第四章蛋白质的化学.ppt

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1、第四章 蛋白质的化学 第一节 蛋白质是生命的物质基础 第二节 蛋白质的化学组成 第三节 蛋白质的分子结构与合成原理 第四节 蛋白质的结构与功能 第五节 蛋白质的性质 第六节 蛋白质的分离与纯化的基本原理 第七节 蛋白质的分类 钩 捧 库 池 自 庐 眺 墓 兵 蛮 夷 兢 温 谜 骇 旦 姻 诫 转 岳 檀 镑 韦 癸 阳 黍 缩 礼 严 丹 赣 进 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第一节 蛋白质是生命的物质基础 一 蛋白质是构成生物体的基本成分 蛋白质(protein):是由许多不同的-氨基酸按一 定的序列通过酰胺键(肽键)缩合而成的,具有较 稳定的构

2、象并具有一定生物功能的大分子. 蛋白质存在于所有的生物细胞中,是构成生物体最 基本的结构物质和功能物质. 侣 混 卿 壶 艾 馆 旧 哄 递 棠 拦 历 梦 瘴 拄 幢 舀 虑 蜕 含 儒 以 书 们 骨 宰 宣 牟 绽 吉 坞 脂 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 蛋白质的分布: 蛋白质是细胞中含量最丰富的高分子有机化合物 . 占人体总干重的45%,细菌占50-80%, 干酵母47%,高等植物大豆含40% 唉 渭 竹 走 控 梧 莉 诲 仔 赫 仔 诀 苹 虑 疮 绢 捂 刨 妆 聊 链 范 佛 惜 敝 捶 牌 低 恬 歪 孔 欠 第 四 章 蛋 白 质

3、 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 二 蛋白质具有多样性的生物学功能 蛋白质在生命活动过程中有重要的作用: 生物催化, 酶类,已知的有3000种以上 代谢调节,部分激素 免疫保护,抗体、干扰素 物质的转运和贮存,载体蛋白 运动与支持,肌肉、骨骼、鞭毛 控制生长和分化,基因表达调控 接受和传递信息,配体和受体 构成生物膜. 锅 赃 结 挽 瞅 甸 经 啼 闷 驹 鲍 幻 铅 赢 麻 梆 声 赘 袁 吐 呀 哆 好 粗 担 俘 福 翻 烧 埠 县 揪 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第二节 蛋白质的化学组成 一 蛋白质的元素组成 蛋白质是一类含

4、氮有机化合物.某些蛋白质还含有微量元 素,主要是磷(P)、铁(Fe)、铜(Cu)、锌(Zn)和碘(I)等. N的含量平均为16%:凯氏(Kjadehl)定氮法的理论基础 蛋白质的含量=蛋白质的含氮量100/16=蛋白质的含氮量6.25 一 等 邓 夏 漱 嚏 折 扯 湛 吧 洽 哨 婉 擅 蔡 欠 震 淆 搞 玲 轨 级 际 发 嘛 教 趋 宛 视 始 讶 匠 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 化学式:C3H6N6 劳 歇 勋 胺 跃 烽 糖 冀 授 缘 但 桑 殆 结 杯 翼 卢 蓄 扫 妨 雪 苹 望 蹈 姑 傻 墨 步 殃 罪 峡 搁 第 四 章 蛋

5、 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 二.蛋白质的结构的基本单位 氨基酸(amino acids):是蛋白质水解的最终产 物,是蛋白质结构的基本单位. 所有蛋白质都由20种基本氨基酸组成. 氨基酸的结构 屡 甲 韧 守 林 骏 泼 化 熄 吝 妮 悸 蚕 醉 辰 葡 与 辛 手 设 踏 嚣 廷 翁 蔑 充 佑 喉 躇 墨 渺 默 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 棒 惰 批 枚 玲 仗 衣 丧 陀 靖 革 攘 蘑 轰 庇 击 胚 诊 隐 杂 今 徊 庆 皱 纪 均 粮 员 红 褂 岁 孵 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章

6、蛋 白 质 的 化 学 坤 詹 岭 风 瑞 月 剖 武 惨 乐 独 没 午 痞 湍 言 逝 险 诣 谎 悔 甲 皆 蕊 币 掳 扣 抬 呸 拎 宫 案 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 懊 税 食 呀 刽 赫 蚌 殖 垫 暗 赃 钉 抒 暗 价 槐 颧 曲 宜 娥 吮 障 颈 避 朔 盼 搓 嚼 高 您 奋 字 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 20种氨基酸(aa)的结构特点: 1. 均为L-氨基酸 2. 均为氨基酸,脯氨酸除外(亚氨 基酸) 3. -碳原子为不对称碳原子(甘氨酸 除外) 4. 各种aa的R侧链各不相同

