原核诱导表达汇总.pdf

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1、1 原核诱导表达的标准操作程序(SOP) 一目的: 使本实验室工作人员了解诱导表达的操作过程,并能实际动手进行原核诱导表达一系 列实验。 二适用范围: 本 SOP 适用于对新基因克隆的表达,并针对新基因产生的可溶性蛋白。 三实验原理: E.coli的乳糖操纵子含Z、 Y 及 A 三个结构基因,分别编码半乳糖苷酶、透酶和 乙酰基转移酶,此外还有一个操纵序列O、一个启动序列P 及一个调节基因I。I 基因 编码一种阻遏蛋白,后者与O 序列结合,使操纵子受阻遏而处于关闭状态。在启动序 列 P 上游还有一个代谢物基因激活蛋白(CAP )结合位点。由P 序列、 O 序列和CAP 结合位点共同构成lac 操

2、纵子的调控区,三个酶的编码基因即由同一调控区调节,实 现基因产物的协调表达。在没有乳糖存在时,lac 操纵子处于阻遏状态。此时,I 序 列在PI 启动序列操纵下表达的Lac 阻遏蛋白与O 序列结合,阻碍RNA聚合酶与P 序列结合,抑制转录起动。当有乳糖存在时,lac 操纵子即可被诱导。在这个操纵子 体系中,真正的诱导剂并非乳糖本身。乳糖进入细胞,经b半乳糖苷酶催化,转变 为半乳糖。后者作为一种诱导剂分子结合阻遏蛋白,使蛋白构象变化,导致阻遏蛋白 与 O 序列解离、发生转录。异丙基硫代半乳糖苷(IPTG )是一种作用极强的诱导剂, 不被细菌代谢而十分稳定,因此被实验室广泛应用。 四、试剂准备:

3、(一)实验器材的灭菌: 枪头的灭菌: 1mL , 200 L, 20 L 的枪头放入枪头盒,用报纸包住(2 层),放入高压灭菌锅 中灭菌,121, 20min 。 80烘箱中烘干,常温放置。 螺口管及离心管的灭菌: 将螺口管和离心管分别放入铝制饭盒中(盖子要拧松,离心管的管盖打开),放 入高压灭菌锅中灭菌,121, 20min 。80烘箱中烘干,常温放置。 50mL 离心管的灭菌: 将 50mL离心管用报纸包住(2 层) ,放入高压灭菌锅中灭菌,121, 20min 。 80烘箱中烘干,常温放置。 (二) LB 培养基的配制 液体 LB 培养基(1L ) :蛋白胨10g 氯化钠10g 酵母提取

4、物5g 调 PH 值到7.5,高压灭菌,4保 存。 固体 LB 培养基(1L ) :蛋白胨10g 2 氯化钠10g 酵母提取物5g 琼脂粉15g 高压灭菌,不烫手的情况下加入抗性,抗性:培养基=1:1000(氨苄,卡那通常 浓度),混匀。马上在无菌操作台中倒平板,并开大风吹干。用封口膜封住,倒置放 于 4保存。 (三) 1M IPTG的配制: 经过计算,10g IPTG可以配42ml 的 1M IPTG 。买来的粉末状的IPTG 一般全部 配成 1M IPTG 。 1、无菌操作台紫外线照射,后通风。 2、用少量去离子水将IPTG 溶解完全,并定容。 3、在无菌操作台中,用 0.22 m 的滤器

5、将配好的IPTG 滤入灭菌后的1.5ml 离心管 中,过滤除菌,-20 保存。 注意事项:在用滤器将IPTG 滤入离心管时,先用针头吸IPTG ,然后将枪头拔 掉,排出气体,滤头加入IPTG 液,在使针管与滤器相连,保证整个装置无气体进入。 滤的过程中,手不能碰滤头。 (四) 3 SDS-PAGE loading buffer的配制: 3 SDS-PAGE loading buffer 10ml 1M Tris-Hcl (PH 6.8) 1.5ml SDS 0.6g BPB( 溴酚蓝 ) 30mg 甘油(丙三醇)3ml 去离子水5.5ml 1将除BPB 以外的药品完全溶解。SDS 常温下很难溶

