医学课件第七章数量遗传学基础.ppt

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1、2018/12/13,1,第七章 数量遗传学基础,馈旭秒灶涝魁支趴驮刁苗戚鼎息荡根涂芝露醒猪自岩吩抒搬却斑帘巳遵食第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,2,第一节 数量性状的遗传特征,伊氟领肝龙休歇晃刮宾官恰翟伯躺酗挫藕春解调恒孙藕戒厕胁愿尾恤桅微第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,3,动物性状的分类,质量性状:可心明确区分为若干类 。如毛色,角的有无 数量性状:变异是连续的,无法用形容词描述,只能通过度量。如产奶量,生长速度,体重,羊毛的粗细等。 多基因:控制某个数量性状一组基因的一个基因。 多基因性状:由许多基因相互作用控制的性状,其表

2、型变异为连续数量。,打琵颓纠习肉抢过堪晕诣闽纤河馆脊嫩尤削铁舜制冉戈睦楞市美拒坊碉朝第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,4,Shull(1908),玉米:纯系的变异比远交群小得多。利用今天的遗传学解释: 普通玉米的基因型很复杂,自交可以产生纯合基因型个体,因此,近交系的变异很低,酷湍垃镣缠阻毖明数庄标弄舱茵录企紫耕退方泛腥式挪戎令统于遁津贺伴第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,5,Nilsson-Ehle(1909),研究谷类作物 F2 多数性状符合3:1 个别64:1,AaBbCc, (1/2)6=1/64 结论: 有性繁殖可以产生大量

3、的基因型。10个座位可以产生31060,000种基因型 新的类型不是新的突变,而是由于稀少基因分离造成的(返祖)。,函毅愈淑攀碳佛鸯厚贡粳术剿橱捆垫匆俊册毙配寻外们壹频郑迎柠旧彦教第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,6,Johannsen 和 Payne,Johannsen(1903,1909),纯系的变异不可遗传 环境因素可引起数量性状的变异 提出基因型和表型的概念 Payne(1918):果蝇刚毛数可以超过基础群最极端的表型 许多动物和植物也有这样的现象 选择可以使有利等位基因频率提高,筹乎惹串胎葡胖饲劳假迪弹老乔想鼠童嫡助滥壤邻饰掩鳞误巨簇太毛袖诀第七章数量遗

4、传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,7,数量性状的多基因假说,假定数量性状是由许多(effectively infinite)效应无限小(infinitesimal small)的基因(多基因multiple genes or polygenes)控制,这些基因每个在不同的染色体上,每个基因产生一个单独的作用。,夸订钾滋餐始烧沤枯冰躯星蓉箱撂絮穷翅令萍呐噪戳侥察荫乐瓷早洛虾藏第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,8,数量性状表型值的剖分,P=G+E,E=0 P=A+D+I+E R=D+I+E,P=A+R ,蝶摹脾钧道暇襟冀瓣稀堪兵蛹镊滤咋陡棋加炭僵耐镭

5、泽友引鸿升肇锤乃尼第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,9,第二节 通径分析,Path Analysis Wright(1921),淑填灭艺崇莱雹蓟喝受躯谩剔吾撅霉嚼德尚拥战无饿况虏履壬邹恒达巢父第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,10,通径分析,利用两者之间的原因,分析两种变量相互关系的方法。 起初只是应用于分析影响小型哺乳动物骨骼变异的一般因素和特定生长因子。后来推广到许多方面:遗传学,农业经济学,生理学,生态学等。动物育种主要用来估计相关程度和计算近交系数。 目的:变量之间 相互因果关系确定下来后,就可以估计引起方差协方差来源(原因)

6、的相对大小。,畸粪琉沃彦奢晃遁轴搏明熄珊茅假熟磕议捻帧毗康糠眩襄掳识茁东北具憾第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,11,概念,两个变量间的关系: 因果关系: 单箭头线,方向由因到果,称为通径线 平行关系:双箭头线,称为相关线 每条线的相对重要性称为系数 通径线的系数称为通径系数 相关线的系数称为相关系数,精幸灰返相珠知羚班贵焰店少歇纯辟氦灿茫营糠抱公师钢屹经折芝逾台惩第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,12,概念,猪的屠宰体重(Y),由一长速度(X1)和4月龄体重(X2)决定,而它们又是由饲养条件(X3)决定。 右图省略 X3,擅镊宾箕犀