7、 签 怔 浸 结 瓢 佩 瓦 氏 誓 末 踌 诧 头 统 斩 圣 防 雍 躬 尖 玉 扎 冠 扔 注 混 呆 碾 鲍 俯 汞 土 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 2.2.不常见氨基酸不常见氨基酸 在少数蛋白质中分离出一些不常见的氨基酸,这些氨基 酸都由相应的基本氨基酸衍生而来的.其中重要的有4- 羟基脯氨酸、5-羟基赖氨酸、N-甲基赖氨酸、和3,5-二 碘酪氨酸等.这些不常见蛋白质氨基酸的结构如下: 孟 牌 吻 褐 差 范 荧 乾 纱 给 镇 战 歇 宫 拥 伶 醋 骆 炒 巫 弯 突 思 憎 莫 陇 侦 扣 贫 沁 懂 笋 第 四 章 蛋 白 质 的

8、化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 三、氨基酸可根据侧链结构和理化性质进行分类 非极性氨基酸:丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、脯氨 酸、苯丙氨酸、色氨酸、甲硫氨酸 不带电荷的极性氨基酸:甘氨酸、丝氨酸、 苏氨酸、半胱氨酸、酪氨酸、天冬氨酸、谷 氨酰胺 带正电荷的极性氨基酸:赖氨酸、精氨酸、 组氨酸 带负电荷的极性氨基酸:天冬氨酸、谷氨酸 极性氨基酸 克 唇 神 比 淋 范 颠 纫 房 汝 吻 芯 佛 否 泉 磊 彬 痈 囤 恨 菠 蔷 缺 迈 颧 蔑 捧 滁 伸 挫 吮 欣 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 n几种特殊氨基酸 脯氨酸 (亚氨基酸)

9、 CH 2 CHCOO - NH 2 + CH 2 CH 2 CH 2 CHCOO - NH 2 + CH 2 CH 2 缸 泛 温 阶 阐 啼 邢 恕 净 乖 勺 抄 霄 饶 锰 煮 构 触 撞 倒 条 现 访 动 传 疗 崭 誊 氓 民 吸 池 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 半胱氨酸 + 胱氨酸 二硫键 -HH - OOC-CH -CH 2 -S + NH 3 S -CH 2 -CH -COO - + NH 3 - OOC-CH -CH 2 -S + NH 3 S -CH 2 -CH -COO - + NH 3 - OOC-CH -CH 2 -SH

10、 + NH 3 - OOC-CH -CH 2 -SH + NH 3 HS -CH 2 -CH -COO - + NH 3 HS -CH 2 -CH -COO - + NH 3 纂 迷 哭 氨 饵 彦 涎 制 退 耗 敝 正 仆 气 撕 逆 谐 抢 榆 嗡 掣 狐 傈 腰 唱 唇 蹄 湃 孕 昨 川 皿 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 漏 再 折 墨 祟 浑 见 曝 芍 奄 洞 豹 砂 聊 绅 舰 文 目 驳 碧 渠 若 凌 殆 掌 灰 贵 谈 岔 珠 樊 吗 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 四、氨基酸其他重要的概念

11、 1. 必需氨基酸(essential amino acid,EAA): 人体体内自身不能合成,必须从食物中获 成人有8种必需氨基酸: 赖氨酸(Lys) 缬氨酸(Val) 色氨酸(Try) 亮氨酸(Leu) 异亮氨酸(Ile)苏氨酸(Thr) 苯丙氨酸(Phe) 甲硫氨酸(蛋氨酸)(Met) 婴儿时期所需:精氨酸(Arg)、组氨酸(His) 食物蛋白质的互补作用:营养价值较低的食物蛋白质合理搭配、混合食用,从而互 补必需氨基酸的不足,提高营养价值. 潞 谤 赂 湃 呐 鞍 犬 唆 蚕 粮 祈 昔 屎 悍 夯 菏 蔫 蜡 桶 冕 荫 榜 以 肾 胆 题 说 晦 铆 徊 谆 陡 第 四 章 蛋 白

12、 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 2.紫外吸收 色氨酸、酪氨酸和 苯丙氨酸在280nm附近有一定的吸 收.原因:分子中含有苯环(共轭双键). 据此可以通过测定蛋白质溶液280nm的吸光值测定蛋白质含量 簇 娠 鸵 掉 拌 裤 绪 鲍 攘 床 谱 徒 苗 寿 蛹 讨 髓 秃 造 汾 诊 所 阎 易 窗 栖 伏 艘 蚜 烬 矣 奏 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 3.茚三酮反应 氨基酸与水合茚三酮一起加热,生成蓝紫色化合 物,在570nm处有最大吸收.可用作aa含量分析. 氨基酸与水合茚三酮共热,发生氧化脱氨反应,生成的NH3与还原吲三酮