6、解,可以在37水浴溶 解。完全溶解后,再加入BPB ,进行溶解。 2把溶好的buffer 分装到1.5ml 的离心管中,1ml/ 管,常温放置。 3使用前,每管加入30 L 巯基乙醇。 注意事项:巯基乙醇为危险品,加入的过程在通风橱中完成,并且带好手套。 (五) 10 PBS 的配制: 0.1M PBS ( 10 PBS)1L NaH2PO4.2H2O 2.83g Nacl 85g Na2HPO4.12H2O 28.98g 3 用去离子水将以上药品进行溶解。(溶解的非常慢,可能需要过夜) 调 PH 值到 7.2,用 0.4 m 的滤膜过滤。常温保存。 工作时用的是1 PBS。 (六) 1.5M

7、 Tris-Hcl (PH 8.8) 的配制: 1.5M Tris-Hcl 250ml Tris 45.425g 1 用 200ml 去离子水将Tris 溶解。 2用浓盐酸调PH 值到 8.8。 3调好PH 的 Tris-Hcl定容到250ml 。 4 0.4 m 的滤膜过滤,常温保存。 注意事项:Tris 的缓冲能力很强,调PH 值时,费些时间,但不要调过。 (七) 1M Tris-Hcl (PH 6.8) 的配制: 1M Tris-Hcl 250ml Tris 30.275g 1用200ml 去离子水将Tris 溶解。 2用浓盐酸调PH 值到 6.8 3调好PH 的 Tris-Hcl定容到

8、250ml 。 4 0.4 m 的滤膜过滤,常温保存。 (八) 30% 丙烯酰胺的配制: 30%丙烯酰胺250ml 丙烯酰胺 72.5 ml BIS 甲叉丙烯酰胺2.5 ml 1把药品用去离子水溶解后定容到250ml 。 2用滤纸过滤,放在棕色瓶子中,4保存。 注意事项:两种药品有毒性,配制过程要带手套和口罩。 (九) 10%SDS 的配制: 1 1g SDS 加入 10ml 去离子水进行溶解。 2分装到1.5ml 离心管中,-20保存。 (十) 10%过硫酸铵的配制: 1 1g 过硫酸铵加入10ml 去离子水进行溶解。 2分装到1.5ml 离心管中,-20保存。 4 (十一)5 SDS-PA

9、GE 电泳缓冲液的配制: 5 SDS-PAGE 电泳缓冲液1L Tris 15.1g Glycine (甘氨酸)94g SDS 5g 将以上药品用去离子水溶解后定容到1L,常温保存。工作时用的是1 SDS-PAGE 电泳缓冲液。 (十二)考马斯亮蓝R-250 染色液的配制: 考马斯亮蓝R-250 染色液1L 1 往 1g 考马斯亮蓝R-250 中加入 250ml 异丙醇,在磁力搅拌器上搅拌六小时以上。 2 加入 650ml 去离子水,磁力搅拌器搅拌过夜。 3 再加入 100ml 冰醋酸进行溶解,磁力搅拌器搅拌。 4 在通风橱内用滤纸进行过滤。常温保存。染色液只能反复用两次。 注意事项:在磁力搅

10、拌器上搅拌时,要把容器封口。 (十三)脱色液的配制: 脱色液1L 醋酸(冰乙酸)100ml 乙醇(无水乙醇)50ml 去离子水850ml 常温保存。 四实验步骤: (一):质粒的转化 1使用无菌操作台之前先用75%的酒精擦拭, 然后将灭菌的培养基以及所有要用到的 器具放到超净台上,在开紫外照射30min 左右。操作之前,关掉紫外,打开通风橱,将手 用酒精擦拭后开始操作。 2从 -80 的冰箱中取出表达菌(BL21 )的感受态细胞(每管100 L) ,在 -80 冰水中融化。 3载体 ( PET32a 等) 与基因片段的连接后质粒1 L,缓慢的加入到100 L BL21 感受态中,冰置15min

