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1、医学信息检索 Medical Information Retrieval,课程负责人：黄晓鹂,第四章 外文医学文献数据库 主讲教师：谈伟文,第一节 MEDLINE数据库 第二节 PubMed数据库 第三节 Ovid平台及系列数据库 第四节 EBSCOhost全文数据库 第五节 ScienceDirect全文数据库,第四章 外文医学文献数据库,书目数据库,全文数据库,MEDLINE International Pharmaceutical Abstracts OVID,PUBMED OVID EBSCO,OVID EBSCO,JournalsOvid EBMR Drug Information
2、Full Text,LWW BMA OUP,第四章 外文医学文献数据库,ACP Journal Club Cochrane Database of Systemic Review(CDSR) Database of Abstracts of Reviews Effectiveness (DARE) The Cochrane Central Register of Controlled Trials（CCTR） Cochrane Methodology Register Health Technology Assessment NHS Economic Evaluation Database,
3、MEDLINE with Full Text,MEDLINE International Pharmaceutical Abstracts OVID,JournalsOvid EBMR Drug Information Full Text,MEDLINE International Pharmaceutical Abstracts OVID,OVID EBSCO ScienceDirect,MEDLINE International Pharmaceutical Abstracts OVID,第一节 MEDLINE数据库,一、MEDLINE概况 二、数据的时间范围和学科范围 三、检索平台,第一
4、节 MEDLINE数据库,一、 MEDLINE概况 MEDLINE 是NLM建立的一个书目型数据库，是世界上著名的生物医学文献数据库，是查找生物医学文献的重要来源。,第一节 MEDLINE数据库,美国国立医学图书馆 NLM,MEDLINE,Medical Literature Analysis and Retrieval System 医学文献分析及检索系统 MEDLARS （1964年） MEDLARS-on-line MEDLINE （1971年）,第一节 MEDLINE数据库,收录1946年至今80多个国家地区的近5600种期刊上的文章及参考文献1900多万篇，涉及39个语种。 目前收录
5、的文献以英文文献为主，多数文献有英文摘要。,第一节 MEDLINE数据库,二、数据的时间范围和学科范围 1946 生物医学和卫生保健 生命科学、行为科学、化学、生物工程、 基础研究、临床护理、公共卫生、卫生政策等,MEDLINE数据库包括: 美国医学索引 (Index Medicus, IM) 牙科文献索引 (Index to Dental Literature) 国际护理索引 (International Nursing Index),内容构成,第一节 MEDLINE数据库,三、检索平台 光盘版 如SliverPlatter（银盘版）、 Cambridge、Dialog 等 网络版 如Pub
6、Med、OVID、EBSCO、 WOK、CSA 等,第一节 MEDLINE数据库,各版本数据相同，但处理方式、检索规则有差异，如 OVID-MEDLINE （1948-，1996-，1946-1965，加工中的数据） PUBMED （1946-，包括加工中的数据）,PubMed检索首页,Ovid-MEDLINE文档划分示例,第一节 MEDLINE数据库,默认检索规则不同 OVID版：title, original title, abstract, name of substance word, subject heading word, keyword heading word, protoc
7、ol supplementary concept, rare disease supplementary concept, unique identifier PUBMED：6个自动转换表及全部字段,第二节 PubMed数据库,一、数据库概况 二、检索方法 （一）基本检索 （二）限制检索 （三）高级检索 （四）主题词库 （五）更多资源 三、检索结果管理,第二节 PubMed数据库,一、数据库概况 美国国立医学图书馆 (NLM) National Library of Medicine 国家生物技术信息中心 (NCBI) National Center for Biotechnology Inf
8、ormation PubMed提供生物医学文献书目信息的数据库。 1997年6月在互联网上免费开放（包含MEDLINE数据库）。 数据量达2,300多万条，部分记录还可直接在网上免费获得全文。 是基于网络的生物医学信息检索系统，是Entrez的一个组成部分。,Entrez系统,PubMed网址,http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi http:/www.pubmed.gov http:/ http:/,PubMed的构成,1. MEDLINE（1946-，含OLDM
9、EDLINE转来的数据 ） 2. NLM正在加工、评审和标引的数据 3. 出版商最新提供、尚未确定MEDLINE是否收录的数据 4. OLDMEDLINE（1946-1965，尚未转入MEDLINE的数据） 5. MEDLINE不予收录的各种数据,第二节 PubMed数据库,二、检索方法 （一）基本检索 1. 自动词语匹配（Automatic Term Mapping，ATM） MeSH Translation Table Journals Translation Table Full Author Translation Table Author Index Full Investigato
10、r (Collaborator) translation table Investigator (Collaborator) index,第二节 PubMed数据库,二、检索方法 （一）基本检索 2. 词组检索 智能扩展检索 例如：输入 lung cancer “lung neoplasms“MeSH Terms OR (“lung“All Fields AND “neoplasms“All Fields) OR “lung neoplasms“All Fields OR (“lung“All Fields AND “cancer“All Fields) OR “lung cancer“All