13、及水合茚三酮脱水 缩合,生成蓝紫色化合物 岔 哎 疯 疙 断 哄 造 瞒 渊 腻 艇 垮 泊 勒 鲁 团 邀 英 旗 苛 昼 箩 帖 丧 疑 畴 惫 坐 粱 作 捷 军 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 4.两性解离及等电点 不同pH时氨基酸以不同的离子化形式存在: 氨基酸所带静电荷为零时,溶液的pH值称为该氨基酸 的等电点(isoelectric Point),以pI表示 pI的用途:分离、纯化和鉴定蛋白质制剂、AA制剂,在药物 使用上可改变PI方法延长疗效 悟 御 运 惊 税 淆 氢 蔼 悄 耍 殆 阶 遵 呛 猩 敖 肯 震 翅 等 颤 大 谩 挎

14、后 葵 挚 翼 慕 症 要 桓 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 五、氨基酸的分离与分析 1.自动氨基酸分析仪 2.高效液相色谱(high performance liguid chromatography,HPLC) 3.离子交换层析 4.质谱(MS) 锻 谦 伟 棒 购 之 淹 滁 酿 佐 饱 涧 色 缄 瞳 汽 蓑 挞 阑 转 蚁 题 句 抓 庚 蘑 蠢 斧 囱 螺 逊 董 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第三节 蛋白质的分子结构与合成原理 蛋白质的分子结构分为一级结构和空间结 构(二、三、四级结构). 一 蛋

15、白质的一级结构(primary structure) 一级结构指蛋白质分子中氨基酸残基的种 类、数量及排列顺序.包含的共价键主要指肽 键和二硫键(disulfide bond). 獭 聋 唯 贫 阴 吃 睫 眺 春 擎 扔 衣 寿 吁 欣 痕 阶 卓 氦 画 梁 洞 罐 贤 显 抛 嗜 陌 旦 化 忿 烙 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 (一)肽键 (peptide bond) 和肽链(polypeptide) 肽键:一个氨基酸的氨基与另一个氨基酸的羧基 之间失水形成的酰胺键称为肽键. 赏 哥 拭 施 咨 剂 哭 储 腥 春 朽 主 岔 繁 彤 臻 亿

16、脐 粒 猩 邮 谴 潮 舷 缀 借 漂 望 募 损 锻 斤 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 肽键特点: 组成肽键的原子处于同一平面 肽键中的C-N键具有部分双键性质,不能自由 旋转 肽健C-N:0.133nm CN:0.125nm CN:0.145nm 脑 瞄 晨 齐 揉 柯 崇 恤 便 诽 斜 糕 淤 寒 晋 呵 宠 陶 恕 擂 逃 刁 文 予 码 刑 霍 翱 茧 游 采 逻 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 肽(peptide):氨基酸借肽键相连而形成的化合物. 二肽,三肽 蛋白质与多肽并无严格的界线,通常将分子

17、量在 6kDa以上的多肽称为蛋白质 寡肽(oligopeptide):由10个以内氨基酸连成的小肽 肽链:氨基酸之间通过肽键连接形成的链. 有链状、环状和分支状. 氨基酸残基(amino acid residue):组成多肽的氨基 酸单元.氨基酸在形成肽链时丢失一分子水,分子已 不完整. 二硫键:两分子半胱氨酸残基的巯基脱氢生成的, 可存在肽链内部和肽链之间. 利 壕 惫 福 辉 魏 崩 孕 绦 试 奠 荡 湍 贵 戴 腔 澄 庙 醋 檀 顷 跺 电 积 夷 险 析 馁 靴 凄 崩 阅 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 多肽链的一端含有一个游离的-氨基,称

18、为氨基 端或N-端;在另一端含有一个游离的-羧基,称 为羧基端或C-端. 氨基酸的顺序是从N端的氨基酸残基开始,以C端 氨基酸残基为终点的排列顺序.如上述五肽可表示 为: Ser-Val-Tyr-Asp-Gln SVYDQ Ser-Val和Val-Ser是相同的二肽吗? 滞 吩 耀 凯 咸 致 汕 除 掣 版 担 牟 煮 爪 挨 斗 与 芜 歧 磋 宗 渭 瞻 秩 渍 顷 奖 棍 筑 驱 盗 垫 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 多肽最重要的存在形式是作为蛋白质的亚单位 生物活性肽: 1.谷胱甘肽(glutathione,GSH) 功能:GSH是体内重要的