11、 。 (无菌操作) 342下热激90s,随后在冰水中冰置5min 。 4涂板:先将涂布棒用酒精棉球擦,然后用酒精灯火焰烧,放置等它凉却。把 处理后的感受态点在含有抗性的固体培养基(氨苄或卡那等)上。用冷却的涂布棒进 行涂布,左手把该盖拿起,小指轻轻转动培养基,右手来涂,涂到培养基表面快干。 (无菌操作) 5放在37培养箱中,倒置培养过夜。 5 注意事项: 1质粒的转化时,质粒是冻在-20 的冰箱中,等它完全化了在进行吸取,往感 受态中加入质粒时,一定要缓慢,因为感受态非常脆弱,防止感受态受伤。 2质粒的转化时,热激的时间90s,一定要控制好时间。 3质粒的转化时,涂布棒在涂布前,一定要晾凉涂布

12、棒。防止感受态被烫死, 或固体培养基的损坏。 (二):挑菌与接菌: 1无菌操作台紫外线照射,后通风。将转化后的平板取出。 2 在无菌操作台中,把消毒后的螺口管(一般一个基因取四个螺口管,进行平行实验) 取出,在酒精灯的外焰上灼烧螺口管管口。 3 灭菌后的LB 培养基从冰箱中取出,在酒精灯的外焰上烧一下培养基瓶口。吸取 LB 培养基 (一般 5.5mL)加入螺口管中,后加入抗性(氨苄霉素、卡那等) 。氨苄霉素 (卡那): LB 培养基 =1:1000(5.5 L) ,抗性由载体决定。 4镊子用酒精棉球擦拭,并在酒精灯的外焰上灼烧,将镊子晾凉。用晾凉的镊子, 夹取 20 L 小枪头,在转化后的平板

13、上挑取单菌落,扔到培养基中。 5 接好菌的螺口管,进行摇菌。 37, 180rpm 。 摇到菌的对数期( OD600值 0.4-0.6 ) , 时间大概2-3h。可以模糊看到手即可。(注意不要摇过) 6用完的平板用封口膜封住,倒置放于4保存。 7若直接用菌液进行接菌,接菌比例为,菌液:LB 培养基 =1:100。 注意事项: 1 接菌吸培养基时,把放置培养基的三角瓶倾斜才吸取培养基,移液枪尽量不 要插进三角瓶中。 2接菌时一定要加入抗性,挑菌落时,要挑单个的菌落,且不要把培养基也扣 起来。 3摇菌不要过了它的对数期,2 小时后随时注意其生长状态。 (三)小量保菌: 1无菌操作台紫外线照射,后通

14、风。 2将摇到标准OD 值的菌液进行小量保菌,先在酒精灯的外焰上灼烧螺口管管口。 3保菌:从灭菌的饭盒中取出4 个 1.5ml 的灭菌的离心管,加入50 L 的灭菌后的 80%的甘油, 并分别加入相应的350 L 菌液。 一个基因的四个平行实验菌都要进行保菌。 (若不保菌,实验不能进行重复,只能从头做) 4标清保菌的类别,名称,时间,如“ BL21 PET32a VAV 1 号 2010.7.14” ,其中的 1 号 是平行对照中它排几号。 5混匀, -20保存。 注意事项: 1在小量保菌中,一个基因的四个平行对照都要保菌,否则得重新摸条件。 2在小量保菌中,菌液与甘油一定要混匀在保存,否则菌

15、会被冻死。 6 (四)蛋白诱导表达条件摸索 1无菌操作台紫外线照射,后通风。 2小量保菌后的四个平行实验组,分别加入不同终浓度的IPTG,在不同的温度条件 下进行诱导(如下图) : 对照编号IPTG 终浓度诱导温度诱导温度 1 号1 mmol/L 3h 37 2 号0.1 mmol/L 3h 37 3 号1 mmol/L 3h 30 4 号0.1 mmol/L 3h 30 (五)小量收菌 1将诱导完成的四个平行实验组菌液,分别取出1mL,对应装于4 个不同的1.5ml 离 心管中并做好标记。剩余的平行实验组菌液放入4保存。 2离心 7000rpm,2min,使菌沉淀。 3把上层培养基倒掉,用1

