文献查询与利用3.ppt

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1、第三章 文献的查询与利用 (literature review),教学要求,1.掌握文献的基本概念,文献类型,文献检索的概念。 2.熟悉文献检索的工具类型,明确文献检索的方法,途径和步骤, 3.了解常用检索工具 4.能够应用工具进行文献查询,查阅文献的目的,了解研究现状,避免重复,减少盲目性 启发思路,借鉴方法。 获得立题和撰写论文的理论依据 增强信息意识、接受检索文献技巧的训 练、掌握文献检索技能,用于科研工作去。,第一节 文献的基础知识,一、基本概念 1、信息 是对客观世界中各种事物的变化和特征的反应;是客观事物之间相互作用和联系的表征;是客观事物经过感知或认识后的再现。 在人类社会中,信

2、息是以语言、文字、符号、图形、声波、光波、电磁波等形式传递,以纸张、胶片、磁带、光盘等作为纪录知识的载体来表示。信息是不同于物质和能量的一种特殊资源。,一、基本概念,2、知识 知识是人类对客观事物的认识、实践经验的总结。 知识是一种特定的人类信息,它是对信息进行提炼和深化的结果。知识经过不断提高和深化,形成较为完整的科学知识体系。,一、基本概念, “知识”有两部分:一是自己所知道和 掌握的,另一部分是懂得到哪里去找到它。 后一部分知识就是如何查找文献的问题。 据调查,科研人员在完成一项科研工 作中用于查找文献(书刊、资料)的时间占 30%-50%,文献源中70%来自期刊。,一、基本概念,3、文

3、献:记录有知识的一切载体 文献具有知识、载体、信息符号和记录方式四个要素。 综上所述,信息知识情报,文献是信息、知识、情报的主要载体形式。人类社会利用文献或文献进行交流,其实质是利用和交流文献中的信息、知识和情报。 信息、物质、能源-世界三大资源,二、文献的类型,(一)按文献载体类型划分 印刷型文献 缩微型文献 视听型文献 机读型文献,二、文献的类型,(二)按文献出版形式划分 1、图书 2、期刊 3、报纸 4、特种文献 :专利文献、会议文献、科技报告、政府出版物、学位论文、技术档案,二、文献的类型,(三)文献级别划分 零次文献 未经发表或进入社会交流、未经系统加工整理的最原始的文献。 一次文献

4、 公开发表的原始论著、期刊上刊登的论文、学位论文、研究报告、专利说明书等 二次文献 将大量无序的一次文献进行收集整理,著录其特征,并按一定的顺序加以编排,供读者检索所形成的文献 三次文献 利用二次文献广泛收集一次文献,经分析、综合、整理而成的文献。,三、文献检索的概念,文献检索是把文献信息按照一定的方式编制起来,并根据检索者的需求,从存贮的文献资料中查找出有关文献的过程。,文献源,存贮(Storage),查找(Search),检索工具,四、文献检索工具的类型,目录:对图书或单独成册的出版物外表特征的著录。 包括分类目录、书名目录、著者目录、主题目录 题录:对独立的文章为单位,对文献的外部特征进

5、行著录 索引: 将书刊资料所刊登的文章的题目、作者、出处及所论及的主题,按一定的原则和方法编排而成。 文摘:在索引的基础上对原始文献用简明、扼要、准确的文字所作的摘录,让读者了解文献的基本内容。分指示性摘要和报道性摘要,五、文献检索的方法、途径和步骤,(一)检索的方法 1、常用法:利用各种检索工具来查找文献。它又分为顺查法、倒查法和抽查法。 2、追溯法:通过已知文献后附有的参考文献中提供的线索来查找文献。 3、分段法:(循环法或交替法)是将常用法和追溯法交替使用的一种综合文献检索方法。 4、浏览法: 是从本专业期刊或其它类型的原始文献中直接查阅文献资料。,(二)检索途径,文献特征 1、外表特征

6、:如文献类型、文献名称、著者名称、语言文字等; 2、内部特征:如学科属性、学科分类、主题内容、结构与符号等。,(二)检索途径,根据文献的外部特征的检索途径 书名途径、著者途径、序号途径 根据文献的内容特征的检索途径 分类途径;主题词途径;关键词途径 ;分类主题途径,(三)检索步骤,分析检索课题,明确检索目的 选择检索工具,确定检索方法 选择检索途径,确定检索标识 查找文献线索 获取原始文献,第二节 医学文献检索工具及数据库,常用的检索工具,手工:中文科技资料目录、国外科技资料目录、中国医学文摘、国外医学、美国医学索引 计算机:CBM MEDLINE 收索引擎:www.nlm.nih.gov