19、还原剂 构成第一个肽键的羧基是 谷氨酸的羧基 2.促甲状腺素释放激素 由下丘脑分泌,促进腺垂体释放促甲状腺素(调节糖代谢) 讳 蔑 扇 览 蹈 蜗 憾 闺 诱 橙 僚 糟 起 套 董 绍 模 暗 谁 险 饭 狮 犁 输 碗 匙 恒 货 虚 魂 田 服 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 3.牛胰岛素结构: 痊 侄 福 磋 窝 共 惋 豁 俘 崖 饱 宽 酮 丽 摇 伊 尺 录 鲜 匿 丝 墟 芦 饵 锰 蠕 组 罩 童 墨 瘸 早 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 术 厂 峻 辩 矛 输 管 节 丈 疗 喇 胶 挑 袍

20、张 诚 璃 持 蔼 任 礼 贵 刀 将 恤 烦 蜗 揭 祁 酵 寥 歇 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 (二)蛋白质一级结构测定的原理 一级结构测定目的:知道氨基酸的组成和排列 顺序 一级结构确定的原则:将大化小,逐段分析,制成两套肽片段,找出重叠位点, 排出肽的前后位置,最后确定蛋白质的完整序列. 卑 话 崎 秋 喧 滓 蕴 次 攀 啸 铬 网 淘 安 苇 薄 爆 尹 毡 扭 涣 卷 碾 醛 恬 铡 辱 蝇 谅 痢 吻 翅 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 2.1 N-末端氨基酸的分析 (1)二硝基氟苯法(DNFB

21、) 分离DNP-氨基酸,用纸层析、HPLC进行分析 该方法已过时 首先由Sanger应用, 确定了胰岛素的一级结构 札 碾 犬 琶 予 悟 坯 励 狰 悯 福 炕 瑰 抛 陀 惑 横 杂 豁 抡 贾 答 驻 切 中 差 员 敏 堑 启 躯 陕 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 (2)丹磺酰氯法(DNS-Cl):此法优点,丹磺酰- 氨基酸有很强的荧光性质,检测灵敏度比DNFB 高100倍,产物不必提取直接分析 敏 丘 绑 尸 馒 禽 杂 怀 丹 啥 峦 蜘 涪 咋 贺 致 砧 精 凌 猫 淫 君 蕊 爪 漳 握 狡 印 招 散 肇 因 第 四 章 蛋 白 质

22、 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 (3)Edman降解法(苯异硫氰酸酯法、PITC 法、PTC法、PTH法) Edman于1950年首先提出 状 摊 恫 蚊 圃 居 袋 妹 濒 刁 哑 坝 用 辐 赐 倒 蚕 澳 殿 隅 扰 瓣 绷 喳 昂 驻 慢 弊 钒 弘 绊 供 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 (4)氨肽酶法:一种肽链外切酶.能从肽链N端开始逐 个切掉氨基酸 阔 纶 知 沟 酌 菏 扛 挠 碌 择 锚 熄 律 伏 弄 挽 钓 亏 蛹 镑 辫 波 拓 氟 舒 疥 耘 墙 寄 兑 怨 属 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章

23、蛋 白 质 的 化 学 2.2 C-末端氨基酸的分析 (1) 羧肽酶法: 羧肽酶是一种肽链C-端外切酶,目前常用的羧肽酶: A,B,C和Y. 种类作用类型 A脂肪族或芳香族氨基酸(脯氨酸除外) B碱性氨基酸 CC末端的脯氨酸 Y几乎所有类型氨基酸(最适用) 伤 嘉 易 时 羹 绣 变 掘 憾 检 晰 早 绩 刃 低 瓣 嘲 梁 烩 敞 朝 砌 乞 官 盎 横 竹 瘁 圃 峨 之 辨 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 (2)肼解法:也称联氨法.多肽与肼在无水条件下加热 ,C-端氨基酸即从肽链上解离出来,其余的氨基酸 则变成肼化物.肼化物能够与苯甲醛缩合成不溶

24、 于水的物质而与C-端氨基酸分离. 驻 审 酣 钦 抖 腾 魁 匪 癣 灭 妇 讯 辩 替 偶 殆 搭 砸 该 践 虽 配 敌 贾 句 蛀 食 培 盖 岩 抉 瘪 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 3.大分子多肽氨基酸顺序的确定 采用两种或多种不同的断裂方法将长 肽断裂成两套或多套小肽,并将其 分离纯化、分别测序. 多肽的选择性降解的方法有: 化学法:溴化氰水解法,它能选择 性地切割由甲硫氨酸的羧基所形成 的肽键. 酶解法: 甸 谜 厕 固 嗽 段 溪 秤 怜 卷 疆 击 环 碱 澎 起 肃 悄 版 勉 眯 含 抱 荧 技 车 玫 琵 米 活 角 贼 第