16、ml 1 PBS 把表达菌重悬,再次离心7000rpm,2min,使菌 沉淀。 4把上层 1 PBS 倒掉,再次离心同步骤3。 5用 80 L 1 PBS 把表达菌体重悬。 6在四个平行的重悬液中,分别加入80 L 3 SDS-PAGE loading buffer 。 ( 把 3 SDS-PAGE loading buffer当成 2 SDS-PAGE loading buffer用) 7煮样8min 。 (打开锅盖煮) 8离心13000rpm,10min。吸上清。 9进行SDS-PAGE 电泳。 注意事项:在煮样时要打开锅盖煮,防止小样进水,若样进水,则不能再用。 (六) SDS-PAGE

17、胶的配制 1分离胶的配制 ( 1)找出配套的胶板,用擦镜纸擦干净,并固定在配胶器上。随后用去离子水 试漏。 ( 2)若胶板不漏水,就进行分离胶的配制。依次将水、30% 丙烯酰胺、1.5M Tris-Hcl ( PH 8.8) 、 10%SDS 、 10%过硫酸铵加到干净的小烧杯中(如下图),混匀。 (1mm 的胶板,一般配一块胶用5ml 。所配的胶浓度一般为12% ,但浓度也要视情况 而定。蛋白越小,胶的浓度越大。) 7 ( 3)将胶板中的水倒掉,并用滤纸吸干水分(不要将滤纸塞到胶板底部)。 ( 4)小烧杯中再加入TEMED ,混匀。 (TEMED可使胶凝固,所以最后加) ( 5)灌胶:混匀的

18、分离胶沿着胶板边缘轻轻灌下,防止产生气泡。 ( 6)用水将分离胶压平。(用水灌满,同时加水时要缓慢加入,防止把胶吹起) 2浓缩胶的配制 (1)待分离胶与水中间形成明显的横线,即分离胶凝固。随后进行浓缩胶的配制,依 次将水、30%丙烯酰胺、1.0M Tris-Hcl (PH 6.8 ) 、 10%SDS 、 10%过硫酸铵加到干净 的小烧杯中(如下图) (2) 将分离胶上层的水倒掉,并用滤纸吸干水分。(尽量不要把滤纸插入) (3)小烧杯中再加入TEMED ,混匀。 ( 4)灌胶。然后插入梳子。 ( 5)把制胶器倒过来,胶仍然不会往外流,或可以明显看出梳子中两个齿之间的 胶面明显凹下去,说明浓缩胶

19、凝固。将凝固的胶板装入电泳槽内,并在电泳槽内加入 SDS-PAGE电泳缓冲液,把胶浸泡一段时间,时间越长越好。(防止梳子与胶相连, 8 或胶因湿度不够而萎缩) (6)点样时,再把梳子拔出来,拔时动作要轻,防止胶齿被拔断。 (七)未诱导和空载的制备 在诱导表达中,有两个重要的对照组,即空载诱导和未诱导。 1未诱导的制备 (1)未诱导是我们所做一个基因除了四个平行实验外,再做的一个对照组菌,唯一不 同的是它不进行诱导(接菌步骤如上) ,在 37下,进行摇菌, 不加 IPTG,摇起来即可。(和 表达完的菌浓度差不多即可) (2)未诱导的菌进行小量处理,见上面的小量收菌。 2空载诱导的制备 (1)空载

20、的转化: 将不连基因片段的空载体质粒,转入表达菌(和前面的试验用一个表达菌),如 “ BL21 -PET32a-VAV 质粒 ” 转入 “ BL21表达菌 ” ,其空载应当是“ BL21 -PET32a” 转入 “ BL21表 达菌 ” 。转化步骤同上。 (2)空载接一个菌(实验组),并摇菌摇到对数期(步骤同上)。 (3)空载的诱导: 空载的诱导条件固定为温度37,时间3h. ,IPTG 终浓度为1mmol/L 。 (诱导步骤 如上) 。 (4)空载的菌进行小量处理,见上面的小量收菌。 (八)蛋白诱导表达条件摸索的SDS-PAGE 电泳 1拔掉SDS 胶上的梳子,并用小针调整齿的位置(使它们都

