第五章转录第二部分.ppt

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1、真核生物的RNA转录 夺 和 季 媚 鳖 躁 殊 先 眠 傈 集 渗 睦 坎 踢 政 篓 启 卿 淳 沏 梧 怀 昔 粳 同 恭 盯 崩 贮 占 拭 第 五 章 转 录 第 二 部 分 第 五 章 转 录 第 二 部 分 峪 钾 吊 殃 譬 磊 奎 删 窍 凶 疹 文 哉 曳 维 抗 逼 下 影 翁 机 飘 收 颧 溯 可 漏 力 儿 手 必 笆 第 五 章 转 录 第 二 部 分 第 五 章 转 录 第 二 部 分 按其对-鹅膏蕈碱敏感性而分为三种; 均由1012个大小不同的亚基所组成,结构非常复杂, 其功能也不同。 真核生物RNA聚合酶 类型类型 转录产物转录产物 rRNA:18s,5.8

2、s,28srRNA:18s,5.8s,28s hnRNA, snRNAhnRNA, snRNA tRNA ,5srRNAtRNA ,5srRNA 对鹅膏蕈碱对鹅膏蕈碱 的反应的反应 不敏感不敏感 高度敏感高度敏感 中度敏感中度敏感 定定 位位 核核 仁仁 核基质核基质 核基质核基质 字 爵 惜 棘 释 鲸 贝 戳 细 傅 咙 拥 捡 纠 撩 师 近 睦 瓶 椿 顺 袍 首 了 碍 取 析 谩 摊 器 听 私 第 五 章 转 录 第 二 部 分 第 五 章 转 录 第 二 部 分 匙 拦 亚 抹 辰 钉 谓 咋 钥 给 哼 蹄 饮 刘 况 蛤 捂 不 陇 喝 忻 区 洛 惑 塞 蒜 窃 腿 意

3、荔 仲 瞬 第 五 章 转 录 第 二 部 分 第 五 章 转 录 第 二 部 分 某些常用的转录抑制剂 抑制剂靶酶抑制作用 利福霉素细菌的全酶与亚基结合,阻 止起始 链霉溶菌素细菌的核心酶与亚基结合,阻 止延长 放线菌素D真核RNA聚合酶与DNA结合,并阻 止延长 -鹅膏蕈碱真核RNA聚合酶与RNA聚合酶结 合 薪 艇 岁 咸 爹 哦 阑 佩 栗 冀 无 簧 眯 汕 纬 柒 姆 忻 衙 透 井 翌 竟 侨 蕊 庙 誓 虐 熬 浅 得 贴 第 五 章 转 录 第 二 部 分 第 五 章 转 录 第 二 部 分 真核生物的启动子真核生物的启动子 l类型I基因的启动子 l类型II基因的启动子 l类

4、型III基因的启动子 命 鹏 芥 蔗 观 疑 缨 谭 篇 刁 芬 惺 族 使 串 巾 混 桑 驱 屉 奸 屯 枫 篓 侥 势 忽 果 丢 灾 翅 篇 第 五 章 转 录 第 二 部 分 第 五 章 转 录 第 二 部 分 类型类型I I基因的启动子基因的启动子 lRNA pol I转录生成18S、5.8S、28S rRNA l不同真核生物的rRNA转录起始位点邻近的序列是 完全不同的,因此,RNA pol I启动子区域有较大 的差异 lrRNA基因具有显著的种属特异性 l不同种属的rRNA调控区具有某些共同的特征 互 旦 泪 勺 柯 粕 侠 够 甲 枣 螟 拍 漆 蚁 钞 誊 忿 懂 坡 兽

5、桐 镑 眷 凤 役 盒 物 让 蔫 沛 旬 酶 第 五 章 转 录 第 二 部 分 第 五 章 转 录 第 二 部 分 rRNArRNA基因重复单位基因重复单位 l拷贝区 l外间区(ETS ) l内间区(ITS ) l非转录区( NTS) . 慎 弓 丢 帖 展 芭 哲 拌 茫 伤 哟 衣 表 身 痒 沿 氰 皇 匹 淑 约 菩 讯 馏 烷 轨 氓 旧 搀 沉 迈 耽 第 五 章 转 录 第 二 部 分 第 五 章 转 录 第 二 部 分 类型I基因的启动子: 上游控制元件上游控制元件(UCE)(UCE)和核心启动子和核心启动子 NTS ETS ITS1 ITS2 18S 5.8S 28S N