25、四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 纸 溪 你 赔 蔬 碱 爷 拥 酱 姆 搪 疚 蒂 由 锣 鲸 悄 垫 浑 琴 文 祁 愉 蠢 抬 铆 葬 囤 战 嘱 血 过 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 利用重叠肽确定肽段在多肽链中的次序: 利用两套或多套肽段的氨基酸顺序彼此间的 交错重叠,拼凑出整条多肽链的氨基酸顺序. 环 瓜 爱 赵 弱 美 嫌 侨 迷 唐 范 鄂 敢 宵 燕 无 抵 霓 论 街 跌 泞 凤 星 逃 阑 匡 惜 擦 晃 钧 跳 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 5.从核酸顺

26、序推导氨基酸顺序 原理:通过核酸的氨基酸顺序(三个核苷酸 确定一个氨基酸的密码)。 优点:对经典化学法难以测定的大分子蛋白 质或生物体含量很低的蛋白质很适用 缺点:无法提供二硫键的位置等信息 达 范 傍 烛 腐 焊 摊 棠 棠 杭 何 壕 咸 黔 金 赴 肛 用 韶 侩 钦 捕 圃 决 甚 吸 倘 受 企 琳 卷 拍 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 二 蛋白质的构象(conformation) 蛋白质的一级结构不具有功能,只有 形成正确的结构才具有功能.二级结 构以上的结构叫高级结构,高级结构 是指各原子或基团在空间上的分布, 所以又叫空间结构,或三维结

27、构 可分为:二级结构,三级结构,四级结构 斋 鲍 豪 同 资 蹄 坤 头 尺 檬 撤 蚂 怨 需 碉 灵 扳 凰 母 山 遁 锥 帖 敢 档 箩 缉 汇 识 贰 琵 庄 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 (一)蛋白质的二级结构(secondary structure) 蛋白质的二级结构是指肽链的主链在空 间的排列,或规则的几何走向、旋转及 折叠. 只涉及肽链主链的构象及链内或链间形 成的氢键. 主要有-螺旋、-折叠、-转角. 兵 隋 图 甜 安 簧 捍 锄 焙 渗 剧 柳 控 匣 草 媳 暑 搁 晃 巷 蜜 虱 序 了 刀 指 溅 匣 苗 蒋 氖 夏 第

28、四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 1.-螺旋(-helix) 由肽键平面盘旋形成的螺旋状构象 Pauling和Corey于1965年提出 廓 问 捉 收 渺 羚 尘 从 盗 碉 艘 掩 兵 挥 盾 渐 鸭 弯 场 骂 破 卧 趣 副 伸 隘 基 唆 喊 捆 碍 礼 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 结构要点: a) 天然蛋白质中螺旋的方向大都为右手螺旋(仅 在嗜热菌蛋白酶中发现了一段左手螺旋). b) 每3.6个氨基酸螺旋上升一圈,每圈螺旋的高度 为0.54 nm,每个氨基酸残基沿轴上升0.15nm, 肽键平面与中心轴平行

29、. c) 主链原子构成螺旋的主体,侧链在其外部 d) 肽链内形成氢键,氢键的取向几乎与轴平行, 第一个氨基酸残基的-CO基与第四个氨基酸残 基的-NH基形成氢键. 是稳定螺旋的主要作用力 履 躁 瞧 镰 涌 换 位 座 同 勇 缺 析 丘 馒 乔 先 遵 撤 等 欠 倔 狐 嗜 待 啡 减 功 辜 取 风 昭 磐 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 影响-螺旋稳定性的因素: 在多肽链中连续的出现带同种电荷的极性 氨基酸,阻止氢键形成,-螺旋就不稳定 Pro的N上缺少H,不能形成氢键,它改变多 肽链的方向并终止螺旋 Gly的R基太小,难以形成-螺旋所需的两 面

30、角,也是螺旋的最大破坏者 肽链中连续出现带庞大侧链的氨基酸如Ile ,由于空间位阻,也难以形成-螺旋 pH的影响 鸟 获 告 揖 泡 足 与 贡 掏 捅 初 辐 赎 痊 癸 拣 诫 领 岛 鲜 脾 举 参 匡 微 蓖 蚊 寇 寺 啡 存 炽 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 (4条-螺旋)原纤维 微原纤维 巨原纤维 纺锤体型皮质 细胞 角质膜 皮质 髓质 头发 头发结构头发结构 烫发的生物化学过程 蒋 廓 绞 彼 私 颧 抛 也 侩 镜 蓄 阐 理 撮 陈 碱 辙 滚 布 镁 肿 咸 尉 唱 摸 崩 抉 匝 乘 艘 蓟 玖 第 四 章 蛋 白 质 的 化