21、平行)。 2点样。用20 L 的小枪头,吸煮过的样品10 L,对准胶孔点样,注意不要把 样品点在外面。我们用的marker 是低分子量蛋白marker 。 一般的点样顺序是: 1 2 3 4 5 6 7 空载未诱导样品 1 号样品 2 号样品 3 号样品 4 号marker 3开始电泳,电泳仪正负极接好,打开电源。浓缩胶:电压low 100V 分离胶:电压high 150V 。 4卸胶染色。等胶内的所有的蓝色都跑出去,电泳停止,一般时间为1 小时 45 分。 把胶板从电泳仪上卸下,用刀片把胶板撬开,胶的浓缩胶部分割除,放入考马斯亮蓝R-250 染色液中进行常温过夜染色。 5脱色。将过夜染色的S

22、DS-PAGE 胶放入脱色液中进行脱色,直到背景发白。 (九)四个平行实验组菌液的选择 1 将脱好的胶拿出进行观察,看四个平行实验组菌液是否进行了蛋白表达。一般来说, 未诱导没有过量的蛋白表达,而空载有一处蛋白的过量表达(大小由表达载体决定),四个 平行实验组也有一处蛋白的过量表达,它比空载表达的蛋白要大,大出的那一部分即我们的 目的蛋白。 2若平行实验组中无过量蛋白表达,尤其是37, 1mmol/L ,3h 无过量蛋白表达, 则说明蛋白无表达。 3若平行实验组中有过量蛋白表达,但它的大小与空载的大小相同。这说明蛋白进行 了漏表达。 9 4 若蛋白表达正常, 则选择诱导温度最低,IPTG 浓度

23、最低的实验组 (30, 0.1 mmol/L , 3h) ,进行下面的小量超声实验。 (十)表达菌的小量超声实验 1把以上做的四个平行实验组菌液从4中拿出。 2将最有条件的实验菌全部收集在1.5ml 的小离心管中。 (其他平行实验组的菌进行 灭菌) 3离心 7000rpm,2min,使菌沉淀。 4把上层培养基倒掉,用1ml 1 PBS 把表达菌重悬,再次离心7000rpm,2min,使菌 沉淀。 5把上层 1 PBS 倒掉,再次离心同步骤3。 6用 500 L 1 PBS 把表达菌重悬。 7将菌液放入小玻璃管中,准备进行超声。 8将超声仪打开预热20min ,并准备冰盒。 9将呈菌液的小玻璃管

24、放入冰盒进行超声,超声效率为3050HZ,超声 3s,停 5s。 直到菌液超澄清(透明呈现鸡蛋清色)。 10将超开的菌液进行离心,13000rpm,10min。 11离心产物上清取出100 L,加入100 L3 SDS-PAGE loading buffer。 12上清倒掉,沉淀用1ml 1 PBS 把表达菌重悬,再次离心13000rpm,10min。 13重复 11 步。 14上清倒掉,用100 L 将沉淀悬起,加入100 L3 SDS-PAGE loading buffer。 15上清和沉淀都进行煮样,开锅盖,8min。 16离心13000rpm,10min。吸上清。 17进行 SDS 电

25、泳。 注意事项: 1小样超声时,要超彻底,一般超45 分钟即澄清。若仍然不澄清,则可能是包涵 体。超的过程中不要超糊。 2在洗超声离心物的沉淀时,要洗干净。 (十一)破菌超声的SDS-PAGE 电泳 1配胶、点样、电泳的步骤如上。破菌超声的点样顺序一般为: 1 2 3 4 5 6 marker 未诱导空载全菌破菌上清破菌沉淀 未诱导,空载,全菌为摸索表达条件时所用的样品。 注:我们破的几号菌,就上几号的全菌样。 2若破菌上清表达的蛋白与全菌的蛋白分子量一致(目的蛋白),且破菌沉淀中没有, 这说明蛋白可溶;若破菌沉淀中有目的蛋白,而破菌上清中没有,说明蛋白为包涵体。 (十二)目的蛋白的大量表达(