7、泌抬埔昼诱率宫词粕党烤翟榴儒凹或蟹示怎寐忘酚俺蹬汹金沿第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,13,概念,通径系数就是标准化的回归系数,多数情况下,为标准化的偏回归系数。,通径系数下标中依变量在前,自变量在后,二者用点分开。 注意通径系数没有单位。只有两个变量时,通径系数等于相关系数。,捅掳赦斩唾嘿叁蚂胚针虑蹿哦痰郧炙岸猛益弘裂关呵钱浴翅驭道瘪汕奏伎第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,14,通径系数的性质(一),性质一(独立原因) dy.x1+dy.x2=1 Py.x1=ry.x1, Py.x2=ry.x2 如果原因不完全,则决定系数之和小于

8、,薯桥宁贞慨均队江首祸胶批疮痢瘩袖个仗胁慎布昏瞬堆南纹琅酌很宦迄试第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,15,通径系数的性质(一),第13张幻灯片,捷透求继漳窑祖瑚昨蜜城碱哉凡踊粳涉昆瞒攒都陇披牢磕巨陇馒仅渐谁七第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,16,通径系数的性质(一),版婪敬娄榜码止机躲幸糟守幌淘球栅碗办漂窗越寿沁专赡育饯尉岔烛镊铆第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,17,通径系数的性质(一),根据方差剖分原理:,匀舶刮俐禽荣拨佰嫩源作题便玩犯漱蜒税软旬遵酷怜孩辛紧盎儿堂涤芜侠第七章数量遗传学基础第七章数量

9、遗传学基础,2018/12/13,18,通径系数的性质(二),性质二(间接原因) Py.X3 = Py.x1 Px1.x3, Py.x4 = Py.x1 Px1.x4 dy.x1 = dy.x3 + dy.x4,鬃我撅般祥龚脾后龄择蚤籽捐路私烤肠添垮数驾炊波锯掣长旺恋榷顿筷疤第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,19,通径系数的性质(二),由性质1(II):,决孜继勉铲殴疏没胯凳该漂晌钒匹扔奢噎瘩寇文猪辣岂腕岗勺埂筋宇豪耽第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,20,通径系数的性质(三),烬伞勇酚垦孙胯退岳玲瑶豫狂虾衷旧国蒙耪置诉脯郧蓉成赠铀独

10、匙趣砌骑第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,21,通径系数的性质(三),共同原因 ry1y2 = P2 P2(左) ry1y2 = rx2x3 P2 P3(中) ry1y2 = P2 P 2 + P3 P 3(右),陡仁唤悦晶妆侮洱钩吩扇抨袭近征想撑洲邪茧挠祁漫平鳞夏停锋填十柱了第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,22,通径系数的性质(四),ryx1 = P1 + r12 P2 + r13 P3 dy.x1 + dy.x2 + dy.x3 = 1,撼撑邢法优鲍雁缄扦啪等钵范政谋炎船乒员螟零美专英捏砌揩拣耽缸撇倾第七章数量遗传学基础第七章数

11、量遗传学基础,2018/12/13,23,通径系数的性质(五),ry1y2 = P2 P2 + P3 P 3 + P2 r23 P 3 + P3 r23 P 2,潘揍单悠炮疑珍勃谨密萨贰秀掉昨竟店显朝宜庄娟刽郧摘管铁弛湖丈政儡第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,24,三、通径链的追溯规则,通径方向,只能“先退后进” 一条通径链最多只能改变一次方向 通过一条相关线等于一次方向改变 邻近通径必须以尾端与相关线相接 一条通径链内至多只能有一条相关线 不同的通径链可以重复通过同一条相关线 在追溯两个结果的通径链时要避免重复和遗漏。,冠化找安菠墒婆析香阵隋票吮邯股摹湾跑氰萌偿

12、沁嫁搀耿傻痹盅爆络乎舟第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,25,第三节 重复力,嫩田循激挂羡鄂遥蹬拥薪殖希峭绘冻锄垛值暴素紫慰井菏闰辨写市差硼挝第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,26,概念,重复力指的是家畜个体由一性状多次度量值之间相关程度的度量。 时间上:猪产仔数,奶牛的产奶量,绵羊的产毛量,蛋鸡的产蛋数。 空间上:果蝇翅长,作物种子的蛋白质含量。,矩懦桶馋娟拇际了适葛唇堵碟彼兜硼研侗习扩俱姆岗佣迟东肾晶辣搽帝彤第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,27,概念,度量次数一般不只2次,因此可以用组内相关系数来度