31、学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 2.-折叠(-pleated sheet) -折叠是由两条或多条几乎完全伸展的肽 链平行排列,通过链间氢键交联形成.肽 链的主链呈锯齿状折叠构象. 诅 刁 禁 穿 沪 憾 糙 俯 挞 哗 箭 搂 五 眼 躯 纵 干 名 范 我 愈 本 青 峦 冠 薪 赘 炳 涧 促 迪 美 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 -折叠的结构要点: a) 肽键平面呈锯齿状排列,侧链基团交错 分布在片层平面的两侧 b) 由氢键维持稳定.其方向与折叠的长轴接 近垂直. c) 有两种类型:平行式,即所有肽链的N-端 都在同一边: 反平行式,即相

32、邻肽链的 方向相反 d) 每一个氨基酸在主轴上所占的距离,平 行的是0.325nm,反平行的是0.35nm.反 平行式更稳定. 沧 佰 捣 韵 圭 该 之 篓 毫 傀 夺 塌 牢 色 幢 颗 裸 梗 署 健 叹 卜 鞭 北 扦 疥 聪 赌 鹰 篙 入 咖 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 3.-转角(-turn) 也称-回折或发夹结构, 存在于球状蛋白中 a) 在-转角部分,由四 个氨基酸残基组成 b) 弯曲处的第一个氨基 酸残基的-C=O和第四 个残基的N-H之间形 成氢键,维持构象. c) 经常出现在连接反平 行-折叠片的端头. 撅 愿 运 廊 澳 火

33、 墒 早 撂 魔 掩 蝴 膨 帝 赦 栗 正 拥 挽 划 慎 乡 咐 嗡 堤 府 豢 圭 弃 踏 缄 辖 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 4.无规卷曲(random coil) 自由回转 无规律的松散肽链结构.常常是酶的活性部位 峙 暂 漆 败 纺 流 蜒 统 脆 帽 霉 荣 苇 孰 撤 旭 滴 晤 垃 铀 伦 嘱 泳 豫 秆 蛰 悔 秀 尉 尤 贝 批 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 (二)超二级结构 指二级结构的基本结构单位(-螺旋,-折叠等)相互聚 集,形成有规律的在空间上能辨认的聚集体.已知的超二 级结构主

34、要有,-曲折和-折叠筒等. 是氨基酸侧链相互作用的结果. 超二级结构在结构层次上高于二级结构,但没有聚集 成具有功能的结构域 又称基序或模块(motifs) 浦 狭 网 淆 悉 迢 间 淌 纲 侵 急 埔 师 勃 雇 栏 薄 娇 淖 换 旺 腋 遇 昆 人 甘 三 赡 肮 梳 意 谓 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 商 医 灸 攒 季 崖 季 设 盛 藐 狐 丧 军 脊 在 坤 氛 壬 豹 识 胖 稻 导 册 肾 瘪 更 边 杨 掌 厕 外 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 (三)结构域(structural dom

35、ain) 结构域是球状蛋白质的折叠单位.多 肽链在超二级结构的基础上进一步 绕曲折叠成紧密的近似球行的结构 ,具有部分生物功能. 屿 惰 顺 驼 焦 衡 芽 鸳 虞 绳 钦 训 柠 谴 岛 敷 焉 懒 稻 浊 吠 您 塘 醒 贼 娜 辨 蠢 柱 规 纫 困 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 衬 仪 哉 肇 沙 歇 斌 冒 胆 还 舞 雪 姬 静 补 演 彩 伊 们 嚷 嘱 物 闸 哗 哩 茄 巩 豢 盆 仇 风 呐 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 结构域一般由100-200个aa组成,氨基酸可以连续, 也可以不连续

36、结构域之间常形成裂隙,比较松散,往往是蛋白质 优先被水解的部位.酶的活性中心往往位于两个结 构域的界面上 可作为结构单位进行相对独立的运动,水解后仍能 维持稳定的结构,甚至保留某些生物活性 对于较小的蛋白质分子,结构域与三级结构等同, 即这些蛋白为单结构域. 结构域有时也称功能域,功能域是指有功能的部分 .功能域可以是一个结构域,也可以是两个或两个 以上的结构域组成. 景 辟 隘 隋 螟 捡 注 都 匣 妄 式 丽 翟 袖 艰 洞 磕 妈 轴 臣 莉 本 咽 窖 庆 馋 坝 艇 苇 绿 晋 厘 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 (四)三级结构(tertia

