CRISPR说明书.docx

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1、CRISPR说明书用于CRISPR基因组编辑的一体式载体系统使用GeneArt? CRISPR核酸载体试剂盒进 行转染、富集、筛选并发表研究成果。GeneArt?规律成簇的间隔短回文重复(CRISPR)核 酸系统是简单、即用的多功能表达载体系统,同时包含用于快速、高效克隆靶向特异性crRNA的Cas9 核酸表达框架和gRNA框架。此系统允许您以序列特异性方式,从单个质粒编辑和设计您所选 的遗传位点。通过GeneArt? CRISPR鉴定相关靶标后,可采用GeneArt? Precision TAL 验证生物相关突变,以降低潜在的脱靶儿率。现以两种形式供应:1.内置即用型试剂 盒2.定制三组分的

2、CRISPR编辑基因组编辑采用人工核酸结合源性修复机制来改变细胞内的DNA。CRISPR/Cas系统充 分利用了短gRNA的优势来靶向细菌Cas9核酸内切酶、定位遗传位点。由于gRNA能够提 供特异性,更改靶标时,仅需要更改gRNA序列编码的设计。基因编辑中所用的CRISPR/Cas系统包含三种组分:Cas核酸Cas9 (双链DNA核酸内 切酶)、一种靶向补充物crRNA以及一种辅助反式激活因子crRNA (图1)。GeneArt? CRISPR核酸教体的crRNA和tracrRNA都以gRNA的方式一同表达,其中gRNA则在细菌系 统中模仿天然的crRNA-tracrRNA嵌合体。所有需要做

3、的工作就是引入一个编辑所需的序 列的双链寡核甘酸,以表达契合体的crRNA部分。图1. CRISPR/Cas9靶向的双链断裂。双链上均出现断裂,发生在靶向序列3端NGG 前间区序列邻近基序(PAM)序列的3碱基对上游。GeneArt? CRISPR核酸载体试剂盒GeneArt? CRISPR核酸教体试剂盒是用于表达哺乳动物细胞内CRISPR/Cas基因组编辑 所需功能组分的报告基因载体系统。这一系列试剂盒现提供有不同的报告基因:带有OFP (橙色荧光蛋白)的GeneArt? CRISPR核酸载体,支持Cas9和CRISPR RNA表达细胞群的 流式细胞术分选(FACS)(图2A):带有CD4的

4、GeneArt? CRISPR核酸载体,支持微珠法 Cas9和CRISPR RNA表达细胞群富集(图2B)。线性化GeneArt? CRISPR核酸载体可提供快速、高效的双链寡核甘酸克隆方法,可将 编辑crRNA (代表所需的靶标)的双链寡核酸克隆进可对Cas9进行序列特异性靶向的表达 框架中。图2. GeneArt? CRISPR核酸酶载体图谱。使用预线性化的教体(带有5个碱基对突 出末端),轻松克隆编码靶点特异性crRNA的双链DNA寡核仃酸。图谱为带有(A) OFP报 告基因和(B) CD4报告基因的载体。gRNA、Cas9和报告基因均通过相同我体表达。Cas9 通过核定位信号靶向细胞核

5、(NLS1和NLS2) o采用一组GeneArt?基因组剪切检测试验测定基因修饰效率切割效率可采用GeneArt?基因组切割检测试验进行检测,这一技术采用错配检测内切 酶方法来检测胞内NHEJ修复期间因合并插入和/或切除而产生的插入或缺失。图3. CRISPR/Cas9介导的切割效率。采用GeneArt?基因组切割检测试验(计划于 2021年1月发布)研究HPRT位点时的凝胶图像。(A)采用表达HPRT特异性CRISPR RNA 的GeneArt? CRISPR核酸0FP毂体获得的结果。(B)采用表达HPRT特异性CRISPR RNA的 GeneArt? CRISPR核酸CD4教体获得的结果。

6、在转染进HeLa细胞后,进行三联切割试验, 并计算插入或缺失的百分比。富集表达Cas9和gRNA的细胞群由于Cas9基因与OFP或CD4连接,使用GeneArt? CRISPR核酸多功能我体系统时的 使用效率可采用荧光显微镜或FACS (如为含有OFP的质粒),或采用抗CD4荧光抗体(如 为CD4质粒)进行监测。图7.表达Cas9和gRNA的细胞群的富集。(A)使用靶向RelA位点的GeneArt?CRISPR核酸OFP载体编码的crRNA时,在293T细胞中的沾染效率。数据显示,感染的样 本中含有超过90%的OFP阳性细胞。(B) GeneArt? CRISPR核酸CD4载体的CD4功能。293 FT细胞转染了 AAVS1特异性的GeneArt? CRISPR核酸CD4教体。采集细胞并采用抗CD4 FITC抗体染色,之后采用流式细胞仪进行分析以测定转染效率。一部分染色的细胞还被接 种到一个平板上,以便采用荧光显微镜进行分析。感谢您的阅读,祝您生活愉快。

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