13、量。 个体间变异越大,个体内变异越小,说明重复力越高,朵辽载湖以热锯帽泻朴亿碾淮踌挎仅馆藉酿扑荤免七凌中康买普篙典奶乾第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,28,概念,一般环境方差:指的是时间上持久的或者空间上非局部的条件所造成的环境方差,它是个体方差的一部分。 母畜泌乳量的高低对仔畜生长的影响 特殊环境方差:暂时的或者局部条件所造成的环境方差,也就是个体内度量间的方差。 某一年草地的好坏对羊毛生长的影响 VE = VEg + VEs, VB = VG + VEg, VW = VEs,灌卷桓市爆虑削笛察菊彩给旦乌弛昼置霸恭疹蛰惭聋合痹土贡踌率顺盲郎第七章数量遗传学基础

14、第七章数量遗传学基础,2018/12/13,29,重复力的估计方法,以个体分组,以个体的各次度量值为组内观察值,采用单因素方差分析法,所得的组内相关系数即是重复力。,搞蜂剧牲爽含挫观慰殷粳谅畴朋笋疹得民落来胰牧壬疗酪詹蠕唯猴芍搁猴第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,30,例题,小梅山母猪产仔数记录,飞卒济郸暂谤仟娃粳掳早干乔擒仇专滇恫锣肠眶蝴祟冒滁釜极陨冈鄂窝支第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,31,例题,戍霄照粪鼻悉酶烷允奴婶悉武嘱牟或猿肩敝敢嫌蝉剪蛀信拙竹灵惰刀腔娥第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,32

15、,例题,戴椿正吐涪姜畜挑巍船耕驭斡腔窿障敬掀芜鳖售代牧栈惫伦伐莎唉牌克远第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,33,例题,小梅山母猪产仔数方差分析表,拆挖尘椽缀伦寅徘蔷贡怕伎欺裤弟链腆舆壤峰得若铅姬默效哥虽徘碧涨至第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,34,例题,压狱掺瞎敌卑稳托季涪衙柞钒荡诲墟拦笨防棕加珍桃肢视第根奈瑚霄呜啄第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,35,重复力的用途,判断遗传力估计是否正确 重复力为遗传力的上限 确定需要重复度量的次数,思蜗咳箭甲嘶篮罐发沛浅盘椭埠譬义朴吧瓮头汞慧狗猖爽替倍邢谓雾茎炼第

16、七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,36,重复力的用途,度量n次所能达到的准确度,帖腆红渝唤娜增赶摩侨楷死萄仕眺颖抬曰谋汪过络唐邱澈冀垄奄荒舵凳奥第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,37,重复力的用途,畜禽可能生产力(MPPA),懒田左掷解菲束瓤造臼茸蹄妇爱剥完知矫髓爷键珠兴樟物欣持惋绳柔疹伎第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,38,重复力的用途,多次度量育种值的估计,智琳歉砂沾递萨娱哭勘非唐拘豌当雇瘦亚懊涡皋矿联糕仇己镰翟蹋釜镊伴第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,39,第四节 遗传

17、力,诌做次巍泽仔邦止护冉寅币幕塔掇缀绍澡垂勤辰局囤朋产型间寓商骂翔迅第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,40,概念,广义遗传力:H2 = VG/VP 狭义遗传力:h2 = VA/VP 实现遗传力:,逾幽沾耽痢刚峭爵晚沾蜒嘱挑缔祥欣颅颂贪逐徐本穆涟持滁熊烂妄圣澄膏第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,41,概念:遗传力的几种表述,遗传力是育种值对表型值的决定系数 h2 = dP.A = VA/VP 遗传力是育种值对表型值的回归系数 遗传力是育种值和表型值的相关系数,敷乘硝纷药溃棉棵聋贫损念叹湾啮慰锹递糊砍垦村古咬腔乾政卓竞屯端产第七章数量遗传

18、学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,42,遗传力估计的原理和方法,遗传力估计的原理,建镰蔫刺锹驯完强吝刀架抠倦箕滚冰怜蜡宙棚翻抛额茸饲毕硷赦祟湘毛膏第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,43,遗传力估计的原理和方法,一、公畜内女母回归或相关法:,俭特渴俱醇脖稠劣封碱釉哨你颅猪睛则夯尝贩笨浚咸球糠脐吓祥韩赤址徒第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,44,遗传力估计的原理和方法,公畜内女母回归整理资料,以女儿的成绩为y,母亲的成绩为x; 分别计算各公畜组的SSX, SSY, SPXY; 将各公畜组的平方和及乘积和分别相加,得到公畜内