26、1L) 1配制培养基1L,每大瓶500ml ,高压灭菌4保存。 2一级接菌:摸索完条件的表达菌进行接菌3 管,每管5ml。抗性:培养基=1:1000, 菌液:培养基 =1:100。 (菌液为针对可溶条件的小量保菌液)步骤如上。37, 120rpm,过 夜摇菌。 10 3标准保菌: 100 L 灭菌甘油加入700 L 过夜菌。混匀,-20保存。(写好名称 日期,如上,放入表达菌的库中) 3二级接菌:对大瓶进行接菌,抗性:培养基=1:1000,菌液:培养基 =1:100。即每瓶 5ml。 4摇菌: 37, 180rpm,摇到对数期,摇到菌的对数期(OD600值 0.4-0.6 ) ,时间 大概 2

27、-3h。可以模糊的看到手即可。(注意在摇过程中随时观察状态,不要摇过) 5诱导:依据摸索好的条件进行诱导。 (十三)大量诱导的收菌: 150ml 离心管灭菌烘干,待用。 2找出两个50ml 离心管,管盖和管壁上做标记,并称重。 36个 50ml 离心管 (包括称重的两个) ,倒入菌液 (4045ml) 。配平,离心 7000rpm, 10min。 4倒掉上清,用1 PBS 把菌重悬,离心7000rpm , 10min 。 5重复4。 6倒掉上清,称菌体的重量。 7悬菌。1g 菌体加入35ml 的纯化时用的上样缓冲液悬起。-20 保存。 (十四)大量表达菌的超声 1把表达菌从-20拿出,在流水中

28、融化。 2把完全融化的表达菌,放入小烧杯中准备超声。 3将超声仪打开预热20min ,并准备冰盒。 4将呈菌液的小烧杯放入冰盒进行超声,超声效率为30 50HZ ,超声3s,停 5s。直到菌液超澄清,呈现鸡蛋清色。(一般超20-30min ,注意不要吵时间太长,使 菌超糊) 5将超开的菌液进行离心,13000rpm , 10min 。 6将上清收集在灭菌的50ml 离心管中,进行纯化。 五促进原核表达的蛋白可溶的方法: 一般来说,人们认为包涵体的形成是因为新生多肽链不能在正确位置形成二硫 键,二硫键错配,进而错误折叠的结果。而IPTG 浓度越低,温度越低,一般蛋白的 可溶性越大,因为这样的条件

29、下,可以减慢蛋白的形成,减少蛋白的二硫键错配,从 而促进蛋白的可溶。 1使蛋白可溶的条件并不是固定的,一般来说,以上条件就可是蛋白可溶(有 时2/4条 件 可 以 把IPTG浓 度 提 的 高 一 点 ) 。 但 如 果 仍 不 可 溶 的 话 , 可 以 试 一 下 0.025mmol/L,常温,过夜诱导。这种条件是IPTG 使用量的最小浓度,可以使包涵体 部分可溶。 2180rpm 摇菌摇对数时,不要摇过。对数期时,是表达菌产蛋白的最佳时期。 表达菌浓度太大,对菌中蛋白的可溶性影响会很大。所以在摇菌到2h 后,一定密切 关注菌的浓度,随时用分光光度计测OD 600 值。这就意味着在接菌时,

30、多接一些菌(由 实际情况而定)。 3蛋白的可溶与表达菌也有关系。 菌株内源的蛋白酶过多,可能会造成外源表达产物的不稳定,所以一些蛋白酶缺 陷型菌株往往成为理想的起始表达菌株。堪称经典的BL21 系列就是lon 和 ompT 11 蛋白酶缺陷型,也是我们非常熟悉的表达菌株。大名鼎鼎的BL21(DE3)融源菌则是添 加 T7 聚合酶基因, 为 T7 表达系统而设计。BL21(DE3)即我们做表达是常用的表达菌。 真核细胞偏爱的密码子和原核系统有不同,因此,在用原核系统表达真核基因的 时候,真核基因中的一些密码子对于原核细胞来说可能是稀有密码子,从而导致表达 效率和表达水平很低。改造基因是比较麻烦的

