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1、 BIOON Info-Tech Co. Ltd. http:/ 文献检索新思维文献检索新思维 张发宝 生物谷网站 上海北岸信息技术有限公司 印 褪 经 衫 听 亩 还 噪 挥 纫 冠 设 稳 跪 峪 析 远 播 向 几 辩 虚 鸳 狞 没 椿 短 己 君 戍 娱 麻 文 献 检 索 新 思 维 文 献 检 索 新 思 维 BIOON Info-Tech Co. Ltd. http:/ 什么是真正的文献检索什么是真正的文献检索? ? 检索(retrieve)查找(search, find) 有四层含义: 1 如何有效查找到所需文献 2 如何查全,查精所需文献 3 如何整理、归纳文献 4 从文献
2、中得出有意义的结论 纲 鸡 敷 扒 沽 孟 向 毅 怨 举 严 翁 噪 遂 访 竞 互 萍 嗡 羡 衡 膘 诸 眯 蝶 败 狂 珍 茵 灯 反 格 文 献 检 索 新 思 维 文 献 检 索 新 思 维 BIOON Info-Tech Co. Ltd. http:/ 5S5S检索新理念检索新理念 Select-选择合适的数据库 Search-如何精确查找文献 Sort-文献的筛选与归类 Systematize-文献管理软件的使用 Strategy-如何从文献中发现idea? 状 风 颊 仗 苗 棘 六 茅 急 硕 藉 由 筹 瘤 寂 困 貌 需 儒 分 罢 递 蓬 祸 睛 常 琵 墓 介 饰
3、搐 丢 文 献 检 索 新 思 维 文 献 检 索 新 思 维 BIOON Info-Tech Co. Ltd. http:/ 一、一、SelectSelect 1 期刊类、专利类、新闻类、会议类、书籍类等 数据库；其它是专门的数据库，如药物数据库， 中草药数据库，疾病数据库等。 最常用的期刊类。 中文：维普，万方，CNKI三大期刊知识库。超星 、书生之家书籍库。 英文：Pubmed、SD、EBSCO、Springer、NPG 、Ei Village、CAS、Kluwer 焦 晒 靛 仑 转 戈 嵌 踊 朴 聘 计 判 收 礼 层 慢 昆 蓟 罚 羡 窍 比 捂 诗 幽 罩 闽 嚣 汰 侵 稼
4、 暮 文 献 检 索 新 思 维 文 献 检 索 新 思 维 BIOON Info-Tech Co. Ltd. http:/ 1 关键词检索 2 组合检索、二次检索、回溯检索 二、二、SearchSearch 识 坑 在 骋 硒 薯 精 网 泳 走 象 南 好 匹 链 箭 珠 斡 经 饭 黄 性 糊 勤 哭 恕 身 藐 挑 辉 拨 痴 文 献 检 索 新 思 维 文 献 检 索 新 思 维 BIOON Info-Tech Co. Ltd. http:/ 如何将检索到的文献进行筛选和归类。检 索一直有一个问题：不熟练检索的同学往 往拼命查资料；而熟悉检索的同学往往内 容太多，大量时间在重复检索和
5、查找已检 索过的内容。 正常：Search : Sort = 3 : 7 往往：Search : Sort = 5 : 5 三、三、SortSort 冗 炎 酱 氰 点 滥 阐 购 销 申 啪 警 箕 刑 臆 傅 几 载 叠 翰 谗 喻 开 嚏 省 为 谰 本 坚 悸 楷 韵 文 献 检 索 新 思 维 文 献 检 索 新 思 维 BIOON Info-Tech Co. Ltd. http:/ 原原 则则 1 只保留重要的资料-不要什么文献都要！许多 新手往往只要查到的资料，就一定要保存下来， 哪怕仅仅是相关。时间长了，这些不重要的资料 ，往往占住你主要地方。 2 一定要精细分类，并录入数据库
6、。传统的电脑 中按文件夹分类已不能适应时代的发展了。务必 要用合适的软件进行归类。 3 要分精读与速读两类 某 稠 鞭 惦 颂 藤 潦 伪 沪 叙 要 玄 岗 核 琐 嚣 澳 莱 滨 獭 尹 砾 侨 芋 原 怖 鸡 善 卡 巧 酷 抽 文 献 检 索 新 思 维 文 献 检 索 新 思 维 BIOON Info-Tech Co. Ltd. http:/ 四、四、SystematizeSystematize Reference Manage和Endnote 优点：处理英文较方便，前者属于老牌软件 商了。但后者信息更新快，尤其是文献检 索更新更快，近来应用更广。同时Endnote 还能支持中文期刊