11、 Fields,第二节 PubMed数据库,查看详细检索式（Search details）,第二节 PubMed数据库,二、检索方法 （一）基本检索 2. 词组检索 强制检索 运算符（“” ） 例如 “kidney allograft“ 执行强制检索时，系统自动关闭ATM功能；但如没有结果，系统会重新启动ATM功能,第二节 PubMed数据库,二、检索方法 （一）基本检索 3. 截词检索 （*代表0到任意个字符，不限于单词，ATM关闭） 4. 布尔逻辑检索 （AND、OR、NOT，左右，括号内优先） 5. 字段限制检索 （，例如 high blood pressureTI）,（一）基本检索举例
12、 1. 关键词或表达式检索:例 robotics and cerebrovascular accident 2. 著者姓名检索: 例 Harvey B Pollard 或 pollard hb 3. 限定字段检索： 例 pollardau 或 asthmati 4. 刊名检索: 例 American journal of hypertension 或 Am J Hypertens 或 0895-7061 5.截词检索: 例 myocardi* , cardio*,第二节 PubMed数据库,关键词或逻辑表达式检索举例,在此直接输入 关键词（单词）robotics 关键词（短语）cerebrov
13、ascular accident 或逻辑表达式robotics and cerebrovascular accident,著者检索举例,在此直接输入 Harvey B Pollard 或 pollard hb 或 pollardau,在此直接输入 American journal of hypertension 或 Am J Hypertens 或 0895-7061,期刊检索举例,截词检索举例,在此直接输入 myocardi* 或 kidney allograft* 但fetus infection* maternal 无效,第二节 PubMed数据库,二、检索方法 （二）限制检索 原Lim
14、it功能，目前已经归入“检索结果管理”部分的Filters中，用Show additional filters可以设置全部限定条件,二、检索方法 （三）高级检索（Advanced） 包括 Builder 和 History 两部分 1. 构建布尔逻辑检索表达式（Builder） 2. 检索历史（ History ） 3. 显示索引列表（ Show index list ）,第二节 PubMed数据库,第二节 PubMed数据库,二、检索方法 （三）高级检索（Advanced） 1. 构建布尔逻辑检索表达式（Builder）,asthma,第二节 PubMed数据库,二、检索方法 （三）高级检索
15、（Advanced） 2. 检索历史（History）,第二节 PubMed数据库,#4 AND #5,二、检索方法 （三）高级检索（Advanced） 3. 显示索引列表（Show Index List）,第二节 PubMed数据库,第二节 PubMed数据库,二、检索方法 （四）主题词库（MeSH Database）,Kidney failure,主题词和副主题词,主题词标记文献的主题或重点，便于查全、查准 MeSH表2013年共收主题词26,853（26 ,142）个。 副主题词对主题词进行限定，描述某个主题范 围内的某个方面，如药物副作用、疾病的诊断、治疗等。 MeSH词表目前共设副主
16、题词83个 用副主题词限定主题词，提高检索的准确性（查准率）。,第二节 PubMed数据库,加权检索 不扩展检索,第二节 PubMed数据库,二、检索方法 （五）更多资源 1. 期刊数据库,URL,第二节 PubMed数据库,二、检索方法 （五）更多资源 2. 临床咨询 Clinical Study Categories Systematic Reviews Medical Genetics,第二节 PubMed数据库,二、检索方法 （五）更多资源 3. 特定文献检索,第二节 PubMed数据库,三、检索结果管理 （一）检索结果的显示（Display Settings） （二）检索结果的分组筛
17、选（Filters） （三）检索结果的保存及其他输出方式（Send to） （四）其他辅助功能,第二节 PubMed数据库,三、检索结果管理 （一）检索结果的显示（Display Settings） 1. 显示格式 2. 每页显示数量 3. 排序,免费全文,全文链接,第二节 PubMed数据库,三、检索结果管理 （二）检索结果的分组筛选（Filters） 1. 文献类型（Article types） 2. 出版日期（Publication dates） 3. 文献可获取性（Text availability） 4. 物种（Species） 5. 显示更多筛选条件（Show additional
18、 filters）,Filters检索结果的分组筛选,第二节 PubMed数据库,三、检索结果管理 （三）检索结果的保存及其他输出方式（Send to）,Clipboard剪贴板,用于临时存储检索结果，可以多次存入 系统允许剪贴板最多容纳500条记录 停止操作8小时后剪贴板中记录将丢失 便于集中存储和打印,Find related data等其他功能,三、检索结果管理 （四）其他辅助功能 Results by year PMC Images search for cardio* Titles with your search terms free full-text articles in P
19、ubMed Central Find related data Search details Recent activity,My NCBI,My NCBI,练习题,1. 在Ovid MEDLINE(R) In-Process & Other Non-Indexed Citations中能否用主题词检索？为什么？ 2. 用PubMed检索“低蛋白饮食（low-protein diet或low-protein diets）治疗慢性肾衰（chronic kidney failure或chronic renal failure ）”的相关文献。 3. 利用PubMed的MeSH Database分别检索low-protein diet和chronic kidney failure的主题词。 4. 利用PubMed的Journal Database检索一种（自己任选）外文期刊，查看它的出版单位、URL等信息。 5. 用PubMed 的Clinical Queries检索甲肝（hepatitis A）的治疗有关文献。 6. 用本章所学的全文数据库分别检索白介素-1（Interleukin-1）与银屑病（PSORIASIS）发病机制的相关性方面的文献全文，选择1篇下载，并查看其参考文献的数量。,河北联合大学 医学信息检索教研室 2013年9月,