7、专业网站: 电子期刊:万方数据: ,PubMed http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/,PubMed检索系统讲授内容,概况 数据库结构 检索方法 结果显示格式设置,PubMed(Public Medine)是美国国立医字图书馆(NLM)下属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的生物医学文献网络数据库。至今收录了1950年以来世界80多个国家和地区出版的5470余种生物医学核心期刊的文献题录和文摘,累计文献量达1700多万篇。 PubMed数据库的服务功能全面而强大,包括了Medline、PreMedline以及最新版医学主题词词表(MeSH)等

8、检索服务。 PebMed为全球的医学工作者特别是临床医生获取医学信息资源提供了极大的方便。,一、概况 1、收录范围,(1)更新速度快,报道文献量大 (2)检索功能强大,方式灵活多样 (3)检索结果提供丰富的资源链接,2、PubMed的主要特点:,二、 PubMed数据库的常见重要字段 AB 文摘 AD 第一著者的单位和地址(包括E-mail) AU 著者 LA 文献语种 MH 医学主题词 PT 出版类型 SO 文献来源,包括刊名、出版年、卷期页码 TA 刊名缩写 TI 篇名 TT 非英语语种的原文篇名或译音篇名,三、检索途径和检索方法 主要提供基本检索、辅助检索和专题文献检索等方式,基本检索区

9、,辅助检索区,专题检索区,1、基本检索 PubMed具自动词语匹配功能,使检索变得简单而又智能:即在检索框输入任何具有实质意义的检索词(不包括带双引号词、采用字段限定的词),PubMed会自动地按一定的词表顺序对检索词进行核对和转换,再进行检索。 当检索词带有双引号、字段标识或截词符时,PubMed将屏蔽自动词语匹配功能,对检索词直接进行检索。 字段限定形式是在检索词后用方括号“ ”附加字段标识符。如Liu Hau PubMed支持布尔逻辑运算,包括:AND、OR、NOT,运算符必须大写。,PubMed检索表达式的一般格式为: 检索词字段标识 布尔逻辑运算符 检索词字段标识。 如lung ne

10、oplasms mh AND 2007dp NOT reviewpt。,(1)关键词检索 在检索框中直接输入检索词,如需限定检索字段则附上限定字段。 例: 输入heart abnormalities AND genetics,系统经自动词语匹配转换后采用的检索式是: (“congenital heart defects“Text Word OR “heart defects, congenital“MeSH Terms OR heart abnormalitiesText Word) AND (“genetics“Subheading OR “genetics“MeSH Terms OR ge

11、neticsText Word) Text Word:在TI、AB、MeSH、PS、SH等字段检索,(2)著者检索 姓在前用全称,名在后用缩写。 比如检索李伟(Li Wei)发表的文献时,检索式应为Li W,但此时的检索结果同时包含Li WH,Li WY等,为进行精确检索,应用双引号将检索词括起来,如“Li W“。如果仅仅采用姓氏检索,一定要附加著者字段的标识符au,比如:Liau。,(3)期刊检索 检索词可用刊名全称、缩写或ISSN号等,The Journal of surgical research。 如果期刊名词语全是具有实质意义的词,则检索应在检索词后加上刊名字段标识符,如Cancer

12、 Research ta,2、辅助检索区,Limits 系统显示多限定条件供用户选择。 Preview/Index 在显示条目之前,显示所查到的文献数,并可修改检索策略。 History 显示检索序号、检索策略、检索时间和结果数。 Clipboard 临时存放检索结果。 Details 查看PubMed的检索策略。,2、辅助检索 (1)Limits(限定检索) 点击Limits,进入限定检索。系统显示多种条件供选择,包括著者限定、期刊限定、是否附有文摘或链接全文或免费链接全文、时间范围、记录进入PubMed的日期、研究对象、性别、语种、子集、文献类型 、年龄、检索字段等。 PubMed通过此功

