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跨膜区分析(TMHMM),2,跨膜区分析(TMHMM),蛋白质含有跨膜区,提示它可能作为膜受体起作用,也可能是定位在膜上的膜蛋白的膜锚定蛋白或离子通道蛋白。 跨膜区常见的分析软件有TMHMM.TMPERD.TMP。TMHMM是一个基于马尔可夫模型预测跨膜螺旋的程序,它综合了跨膜区疏水性、电荷偏倚、螺旋长度和膜蛋白拓扑学限制等性质,可对跨膜区及膜内外区进行整体预测。由于其在区分可溶性蛋白和膜蛋白方面尤为见长,故常用于判定一个蛋白是否为膜蛋白。 http:/www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM-2.0/,SIB,步骤一: 打开在线工具,http:/www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM-2.0/,步骤二:提交序列,步骤三:参数设置,参数介绍: Extensive, with graphics(图形化显示) Extensive, no graphics (不以图形化显示) One line per protein(每个蛋白遵行显示),步骤四:显示结果,结果解读,结果显示: P8蛋白的1-405位氨基酸位于细胞膜表面,406-426位氨基酸之间形成一个典型的跨膜螺旋区。,结果显示: 与该蛋白的疏水性区域分析结果基本一致,表明P8蛋白可能是一个与细胞信号传导有关的膜受体蛋白。,