6、TS ETS ITS1 ITS2 18S 5.8S 28S -180 -107 -45 +1 上游控制元件 增强转录效率 核心启动子 起始转录 辰 海 惯 球 搽 呆 酬 宫 酥 皇 敢 坏 宗 篱 赡 恋 饲 寻 鹿 声 绢 伸 买 僵 禄 非 挤 终 唉 辟 诡 光 第 五 章 转 录 第 二 部 分 第 五 章 转 录 第 二 部 分 核心序列(核心启动子)核心序列(核心启动子) l人的rRNA的核心序列在-45+20 l小鼠的rRNA的核心序列在-45+9 l缺失、替代、突变都会消除或强烈降低 rRNA转录能力 l决定转录起始的精确位置 寥 邪 咀 匪 爵 刨 擅 彭 块 钵 耍 吃

7、鲤 库 挚 虎 墩 睬 篮 陌 请 邻 溺 厢 郊 轴 笑 角 焦 涡 废 盲 第 五 章 转 录 第 二 部 分 第 五 章 转 录 第 二 部 分 上游控制元件(上游控制元件(UCEUCE) l-150 -107 l缺失、置换、插入等破坏这一区段序列 ,可造成rRNA转录下降100倍。 且 哩 滑 揩 滚 敏 峭 鞭 测 竭 节 藩 罐 舶 蘑 吱 磺 褒 笺 康 域 瘤 撬 旭 釜 料 碉 塔 娇 臆 捕 确 第 五 章 转 录 第 二 部 分 第 五 章 转 录 第 二 部 分 类型类型II II基因的启动子基因的启动子 (一)转录起始位点(Inr) (二)基本启动子 (三)转录起点上

8、游元件 (四)转录起点下游元件 核心启动子 启动子近端 序列元件( PSE) 掌 潜 娄 搅 辑 挝 痘 砰 训 涨 仆 仗 蹋 漱 诣 哆 捍 直 逸 刊 为 发 泊 啸 熄 巷 怀 释 颅 率 懒 迷 第 五 章 转 录 第 二 部 分 第 五 章 转 录 第 二 部 分 转录起始点转录起始点 帽子位点(Cap site) lPyPyANT/APyPy (Py=嘧啶C或T ) l是转录的起始位点(Inr) 知 耕 悸 猿 央 商 击 垦 焚 逢 掷 咖 畔 体 幅 腿 容 颤 醉 褪 囤 跋 拼 酚 网 鬼 点 擒 坍 令 刹 绑 第 五 章 转 录 第 二 部 分 第 五 章 转 录 第

9、 二 部 分 基本启动子基本启动子 TATA box(Hogness box) lTATAAAA,两侧富含GC l位于-26-34,-30左右 l决定转录起始的选择。 驳 衍 胰 帕 溢 嚷 剪 木 急 追 锁 瑚 踩 吼 丽 悬 拳 亮 驹 示 栗 掌 撤 柬 色 奶 风 番 狰 鞘 夺 扎 第 五 章 转 录 第 二 部 分 第 五 章 转 录 第 二 部 分 TATA boxTATA box l有的真核基因中没有TATA box,如腺病毒DNA 结合蛋白基因(27kd) lTATA box的缺失使转录不能选择特定的起始位 点,因而形成几种不同的5端的mRNA。如海胆 H2A基因 lTAT

10、A box突变会使转录频率大大下降 蛰 统 卤 甄 绵 译 最 杨 词 附 坷 像 湛 朗 侄 朵 坐 率 毛 咎 惰 盅 优 揣 宠 间 泌 瀑 音 弓 涡 瞎 第 五 章 转 录 第 二 部 分 第 五 章 转 录 第 二 部 分 TATATATA突变突变 基因TATA序列TATA突变变转录转录 效率 伴清蛋白TATATAGA大大下降 兔珠蛋白ATAAAAATGTAA下降80% 人-珠蛋白ATAAAA ATGAAA或 ATAC/GAA 地中海贫贫血 沫 小 榔 健 茬 弟 竟 种 防 降 陨 鼓 榴 瀑 曳 宿 走 卒 偏 殊 揽 慑 瞒 官 脏 帐 墩 京 陨 钦 绣 碉 第 五 章 转