13、能来实现限制检出文献量,提高文献查准率。,(2)Preview/Index(预检索和索引浏览) 在显示文献题录前,显示检索策略和检索结果的数量。 可修改检索策略:提供二次检索检索功能。 从索引词表中浏览并选择词条,完善检索策略:在“Preview/Index ”页面下方的提问框内输入检索词,点击Index,系统显示相应的索引词表,然后可进一步选词进行二次检索。,可通过在此输入检索词,点击Prieview或Index来进行二次检索,检索策略和检索数量,(3)History(检索史),主要用于查看检索式序号、检索词、检索时间和检索结果的数量。 要查看检索到的记录,点击检索结果的数量即可。 可直接组

14、合检索序号进行逻辑组配检索,查看检索策略和检索结果,并可用检索式序号进行逻辑组配检索,(4)Clipboard(粘贴板) 供暂时存放选定的记录,以便于集中保存、打印或订购原文时使用。 要在Clipboard中存储记录,首先要在检索结果中对选定的记录作标记,然后在“Send to”下拉菜单中选“Clipboard”,再点击“Send to”即可。,(5)Details(详细检索式) 主要用于查看PubMed的检索策略,即词汇自动转换结果。 使用Details键还可对检索策略进行修改:点击Query Translation框中的检索策略,将其修改后点击Search,检索词被PubMed转换的详细情

15、况,可对此检索式进行修改,然后点击Search实施检索,3、专题文献检索 (1)MeSH数据库(MeSH Database) 具有检索功能的MeSH词表。通过该功能可以选择规范化的主题词组配相关联的副主题词、查看词义注释、浏览树状结构等。 例:维生素C治疗哮喘的研究,检索词输入框,输入的检索词若不是正式主题词,系统将提供同义或近义的MeSH词供选择,MeSH的定义和历史注释,主题词的词义详解,1、选择组配的副主题,3、点击此将选定的主题词检索式提交到PubMed检索界面,2、选择加权或扩展检索,主题词的树状结构表,1,2,3,4,(2)临床查询(Clinical Queries) 是一个为临床

16、医生和临床试验工作者设置的服务功能,常用此功能作循证医学检索。该功能提供三个栏目供检索选择:Search by Clinical Study Category(可对临床疾病的病因、诊断、治疗、预后和临床预测指南进行查询)、Find Systematic Reviews(可对系统评价等进行查询)、Medical Genetics Searches(可对医学遗传学方面文献进行查询),四、PubMed检索结果的输出 1、格式 Summary:著者、篇名、出处、语种、文献类型、PMID、记录状态 Brief:著者、篇名、PMID Abstract:Summary+摘要、著者单位及地址、人名主题 Abs

17、tractPlus:Abstract+Related Links的篇名和简单出处 Citation:Abstract+MeSH、化学名称等 Medline:全部字段 LinkOut:Full Text Sources及馆藏的链接,方便读者快速了解是否有免费原始文献链接等情况 Related Articles:相关文献 2、显示,格式的选择,没有摘要,(绿色)可链向出版商提供的免费全文,有摘要,(橘绿色)可链向PubMed中心获得免费全文,3、保存、打印、Email “Send to”提供了多种保存方式及打印、Email服务 (1)Text:屏幕按文本格式显示当前屏幕的记录,然后通过浏览器中的保

18、存功能进行保存 (2)File:直接将所有检出记录或选定记录按文本格式进行保存,每次最多能保存10000条记录。 (3)Clipboard: 将所有检出记录或选定记录添加到临时粘贴板中。适用于将不同检索式的检索结果集中保存在同一个文件中。 (4)Printer:打印当前屏幕的记录。 (5)E-mail:将检索结果发送到指定的电子邮箱。,第三节 网络检索工具,一、概述 1、网络信息资源的定义 主要是指以电子数据的形式将文字、图像、声音、动画等多种形式的信息存放在光磁等非印刷纸质的载体中,并通过网络通信,计算机或终端等方式再现出来的信息资源,也可以理解为通过计算机网络可以利用的各种信息资源的总和。

19、 2、网络信息资源的特点 信息量大,传播广泛、信息层次多,品种多样、自由发布,交流直接、信息传播速度快,变化频繁、检索方便,实用性强、内容庞杂,良莠不齐,二、网络医药信息检索的一般方法 1、利用搜索引擎获取 2、从政府部门、科研机构、学会组织网站中获取 3、从医药院校网页中获取 4、从医院网页中获取 5、从医药企业网页中获取 6、从医药专业网站中获取,1、利用搜索引擎获取 搜索引擎是一种在因特网上查找信息的工具。用户提出检索要求,搜索引擎代替用户在数据库中进行检索并将检索的结果反馈给用户。 优点:范围广、更新快,能及时向用户提供新增信息、检索方便、直接等 缺点:检索结果准确性差、有较多重复、虚

