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2、EBI,基因组数据库检索的几个问题中国医科大学,4,如何找到一个感兴趣的基因及相关信息？ 一旦基因在图谱上被定位，又如何方便地找到同一区域的其它基因？,问题一,基因组数据库检索的几个问题中国医科大学,5,美国国立生物技术信息中心 (NCBI) 的Entrez Gene NCBI主页网址为http:/,UCSC(University of California,Santa Cruz)基因组浏览器 UCSC主页网址为http:/genome.ucsc.edu/,基因组数据库检索的几个问题中国医科大学,6,利用NCBI的Entrez Gene,输入基因名称,基因组数据库检索的几个问题中国医科大学,7
3、,基因组数据库检索的几个问题中国医科大学,8,基因组数据库检索的几个问题中国医科大学,9,基因组数据库检索的几个问题中国医科大学,10,基因组数据库检索的几个问题中国医科大学,11,基因组数据库检索的几个问题中国医科大学,12,基因组数据库检索的几个问题中国医科大学,13,基因组数据库检索的几个问题中国医科大学,14,染色体,STS,数据库编号,蛋白、疾病、基因,基因组数据库检索的几个问题中国医科大学,15,基因组数据库检索的几个问题中国医科大学,16,基因组数据库检索的几个问题中国医科大学,17,基因组数据库检索的几个问题中国医科大学,18,基因组数据库检索的几个问题中国医科大学,19,基因
4、组数据库检索的几个问题中国医科大学,20,基因组数据库检索的几个问题中国医科大学,21,如何找到一个基因的序列？此序列除了含有所有已注释的外显子和内含子外，还有用于引物设计的一些碱基？,问题二,基因组数据库检索的几个问题中国医科大学,22,基因组数据库检索的几个问题中国医科大学,23,第一外显子,SNP,基因组数据库检索的几个问题中国医科大学,24,基因组数据库检索的几个问题中国医科大学,25,基因组数据库检索的几个问题中国医科大学,26,基因组数据库检索的几个问题中国医科大学,27,Ensembl EMBL EBI（European Molecular Biology Laboratory和
5、European Bioinformatics Institute）以及the Sanger Institute共同支持。包含各种真核生物基因组信息。 http:/,基因组数据库检索的几个问题中国医科大学,28,基因组数据库检索的几个问题中国医科大学,29,基因组数据库检索的几个问题中国医科大学,30,外显子信息,基因组数据库检索的几个问题中国医科大学,31,NCBI、UCSC及Ensembl有时对同一基因使用不同的符号，但是数据基本一致。这3个站点之间可以自由地穿梭。,基因组数据库检索的几个问题中国医科大学,32,基因组数据库检索的几个问题中国医科大学,33,问题三,已知一段mRNA序列，怎
6、样在人类基因组图谱中找到对应的DNA片段？ 一旦它的位置确定，如何找到选择性剪接位点位置？,基因组数据库检索的几个问题中国医科大学,34,mRNA登录号,BG334944,获得序列,NCBI,确定位置,UCSC,一段序列,GGCCTAAGTCGCCGCAGAACTGCCACGTGGGGATGAGATTTGCTGGGCTGGTAGCGGCGGCTGCTGCGGG GTCCCGCCCACGTGAAGCCAGCCTAACTGAGCTCTGGACTT.,基因组数据库检索的几个问题中国医科大学,35,基因组数据库检索的几个问题中国医科大学,36,基因组数据库检索的几个问题中国医科大学,37,基因组数据库
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