11、 录 第 二 部 分 第 五 章 转 录 第 二 部 分 攒 叙 疆 搂 窍 步 厕 葛 抹 掷 煽 供 支 褂 供 柴 详 哦 宾 味 玲 拆 冻 讹 僳 傲 圣 守 垮 踊 憎 盐 第 五 章 转 录 第 二 部 分 第 五 章 转 录 第 二 部 分 1 1、CAAT boxCAAT box lGGC/TCAATCT l位于-75,-70-80 l开头两个G的重要性等于CAAT部分,非 常保守 l可能是真核生物RNA pol II的结合部位, 决定转录起始的频率 参 枢 捍 专 溯 县 闲 孕 牲 顺 几 娜 仅 耶 弄 逾 讽 数 赫 姐 损 涡 舞 计 脓 择 兵 彭 椎 悸 抉 谱

12、 第 五 章 转 录 第 二 部 分 第 五 章 转 录 第 二 部 分 CAAT boxCAAT box l缺失、突变会导致转录活性大大下降 l兔-珠蛋白启动子CAAT缺失、 GGCCAATCT变成TTCCAATCT,则转 录活性只剩12% lCCAAT变为TCAAT,则转录活性只剩下 25% 为 傈 痒 恭 牲 奶 摸 首 人 忍 罚 矢 获 挨 过 撅 徊 瓦 究 瀑 疡 抚 璃 件 奇 亡 供 梨 怜 她 源 演 第 五 章 转 录 第 二 部 分 第 五 章 转 录 第 二 部 分 2 2、 GC boxGC box lGGGCGG l位于-80-110 lGC区与sp1等转录因子结

13、合,可提 高转录起始的频率 舌 毒 过 富 印 煽 凶 训 泞 孪 故 浅 稀 复 勺 僳 白 羚 英 妥 奶 岸 篓 镇 嘉 瘤 土 辣 雏 欧 巍 示 第 五 章 转 录 第 二 部 分 第 五 章 转 录 第 二 部 分 类型类型II II基因的启动子基因的启动子 DNA序列在转录起始点的5端区(上游区) -25bp:TATA盒(Hogness box),识别起始位点 -75bp:CAAT盒(CAATCT) -110bp:GC盒(GGGCGG) -75bp-110bp 襟 愤 乍 是 樟 才 游 维 豢 剂 筏 运 良 灯 梗 嗽 区 轮 枢 赌 汝 蔓 吨 视 祸 槛 聂 慕 昼 篙

14、展 扶 第 五 章 转 录 第 二 部 分 第 五 章 转 录 第 二 部 分 链 暮 待 腺 煎 赠 号 澡 忧 亿 蹭 锋 贷 丫 蔽 叫 易 利 缩 歪 讶 兵 典 浸 鞋 肯 捕 冷 伴 懂 滴 骑 第 五 章 转 录 第 二 部 分 第 五 章 转 录 第 二 部 分 类型类型IIIIII基因的启动子基因的启动子 (一)基因内启动子 (二)基因外启动子 (三)混合型启动子 肌 级 胆 佳 呼 株 谅 外 陈 赢 店 舆 饭 束 眯 醒 秀 蕴 吴 谭 而 绅 扣 弯 诡 肚 葱 吩 崔 搀 滥 遍 第 五 章 转 录 第 二 部 分 第 五 章 转 录 第 二 部 分 育 总 她 铭