20、假信息、不同的搜索引擎检索界面、检索策略的构造和输入方式不同等。 适合于检索特定的信息及较为专、深、具体或类属不明确的课题。 代表:Google、百度 、天网,(1)搜索引擎的使用以Google为例,检索提问输入框,检索按钮,信息对象选择,A、基本搜索 Google查询简洁方便,仅需输入查询内容并点击“Google搜索”按钮即可得到相关资料。 Google搜索采用关键词精确搜索,对查询要求“一字不差”。例如:对“药学院”的搜索和“药科大学”的搜索,会出现不同的结果。因此在搜索时,应尽可能使用不同的表达词(同义词、近意词)。 “手气不错”按钮:自动将您带到Google推荐的网页。,B、逻辑运算

21、逻辑“与”: 在检索键词之间空一空格即表示逻辑与 逻辑“或” :用大写“OR”表示。OR前必须有空格。 逻辑“非”:用“-”表示,“-”号前必须有空格。,C、缩小搜索范围 当查询得到过多结果时,为得到最实用的资料,需要进行缩检。 (1)输入更多的关键词加以限制检出内容,关键词之间用空格隔开即表示逻辑“与”操作。 例:核磁共振诊断脊柱裂, (2)用“-”表示逻辑差,可以精简搜索结果 例:搜索包含“肝硬化”和“治疗”但不含“肝炎”、“乙肝”和“丙肝”的中文网页 通过去掉不相关信息,结果减少2/3,D、忽略字符和强迫搜索 Google对一些网路上出现频率极高的英文单词,如“i”、“com”、“www

22、”等,以及一些符号如*.等,作忽略处理。 例:搜索关于www起源的一些历史资料。 搜索:www的历史 internet 结果: “www”和“的” 因为使用过于频繁,搜索引擎将其省略,于是上述搜索只搜索了“历史”和“internet”。这显然不符合要求。,如果要对忽略的关键字进行强制搜索,则需要在该关键字前加上明文的“+”号。 搜索:+www +的历史 interne 另一个强制搜索的方法是把上述的关键字用英文双引号引起来。 搜索:“www的历史” interne 这一搜索事实上把“www的历史”作为完整的一个关键字。 另外,大部分常用英文符号(如问号,句号,逗号等)无法成为搜索关键字,强制也

23、不行。,E、特殊功能 ()使用网络元素 例1:对搜索的网站进行限制,“site”表示搜索结果局限于某个具体网站或者网站频道,如:搜索中国教育科研网站()上所有包含“金庸”的页面。检索提问为: 金庸 site: 例2:将检索词限制在某个内容,如 intile:肝硬化,()查询某一类文件 在关键词后面加 “filetype:文档类型(如DOC、XLS、PPT、PDF)”表示限制检出结果的文档类型。 例1:查找文献信息检索的有关课件 检索式:文献信息检索 filetype: ppt 例2:查找有关计划生育的PDF文档PDF (学术论文的格式一般为PDF ) 检索式:计划生育 filetype:pdf

24、 例3:查找有关计划生育管理条例的word文档 检索式: 计划生育 管理条例 filetype:doc,F、高级搜索:按照提示在相应的检索输入框中,输入检索提问。,(2)医学搜索引擎 健康网搜索引擎(http:/ ) 健康网搜索引擎是面向广大网友的健康资讯检索系统,提供“全文检索”,“标题检索”,两种检索方式,通过主题词(关键词)匹配查询所需信息。并且提供分类途径检索。,HealthAtoZ (http:/ ) HealthAtoZ 是一个功能强大的Internet医学信息资源搜寻器。它能对与医学有关的信息进行准确、有效地搜寻。它所收集的信息均经过医学专业人员的人工编排,以保证搜寻的准确性及方

