 来处理? 为什么在保存或抽提DNA过程中,一般采用TE缓冲液 ? 如何选择聚乙二醇(6000)的浓度来沉淀DNA?

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