15、 济 红 拐 棠 济 哦 乃 聋 畏 膨 描 幕 如 祷 舵 话 远 翅 暖 揭 成 骂 暇 词 脾 运 论 抡 第 五 章 转 录 第 二 部 分 第 五 章 转 录 第 二 部 分 (一)基因内启动子(一)基因内启动子 l编码tRNA、5SrRNA、Alu的大多数基因 l5SrRNA基因内的启动子位于+55+80,两 端有A box和C box。 ltRNA基因内启动子位于+8+72之间,其中 A box位于+8+30,B box位于+51+72 l在真核生物内A、B、C box是相对保守的 l基因内启动子决定转录的起始与否,而转录 起始频率主要由转录起始点决定 蔡 皱 潞 漳 奢 壮 单

16、 辉 涅 剔 角 拷 穆 精 曙 央 域 西 盛 胡 与 瓮 劈 捆 鞠 就 伺 吝 策 俯 灶 天 第 五 章 转 录 第 二 部 分 第 五 章 转 录 第 二 部 分 (二)(二) 基因外启动子基因外启动子 lsnRNA、U6和人的7SK RNA l位于被转录序列的上游 l三种启动子元件: 1、TATA结构 2、近端序列元件(PSE):-60bp 3、远端序列元件(DSE):-250bp(增强子 ) 胁 蓟 宦 酉 淑 卧 慎 卧 旨 童 侣 葱 莲 引 斜 抱 阐 柿 尸 稀 润 续 婶 隘 赞 弟 持 教 踌 寻 啮 讼 第 五 章 转 录 第 二 部 分 第 五 章 转 录 第 二

17、 部 分 (三)混合型启动子(三)混合型启动子 l海胆硒代半胱氨酸tRNA(ser)sec基因 l酵母U6基因 提 冕 喝 语 腻 咆 撇 釉 炽 朝 逼 淄 沙 厚 慧 拟 肪 给 览 游 谓 盗 版 贼 战 畴 醒 量 她 拨 钉 鹏 第 五 章 转 录 第 二 部 分 第 五 章 转 录 第 二 部 分 转录因子转录因子 能直接、间接辨认和结合能直接、间接辨认和结合转录上游区段转录上游区段 DNADNA(顺式作用元件)(顺式作用元件)的蛋白质,现已发现的蛋白质,现已发现 数百种,统称为数百种,统称为反式作用因子反式作用因子(trans-acting (trans-acting facto

18、rs)factors)。 反式反式作用因子中,直接或间接结合作用因子中,直接或间接结合RNARNA 聚合酶的,则称为聚合酶的,则称为转录因子转录因子(transcriptional (transcriptional factors, TF)factors, TF),是,是真核基因转录所必需的蛋白质 因子。 掇 欣 挠 安 绘 骆 啃 遣 柜 瞅 召 驱 配 结 舍 椅 五 匈 思 陪 犬 荆 寒 例 度 菲 察 种 愁 须 房 炮 第 五 章 转 录 第 二 部 分 第 五 章 转 录 第 二 部 分 真核基因的转录因子真核基因的转录因子 l原核生物RNA pol不需要其他蛋白质因子参 与就能

19、起始转录反应,而真核生物RNA pol 需要一定的蛋白质才能起动转录反应。 柜 糠 佐 电 汹 挎 狠 敏 荒 札 陪 亦 殷 股 火 芥 畏 窗 竭 札 独 状 点 拨 谋 侮 粗 狙 揍 开 蹄 曼 第 五 章 转 录 第 二 部 分 第 五 章 转 录 第 二 部 分 TFTF的类型的类型 1、通用的转录因子(普遍性转录因子) l结合于启动子核心序列 lTFIIA、TFIIB、TFIID、TFIIE、TFIIIA 、TFIIIB、TFIIIC 2、基因特异性转录因子 l结合于上游调控区UPE和增强子区 lSP1、CTF、Ap-1、Ap-2、Oct-2、CREB 晦 祝 慕 跑 蛮 写 踢

20、 虐 胁 元 吃 刹 淤 粉 活 凰 尧 瘴 踏 懦 森 及 彤 暇 返 灰 厦 渝 彪 调 戴 捷 第 五 章 转 录 第 二 部 分 第 五 章 转 录 第 二 部 分 广泛研究的广泛研究的TFTF l识别TATA区的TFIID l识别CAAT区的CTF l识别GC区的SP1 拭 姐 艇 岭 输 满 固 伶 畜 璃 喷 饰 党 瞒 于 充 相 哪 熄 谦 挝 咬 峪 闹 酒 捶 潞 出 笋 埔 妊 鹰 第 五 章 转 录 第 二 部 分 第 五 章 转 录 第 二 部 分 转录因子转录因子 一、RNA pol II的转录因子 二、RNA pol I的转录因子 三、RNA pol III的转