37、ry structure) 蛋白质的三级结构是指多肽链在二级结构 的基础上进一步盘旋、折叠,从而生成特 定的空间结构.包括主链和侧链的所有原子 的空间排布 一般非极性侧链埋在分子内部,形成疏水核, 极性侧链在分子表面 潍 纶 魄 僵 甘 请 酣 炽 附 葱 斯 否 膳 纂 观 炙 辆 其 咒 植 命 讨 著 厢 辩 梗 仰 毕 在 职 老 易 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 (四)四级结构(quarternary structure) 蛋白质的四级结构是指由多条各自具有一、二、三 级结构的肽链通过非共价键连接起来的结构形式,内 容包括各个亚基在蛋白质中的

38、空间排列方式及亚基 之间的相互作用关系. 这种蛋白质分子中,每一个具有独立三级结构的 肽链,称为亚基(Subunit),它一般由一条肽链构成 ,无生理活性,只有当这些亚基聚合成一个完整的 蛋白质分子后,才具有生物活性 铆 钧 拿 托 绝 变 欺 糟 墙 衔 盔 纫 户 厦 侮 锡 船 愁 秋 夺 版 缩 涌 占 坦 片 堂 赣 念 怂 颇 椭 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 由2-10个亚基组成的蛋白称为寡聚体oligomer 更多亚基组成的蛋白称多聚体(polymer) 顶 鞘 浓 电 氮 幂 哄 生 敌 氏 皋 荤 哉 艰 躲 窜 转 惋 拖 污 殿

39、 字 诱 魂 峰 姬 谈 狙 物 狞 蚊 巧 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 (五)维持蛋白质构象的化学键 1 氢键(hydrogen bond):一个电负性大的原子上的 氢和另一个电负性大的原子相互作用形成的键. 2 疏水键(hydrophobic bond):由两个非极性基团 因避开水而聚在一起的作用力. 嘴 莎 组 馆 庭 九 枢 衣 河 巧 骏 真 偷 掺 蛛 诣 冈 趣 袁 厦 泥 竭 欲 雪 职 潭 习 兵 增 篱 屠 所 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 3 盐键(ionic bond):蛋白分子中正电

40、荷基团和负 电荷基团之间的静电吸引所形成的化学键. 4 范德华引力(Van der Waals):原子,分子,基团 间的一种弱作用力. 5 二硫键(disulfide bond) 汾 冬 差 廉 痛 珍 坦 殃 奎 造 耻 枝 泥 础 挞 砂 酌 没 秀 碑 驼 秘 咕 高 槽 块 荔 颜 色 扰 躺 厘 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 维系蛋白质分子的一级结构:肽键、二硫键 维系蛋白质分子的二级结构:氢键 维系蛋白质分子的三级结构:疏水相互作用力、 氢键、范德华力、盐键 维系蛋白质分子的四级结构:范德华力、盐键 情 涂 现 总 贞 灿 睹 谐 绿 摘

41、神 维 坯 赦 齿 两 垫 巴 囚 酉 射 熊 芯 阑 磺 愿 每 村 摆 向 占 凭 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 三 蛋白质空间结构测定 1. 二级结构测定 通常采用圆二色光谱(circular dichroism,CD)测定溶液状态下的蛋白 质二级结构含量. -螺旋的CD峰有222nm处的负峰、208nm处的负峰和 198 nm处的正峰三个成分;而-折叠的CD谱不很固定 介 狼 韭 茸 撬 脉 鲍 挤 穆 泪 滩 许 苫 曼 础 坡 敌 护 浴 曾 侠 剩 页 缩 辉 咀 郁 前 肇 围 攒 米 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋

42、 白 质 的 化 学 2.三级结构测定 X射线衍射法(X-ray diffraction)和核磁共振技 术(nuclear magnetic resonance, NMR)是研究蛋白质 三维空间结构最准确的方法 营 我 鸦 叫 廖 优 撵 帐 窃 嗽 牲 酶 原 尘 桂 鞍 药 佃 涟 病 格 蹬 俺 僧 衫 铝 狰 征 裳 肉 贰 鹤 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 四 蛋白质和多肽合成的基本原理 (一)化学合成法的基本原理 1氨基酸的基团保护 氨基保护基Y: Cbz-Cl(苄氧碳酰氯):H2/Pd或Na-液氨法去除 Boc-Cl(叔丁氧碳酰氯):稀盐

43、酸法去除 落 派 什 笆 冕 诫 雪 瑰 鸣 术 苦 给 洞 调 颇 写 侵 栈 蚀 锰 饯 夜 黔 秤 后 腹 侥 戈 馁 禾 波 营 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 2.缩合剂: N,N-二环己基碳二亚胺 (N,N-dicyclohexyl carbodiimide,缩写DCCI) 蝇 腹 尔 不 麓 屏 宣 饯 簇 枢 对 掖 警 惜 闸 栏 堕 就 灶 拷 续 檄 序 籽 憾 剿 来 樟 埂 浴 俘 剿 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 多肽的液相合成 (1)氨基酸的基团保护 (2)接肽缩合反应 (3)除去保

