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1、1,化学致癌研究所 预防医学教研室,环境基因组计划,蒋义国,广州医学院,2,一、背 景,人类基因组计划 结构基因组学研究 “后基因组计划” 功能基因组学研究,同一环境下，为什么不同人发病危险性有差异？ 环境因素与遗传因素是如何相互作用的？,3,二、有关概念,环境应答基因：对环境因素的作用有特定反应的基因。,环境基因组：基因组中环境应答基因的总和,4,遗传多态性：由于基因组上某个位点可由多个基因占据（即基因多态性）而引起的遗传变异。,多态性标准：人群中%（%）以上个体发生变异。,5,三、环境基因组计划的确立,1997年10月，美国国立环境卫生科学研究所提出。,6,7,8,1998年4月启动该计划
2、，头6年投入6千万美元。,环境基因组计划与人类基因组计划的关系。,多机构合作。,9,四、环境基因组计划研究的基因,DNA修复基因 信号传导基因 参与氧化过程的基因 细胞循环控制基因 介导免疫和感染反应的介质基因 外源化合物代谢及解毒基因,拟确定10类200多个已知环境疾病易感基因,激素代谢基因 细胞内药物敏感基因 介导营养因素的基因 受体基因,10,鼓励发现与鉴定未知的环境相关基因,评议,选定待研究基因,候选基因的提名,11,五、环境基因组研究的策略,再测序 （resequencing）,多态性功能分析,流行病学实践,改进预防和保护政策,对一个已知序列基因所在位点的其它等位基因进行序列分析，获
3、得多态性资料。,研究等位基因生物学意义，分析结构与功能关系。,开展基因环境相互作用对疾病发生影响的人群研究。,12,六、环境基因组计划研究的内容,DNA序列分析（6个项目） 功能分析（重点内容，62个项目+ 9） 技术研究（4个项目 + 2） 人群研究（21个项目 + 3） 生物统计学与生物信息学研究 （4个项目 + 1） 伦理、法律及社会意义研究 （2个项目 + 2） 7. 鼠比较基因组学研究（5个项目）,13,七、GeneSNPs数据库,收录在环境暴露易感性方面起作用的基因。,分为细胞分化、细胞信号、细胞结构、基因表达、体内平衡、代谢、细胞周期、DNA修复8类基因。,以卡片的形式提供基因有
4、关资料。,14,八、环境基因组研究的延伸 毒理基因组学,近2年提出“毒理基因组学”概念 毒理基因组学的目的： 以DNA微阵列鉴定已知或未知毒物的作用机理,15,毒性基因微阵列（毒理芯片）的构建 毒性基因微阵列的应用： # 化合物安全性预测 # 基因突变和基因多态性分析 # 研究混合物毒作用的交互作用 # 通过基因表达网络阐明毒作用终点和 毒作用机制,16,美国国家毒理基因组学中心（NCT） # 2000年6月建立 # 附属于美国国立环境卫生科学研究所 # 目前目标： 构建可一次快速检测多种化合物对不 同基因毒作用的DNA微阵列 鉴定个体对环境有害物易感的基因组 因素,17,九、环境基因组研究对
5、预防医学的影响,揭示基因环境相互作用的机制。 根本上改变环境化学物暴露危险度的评价方法。 帮助政府制定科学的预防政策，保护携带易感基因个体。 促使“群体预防”向“个体预防”转化。 使“基因预防”成为可能。,18,十、我国对环境基因组研究的响应,我国研究的必要性 # 基因多态性存在种族差异。 # 优势： 人口众多，有大量罕见或常见疾病的个体； 很多地区保留有相对异质性人群； 城乡地理环境和疾病发生情况相差很大； 家系成员相对集中。 # 在国际相关学科中应占一席之地,19,90年代中后期在国家自然科学基金等资助下开始启动,环境基因组计划内容开始有中文介绍 书籍 分子毒理学基础 解码生命 综述文章,20,研究生招生研究方向的体现,筹建环境基因组专门研究机构的设想,21,召开“环境基因组学与药物遗传学”国际研讨会 2001年5月，上海 主办：国家人类基因组南方研究中心 美国环境与职业健康研究所 协办：美国国立健康研究院 中国国家自然科学基金委员会 罗氏（中国）公司,22,十一、广州医学院化学致癌研究所/预防医学教研室与国际接轨的切入口,我室 所项 目,1999年国家自然科学基金（寻找环境致癌新基因）,2000年国家、2001年省自然科学基金（肿瘤基因预防）,23,谢 谢,素材和资料部分来自网络，如有帮助请下载!,