「毕赤酵母电转化方法及转化子的筛选」.docx

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1、毕赤酵母电转化方法及转化子的筛选菌体的准备:1. 挑取酵母单菌落,接种至含有5 ml YPD 培养基的50ml三角瓶中,30C、2 50 300r/min培养过夜;2. 取100-5 0 0 口(W 1:100)的培养物接种至含有 50ml新鲜培养基的200mL三角摇瓶 中,2830C、250-30 0 r/m i n 培养过夜 (约 20h),至 OD60O 达到 1.31.5;3. 将细胞培养物于4 C, 1500g离心5 mi n ,用50ml的冰预冷的无菌水将菌体沉淀重悬;4 . 按步骤3离心,用2 5ml的冰预冷的无菌水将菌体沉淀重悬5 . 按步骤3离心,用2 -5ml,1M的冰预冷

2、山梨醇溶液将菌体沉淀重悬;6 .按步骤3 离心,用1 60 d的冰预冷的1mo 1的山梨醇溶液将菌体沉淀重悬,其终体积约为240 ul;备注:可将其分装为8 0。一份的包装-70冷冻起来,2周之内使用,但会影响其转化效率。 比如常见的pPIC9K的载体转GS 115 一般先用MD平板初筛,然后长出的克隆子可以挑到不 同浓度的含 G4 1 8抗性的 YPD平板上筛选高拷贝。对正确筛选出的单菌落接YPD小瓶摇活后,转大瓶B MGY摇瓶发酵。一般对于甲醇诱导菌株,摇瓶一天左右后开始补加甲醇, 就类似BMMY的功能了。? KM71比GS 11 5生长的要慢。毕赤酵母都应该是白色菌落的? 对于LOX家族

3、蛋白的表达,可尝试在酵母培养基中加入C u 2+离子,提高表达量和蛋白活性?菌种保存:挑单克隆到YPD中培养1 8 -2 4 h ,然后取菌液以1 :1加入30%M菌甘油,-8 0 °Cul/管冻存(一般用10ug以上质粒用S alI酶切,然后直接加乙醇沉淀,7 0 %乙醇洗一遍,约20ul d dH2O重溶。转化效率一般大于 100个克隆每ugDNA。建议你不要用胶回收 kit,回收的D NA可能还有盐,导致电击时放电时间很短。乙醇沉淀主要步骤如下:1)酶切体系(8 0 ul)中2倍体积的无水乙醇加 1/1 0体积的PH5.2 NaAC,混匀?2)-20C 20 分钟沉淀? 3 )

4、1 3 2 0 0rpm, 2 0min,离心后弃上清4?) 7 5%乙酉I 3 0 0u 1轻轻洗,同上离心5 m in,弃上清5)3 7度烘箱至无乙醇气味(或是用 搔压的出风口吹出的暖风吹)。20)6?ul ddH2O重溶) 电击转化:8 . 将5 20 2的线性化DNA溶解在5-10科l TE溶液中,与80 d的上述步骤6 所得的菌体混匀,转至0.2cm冰预冷的电转化杯中;9 .将电转化杯冰浴5mi n ;10 .根据电转化仪提供的资料,参考其他文献及多次摸索,确定合适的电压、电流、电容等参数,按优化的参数,进行电击;1 1.电击完毕后,马上加入1ml 1M的冰预冷的山梨醇溶液将菌体混匀

5、,转至1.5ml的EP管中;(置于30度摇床低速培养1h,再涂板)12 .将菌体悬液涂布于 M D平板上,每2 0 0 6 00 pl涂布一块平板;13 .将平板置于30 c倒置培养,直至单个菌落出现(3-4天)。推荐:电压1.5kV ;电容2 5F电阻2 0 0 Qo电击时间为 4 10msec=P i chia酵母表达直接PCR鉴定重组子的方法1.平板上的菌落长到肉眼可见时(约12小时);2,取1ml酵母悬液4000rmp离心,pbs重悬,煮沸5 mins,放到冰上5 mins,直接就可以 用做pc r的模板了3,将除了模板之外的其它PCR反应液的组分准备好,并分装。3.用灭菌的牙签挑取菌

6、落,在PCR管中涮一下,PCR扩增,禾I用5AOX 1和3'AOX 1引物对转化子进行 PCR复筛,同时检测基因插入(如果重组质粒以 单交换的方式整合到P ich ia pas tor i s基因组,则会扩增到两条带,一条为 2.2k b (KM7 1为3 .6k b)宿主茵AOXI基因,另一条为包括目的基因和成熟肽序列和a-facto r信号肽序列的片段。)Ea ch 50皿 aliq u ot of competen t Pichia c ells with3g由nearizedp1asmidD NA wi 1 ly ield 50 co 1 on i es on selecti

7、v e medium.M u t s 表型重组酵母的诱导表达实验As a g en er a l ru 1 e whe n i n ducing exp ression,neverallowculturest o be more than 10-30% of y o ur total f laskvolume.1,挑选一单菌落,置于装有5 0ml MGY、BMG或BMGY培养基的50 0 ml摇瓶中,于28 -30 C /2 5 0- 3 00 r pm 培养至 OD600 = 2 6 (-1 6 - 1 8 h);2, 室温下1 5 0 0300 0 g离心5 m i n,收集菌体,用1 /