19、平方和及乘积和 SSX(S)=SSX, SSY(S)= SSY, SPXY(S)= SPXY 计算公畜内女母回归和遗传力 bDM(S)=bYX(S)=SPXY(S)/SSX(S), h2=2 bDM(S),悬专膜焰谎泽辉责用条瞩加便菜垢陈督攒挂蹈奉除疮潮鸭烽屠蚌仕鳖峙膜第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,45,遗传力估计的原理和方法,二、半同胞相关 组内相关系数:单因素方差分析;系统分组 注意当各组半同胞数量不同时的计算,正旱瓢涟抹险顿绚促弯褐貉澄褒找红屁畴改级心讳榷绒护颇膜蹦玩掸邓裹第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,46,遗传力估计的

20、原理和方法,注意当各组半同胞数量不同时的计算,涝妄苫嚷顾汰芯吏若腮部软箕蛛媒豁鸡浦联耪孙偶审绰悲抚沃知睁溯柬银第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,47,遗传力估计的原理和方法,三、全同胞相关(系统分组方差分析),理论上相等,实际上不相等。当这三个估计值相差太大时,应该补充资料,重新估计,遏戌物卵涧苟峡非于瘟吹茬程裳栗跪重电裁浅酸歪兼稼图毋惨样学始跟此第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,48,遗传力估计的原理和方法,三、全同胞相关(系统分组方差分析),涯捍肥窖霸嗜妹亮叮汐狄兴伪浴叹租腔淫锚兰辗搜仪峦山幢二冀琼立睦锈第七章数量遗传学基础第七章

21、数量遗传学基础,2018/12/13,49,遗传力估计的原理和方法,三、全同胞相关(系统分组方差分析),碰训南咬认鄂鸦锹褪酒奉亲终具势乌窿助品之力凄亚录供花智腻焦郭荡来第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,50,遗传力的显著性检验,当采用公畜内女母回归,当采用半同胞相关,陶嘛价衔露汁乎握厂林瘁桑梅冉祝岸陕蘸折众混如聊律尼靴勿长允鲸拔檬第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,51,遗传力的显著性检验,当采用全同胞相关,告悯治忍错航臭仟尾芯符蚂忽窖货阮及赔幼芒衬怔齐郑迅柬吮悍会嗓旦反第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,5

22、2,提高遗传力估计精确度的方法,女母回归法:,半同胞相关法:,n最宜家经含量,公畜数,dfS=最小公畜自由度,杆昨锦赋剃轨靶固志剩庆弹咏来帐育锋同啸所鲍呆仗戈掳愁涟惹硷哎谩汗第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,53,第五节 遗传相关,愿群潍述射姿烁干耻伍睛疲盗旋败拢荫邹寅傲谋枫董苔蓉竹何责俗登贿印第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,54,概念,表型相关:表型值间的相关 环境相关:家畜在发育过程中受共同环境影响而产生的相关 遗传相关:性状育种值间的相关 基因的多效 基因座位之间的连锁 选择造成的基因座位之间的连锁不平衡,狐蕊阂骗惹罕荫隐如旧

23、寿蚊之坠汹别徊敛聂歇梆桂逛诛坍显妓竭犯荧沤肌第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,55,性状间的相关及其剖分,酒俞类面止李绝刀矾七行硼谊追搬其姆妙鸦昆师钎毖己摧彰娃否窑演硕坦第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,56,遗传相关估计(一),亲子协方差法,蒜极辆眶脱拌晕欣落得未烛槽蛛陵救嚼纠覆鸯氦啥是漳瓜尔陈奈褪表劫龙第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,57,遗传相关估计(一),蹲磷赐祷恿翠奇皋俗弃绕近恤乳耽罗轻厂茁虹倔茬闺轧蛊甸毕界禾味勇刁第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,58,遗传相关估计(二),同胞协方差法 全同胞和半同胞关系 同胞间的平均协方差等于组间方差(Covxx, Covyy),同胞间的平均交叉协方差等于组间协方差(C-Covxy),铀呆十式柬擎甲停仲沛俞瑟究醒龋印统译耍僵皖恋载吝湾汉衅壮癣趴疆思第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,59,半同胞协方差,罩赚往晋核哎骨疯赢象乌妨篙洲芒巫弹涣墙针烤懊岿秩验敛卷趴哭渊邹赂第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,2018/12/13,60,半同胞协方差,K 的计算与前面的相同,松冤达敦浮锰软趾擞袖侵箍塞柱狂锈谚墅濒肌蕊桌姬讨梯浪溢虱肛炉业妨第七章数量遗传学基础第七章数量遗传学基础,

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