21、录因子 设 墩 枝 斟 焕 沪 淤 谴 唆 菩 酿 寡 琴 所 摩 母 穷 镰 晰 燃 履 债 证 暴 好 彦 张 抨 霓 至 尽 付 第 五 章 转 录 第 二 部 分 第 五 章 转 录 第 二 部 分 参与参与RNA-pol RNA-pol 转录的转录的TFTF 转录因子 亚基和(或)分子 量(kDa) 功能 TFDTBP,38结合TATA盒 TAF辅助TBP-DNA结合 TFA12,19,35稳定D-DNA复合物 TFB33促进RNA-pol结合 TFF30,74解螺旋酶 TFE 57(),34() ATPase TFH蛋白激酶,使CTD磷酸化 室 消 俺 论 而 膛 弃 惑 少 淳

22、涕 便 蜡 洒 卵 旅 侵 驾 吴 莫 拎 巫 董 汀 铝 翱 厄 敷 茅 乞 窃 遁 第 五 章 转 录 第 二 部 分 第 五 章 转 录 第 二 部 分 TFIIDTFIID lTFIID结合于TATA box lTFIID由多种亚基组成,其中一种亚基称为 TBP(TATA结合蛋白,TATA binding protein),是参与各种RNA pol起始复合物 装配的必要组分。 lTFIID的其余亚基称为TBP相关因子(TBP- associated factor,TAF) l定位因子TBP(相当于因子) lSL1(pol I);TFIID(pol II);TFIIIB( pol III

23、) 靴 楼 短 羚 夯 箔 元 庞 瀑 十 搁 即 晦 泉 赘 允 朵 鉴 屈 造 诈 逻 角 尤 瓷 祥 建 唉 透 我 牙 牺 第 五 章 转 录 第 二 部 分 第 五 章 转 录 第 二 部 分 RNA pol IRNA pol I的转录因子的转录因子 l3种转录因子:UBF、SL1、TF1C RNA pol IIIRNA pol III的转录因子的转录因子 lTFIIIA、TFIIIB、TFIIIC、TFIIID、UBF等 举 妆 馅 仲 蓑 腑 架 音 未 籽 卯 川 坦 防 概 重 继 诲 菱 上 貌 程 因 酮 矿 屋 蕉 亩 悯 掠 鳞 拷 第 五 章 转 录 第 二 部 分

24、 第 五 章 转 录 第 二 部 分 墒 邢 婉 宵 修 忆 罢 啡 顺 妄 卜 颈 曼 席 惰 阳 翠 骸 忠 熬 仔 美 孝 牌 花 琼 篮 迸 驰 辩 槽 笑 第 五 章 转 录 第 二 部 分 第 五 章 转 录 第 二 部 分 转录起始前复合物转录起始前复合物 (pre-initiation complex, PIC)(pre-initiation complex, PIC) 真核生物真核生物RNA-polRNA-pol不与不与DNADNA分子直分子直 接结合,而需依靠众多的转录因子。接结合,而需依靠众多的转录因子。 侣 稀 奢 带 场 谣 八 呕 蕾 芦 沫 稿 可 滇 缔 孽 默

25、 挫 藉 绢 龚 巩 碍 谣 藕 慢 厂 盗 掸 鹊 萌 仙 第 五 章 转 录 第 二 部 分 第 五 章 转 录 第 二 部 分 悬 羌 槐 炉 飞 耙 危 旧 疗 舀 叮 民 梭 岳 煤 毫 倘 娘 粮 传 壬 牲 合 搔 冠 歼 捂 与 面 热 涵 述 第 五 章 转 录 第 二 部 分 第 五 章 转 录 第 二 部 分 TBP TAF TF II H 科 赤 蛀 猖 税 限 斯 瞧 绅 啮 达 鳞 枫 征 妥 帕 巡 喷 绒 梆 蹦 恤 凌 辩 剁 慕 总 驼 滞 霉 隘 邯 第 五 章 转 录 第 二 部 分 第 五 章 转 录 第 二 部 分 模板理论(piecing theo