31、做法,Rosetta 2 系列就是更好的选 择 这 种 携 带pRARE2质 粒 的BL21衍 生 菌 , 补 充 大 肠 杆 菌 缺 乏 的 七 种 (AUA,AGG,AGA,CUA,CCC,GGA 及 CGG )稀有密码子对应的tRNA ,提高外源基 因、尤其是真核基因在原核系统中的表达水平。(已经携带有氯霉素抗性质粒) 当要表达的蛋白质需要形成二硫键以形成正确的折叠时,可以选择K-12衍生菌 Origami 2系列, thioredoxin reductase (trxB)和 glutathione reductase (gor)两条主要还原 途径双突变菌株,显著提高细胞质中二硫键形成几

32、率,促进蛋白可溶性及活性表达。 (卡那霉素敏感) Rosetta- gami? 2 则是综合上述两类菌株的优点,既补充7 种稀有密码子,又能够 促进二硫键的形成,帮助表达需要借助二硫键形成正确折叠构象的真核蛋白。(卡那 霉素敏感) Origami B 是衍生自lacZY 突变的BL21 菌株,这个突变能根据IPTG 的浓度精 确调节表达产物,使得表达产物量呈现IPTG 浓度依赖性。(四环素敏感) 在决定试用这些名字古怪的菌株时,有几个小Tips 是要注意的,一个是不同菌株 有时已经携带某个质粒或者已经具有某种抗生素抗性,要注意自己的表达质粒是否能 与之兼容。比如Rosetta 2 已经携带有氯

33、霉素抗性质粒,不能再用氯霉素筛选等等。 现象可能原因改进方案建议菌株 无蛋白表达 E. coli 的密码子偏移性 补充稀有密码子的 tRNA ;将稀有密码子突变为 普通大肠杆菌密码子 Rosetta 2 Rosetta-gami 2 Rosetta-gami B RosettaBlue 出现截短蛋白 包涵体 二硫 键形成困难 降低宿主胞质的还 原性; 利用促进二硫键形成的 各种载体标签 Origami 2 Rosetta-gami 2 Rosetta-gami B 表达 过快,表达量过高 控制优化表达水 平:降温,IPTG 浓度优化 Tuner Rosetta-gami B 蛋白无活性蛋白错误

34、折叠 降低宿主胞质的还 原性; 利用促进二硫键形成的 各种载体标签 Origami 2 Rosetta-gami 2 Rosetta-gami B 控制优化表达水 平:降温,IPTG 浓度优化 Tuner Rosetta-gami B 细胞死亡,生长 极困难 毒性 蛋白 更严格的本底表达 控制 pLysS 菌株 无克隆生长 过高 本底表达 更严格的本底表达 控制 pLysS 、 pLysE 菌株 4若实在不可溶,只能把蛋白截短,这样可溶性会明显增加。 12 六 SDS-PAGE的相关技巧: 1 SDS-PAGE 电泳的原理: SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳,是在聚丙烯酰胺凝胶系统中引进SDS(十二

35、烷基硫 酸钠),SDS 会与变性的多肽,并使蛋白带负电荷,由于多肽结合SDS 的量几乎总 是与多肽的分子量成正比而与其序列无关,因此SDS 多肽复合物在丙稀酰胺凝胶电 泳中的迁移率只与多肽的大小有关,在达到饱和的状态下,每克多肽可与1.4g去污 剂结合。当分子量在15KD到 200KD之间时,蛋白质的迁移率和分子量的对数呈线 性关系,符合下式:logMW=K-bX,式中: MW 为分子量,X 为迁移率,k、b 均为常 数,若将已知分子量的标准蛋白质的迁移率对分子量对数作图,可获得一条标准曲线, 未知蛋白质在相同条件下进行电泳,根据它的电泳迁移率即可在标准曲线上求得分子 量。 2 SDS-PAG