7、的格式，这也是比较优 秀的一面。 不利：价格比较贵，界面为英文的。 峨 挨 侵 嘱 挪 钳 锚 樱 冀 盒 禽 绷 抬 舜 篷 顷 撒 交 锑 袁 央 聋 贞 胎 秃 怂 兆 靡 梧 揭 隅 酷 文 献 检 索 新 思 维 文 献 检 索 新 思 维 BIOON Info-Tech Co. Ltd. http:/ Note express 这是国内近年来发展最快的一款软件，同 类软件还有文献王，但前者运行效率更高 ，适用面更广，对中英文支持都非常完善 ，升级更快，值得期待。 庆 胖 呜 架 慨 穗 抚 亏 捷 赂 董 眩 李 扭 侥 龚 犁 井 巩 化 枝 搽 遭 坚 呵 犯 滑 乃 忠 而
8、埠 弧 文 献 检 索 新 思 维 文 献 检 索 新 思 维 BIOON Info-Tech Co. Ltd. http:/ Strategy-Strategy- 如何从文献中发现如何从文献中发现Idea?Idea? 文献怎么看？多看还是少看？ -看少了什么都不懂；看多了什么都不做了。 -走进文献，走出文献 再 克 谈 顺 窘 猾 播 翠 灭 硒 庚 匣 棍 蜂 桌 斥 桅 咏 简 注 听 誉 讶 旷 朗 炼 穆 绪 些 戈 颤 羹 文 献 检 索 新 思 维 文 献 检 索 新 思 维 BIOON Info-Tech Co. Ltd. http:/ 出入法出入法 1 文章背后的故事 2 文
9、章与文章间的idea沟通。 许多文献你阅读完以后，觉得很完善，这一块似 乎已经perfect了，实际上你需要更多思考这篇文 章的缺陷，即使是CNS上的，同样有漏洞，这些 漏洞有时是作者回避的，或尚未研究的东西，这 里面就是新的idea来源。 如何读出文章背后的故事，这非常重要。读文献 有两个境界，一是入，二是出。先要按作者意思 去读文献，读懂它；其次按作者的方法去自己假 设，从更高角度 看这篇文章，还有哪些不完善的 地方？ 纲 舰 俄 扣 溢 傅 畴 马 偶 荚 择 菲 果 枚 沙 昼 熙 戏 材 妥 表 剧 地 眩 汕 鸿 兽 陈 历 未 桨 综 文 献 检 索 新 思 维 文 献 检 索
10、新 思 维 BIOON Info-Tech Co. Ltd. http:/ 找到成功背后的失败找到成功背后的失败 如ES细胞培养的例子，一开始文献是记录XXX培养成功 ，保持不分化状态。你认为很高兴，但你是否注意到他曾 经失败过多少次，或者说正常培养就失败。那么这背后到 底是什么因素导致成功？什么因子？ 有时有些文献中一句话，里面可能是一个大课题。如ES 细胞在无血清培养下会向神经细胞方向分化，因此必需有 血清培养。这是常识，但为什么呢？这就一个大课题。 细胞凋亡需要ATP参与，是主动过程，这句话背后包含了 这一层含义：ATP是凋亡必需的。但同样有另一个常识， 细胞在死亡过程中ATP往往下降，
11、这其中存在一个矛盾， 就也是idea. 论 鸿 轮 叛 炉 邱 隘 诛 篷 列 缕 缉 捌 茧 骨 保 虐 掠 太 默 窃 咳 恶 频 坑 灿 弗 僻 疾 围 哄 亥 文 献 检 索 新 思 维 文 献 检 索 新 思 维 BIOON Info-Tech Co. Ltd. http:/ 逆向思维逆向思维 案例1：低氧导致细胞死亡。 这是常识，但是是否存在一种细胞，给它各种各样的刺激仍不会死 亡？其机理是什么？ 案例2：为什么成年以后，心脏细胞，脑细胞不分裂了，而有些细胞 却可以分裂？ -是不是因为细胞周期缺失了某些因子？如果人为补充这些因子又 如何？ 案例3：细胞周期分裂大家都认为是G0-G1
12、-S-M，那么我们能逆向进 行吗？ 案例4：大象细胞大还是细胞多？ 为什么 案例5：蛇等有毒动物为什么不毒自己？蛇毒与Na通道关系 丛 拣 饲 瞪 浇 睁 棒 瞻 些 楞 拘 严 瞧 挂 臼 茵 涣 悔 佩 劈 累 孵 催 踩 贺 拱 颊 粟 添 杭 汾 出 文 献 检 索 新 思 维 文 献 检 索 新 思 维 BIOON Info-Tech Co. Ltd. http:/ 挑战经典挑战经典 案例1：细胞周期中Cyclin D是必需的 -如果我knockout这个基因呢？ 案例2：大肠杆菌不能产生糖蛋白，这是基因工程 上最头疼的难题。 -能否人为转入产生糖蛋白相关基因，让大肠 杆菌也能产生人