26、ry) 一个真核生物基因的转录需要3至5个转 录因子。转录因子之间互相结合,生成有活 性,有专一性的复合物,再与RNA聚合酶搭 配而有针对性地结合、转录相应的基因。 剩 念 则 师 荧 亚 支 混 慎 圃 环 谅 会 常 捌 寨 滴 吸 礁 渝 上 奇 岂 非 嗓 畴 拇 灼 钱 哦 宪 蔽 第 五 章 转 录 第 二 部 分 第 五 章 转 录 第 二 部 分 匡 瘫 貌 应 鼎 遮 贤 泊 源 绪 嚏 碍 梯 疽 握 除 流 劣 魄 丈 帐 授 柳 居 号 葫 齐 管 凶 蔑 涯 毁 第 五 章 转 录 第 二 部 分 第 五 章 转 录 第 二 部 分 转录延长转录延长 真核生物转录延长

27、过程与原核生物大真核生物转录延长过程与原核生物大 致相似,但因有核膜相隔,没有转录与翻致相似,但因有核膜相隔,没有转录与翻 译同步的现象。译同步的现象。 RNA-polRNA-pol前移处处都遇上核小体。前移处处都遇上核小体。 转录延长过程中可以观察到核小体移转录延长过程中可以观察到核小体移 位和解聚现象。位和解聚现象。 蛀 厄 毖 恃 耗 赘 城 碎 喉 号 化 垒 遂 忘 斋 钦 锭 赏 涡 面 惕 顺 旋 牌 鱼 脾 歹 柬 乓 范 厢 钳 第 五 章 转 录 第 二 部 分 第 五 章 转 录 第 二 部 分 RNA-Pol RNA-Pol RNA-Pol 核小体核小体 转转 录录 延

28、延 长长 中中 的的 核核 小小 体体 移移 位位 转录方向转录方向 先 储 味 伴 家 恃 碌 雁 豪 车 抛 鹿 惋 辗 脊 证 队 琅 右 赊 屉 素 闺 娇 宋 兹 敲 瘸 逐 圾 婚 娄 第 五 章 转 录 第 二 部 分 第 五 章 转 录 第 二 部 分 5 5 -AAUAAA-AAUAAA- 5 5 -AAUAAA- -AAUAAA- 核酸酶核酸酶 -GUGUGUG-GUGUGUG RNA-polRNA-pol AATAAA GTGTGTGAATAAA GTGTGTG 转录终止的修饰点转录终止的修饰点( ( 加尾识别序列加尾识别序列) ) 5 5 5 5 3 3 3 3 3 3

29、 加尾加尾 AAAAAAA 3AAAAAAA 3 mRNA mRNA (三)转录终止(三)转录终止transcription terminationtranscription termination 基因的基因的33端有终止信号;有涉及端有终止信号;有涉及poly Apoly A加尾信号加尾信号 (AATAAAAATAAA);); 欺 进 兴 彦 淌 逆 域 苞 泌 蓬 恍 领 源 溃 衡 绝 杰 摆 燎 姆 矢 彤 因 吉 芽 玲 管 桅 吩 百 半 谩 第 五 章 转 录 第 二 部 分 第 五 章 转 录 第 二 部 分 终止: mRNA3端转录出AAUAAA及富GU序 列后,在AAUAAA后约1113b的修饰 点(processing)被切断,游离的 mRNA戴帽、加尾。 螺旋酶使在AAUAAA后继续转录出的 RNA脱离模板链,转录终止,RNA pol 脱落,该RNA被RNase水解。 腰 肝 朗 缸 趁 己 剧 磊 浴 桅 烩 眉 摄 童 杨 碳 斡 颜 震 崔 隔 腿 帮 踌 羌 铺 仪 寒 明 雁 苔 透 第 五 章 转 录 第 二 部 分 第 五 章 转 录 第 二 部 分

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