8、5至U 1/1 0原培养体积的 MM, BMM 或 BMMY重悬菌体(约2.55ml );3, 将步骤2 所得的菌液置于100ml的摇瓶中,用双层纱布或粗棉布封口,放置于 2 8 -30 °C/ 2 5 0 - 300 rpm的摇床上继续生长;4, 每24 h向培养基中添加1 00 %甲醇至终浓度为 0. 51.0 %;5,按时间点分别取菌液样品,取样量为1ml,置于1.5 ml EP 管中,最大转速离心 23 min ,分别收集上清和菌体, 分析目的蛋白的表达量和菌液最佳收获时间。时间点一般取:0、2 4、48、72、96 和 1 2 0 h;6 . 对分泌表达,分离样品的上清液;

9、对胞内表达,分离样品的菌体沉淀,带检测样品用液氮或干冰速冻后,于80 ° C保存备用;7 , 可以用S DS-PAG E、Western-B lo t及活性实验检测与鉴定重组蛋白的表达。Mu t +表型重组酵母的诱导表达实验1. 挑选一单菌落,置于装有25ml MG Y、BMG或BMGY培养基的2 50m l摇瓶中,于28-30 ° C/250-30 0 rpm培养至 OD6O0 = 2-6 (16-18 h);2,室温下15003 000 g离心5m i n,收集菌体,用M M、BMM或BMMY重悬菌体,使 O D600 =1. 0 左右(约 1 00200ml);3.将

10、步骤2所得的菌液置于1L的摇瓶中,用双层纱布或粗棉布封口,放置于28-30° C/250- 3 00 rpm的摇床上继续生长;4,每2 4 h向培养基中添加1 00%甲醇至终浓度为0 .51.0%;5,按时间点分别取菌液样品, 取样量为Im l,置于1. 5ml EP管中,最大转速离心23min, 分别收集上清和菌体,分析目的蛋白的表达量和菌液最佳收获时间。时间点一般取:0、6、12、24、36、48、60、72、84 和 9 6h;6 .对分泌表达,分离样品的上清液;对胞内表达,分离样品的菌体沉淀,带检测样品用液氮 或干冰速冻后,于-80° C保存备用;7 . 可以用SD

11、S-PAGE、Wester n-Blot及活性实验检测与鉴定重组蛋白的表达。BMG Y和BM MY的换液方式有 2种:1. 一种是离心换液,即在生长培养结束后,转移到灭菌大离心管中,4 0O0rpm室温离心5 分钟后,用B MMYfc下菌体,再转移到摇瓶,整个过程均用灭菌移液管操作。2)另一种是静止换液,即在生长培养结束后,将摇瓶在无菌室静止 4小时后,直接在酒精灯 旁倾倒培养液,再加入诱导培养基,此种方法的缺点有少量生长培养基残留。是离心换液或者静止换液,到底那个好,只有根据自己的实验结果来考量。如果只是从防治污染的角度来说,静止换液也好一些,因为操作毕竟少一些,速度也快。用新开启的分析纯甲

12、醇,一直放在无菌室里面,每次直接用灭菌T IP吸取加入摇瓶就可以了。也有人试过用膜过滤,结果膜都溶解了。菌体是在BMM件培养的,可以不用BMMY做对照,在6 0 0nm处测OD值,培养基和P B S 光吸收都很低,P B S更方便。麦芽浸提液培养酵母(不换液,补料),生长阶段结束后,密度可达到10-12,诱导培养结束后,密度可达到1 8左右。如果用1体积白M0,在生长阶段结束后,换液时 ,加入1/10 1/2体积白MMYS行诱导培养(即浓缩培养),细胞密度也可达到20以上。通常,真正的高密度发酵只有在发酵罐里才能实现,OD 600可达到40- 6 0及以上。摇瓶很难达到那样的密度,不过可以采取

13、浓缩培养的方式实现高密度。摇瓶不能像发酵罐那样保证通气量,但可以通过装量来暂时替代这个指标。,S Mu t +/Mu t 的筛选用Sac I,Sa 1 I or S t u I线性化插入HIS4位点的载体转化 GS15 5后,多数转化子应为 Mut+,但也有 Hi s Mut '的转化子存在(见 Invitr ogen protocol p36), Not I o r Bgl 11线性化插入 AOX I位点的载体转化 GS155后,用 MD/MM 平板可区分M ut+/Mu St 。Use the p 1 a t es c o nt a in i ng the H i s + t a

14、ans f orma n t s and scre e n f or the Mut+ and MutS ph e no type as d escrib e d below.2. U sing a st e ril e to othpick , pick one c o lony and s t reak o r patch one H i s+ tr a nsforman tin aregular patte r n on bot h an MM plate an danM D p late, m aking s ure topatcht h e MM p 1 ate firs t .3.

15、 U se a new to o thpick for eacht r a nsform ant and continueuntil1 00tr a n s form a nts have b ee n patch e d (23 p lates).4. T o different i a t eMut+ fro m MutS, make one patch forea chof the contr ols (GS11 5/His+ M u tSA 1 bumin andGS11 5 / H i s+ Mut+3 -gal) ont otheMD and M M pl a t es.5. Incu b ate t he p 1 ates at 30 for 2 days.6. After 2 days or 1 onger at 3 0C, s core t h e plates. Mut + tra n sforma n ts w ill grow well on both M D and MM pl a tes. Mut S tr a n s f o rmants will grow we ll o n M D plate s , b ut sh o w litt 1 e o r no growth o n t he MM pla t es.

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