36、E 电泳遇到的相关问题及解答。 (1)配胶缓冲液系统对电泳的影响? 在 SDS PAGE 不连续电泳中,制胶缓冲液使用的是Tris HCL 缓冲系统,浓 缩胶是pH6.7 ,分离胶pH8.9 ;而电泳缓冲液使用的Tris 甘氨酸缓冲系统。在浓缩 胶中,其pH 环境呈弱酸性,因此甘氨酸解离很少,其在电场的作用下,泳动效率低; 而 CL 离子却很高,两者之间形成导电性较低的区带,蛋白分子就介于二者之间泳动。 由于导电性与电场强度成反比,这一区带便形成了较高的电压剃度,压着蛋白质分子 聚集到一起,浓缩为一狭窄的区带。当样品进入分离胶后,由于胶中pH 的增加,呈 碱性,甘氨酸大量解离,泳动速率增加,直

37、接紧随氯离子之后,同时由于分离胶孔径 的缩小, 在电场的作用下,蛋白分子根据其固有的带电性和分子大小进行分离。所以, pH 对整个反应体系的影响是至关重要的,实验中在排除其他因素之后仍不能很好解 决问题的情况,应首要考虑该因素。 (2)提高SDS-PAGE电泳分辨率的途径? 聚丙烯酰胺的充分聚合,可提高凝胶的分辨率。建议做法:待凝胶在室温凝固 后,可在室温下放置一段时间使用。忌即配即用或4 度冰箱放置,前者易导致凝固不 充分,后者可导致SDS 结晶。一般凝胶可在室温下保存4 天, SDS 可水解聚丙烯酰 胺。 (4) “ 微笑 ” (两边翘起中间凹下)形带原因? 主要是由于凝胶的中间部分凝固不

38、均匀所致,多出现于较厚的凝胶中。处理办 法:待其充分凝固再作后续实验。 (5) “ 皱眉 ” (两边向下中间鼓起)形带原因? 主要出现在蛋白质垂直电泳槽中,一般是两板之间的底部间隙气泡未排除干净。 处理办法:可在两板间加入适量缓冲液,以排除气泡。 (6)为什么带出现拖尾现象? 主要是样品融解效果不佳或分离胶浓度过大引起的。处理办法:加样前离心; 选择适当的样品缓冲液,加适量样品促溶剂;电泳缓冲液时间过长,重新配制;降低 凝胶浓度。 13 (7)为什么带出现纹理现象? 主要是样品不溶性颗粒引起的。处理办法:加样前离心;加适量样品促溶剂。 (8)什么是“ 鬼带 ” ,如何处理? “ 鬼带 ” 就是

39、在跑大分子构象复杂的蛋白质分子时,常会出现在泳道顶端(有时 在浓缩胶中)的一些大分子未知条带或加样孔底部有沉淀,主要由于还原剂在加热的 过程中被氧化而失去活性,致使原来被解离的蛋白质分子重新折叠结合和亚基重新缔 合,聚合成大分子,其分子量要比目标条带大,有时不能进入分离胶。但它却于目标 条带有相同的免疫学活性,在WB 反应中可见其能与目标条带对应的抗体作用。处理 办法:在加热煮沸后,再添加适量的DTT 或 Beta 巯基乙醇,以补充不足的还原剂; 或可加适量EDTA 来阻止还原剂的氧化。 (9)为什么溴酚蓝不能起到指示作用? 我们在实验中常会遇到溴酚蓝已跑出板底,但蛋白质却还未跑下来的现象。主 要与缓冲液和分离胶的浓度有关。处理办法:更换正确pH 值的Buffer ;降低分离胶 的浓度。 (10) 为什么电泳的条带很粗? 电泳中条带很粗是常见的事,主要是未浓缩好的原因。处理办法:适当增加浓缩 胶的长度;保证浓缩胶贮液的pH 正确( 6.7);适当降低电压。

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