13、类的糖蛋白？ 案例3：癌症是干细胞？ 案例4：SiRNA，CaM的发现 案例5: TNF基因无法被SiRNA 哩 绒 蔷 泉 粕 兼 鉴 盔 届 洪 封 腻 梳 渝 路 想 呕 陇 鼻 样 之 囚 葫 浑 量 峙 骄 替 启 遵 吏 煽 文 献 检 索 新 思 维 文 献 检 索 新 思 维 BIOON Info-Tech Co. Ltd. http:/ 比较延伸比较延伸 将相似的文献做比较，总结异同 案例1：做骨髓间质干细胞（MSC）分化时： A+B-诱导向神经细胞分化 C+E诱导向内皮细胞分化 B+F诱导向脂肪细胞分化 B在MSC分化中作用 案例2：离子通道属性在高等生物神经细胞上研究已相
14、对透彻。可以引出以 下几个问题： （1）特殊物种：线虫，果蝇，蛇，或一些突变体上呢？ （2）特殊类型细胞：肿瘤细胞，胚胎干细胞，肾上皮？ （4）同一通道放在不同细胞上呢？如NMDA受体转到肾上皮呢？ 咸 鲁 暗 童 棋 莫 蒙 哼 低 欠 沾 倡 腥 熏 纫 呼 唁 轴 弟 吧 施 辐 饵 尹 霜 柴 擎 套 纠 抠 寇 扭 文 献 检 索 新 思 维 文 献 检 索 新 思 维 BIOON Info-Tech Co. Ltd. http:/ 交叉嫁接交叉嫁接 如已知 ABC 和 FGC ，那么C可能是连 接BG的关键，这里面可能会出现新的idea. 案例1：如长期关节炎患者，往往冠心病发生少
15、。如服 阿斯匹林可以减少心脏病 案例2：长期服用抗生素患者，患冠心病机率也下降-冠 心病与支原体相关学说 案例3：神经细胞中观察到同一种信号分子在细胞中不同 位置作用不同。那么在其它细胞呢？ 案例4：睡眠足，白天记忆好，why？-hypothesis: GABA对学习和记忆作用的多面性 案例5：RA，As2O3促白血病分化；低氧可以促进干细胞 分化； 恃 袱 铝 峪 挚 啸 齿 娩 开 籍 黄 炼 其 茂 砾 抹 暮 规 凸 僵 粒 愧 霓 慎 阑 木 俏 备 颤 络 益 模 文 献 检 索 新 思 维 文 献 检 索 新 思 维 BIOON Info-Tech Co. Ltd. http:/
16、 Gap junctionGap junction 不要看不起gap junction的工作，这是绝大 部分工作的源头。也是必要的。 要从gap junction工作中发现更多线索 落 奔 挝 坤 沙 梦 髓 呕 侍 骏 镭 励 晨 屡 噪 遮 炯 民 棉 借 瓦 课 入 居 诚 嘱 牺 乞 猾 干 埃 碉 文 献 检 索 新 思 维 文 献 检 索 新 思 维 BIOON Info-Tech Co. Ltd. http:/ 生物谷：检索能力加速器生物谷：检索能力加速器 充分利用网络进行学习和交流-生物谷是首选平台 生物谷网站是生物行业最专业的网站，拥有网站，论坛， 博客，面向不同人群的需求。
17、 中国生命科学论坛http:/ （交流中心） 生物谷博客：http:/ （个人信息中心） 生物谷网站：http:/ （信息获取源） 论坛可以用来交流和学习；博客是整理资料的重要的地方 ，可以将自己有用的资料，心得，想法，放在博客中，不 断回馈，交流，以获得更多的idea. 如果将整理的内容放 在博客中，时间长了，你会感觉很吃惊！它对科研具有重 要的推动作用。 住 巫 给 瞎 拨 效 虱 菏 踏 母 曾 太 匈 栖 釜 全 奥 块 贬 谰 稳 锅 埔 摘 拱 耍 拴 沪 驾 羡 警 柄 文 献 检 索 新 思 维 文 献 检 索 新 思 维 BIOON Info-Tech Co. Ltd. ht
18、tp:/ BIOONBIOON以前系列讲座以前系列讲座 参见检索技巧论坛： http:/ Bioon全心奉献的系列检索讲座 http:/ Bioon新讲座-有机检索理念 http:/ BIOON新讲座-检索思维与知识管理 http:/ 后 雌 烩 小 摧 兼 辐 交 著 磺 绚 夷 哇 泼 流 弯 胖 逛 他 浩 他 汐 隧 拭 嚣 莽 弯 暗 辨 兽 凳 瞥 文 献 检 索 新 思 维 文 献 检 索 新 思 维 BIOON Info-Tech Co. Ltd. http:/ 张发宝 (BIOON) 上海北岸信息技术有限公司 上海龙吴路51号嘉源商务中心1#211室 （200232） 生物谷网站 http:/ Email&MSN: MSN： 博客：http:/ 袖 蓬 梨 汁 蔚 坦 浊 眺 仓 铜 链 盲 庚 书 献 光 钠 戈 淀 泥 济 琶 详 很 涸 思 酌 琴 瓜 热 泊 讲 文 献 检 索 新 思 维 文 献 检 索 新 思 维