25、便性。所收集的内容每周均进行更新。可按分类及关键词的方式进行检索。,其他医学专业搜索引擎 37医学网医网导航检索(http:/ ) 提供医药卫生、疾病防治、保健养生等网站分类导航,并按按学科进行分类。 导医搜索 (http:/ 全球医疗网址大全,专业的医学健康搜索门户,全面的医学健康新闻。 搜狐医疗查询(http:/ ) 查询疾病、症状、医 院、专家、化验、药物,其他医学专业搜索引擎(外文) Medical Matrix(http:/www.medmatrix.org/) Medical Matrix的使用方法与其它Internet信息检索工具的使用方法基本相同,有分类检索和关键词检索两种检索

26、方式。它的特点是提供免费Mailing Lists,只要订阅了它的Mailing Lists,即可定期收到网上新增医学节点的通知。 Medical world Search(http:/ CliniWeb International(http:/www.ohsu.edu/cliniweb/) HONcode(http:/www.hon.ch/HONcode/index_t.html) MedSite ( http:/),搜索引擎并不是万能的 搜索引擎从抓取网页、解析、索引到提供检索有一定的周期,找最新内容应该去看网站新闻,另外,搜索引擎对动态内容,如:论坛和数据库内容的网页检索能力较弱,所以这

27、类信息也不适合用搜索引擎搜索,而是应该去相关的网站寻找。,2、从政府部门、科研机构、学会组织网站中获取 国家卫生部 http:/ 国家食品药品监督管理局 http:/ 国家食品药品监督管理局药品认证管理中心(CCD) http:/ 国家食品药品监督管理局药品审评中心 http:/ 中华医学会http:/ 中国医学科学院http:/ 世界卫生组织 http:/www.who.int/ 美国食品药品监督管理局 http:/www.fda.gov,3、从医药院校网页中获取 4、从医院网页中获取 5、从医药企业网页中获取,6、从医药专业网站中获取 中国医药信息网 http:/ 药学之窗 http:/

28、中国中医药网 http:/ 中国医药网 http:/ 中国金药网 http:/ 中国医药卫生大联网 http:/,四、网络信息检索技巧 1、选择合适的网络检索工具 (1)一般性的浏览查询或强调获取较为综合、准确的信息时,应使用目录型检索工具,如Yahoo!; (2)细节查询或强调获取较为具体、特定的信息时,应使用如百度之类的索引式搜索引擎; (3)区分学术性检索工具和商业性检索工具,如WWW Virtual Library 与 Yahoo!,2、加快检索速度 (1)直接进入相关站点; 平日的积累、收藏夹和书签的利用、参阅网址大全等工具书 (2)利用特殊型网络检索工具和一些特色服务站点,如对新闻

29、、天气、交通、地图等信息的查询; (3)阅读检索工具的使用说明或帮助文件; (4)多窗口浏览、检索; (5)文本方式传输。,3、提高检索的精度、准确性 (1)选择合适的检索词,尽量使用专指词、特定概念或非常用词,避免普通词、泛指概念; (2)构造恰当的检索提问,学会利用检索工具所规定的AND、OR、NOT等逻辑符、引号等检索符号; (3)使用限定条件、限定词,充分利用检索界面上提供的限制条件,如语种、时间、类型、数量等; (4)利用进阶、精练检索功能,“Refine”或“二次检索”。,4、扩大检索范围 (1)使用同义词、近义词;如:乙肝 OR 乙型肝炎 (2)使用多个搜索引擎或者元搜索引擎,如

30、 metacrawler、万纬搜索等; (3)利用某些搜索引擎的自动扩检功能,如 “More like this”、“相关网页(搜索)”,5、缩小检索范围: (1)用“+”可以精简搜索结果(或者空格) 如想找有关白云药业公司的内容,用:白云药业 +公司或者:白云药业 公司 (2)用“-”可以精简搜索结果 如你想搜索有关“肝炎”的文献,但却并不想找乙型肝炎有关的内容时,用:肝炎 -乙型肝炎,6、其他 (1)打不开网页用网页快照。 (2)不一定都使用搜索引擎 如查找江泽民在十五大上做的报告,首选网站应该是人民日报网站 如要为购买手机而搜索信息,则到行业网站,中国手机网(任一品牌网站都不会有其他品牌的信息),复习题,1. 检索工具的类型与特点; 2. 检索工具的结构组成及其作用; 3. 检索方法的种类及其特点; 4. 检索途经的种类及其特点; 5. 索取原始文献的途经。,第四节 科技查新咨询 (自学),

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