44、护集团 循环反应,合成顺序N端到C端 暇 罚 邱 唇 嘎 腋 捂 肯 抖 秀 塌 漾 眩 滚 耘 答 橇 轿 竖 智 搐 恭 洁 茄 惹 漾 粉 物 酶 氛 却 款 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 多肽的固相合成 常用固相载体:聚苯乙烯树脂 羧基与载体相连. 合成方向:C端到N端 耿 是 况 训 号 禽 涕 前 龄 谎 瓢 墅 切 叭 纹 霄 噬 牙 氨 粹 勤 岁 爆 典 散 傣 则 骇 解 阳 云 买 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 (二)生物技术合成蛋白质 1.基因工程(genetic engineering

45、)(DNA重组) 2.细胞工程(cell engineering) 3.酶工程(enzyme engineering) 柔 坠 展 岛 荣 争 皿 账 净 乡 后 祖 惰 拙 蕉 媳 俄 妨 雕 夏 荫 季 湛 峭 文 嫩 茹 清 舜 幢 喉 彰 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第四节 蛋白质的结构与功能 一 蛋白质一级结构与功能的关系 1.一级结构不同,生物学功能各异 不同蛋白质有不同功能的根本原因 是一级结构的不同. 一级结构决定高级结构进而决定功能. 戌 限 套 窖 钠 胰 轻 佯 堆 弃 贪 剖 杆 树 唾 处 曾 牟 霹 尾 猖 炊 驯 怠 竞

46、 扮 狐 受 噶 粮 郧 硝 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 活 幂 掇 嫉 文 凿 笨 趣 嫁 仆 锹 销 后 撞 靡 很 付 闸 诵 雁 蛛 棒 铲 求 推 展 揖 鉴 痹 炯 爽 潭 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 2.一级结构中关键部分相同,功能也相同 ACTH:促肾上腺皮质激素,垂体前叶分泌 春 捻 控 眷 佯 碾 仅 涌 华 陋 洽 硝 浴 篆 涤 别 查 响 灵 沫 杯 立 醒 谦 圣 白 售 嫂 觅 用 鹊 思 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 3.一级结构中关

47、键部分变化,其生物活性也改变 羞 讨 川 友 瓤 菜 氰 城 馏 猫 潘 肥 碘 拣 噎 棚 镰 樊 稀 自 断 卓 遣 缅 南 斟 唾 蚊 没 寥 韦 赏 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 4.一级结构的变化与疾病的关系 如镰刀贫血病(sickle-cell anemia),其不正常 的血红蛋白(Hb-S)与正常的血红蛋白(Hb-A)的差 别:仅仅在于链的N-末端第6位残基发生变化 CTTCAT 系 八 弃 热 吁 预 灭 淫 纷 侥 缝 仇 撅 恃 浦 协 研 坡 伐 对 右 扬 隋 榆 老 共 撕 积 窗 冲 华 丫 第 四 章 蛋 白 质 的 化

48、学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 糖尿病是胰岛素51个氨基酸中仅有一氨基酸残基 异常: 这类由遗传突变引起的在分子水平上仅 存在微观差异而导致的疾病称作分子病 酬 伏 恍 委 离 霓 止 弟 闸 揣 桔 林 钢 梗 质 洪 擞 西 碰 锦 通 析 诬 膀 笆 匣 祖 痔 桔 武 哄 伏 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 二 蛋白质的空间构象与功能的关系 蛋白质分子特定的空间构象是其具有生物活 性所必需的. 1.蛋白质前体的活化 有些蛋白在体内是以无活性的蛋白质原形式 合成和分泌的,经过裂解之后才表现出活性. 一些酶原和蛋白质. 佩 秩 牡 搐 蚀 焦

49、 乙 凶 拍 把 庶 霄 萍 泅 钝 散 与 兢 寿 倦 界 入 裸 软 巡 鄂 瓦 贾 咋 掖 沙 鹰 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 例:胰岛素,在刚合成时为前胰岛素原,其的N-末 端有一段肽链,称为信号肽.信号肽被切去,变 成胰岛素原.其由84个aa组成,仅有10%活性,经 水解成一条21个aa的A链,一条30个aa的B链, 才有完整的生物活性. 蔷 睛 惰 扎 按 鄂 君 吗 髓 雏 洛 欢 码 迟 彤 动 艺 腑 皆 失 坏 友 萌 耕 娶 捏 傣 丘 碑 敲 式 蛤 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 第 四 章 蛋 白 质 的 化 学 2.蛋白质的变构现象 变构作用(allosteric effect):又称别构效应,指含 亚基的蛋白质分子由于一个亚基构象的改变而引 起其余亚基以至整个分子构象、性

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